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Melhorando a rotulagem de imagens médicas com M-VAAL

Um novo método melhora o processo de rotulagem em imagem médica.

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M-VAAL: RotulagemM-VAAL: RotulagemInteligente de Imagensna rotulagem de imagens médicas.Uma nova abordagem otimiza a eficiência
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Conseguir imagens médicas com os rótulos certos costuma ser muito caro. Isso acontece porque precisa de especialistas que demoram pra garantir que tudo esteja correto. Aprendizado Ativo é um método que ajuda a reduzir o número de imagens que precisam de rótulos, escolhendo só os exemplos mais úteis pra revisão dos especialistas. Esses exemplos úteis podem ajudar muito a melhorar como o aprendizado de máquina funciona, o que é importante pra diagnosticar problemas de saúde e planejar tratamentos.

Apesar de existirem alguns métodos que tentam escolher as melhores imagens pra rotulação na Análise de Imagem Médica, muitos deles não funcionam pra diferentes tipos de tarefas. Frequentemente, eles deixam de usar outras informações úteis que poderiam tornar o processo mais forte. Por isso, um novo método chamado Aprendizado Ativo Adversarial Variacional Multimodal (M-VAAL) foi criado. Esse método usa detalhes extras de diferentes tipos de informações pra ajudar a melhorar a escolha das imagens que precisam de rótulos.

O que é Aprendizado Ativo?

Aprendizado ativo é um jeito de selecionar as imagens mais informativas de um grande grupo que não têm rótulos. O objetivo aqui é melhorar a performance das tarefas de aprendizado de máquina com um número limitado de amostras rotuladas. O processo começa com algumas imagens rotuladas e depois as imagens são escolhidas pegando-as do grupo de exemplos não rotulados pra adicionar ao conjunto rotulado. Essa seleção é feita de forma iterativa, onde as melhores imagens são escolhidas a cada vez pra serem rotuladas pelos especialistas, e essas novas imagens rotuladas são usadas pra treinar o modelo de aprendizado de máquina novamente.

Análise de Imagens Médicas

Imagens médicas envolvem métodos pra tirar fotos do corpo pra ajudar a diagnosticar doenças ou planejar tratamentos. Essas tarefas incluem identificar características dentro das imagens ou classificar doenças. Nos últimos anos, técnicas de aprendizado profundo têm mostrado bons resultados em usos clínicos. Mesmo assim, o uso desses modelos em situações reais de saúde é muitas vezes limitado porque não há acesso suficiente a um grande conjunto de imagens rotuladas.

É caro conseguir imagens médicas rotuladas, e alguns têm olhado pra criar imagens falsas que vêm com rótulos verdadeiros. Mas essas imagens geradas nem sempre combinam com imagens médicas reais de forma precisa, especialmente em casos raros. Isso pode deixar os modelos tendenciosos e fazer com que não funcionem bem. Outra abordagem que ganhou interesse é o aprendizado semi-supervisionado. Esse método usa algumas imagens rotuladas junto com muitas imagens não rotuladas, mesmo assim ainda precisa de imagens específicas pra serem escolhidas pra os especialistas anotarem.

Como o M-VAAL Funciona?

O M-VAAL tem como objetivo melhorar o processo usando informações de múltiplos tipos de imagens. No campo da medicina, os médicos não olham só pra uma imagem; eles também consideram outros relatórios e informações sobre a condição do paciente. Usando essa informação extra, o M-VAAL melhora o processo de seleção para o aprendizado ativo.

Nesse approach, duas tarefas principais são realizadas: primeiro, um aprendiz de tarefa é construído pra treinar modelos de aprendizado de máquina usando as amostras rotuladas, e segundo, um amostrador escolhe as melhores imagens pra rotulação. Combinando vários tipos de imagens, o M-VAAL pode tomar melhores decisões sobre quais imagens não rotuladas escolher.

Análise de Tumor Cerebral e Raio-X de Tórax

A eficácia do M-VAAL foi testada em dois tipos de conjuntos de dados: um focando em tumores cerebrais e o outro em imagens de raio-X de tórax.

Segmentação de Tumor Cerebral

Na tarefa de tumor cerebral, imagens foram tiradas usando diferentes protocolos que forneceram cortes de vários tipos de imagens de ressonância magnética. O objetivo era encontrar e rotular diferentes partes dos tumores nessas imagens baseado em certas características. O conjunto de dados de tumor cerebral foi dividido em casos de treinamento, validação e teste, garantindo que nenhuma informação do paciente vazasse.

Classificação de Raio-X de Tórax

O conjunto de dados de raio-X de tórax incluiu imagens classificadas em três categorias: infecção por COVID, infecção não-COVID e Normal. Essas imagens vêm com uma máscara identificando segmentos nas imagens. O objetivo era classificar as imagens de raio-X de tórax corretamente nessas categorias usando a abordagem M-VAAL.

Avaliação de Performance

A performance do M-VAAL foi comparada a dois outros métodos: amostragem aleatória e um método anterior chamado VAAL. Os resultados foram promissores, mostrando que o M-VAAL selecionou amostras mais úteis tanto pra segmentação de tumor cerebral quanto pra classificação de raio-X de tórax.

Pontuações de Segmentação

A análise focou em como o M-VAAL se saiu na segmentação de tumores cerebrais em comparação com os outros métodos. M-VAAL forneceu resultados melhores, especialmente quando havia menos amostras rotuladas disponíveis. Isso mostrou que o M-VAAL pode aproveitar os dados não rotulados de forma eficiente e oferecer quase a mesma performance de quando está completamente treinado.

Classificação Multi-rótulo

Na classificação multi-rótulo para tipos de tumor, o M-VAAL superou os outros métodos em termos de média de precisão, especialmente quando trabalhou com menos amostras de treinamento. Isso significa que nem todas as amostras contribuem igualmente pro processo de aprendizado; escolher as certas é importante.

Classificação Multi-classe

A performance de classificação também foi checada para as imagens de raio-X de tórax. O M-VAAL consistentemente se saiu melhor que os outros métodos. Embora a precisão geral tenha melhorado com o aumento de amostras rotuladas, o M-VAAL mostrou sua capacidade de permanecer efetivo mesmo com menos amostras usadas.

Planos Futuros

O objetivo agora é continuar melhorando o M-VAAL. Avaliações adicionais serão feitas em grandes quantidades de dados médicos não rotulados, focando em diferentes tipos de imagens. O potencial de usar diferentes formas de informação, como dados de profundidade, também pode ser explorado pra melhorar o processo de amostragem em várias tarefas médicas.

Conclusão

O M-VAAL serve como um método útil pra melhorar a seleção de amostras pra rotulação na análise de imagem médica. Ao usar várias formas de dados, ele mostra uma tendência positiva em direção a um aprendizado ativo mais eficiente. A necessidade de dados bem rotulados é crucial, e essa abordagem dá uma nova direção pra pesquisadores e profissionais da área médica, tornando o processo de aprendizado menos intensivo enquanto ainda alcança uma performance forte. Os ajustes contínuos nos hiperparâmetros vão aumentar o sucesso desse método em aplicações do mundo real.

Fonte original

Título: M-VAAL: Multimodal Variational Adversarial Active Learning for Downstream Medical Image Analysis Tasks

Resumo: Acquiring properly annotated data is expensive in the medical field as it requires experts, time-consuming protocols, and rigorous validation. Active learning attempts to minimize the need for large annotated samples by actively sampling the most informative examples for annotation. These examples contribute significantly to improving the performance of supervised machine learning models, and thus, active learning can play an essential role in selecting the most appropriate information in deep learning-based diagnosis, clinical assessments, and treatment planning. Although some existing works have proposed methods for sampling the best examples for annotation in medical image analysis, they are not task-agnostic and do not use multimodal auxiliary information in the sampler, which has the potential to increase robustness. Therefore, in this work, we propose a Multimodal Variational Adversarial Active Learning (M-VAAL) method that uses auxiliary information from additional modalities to enhance the active sampling. We applied our method to two datasets: i) brain tumor segmentation and multi-label classification using the BraTS2018 dataset, and ii) chest X-ray image classification using the COVID-QU-Ex dataset. Our results show a promising direction toward data-efficient learning under limited annotations.

Autores: Bidur Khanal, Binod Bhattarai, Bishesh Khanal, Danail Stoyanov, Cristian A. Linte

Última atualização: 2023-06-21 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://arxiv.org/abs/2306.12376

Fonte PDF: https://arxiv.org/pdf/2306.12376

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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