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# 生物学# 生化学

インテグレーターコンプレックス:遺伝子調節のキープレイヤー

インテグレーター複合体は遺伝子発現の制御に重要な役割を果たしてるよ。

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インテグレーター複雑ドライインテグレーター複雑ドライブ遺伝子発現に関する主要な発見。遺伝子調節におけるインテグレーターの役割
目次

生物の中で、細胞は遺伝子がオンになるかオフになるかをコントロールする必要があるんだ。このコントロールの重要な部分は、RNAポリメラーゼIIっていう酵素が遺伝子のコピーを始めた後、完全に終わる前に一時停止するプロセスに関わってる。この一時停止は、転写プロセスを助けるか妨げるいくつかのタンパク質によって管理されてる。DSIFとNELF1っていう2つの重要なタンパク質はRNAポリメラーゼIIを一時停止させる役割を果たす一方で、P-TEFbっていう別のタンパク質複合体は酵素が進むのを手助けして遺伝子のRNAコピーを作るのを終わらせるんだ。でも、時々RNAポリメラーゼIIが早すぎるタイミングで止まってしまって、完全なRNAコピーが作られないこともあって、これが起こるのはインテグレーターっていう別のタンパク質複合体が関与する時なんだ。インテグレーターは特定の種類のRNAを処理する役割で最初に発見されたけど、今では他の遺伝子の転写にも影響を与えることがわかってる。

インテグレーター複合体の役割

インテグレーター複合体は、いくつかのタンパク質部分から構成されてる、いわゆるサブユニットってやつだ。これはRNAポリメラーゼIIと相互作用して遺伝子のRNAコピーを完成させたり、早すぎる停止を防ぐのに関わってる。インテグレーター複合体は15の主要な成分から成り立っていて、新たに特定されたサブユニットも含まれてる。研究者たちは、INTS11っていうRNAを切るハサミみたいな働きをするタンパク質と、PP2A-Cっていうタンパク質が一緒に協力して遺伝子の発現に影響を与えることを発見したんだ。もしインテグレーターがうまく機能しなかったら、深刻な遺伝的問題を引き起こす可能性があるんだよ。

インテグレーターの構造と機能

インテグレーターがどんな形をしていて、どう機能するのかを理解するのは重要なんだ。最近の研究では、インテグレーターは異なるモジュールから成る複雑な構造を持っていることが示されている。その中の一つのモジュール、アームモジュールって呼ばれるやつは、インテグレーターとRNAポリメラーゼIIをつなぐ重要な役割を果たしてる。研究者たちは先進的な技術を使って、これらの構造を詳細に可視化したんだ。アームモジュールはフックのような形をしていて、モジュールの異なる部分が柔軟な部分でつながってるんだ。この柔軟性は、コンポーネントが動き回れることを意味していて、これは彼らの機能にとって重要なんだ。デザインの鍵となるのは、サブユニットがどのように合体するかってこと。具体的には、INTS15っていうサブユニットがインテグレーターの異なる部分の間に橋渡しをして、全体の構造の安定性を保つのを助けてる。

インテグレーターと転写因子の相互作用

インテグレーターは一人じゃ働かない;いろんな他のタンパク質、特に遺伝子の活動を制御するために特定のDNA領域に結合する転写因子と相互作用してる。注目すべき転写因子の一つがZNF655で、これは亜鉛フィンガータンパク質って呼ばれる人気のある転写因子のファミリーに属してる。これらの転写因子は、特に癌のような文脈で遺伝子を調整するのを助けることが多いんだ。研究者たちは、ZNF655がインテグレーター複合体の特定の部分、特にINTS13サブユニットに結合することを発見した。このZNF655のインテグレーターへの結合は、全体の複合体を安定させるために重要なんだ。ZNF655が存在すると、インテグレーターはその仕事をうまくこなすようで、細胞の成長やさまざまな信号に対する反応に関わるプロセスにリンクしてる可能性があるんだよ。

タンパク質構造の調査

これらのタンパク質がどのように相互作用するかを詳しく知るために、研究者たちは低温電子顕微鏡法っていう方法を使って、非常に細かいスケールで構造を可視化したんだ。これにより、アームモジュールがRNAポリメラーゼIIと関連しているとき、インテグレーター複合体にどのようにフィットするかの正確な絵を作ることができたんだ。これらの可視化では、インテグレーター複合体がRNAポリメラーゼIIに複数の場所で強い結びつきを形成していることが明らかになった。このつながりは、遺伝子発現を調整するための機能にとって重要なんだ。研究ではまた、インテグレーターのRNAポリメラーゼIIに対する位置が、DNA配列との複雑な相互作用を可能にするかもしれないことも明らかになった。こうした相互作用は、転写プロセスがどれだけスムーズに進むかに影響を与えるかもしれないんだ。

ZNF655と他の転写因子の重要性

ZNF655とインテグレーター複合体の相互作用は、インテグレーターが遺伝子の転写に影響を与える潜在的な調節メカニズムを示してる。つまり、ZNF655がインテグレーターに結合すると、全体の複合体の安定性が強化され、インテグレーターがRNAポリメラーゼIIとどれくらい長く結合しているかに影響を与える可能性があるんだ。この相互作用は、環境の変化に迅速に反応する必要がある場所では重要かもしれないね。

ZNF655だけじゃなくて、他にもいくつかの転写因子がインテグレーターと相互作用するんだ。それぞれの因子がユニークな調節能力を提供できるかもしれなくて、インテグレーターが細胞内のさまざまな信号に応じて反応できるようにしてる。これにより、インテグレーターは遺伝子発現において単なる受動的な役割を果たすだけじゃなくて、これらの転写因子から提供される文脈に基づいて遺伝子がいつ、どう発現するかを決定するのに積極的に参加する可能性があるんだ。

遺伝子調節への影響

インテグレーターと転写因子の相互作用を理解することは、遺伝子調節の全体像をより包括的に理解するのに役立つんだ。インテグレーターが異なる転写因子と結合する能力は、状況に応じて特定の遺伝子への転写機構をターゲットにするのを助けるかもしれない。この柔軟性は、細胞機能とストレスや成長シグナルへの反応にとって重要なんだ。

インテグレーターの相互作用についてわかっていることを考えると、これらの複合体をターゲットにして疾患を治療するための治療戦略の可能性について疑問が生じるよね。特に遺伝子発現がしばしば誤って調整される癌の場合、インテグレーターと転写因子の相互作用を変更することで、研究者たちは制御された方法で遺伝子発現に影響を与える新しい方法を見つけられるかもしれない。

結論

要するに、インテグレーター複合体は遺伝子発現を調整するのに不可欠で、転写プロセスを管理したり、ZNF655のようなさまざまなタンパク質と一緒に働いてるんだ。これらのタンパク質の複雑な関係と構造は、遺伝子制御の洗練されたシステムを示してる。これらの相互作用と細胞機能への影響を研究し続けることで、遺伝子調節やさまざまな疾患を治療するための新しいアプローチに関する新しい知見を得る道を開くかもしれない。インテグレーターは細胞の複雑な構成要素だけど、遺伝子が正しく発現することを確保するのに重要な役割を果たしていて、これは生物の健康と機能にとって不可欠なんだ。

オリジナルソース

タイトル: Structural basis of the Integrator complex assembly and association with transcription factors

概要: Integrator is a multi-subunit protein complex responsible for premature transcription termination of coding and non-coding RNAs in Metazoans. This is achieved via Integrators two enzymatic activities, RNA endonuclease and protein phosphatase, acting on the promoter-proximally paused RNA Polymerase II (RNAPII). Yet, it remains unclear how Integrator assembly and recruitment are regulated and what are the functions of many of its core subunits. Here we report two cryo-EM reconstructions of large Integrator sub-complexes: INTS10/13/14/15 (Arm module) and INTS5/8/10/15, which allowed integrative modelling of the fully-assembled Integrator bound to the RNAPII paused elongating complex (PEC). INTS13/14 are positioned near the DNA upstream from the transcription pause site, suggesting a potential role in the chromatin context. An in silico protein interaction screen of over 1500 transcription factors (TFs), identified Zinc Finger Protein 655 (ZNF655) as a direct interacting partner of INTS13 that associates with a fully assembled, 17-subunit Integrator complex. We propose a model wherein the Arm module acts as a platform for the recruitment of TFs that could modulate the stability of the Integrators association at specific loci and modulate transcription attenuation of the target genes.

著者: Wojciech P. Galej, M. Razew, A. Fraudeau, M. M. Pfleiderer

最終更新: 2024-01-31 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.30.577955

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.30.577955.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

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