真菌感染を克服する:遺伝的アプローチ
研究者たちが酵母種の抗真菌耐性に影響を与える遺伝的要因を明らかにした。
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真菌感染は世界中で大きな健康問題になってる。毎年約1300万人が影響を受けて、150万人が亡くなってるんだって。これらの感染症は、癌やHIVみたいな免疫システムを弱める健康問題のせいで、もっと危険になることもある。最近では真菌の薬剤耐性が増えてきてるから、感染症を治す新しい方法を見つけることが必要なんだ。主に病気を引き起こす真菌には、カンジダ、アスペルギルス、クリプトコッカスの種がある。サッカロマイセス・セレビシエのような酵母の株も、特に免疫力が弱い人で感染症を引き起こすことがあるよ。
現在の抗真菌治療
今、4種類の主な抗真菌薬がある:アゾール、ポリエン、ピリミジン類似体、エキノカンジン。フルコナゾールやミコナゾールみたいなアゾールは、カンジダやクリプトコッカス感染の治療によく処方される。これらの薬は、真菌細胞膜の重要な部分の生成を妨げることで働くんだ。ピリミジン類似体のフルシトシンは1968年から使われていて、他の抗真菌薬と一緒に使われて耐性を最小限に抑える目的でよく使用されてる。
エキノカンジン類、たとえばカスポファンギンやミカファンギンは新しいクラスの抗真菌薬で、真菌細胞壁の重要な成分を妨害して細胞死を引き起こす。
薬剤耐性の問題
真菌の薬剤耐性は増大する問題なんだ。真菌は遺伝子の変異を通じて耐性を発展させて、薬が効果的に働くのを難しくしてる。例えば、カンジダの一部の株は、標的遺伝子を変えることでフルコナゾールに対して耐性を持つようになり、治療が失敗することがある。薬剤耐性の増加は公衆衛生にとって大きな脅威で、新しい対策が必要だよ。
真菌耐性に関する研究
真菌がどのように治療に対して耐性を持つようになるのかをより良く理解するために、研究者たちはさまざまな株の遺伝的差異を調べてる。これらの差異は、なぜある真菌が治療に生き残り、他がそうでないのかを特定するのに役立つんだ。特に、いくつかの酵母株は自身の遺伝的構成のおかげで、非常に速く耐性を発展させることができる。
最近数年間で、ラボモデルや実際の真菌で抗真菌耐性を研究するためのさまざまな高度な技術が使われてきた。でも、多くの研究はラボ株に依存していて、真菌が自然の中でどのように適応し進化するかを正確に表してない可能性がある。だから、さまざまな真菌の自然の多様性を考慮した抗真菌耐性の遺伝的マーカーを見つけるための新しい方法が必要なんだ。
研究で使われた方法
この研究では、異なる種から作られた酵母ハイブリッドに焦点を当てた。特に、サッカロマイセス・セレビシエとサッカロマイセス・クドリアヴゼヴィの2つの酵母種からの二倍体ハイブリッドを見て、抗真菌薬を使ったときの成長をテストしたんだ。これらのハイブリッドの子孫を調べることで、抗真菌治療に対する感受性や耐性に関連する遺伝的特性を理解しようとした。
この研究は、酵母を育てたり、異なる抗真菌薬で処理したり、成長と適応力を分析したりする一連のステップを含んでた。これによって、酵母が抗真菌治療に耐える能力に関連する遺伝的領域を特定することができたよ。
研究の結果
結果は、ハイブリッド株が抗真菌薬の存在下でどれだけ成長したかに大きな変動があることを示した。この変動は、遺伝がこれらの株が治療にどれだけ耐性があるか、または感受性があるかを決定する重要な役割を果たすことを示してる。合計で、研究者は酵母の抗真菌剤への耐性に関連する100以上の特定の遺伝的領域を特定した。
これらの遺伝的領域の中には、既知の耐性メカニズムに関連するものもあれば、新たに特定されたものもあった。この情報は、科学者が将来の抗真菌治療のための潜在的な遺伝的ターゲットを特定するのに役立つんだ。
多面的遺伝子の重要性
研究では、さまざまな抗真菌治療に対する耐性に影響を与える重要な遺伝子がいくつか見つかったんだ。これらの遺伝子は、酵母が異なる種類のストレスにどう反応するかに役立つかもしれなくて、遺伝的特性の相互関係を強調してる。具体的には、BCK2とDNF1という2つの遺伝子が抗真菌耐性に重大な影響を持つと特定された。さらに検証もされたおかげで、その重要性が確認されたよ。
これらの発見は、こうした多面的遺伝子を理解することが効果的な抗真菌治療の開発に重要だということを示唆してる。薬剤耐性に影響を与える遺伝的要因に注目することで、研究者たちは真菌感染に悩む患者のために、より個別化された治療オプションに向けて努力できるんだ。
未来の方向性
この研究から得られた知識は、抗真菌薬の開発に新しい扉を開くもので、耐性の遺伝的マーカーを特定することで、科学者たちは異なる真菌株の独自の遺伝的構成を考慮したより効果的な治療を作れる可能性がある。これにより、より効果的な治療法が得られて、抗真菌耐性の増大問題に対処する手助けになるはず。
まとめると、この研究は真菌病原体の遺伝学に対する継続的な研究の重要な必要性を強調している。これらの生物が治療にどう適応するかに焦点を当てることで、研究者たちは真菌感染や薬剤耐性がもたらす課題に対処するための新しい戦略を切り開くことができる。真菌疾患に関連する公衆衛生の成果を改善するために、こうした遺伝的特性を探求し続けることが重要なんだ。
タイトル: Impact of inter-species hybridisation on antifungal drug response in the Saccharomyces genus.
概要: Antifungal drug resistance across fungal and yeast pathogens presents one of the major concerns for global public health. Understanding the interactions between genetic background and environment is important for the development of new, effective treatments of infections. Allelic variation within populations of Ascomycota as well as hybridisation impacts the phenotype in response to stressful conditions, including to antifungal drugs. We exploited recent advances in multigenerational breeding of Saccharomyces interspecies hybrids to study the impact of hybridisation on antifungal resistance and identify quantitative trait loci (QTL) responsible for the phenotypes observed. A library of Saccharomyces cerevisiae x S. kudriavzevii hybrid offspring was screened in the presence of sub-lethal concentrations of six antifungal drugs and revealed a broad phenotypic diversity across the progeny. QTL analysis was carried out comparing alleles between the pools of high and low fitness offspring, identifying hybrid-specific genetic regions involved in resistance to fluconazole, micafungin and flucytosine. We found both drug specific and pleiotropic regions, and through gene ontology and SIFT analysis we identify potential causal genes, such as BCK2 and DNF1 that were validated via reciprocal hemizygosity analysis. We highlight 41 regions that contain genes not previously associated with resistance phenotypes in the literature. The results of this screening will help identify new pathways contributing to drug resistance, and lead to greater understanding of how allelic variation, hybridisation and evolution affect antifungal drug resistance in yeast and fungi.
著者: Daniela Delneri, F. Visinoni, W. Royle, R. Scholey, Y. Hu, S. Timouma, L. Zeef, E. J. Louis
最終更新: 2024-01-31 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.29.577396
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.29.577396.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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