FXRとFincoR:肝臓の健康の重要なプレーヤー
研究によると、FXRがFincoRに影響を与えて、肝疾患の治療に影響してるらしい。
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非アルコール性脂肪肝疾患は、世界中で最も一般的な肝臓の問題だよ。これは、肝臓移植が必要になったり、最悪の場合、死に至るような深刻な健康問題につながる可能性がある。最初は肝臓に脂肪がたまるだけの簡単な状態から始まるけど、時間が経つにつれて非アルコール性脂肪肝炎(NASH)というもっと深刻な状態に進展することもある。治療しないままだと、NASHは肝臓に深刻な損傷を引き起こし、肝硬変や肝臓がんにもなるかもしれない。
今のところ、NASHを治療するための承認された薬はないから、新しい治療法を探すことが重要なんだ。たくさんの研究が、ファルネソイドX受容体(FXR)と呼ばれる特定のタンパク質に注目してる。FXRは、肝臓の脂肪や糖代謝に関連する様々なプロセスを調整する重要な役割を持ってる。
FXRって何?
FXRは胆汁酸によって活性化される物質で、これは肝臓で脂肪を消化するのを助けるために作られるんだ。FXRがオンになると、肝臓内の胆汁酸、脂肪、糖のレベルを管理する遺伝子の活動を制御するのを助ける。この制御は、体内のこれらの物質をバランスよく保つために大切。さらに、FXRが活性化されると、肝臓を炎症や傷から守ることもできる。
FXRは主に肝細胞のDNAの特定の部分に結合して、ターゲット遺伝子の生成に影響を与えるんだ。肝臓の健康にとって重要な役割があるから、科学者たちはNASHや原発性胆道炎(PBC)などの肝臓の疾患に対する新しい薬のターゲットとしてFXRをますます注目している。
FXRに作用するいくつかのタイプの薬があり、いくつかは臨床試験中だけど、NASHやPBCの治療に希望が持てる。
生物学における非コーディングRNAの役割
最近の生物学の興味深い発見の一つは、非コーディングRNAの発見だよ。以前は、遺伝物質のかなりの部分が「ジャンクDNA」と思われていたけど、研究者たちは多くのこれらの非コーディング領域が、様々な生物学的プロセスにおいて重要な役割を果たす機能的なRNA分子を生成していることを発見した。
この非コーディングRNAの中には、長い非コーディングRNA(lncRNA)というカテゴリがある。これは200ヌクレオチド以上の長さのRNA分子で、さまざまな生物学的活動に関与している。これらのlncRNAの中には、遺伝子の調節に関連していることを示す特別な特徴を持つゲノムの特定の領域から生成されるものもある。
エンハンサーRNA(ERNA)と呼ばれる特定の種類の非コーディングRNAは、ゲノムのエンハンサー領域から生成される。エンハンサーは遺伝子発現を制御する重要な役割を果たすDNA要素なんだ。多くのeRNAはまだ適切に特定されたり研究されたりしていないけど、それを理解することが、正常な機能や病気の状態で遺伝子がどのように調節されるかを理解する鍵になるかもしれない。
FXRと非コーディングRNAへの影響
研究から、FXRがマイクロRNAと呼ばれる特定の小さな非コーディングRNAの生成に影響を与えることが示されている。ただし、FXRとlncRNAとの関連性についてはあまり調査されていない。FXRが多くの遺伝子を直接制御することを考えると、科学者たちは、FXRが特にエンハンサーから来るlncRNAの調節にも関与しているかを探りたいと考えたんだ。
研究者たちは、FXR活性化薬で処理されたマウスの肝組織を分析するために高度な技術を使った。彼らは、FXRによって調節されるいくつかのeRNAを発見し、その中にはFXR誘導非コーディングRNA(FincoR)という名前の非常に誘導され豊富なeRNAが含まれていた。このRNAは主に肝臓に見られ、特定のFXR活性化剤によって特に増加する。
強力な遺伝子編集技術を使って、研究者たちはFincoRのレベルを減少させたマウスモデルを作成した。FincoRの減少がFXR活性化薬の有益な効果に大きな影響を与えることがわかり、FincoRがこれらの治療による肝臓の良い変化にとって重要であることが示された。
FXR活性化とFincoR発現
GW4064のような薬によってFXRが活性化されると、肝臓でのFincoRの生成を促進する。研究者たちは、FXRによって調節される可能性のあるゲノムの特定の領域を特定することから始めた。彼らはエンハンサー領域に焦点を当て、その後マウスの肝臓でFXRが活性化されると何が起こるかを実験した。
FXRの活性化が約190のeRNA、特に19番染色体に位置する新しい転写産物であるFincoRの生成を増加させることがわかった。GW4064での処理後、FincoRのレベルが大幅に上昇したことが確認された。この増加は一時的で、処理後約1時間でピークに達し、その後徐々に減少した。
さらなる分析では、FincoRが他の組織と比べて肝臓に主に存在することが示された。また、肝細胞の核にも存在することがわかり、遺伝子発現の調節に関与している可能性が示唆された。
合成FXRアゴニストによるFincoRの誘導
研究者たちはFincoRの誘導が特定の薬に特有かどうかを調べた。GW4064、cilofexor、tropifexorなどいくつかの薬をテストし、同じカテゴリのFXR活性化剤に属さない他の薬と比較した。
その結果、FincoRはハンマーヘッド型のFXRアゴニストによってのみ強く誘導され、半合成アゴニストであるOCAや非ハンマーヘッド型の腸特異的アゴニストfexaramineではFincoRレベルの有意な上昇は見られなかった。このことから、FincoRが特定のタイプのFXR薬に対して特有の応答を持つことが示された。
FincoRノックダウンマウスの作成
FincoRの役割をさらに研究するために、科学者たちは肝臓でのFincoRのレベルが減少した特殊なマウスを作成した。FincoRをノックダウンしても、正常な条件下で特定の肝機能に大きな変化はなかった。このことは、FincoRが肝臓の健康に寄与しているものの、その不在が日常的な操作を妨げないことを意味している。
しかし、これらの修正されたマウスをGW4064で処理すると、期待される治療の利益が大幅に減少した。これはFincoRがこの薬の良い効果を仲介する役割を持っていることを示している。
チームは、FincoRのノックダウンによって肝臓で発生した他の変化を理解するために、より包括的な遺伝子発現分析を行った。FincoRによって調整されるいくつかの遺伝子が、重要な代謝プロセスや炎症に関連していることがわかった。
NASHマウスにおけるTropifexor治療の効果
Tropifexorは、現在臨床試験中の有望な薬だ。研究者たちは、Tropifexorが肝臓の健康に与える有益な効果がFincoRがない状態でも発生するかどうかを理解したいと考えた。食事誘発性NASHを模倣するマウスモデルで、通常のマウスとFincoRノックダウンマウスの両方にTropifexorを投与した。
その結果、Tropifexor治療は肝臓の脂肪を大幅に減少させたが、FincoRがない状態でも影響はなかった。ただし、肝臓の炎症や線維症のようなNASHの他の側面を調べたところ、FincoRレベルが低下した場合のTropifexorの利益が大幅に減少することがわかった。
これは、FincoRがTropifexorの全ての有益な効果にとって重要というわけではないが、肝炎症や線維症の軽減において重要な役割を果たしていることを示している。
慢性肝疾患におけるFincoRレベルの理解
さらなる研究で、FincoRのレベルがNASHや胆汁うっ滞性肝障害を含む慢性肝疾患のマウスモデルで上昇していることが明らかになった。FincoRの存在が増加していることは、肝臓の損傷や炎症に反応している可能性がある。
また、研究者たちは、ヒト版のFincoRと考えられるXR_007061585.1のレベルが患者の肝疾患の中でどう変化するかも探った。PBCやNAFLDのケースではこのヒトRNAが上昇しているが、重度のNASH線維症患者では見られなかった。この発見は、肝臓の損傷に対する適応反応の可能性を示唆しているが、このRNAの正確な役割はまだ明らかではない。
結論
この研究は、FXR、FincoR、肝臓の健康の重要なつながりを強調している。FXRはタンパク質コーディング遺伝子を調節するだけでなく、肝機能に大きな影響を与える非コーディングRNAも調整する。特にFincoRは、肝臓疾患の文脈で特定のFXR活性化剤の有益な効果を強化することが示されている。
これらの発見は、肝疾患の治療におけるFXRおよび関連経路を標的とした新しい治療戦略の道を開く。FincoRのようなeRNAの機能やメカニズムの範囲を探るために、さらなる研究が必要だ。これがNASHやPBCのような慢性肝疾患のより効果的な治療法につながるかもしれない。
タイトル: Hammerhead-type FXR agonists induce an eRNA FincoR that ameliorates nonalcoholic steatohepatitis in mice
概要: The nuclear receptor, Farnesoid X Receptor (FXR/NR1H4), is increasingly recognized as a promising drug target for metabolic diseases, including nonalcoholic steatohepatitis (NASH). Protein coding genes regulated by FXR are well known, but whether FXR also acts through regulation of long non-coding RNAs (lncRNAs), which vastly outnumber protein-coding genes, remains unknown. Utilizing RNA-seq and GRO-seq analyses in mouse liver, we found that FXR activation affects the expression of many RNA transcripts from chromatin regions bearing enhancer features. Among these we discovered a previously unannotated liver-enriched enhancer-derived lncRNA (eRNA), termed FincoR. We show that FincoR is specifically induced by the hammerhead-type FXR agonists, including GW4064 and tropifexor. CRISPR/Cas9-mediated liver-specific knockdown of FincoR in dietary NASH mice reduced the beneficial effects of tropifexor, an FXR agonist currently in clinical trials for NASH and primary biliary cholangitis (PBC), indicating that that amelioration of liver fibrosis and inflammation in NASH treatment by tropifexor is mediated in part by FincoR. Overall, our findings highlight that pharmacological activation of FXR by hammerhead-type agonists induces a novel eRNA, FincoR, contributing to the amelioration of NASH in mice. FincoR may represent a new drug target for addressing metabolic disorders, including NASH.
著者: Jongsook Kemper, J. Chen, R. Wang, F. Xiong, H. Sun, W. Li
最終更新: 2024-02-08 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.11.20.567833
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.11.20.567833.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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