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# 生物学# 発生生物学

転移因子:ゼブラフィッシュの発生における重要な役割

研究によってゼブラフィッシュの胚発生におけるトランスポゾンの役割が明らかになった。

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TEsがゼブラフィッシュのTEsがゼブラフィッシュの発生に影響を与えるの成長に重要だってわかったよ。新しい研究で、TEがゼブラフィッシュの胚
目次

転移可能要素(TEs)は、ほぼすべての生物に見られるDNAの断片だよ。ある生物では遺伝子の大部分を占めることもあって、5%から90%にもなるんだ。これらの要素はゲノム内を移動できて、DNAの構造に変化をもたらすことがある。この移動は突然変異を引き起こして、ゲノムを不安定にすることもある。

長い間、科学者たちはTEsは単なる自己中心的な存在で、自分の生存と複製にしか興味がないと思っていた。TEsはホスト生物に何の利益も与えずに自分自身をただコピーしているだけだと考えられていたんだ。でも最近の発見では、TEsがゲノム内に定着すると、新しい遺伝子や調節配列の形成に実際に貢献できることがわかった。これがホスト生物が正常に機能するために重要なんだ。

科学者たちは進化の過程でTEsがたくさんの方法で使われているのを見てきたけど、このプロセスがどのように始まるのかはまだまだ学ぶことがあるみたい。ほとんどの研究は動かなくなった古いTEsに焦点を当ててきたけど、最近は若くてアクティブなTEsが細胞で重要な役割を果たすことがわかってきたんだ。これがTEsが単に有害だという考え方に挑戦して、ホスト生物との協力的な関係を持つ可能性を示唆している。

ゼブラフィッシュの発生におけるBik-1とBik-2の理解

面白いTEの一つがBik-1っていうものなんだ。このTEはゼブラフィッシュで活発だと思われていて、早期発生の研究に使われるモデル生物なんだ。科学者たちは、Bik-1を含む特定のTEsがゼブラフィッシュの胚の発生中に発現することを発見した。これが、Bik-1が単に自分の利益のためだけじゃなくて、正常な発生に重要な役割を果たすかもしれないことを示唆している。

Bik-1ファミリーのTEsには、胚の発生中に中胚葉と神経堤(NC)の系統で見られる配列が含まれている。科学者たちはBik-1や関連する配列を特定の細胞タイプのマーカーとして使ってきたけど、実際にそれらがコードするタンパク質の役割は十分に研究されていないんだ。

Bik-1はゼブラフィッシュのゲノム内にあるいくつかの似たような配列のファミリーの1つだ。Bik-1にはGagというタンパク質の形成を助けると考えられている部分が含まれている。このタンパク質は、ホストDNAに自分の遺伝物質を挿入するウイルス、すなわちレトロウイルスの構造に重要なんだ。

ゼブラフィッシュ胚におけるBik-1の役割に関する研究

Bik-1をよりよく理解するために、研究者たちはゼブラフィッシュの中でのBik-1の歴史を調べた。彼らはゼブラフィッシュのゲノム内に196のBik-1の挿入を見つけた。一部は全パーツが intactな完全なコピーで、他は壊れたか不完全だった。研究者たちはこれらの挿入が時間とともにどのように変化してきたか、まだアクティブかどうかを調べたんだ。

異なるゼブラフィッシュの系統を比較したところ、Bik-1の挿入は変動していて、それが集団内でまだ変わっていることを示していた。新しい挿入が現れるのは、Bik-1がゼブラフィッシュの遺伝物質内を移動できることを示すんだ。

Bik-1が発生に重要かどうかを確認するために、研究者たちは特別な技術を使ってゼブラフィッシュの胚内のBik-1 mRNAの量を減らした。彼らは、この減少が胚に大きな発生の問題を引き起こすことを発見した。ほとんどの胚には、短い体や異常な細胞の組織化などの発生の問題の明らかな兆候が見られた。

フォローアップの研究で、研究者たちは胚で見られた問題がBik-1の低レベルに起因することを確認した。彼らはBik-1の発現を増やすための異なる方法を使い、それがいくつかの発生の問題を救うのを助けた。これは、Bik-1によって生成されるGagタンパク質が正常な発生に重要であることを示している。

Bik-1 Gagタンパク質とその効果

研究者たちは、Bik-1 Gagタンパク質が他の細胞接着に関与するタンパク質と同様に、細胞の外膜に局在する傾向があることを発見した。これが、Bik-1が細胞同士のくっつき方や発生中の移動に影響を与えるかもしれないと考えさせたんだ。

さらに実験で、科学者たちはBik-1 Gagタンパク質を鶏の胚に導入した。鶏はゼブラフィッシュと同じTEsを持っていないから、Bik-1 Gagタンパク質が発生に与える影響を見るのにいいモデルだった。彼らは、Bik-1 Gagを過剰発現させると、脳や脊髄の形成に重要な神経管の正常な発生を妨げることを発見した。

Bik-1 Gagの導入は胚内での細胞の移動に影響を与え、細胞の移動に問題を引き起こした。ゼブラフィッシュで見られた問題と似ていて、これがBik-1 Gagの機能が種を超えて正常な発生に不可欠であることを示唆しているんだ。

Bik-2とその役割の探求

Bik-1を研究した後、研究者たちはゼブラフィッシュで神経堤に影響を与えるBik-2という関連の近いTEに注目した。Bik-2のGagタンパク質も細胞の発生にとって重要で、TEsがホスト生物に協力的な役割を果たすことを支持しているんだ。

研究者たちはBik-2 Gagタンパク質が神経堤細胞の移動に必要かどうかを確かめるために特定の実験をデザインした。Bik-2の発現を妨げると、異常な細胞の移動パターンが引き起こされ、Bik-1とBik-2の両方がゼブラフィッシュの初期発生に不可欠であることをさらに示している。

発見の重要性

Bik-1とBik-2に関する研究は、いくつかの転移可能要素が単なる受動的なDNAの断片ではなく、さまざまな発生プロセスに積極的に参加できることを示している。この発見はTEsの性質についての長年の信念に挑戦している。単なる自己中心的な遺伝子要素として見られるのではなく、Bik-1やBik-2のようなアクティブなTEsが多細胞生物の発生において重要で有益な役割を果たせるってことだね。

TEsがそんなに重要な役割を果たすことができるという考え方は、彼らの進化的な影響についての疑問を引き起こす。TEsとそのホストとの関係は、これまで考えられていたよりも協力的かもしれなくて、どのように生物が進化し適応するかに関する発見につながるかもしれない。

要するに、Bik-1やBik-2のようなTEsを研究することで、これらの要素がホスト生物の発生を形作るだけでなく、重要な生物学的プロセスの一部になる複雑な相互作用が明らかになるんだ。この分野での研究を続ければ、遺伝学や進化、生物発生に関する新しい理解につながるかもしれないね。

オリジナルソース

タイトル: Gag proteins encoded by endogenous retroviruses are required for zebrafish development

概要: Transposable elements (TEs) make up the bulk of eukaryotic genomes and examples abound of TE-derived sequences repurposed for organismal function. The process by which TEs become coopted remains obscure because most cases involve ancient, transpositionally inactive elements. Reports of active TEs serving beneficial functions are scarce and often contentious due to difficulties in manipulating repetitive sequences. Here we show that recently active TEs in zebrafish encode products critical for embryonic development. Knockdown and rescue experiments demonstrate that the endogenous retrovirus family BHIKHARI-1 (Bik-1) encodes a Gag protein essential for mesoderm development. Mechanistically, Bik-1 Gag associates with the cell membrane and its ectopic expression in chicken embryos alters cell migration. Similarly, depletion of BHIKHARI-2 Gag, a relative of Bik-1, causes defects in neural crest development in zebrafish. We propose an "addiction" model to explain how active TEs can be integrated into conserved developmental processes.

著者: Cédric Feschotte, N.-C. Chang, J. N. Wells, A. Y. Wang, P. Schofield, Y.-C. Huang, V. H. Truong, M. Simoes-Costa

最終更新: 2024-03-25 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.25.586437

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.25.586437.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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