新しい方法でMRIとDTIを使ってパーキンソン病を分類する
ある研究が、画像データを使ってパーキンソン病を3つのカテゴリーに分類する方法を提案してるよ。
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目次
パーキンソン病(PD)は、動きに影響を与える一般的な神経障害だよ。震えや硬直、バランスの取りづらさみたいな症状を引き起こすことがあるんだ。PDの早期診断は超重要で、今のところ治療法はないからね。世界保健機関(WHO)によると、60歳以上の人の約1%がこの病気にかかってるみたい。
パーキンソン病の診断は、症状が様々で明確なバイオマーカーがないから難しいんだ。面白いことに、実は早期のPDを持ってる患者の約10%は、スキャンが正常なんだ。これにより、ドーパミン欠乏の証拠がないスキャン(SWEDD)っていう特定のグループができちゃって、診断がさらに難しくなってる。だから、医者はPD、SWEDD、健康な人(HC)の3つのグループを区別しなきゃいけないんだ。
診断のための画像技術
医者はMRI、SPECT、PETみたいな画像技術を使ってパーキンソン病を診断することが多いよ。ただ、PETとSPECTは侵襲的で高額だからあまり好まれないんだ。最近、拡散テンソル画像(DTI)っていう方法が注目されてる。DTIは脳内の水の動きを測定して、PDに影響を受ける白質の構造を分析するのに役立つんだ。
いくつかの研究では、神経画像データを使ってPDを分類するために機械学習やディープラーニングモデルが使われてるよ。例えば、脳の構造の変化が年齢とどう関係するかとか、分類精度を向上させる方法を探ってる研究者もいる。異なる画像技術からの特徴を組み合わせることで、アルツハイマー病の他の条件では良い結果が出てるんだ。
より良い分類の必要性
いくつかの試みがあったけど、マルチモーダルデータを使ってパーキンソン病の3つのカテゴリーを直接分類する効果的な方法がまだ不足してるんだ。従来の方法は二項分類に焦点を当てがちで、PD、SWEDD、HCの3クラス問題に取り組むのが難しくなってる。
私たちのアプローチ:MRIとDTIの組み合わせ
この研究では、MRIとDTIデータを使ってパーキンソン病を3つのカテゴリーに直接分類することに焦点を当ててる。白質と灰白質のMRIデータ、DTIからの分数異方性と平均拡散率を分析するために4つの畳み込みニューラルネットワーク(CNN)を使ってるんだ。それぞれのCNNが、データが3つのカテゴリーのどれかに属する可能性を示す確率を提供するんだ。
次に、最適加重平均融合(OWAF)っていう技術を使って、これらのCNNからの結果を組み合わせるんだ。これによって全体の分類がより正確になるよ。私たちのアプローチは、PPMIという公開データベースからのデータを使って95.53%の素晴らしい精度を達成したんだ。
データの準備と方法
正しいデータを得ることは、私たちのモデルにとって非常に重要だよ。MRIデータを準備するために、ボクセルベースの形態計測(VBM)法を使ったんだ。このプロセスで、脳を灰白質、白質、脳脊髄液に分割するんだ。それから、これらの異なるタイプの組織の振る舞いを分析するよ。
DTIでは、脳内の水の動きを理解するために分数異方性と平均拡散率データを取り出すんだ。処理の結果、灰白質、白質、分数異方性、平均拡散率の4種類のデータが得られるよ。
データのバランス調整
各クラスのサンプル数が不均衡だってわかった。これがモデルの効果的なトレーニングに問題を引き起こす可能性があるんだ。それを解決するために、ADASYNっていう技術を使ったよ。この方法で、少数グループのサンプル数を合成サンプルを作ることで増やして、全クラスに同じ数のサンプルが確保されるようにしたんだ。
CNNモデルの構築
4つのCNNモデルを作ったんだけど、それぞれが1種類のデータに対応してるよ。各モデルにはデータ処理のための10層があって、層の数を調整することで良い精度と計算コストのバランスを取ろうとしたんだ。CNNはデータをスライスごとに処理してて、それぞれのスライスが脳の一部を表してるんだ。
トレーニングの後、各モデルはデータをHC、PD、SWEDDのいずれかに分類できるようになるよ。トレーニング中には、モデルが効果的に学べるように特定の損失関数を使ってるんだ。
結果の統合:決定レベルの融合
4つのCNNがトレーニングされたら、最終分類結果を得るために出力を組み合わせる必要があるんだ。各モデルが最終的な決定にどのくらい影響を与えるかを決めるための重みを使うよ。重みは2段階のプロセスで計算され、最適化されるから、融合方法が効果的になるんだ。
結果を組み合わせると、各クラスの全体的な確率が得られて、最も確率が高いクラスを選ぶってわけ。
実験結果
私たちの実験では、合計281人の被験者を使ったよ。健康な人、パーキンソン病と診断された人、SWEDDを示す患者が含まれてる。それぞれのクラスに同じ数のサンプルがあって、バランスが取れてるよ。
モデルをトレーニングするためにデータの80%を使い、残りの20%をテスト用に使ったんだ。テスト中は、精度、適合率、再現率、F1スコアなどのメトリックを使ってモデルの効果を評価したよ。
異なるデータタイプの影響
MRIとDTIデータを使った場合のモデルのパフォーマンスを確認するためにアブレーションスタディを実施したんだ。両方のデータタイプを使った方が、各データタイプを単独で使った時よりも良い分類結果が出たのがわかったよ。3つのカテゴリーの分類の難しさが明らかで、データを組み合わせることでこれらの課題を克服できたんだ。
他の方法との比較
私たちの方法を、単一または複数の画像モダリティを使用した他の10の最新のアプローチと比較したよ。私たちの結果は、一般的に他の方法を上回っていて、特に3クラス分類のコンテキストではその傾向が強かった。ほとんどのアプローチはPDと健康な人を区別することにしか焦点を当ててなかったけど、私たちの方法は3つのグループすべてを効果的に分類できたんだ。
結論
要するに、私たちはMRIとDTIデータを使ってパーキンソン病を3つのグループに分類する新しい方法を紹介したよ。私たちのアプローチでは4つのCNNモデルと決定レベルの融合技術を使って高い精度を達成したんだ。結果は、様々な画像モダリティを組み合わせることで分類結果が大幅に改善できることを示してる。
将来的には、他の画像技術からのデータを使用して臨床の場で私たちのモデルを適用したいと思ってるし、パーキンソン病に関連する他の状態を分類するためにモデルを適応させることを目指してるんだ。
タイトル: Multi-modal multi-class Parkinson disease classification using CNN and decision level fusion
概要: Parkinson disease is the second most common neurodegenerative disorder, as reported by the World Health Organization. In this paper, we propose a direct three-Class PD classification using two different modalities, namely, MRI and DTI. The three classes used for classification are PD, Scans Without Evidence of Dopamine Deficit and Healthy Control. We use white matter and gray matter from the MRI and fractional anisotropy and mean diffusivity from the DTI to achieve our goal. We train four separate CNNs on the above four types of data. At the decision level, the outputs of the four CNN models are fused with an optimal weighted average fusion technique. We achieve an accuracy of 95.53 percentage for the direct three class classification of PD, HC and SWEDD on the publicly available PPMI database. Extensive comparisons including a series of ablation studies clearly demonstrate the effectiveness of our proposed solution.
著者: Sushanta Kumar Sahu, Ananda S. Chowdhury
最終更新: 2023-07-06 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://arxiv.org/abs/2307.02978
ソースPDF: https://arxiv.org/pdf/2307.02978
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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