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# 健康科学# 感染症(HIV/AIDSを除く)

五カ国におけるアルボウイルス感染の包括的研究

メタコホートはラテンアメリカのアルボウイルス感染についての理解を深めるためにデータを集めてるよ。

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ラテンアメリカ全体のアルボラテンアメリカ全体のアルボウイルス研究るために集めたデータ。アルボウイルス感染症と戦って医療を改善す
目次

メタコホートは、ブラジル、コロンビア、エルサルバドル、ニカラグア、ベネズエラの5カ国にわたる9つの研究から集められたデータのコレクションだよ。これらの研究は、昆虫によって伝染するウイルスであるアルボウイルスによる感染に焦点を当てていて、母親とその赤ちゃんを対象にした研究もあれば、子供や妊婦に注目した研究もあるんだ。

参加者のリクルート

ほとんどの参加者は、メールや電話でリクルートされるんじゃなくて、健康ユニットから研究に紹介されてる。参加することで、より良い医療や追加の検査を受けられるから、特にリソースが限られた地域で価値があるんだ。

免疫反応とウイルス感染

免疫システムが異なるデングウイルスのタイプやジカウイルスにどんな反応を示すかの研究が注目を集めてる。これらの免疫反応を理解することで、なぜ一部の人が重度のデングやジカウイルスのアウトブレイクに関連する合併症を経験するのかがわかるかもしれないんだ。こうした相互作用を研究するには、さまざまな病原体にさらされた大勢の参加者が必要というわけ。

ReCoDIDコンソーシアム

ReCoDIDコンソーシアムは、欧州委員会とカナダの健康研究所の支援を受けてる。目的は感染症を研究してる研究者を手助けするために、整理された参加者データとその分析ツールを提供することなんだ。このイニシアティブは、過去の感染が新しいアウトブレイクに対する免疫反応にどう影響するかを理解するのを助けることで、個別化医療のアプローチにも役立つんだ。

メタコホートデータ

このコホートは、5カ国から集められたアルボウイルスのデータをカバーしてる。集められるサンプルは研究によって異なり、デングウイルスやジカウイルスの検査、健康の結果や臨床介入に関する情報も含まれてる。ReCoDIDコンソーシアムは、参加者レベルで人間の遺伝子や免疫反応などのデータをつなげるプラットフォームを構築中だよ。

メタコホートに関与した研究

急性発熱性疾患(AFI)メタコホート

AFIメタコホートは、アルボウイルス感染に関連する研究結果を共有することに同意した9つの研究からのデータで構成されてる。ほとんどの研究は血液サンプルを集めて、いくつかは尿や唾液のサンプルも集めてる。参加者の選定基準は研究ごとに異なっていて、あるところは発熱のある患者のみを対象にしたり、他のところは発疹や赤い目のような追加の症状を探したりしてる。

診断コホート

このコホートは、デング診断のために迅速検査がどれだけ役立つかを評価しようとしてた。参加者は2歳以上で、陽性の迅速検査後に観察を受け、さまざまな間隔でフォローアップが行われたよ。

予後コホート

このコホートの目的は、デング感染の重症度を評価するための予測検査を検証することだった。患者はデングと診断された後に合併症をモニターされたんだ。

ピエデクエスタの家庭ベースダイナミックコホート(PHBDC)

この研究は、異なる年齢層のデングの有病率を特定することに焦点を当てていて、どの子供にワクチン接種を優先すべきかを判断するのを目指してる。地元の健康な人々を含め、発熱性疾患の症例を追跡してるんだ。

AEDESコホート

これらのコホートは、デングの診断と重症度の予測方法を開発し、検証することを目指した3つの独立した研究のデータを組み合わせてる。研究はさまざまなアウトブレイクの際に行われ、デングの疑いのある患者が含まれてたよ。

CYD15研究

この試験は、新しいデングウイルスワクチンの効果を評価するために健康な子供と青年を対象にしたんだ。参加者はワクチンかプラセボを受け取るようにランダムに割り当てられ、発熱やデングの感染をモニターされたよ。

小児デングコホート研究(PDCS)

この地域ベースの研究は、ニカラグアで始まりデングの感染を理解することを目指してる。その後、ジカウイルスやチクングニアウイルスなど他のウイルスも含むように拡大され、参加者は症状の観察とフォローアップを受けてる。

小児デング入院研究(PDHS)

このコホートは、入院した子供たちの重度のデングに対するリスク因子を理解することに焦点を当ててる。参加者は定期的にモニターされ、検査を受けたんだ。

デングリスク評価、管理、監視に関する国際研究コンソーシアム(IDAMS)

IDAMS研究は、デングの進行を予測するのに役立つ指標を探してた。ラテンアメリカの参加者のデータもメタコホートに含まれてるよ。

症状のある妊婦のコホート

この研究では、発熱や発疹の症状がある妊婦を調べて、未出生の子供に対する潜在的な影響、特にジカウイルスへの曝露についてモニターしたんだ。

ハーモナイゼーションの取り組み

異なる研究からのデータを統一した形式にまとめるプロセスをハーモナイゼーションって呼ぶんだ。これは研究間のデータ収集の違いを考慮した徹底的な分析を行うために重要だよ。ReCoDIDコンソーシアムは、一貫したデータ定義を確保するために、このハーモナイゼーションのための構造的な方法を構築してるんだ。

主な発見

これらの研究からのいくつかの重要な発見には、以下が含まれるよ:

  1. 低いビタミンDレベルは、デングの悪化に関連しているかもしれない。
  2. 高い既存の抗体レベルは、重度のデングからの保護に役立つかもしれない。
  3. 患者のデングの重症度を予測するための新しいスケールが作られた。

メタコホートの強みと弱み

ReCoDIDコンソーシアムの強みの一つは、参加者データのハーモナイゼーションに焦点を当てているところで、これにより研究間の比較がしやすくなるんだ。確立されたデータスタンダードを使用することで、異なる研究がより簡単に協力できる。しかし、ハーモナイゼーションプロセスは資源を多く消費することもあるんだ。

メタコホートは、参加者の多様な背景からも恩恵を受けているんだ。これにより、さまざまな集団におけるウイルスに対する免疫反応の異なるパターンを観察できるんだ。目標は、こうした集団のトレンドをモニターして、関連ウイルス間の相互作用に関するさらなる情報を集めることだよ。

将来の方向性

ReCoDIDコンソーシアムは、今後の研究でデータを収集するための標準フォームを開発する予定なんだ。これによりハーモナイゼーションプロセスが簡素化され、研究者のコストが削減されることを期待してる。将来的には、これらのウイルスに関する新しい情報が出てくる中で、アルボウイルスの病気をより良く理解し、追跡するのをサポートすることを目指してるんだ。

データアクセス

このデータに興味がある研究者は、最終的にさまざまなプラットフォームを通じて包括的なデータセットにアクセスできるようになるよ。これらのデータセットには、研究にわたって収集された変数の説明が含まれる。ただし、参加者データを保護し、情報共有における倫理的ガイドラインが遵守されるための厳格な措置が講じられてる。

倫理的考慮事項

ReCoDIDコンソーシアムは、データの倫理的共有にコミットしていて、特に低・中所得国の研究者が直面する独自の課題に対処してる。彼らが使用するフレームワークは、参加者の権利が保護され、研究の利益が公平に共有されるように国際的なガイドラインに従ってるんだ。

結論

このメタコホートの設立は、アルボウイルスの研究において重要な進展を示していて、複数の研究から多様なデータを結集してるんだ。ReCoDIDコンソーシアムを通じて開発された発見や方法論は、これらの疾病の理解を深め、将来のアウトブレイクに対する公衆衛生の対応を向上させることを目指してるよ。

オリジナルソース

タイトル: Cohort Profile: ReCoDID Consortiums Harmonized Acute Febrile Illness Arbovirus Meta-Cohort

概要: Infectious disease (ID) cohorts are key to advancing public health surveillance, public policies and pandemic responses. Unfortunately, ID cohorts often lack funding to store and share clinical-epidemiological data (CE) and high-dimensional laboratory (HDL) data long-term, which is evident when the link between these data elements is not kept up to date. This becomes particularly apparent when smaller cohorts fail to successfully address the initial scientific objectives due to limited case numbers, which also limits the potential of pooling for these studies to monitor long-term cross-disease interactions within and across populations. To facilitate advancements in cross-population inference and reuse of cohort data, the European Commission (EC) and the Canadian Institutes of Health Research, Institute of Genetics (CIHR-IG) funded the ReCoDID (Reconciliation of Cohort Data for Infectious Diseases) Consortium to store and share harmonized and standardized CE and HDL data on a federated platform and also provide innovative statistical tools to conduct meta-analyses of the individual patient data. Here we describe the harmonization of CE data from nine arbovirus (arthropod-borne viruses) cohorts in Latin America, which serve as a starting point for the ReCoDID meta-cohort. CE data was retrospectively harmonized using Maelstroms methodology and standardized to Clinical Data Interchange Standards Consortium (CDISC). This meta-cohort will facilitate various joint research projects, e.g., on immunological interactions between sequential flavivirus infections and for the evaluation of potential biomarkers for severe arboviral disease.

著者: Heather Hufstedler, G. Gomez, C. Montenegro, Y. Roell, A. Lozano, A. Tami, T. Magalhaes, E. T. A. Marques, A. Balmaseda, G. Calvet, E. Harris, P. Brasil, V. Herrera, L. Villar, L. Maxwell, T. Jaenisch

最終更新: 2023-10-12 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.10.10.23296846

ソースPDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.10.10.23296846.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた medrxiv に感謝します。

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