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# 生物学# ゲノミクス

成長率が樹木の遺伝子に与える影響

木の成長率は遺伝的変化や適応に影響を与える。

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樹木の遺伝学と成長率樹木の遺伝学と成長率樹木の成長と遺伝的変化の関係を調べてる。
目次

木は地球上で最も古い生物の一部だよ。生態系において重要な役割を果たしていて、経済的にも価値があるんだ。長生きで固定された場所にいるから、多くの樹種は非常に適応力がある。環境のストレスによって姿や機能を変えることができるんだ。最近の研究では、こうした変化が遺伝子の動きによって影響を受ける可能性があるって示唆されているよ。

木における遺伝子の役割

ノルウェースプルースのような木では、若い木がストレスに対する「記憶」を持つことがあるんだ。これは特定のホルモンにさらされることで起こる。この記憶が、後の虫の攻撃から木を守る手助けをするんだ。ただ、この記憶は次の世代には通常引き継がれないけど、木がゆっくり成長するから、これらの変化の影響は長く続くんだ。

エピジェネティクスは、DNAの基本的な配列に変化を伴わない遺伝子発現の変化を指すんだ。つまり、木は実際の遺伝コードを変えずに、遺伝子の働きに影響を与える変化を経験できるってこと。時には、これらの変化が永続的で、木が成長する過程でランダムに起こることもあるんだ。永続的な変化の一例は、DNA上の特定の化学マークであるシトシンメチル化の獲得や喪失だよ。

木におけるメチル化の仕組み

シトシンメチル化は、木が遺伝子を調節するのに重要なんだ。このメチル化に変化があったとき、それを「エピ突然変異」と呼ぶんだ。研究によると、これらのランダムな変化は、木が成長するにつれて細胞分裂を通じて引き継がれることがあるんだ。エピ突然変異が木の頂端成長点(SAM)で起こると、新しい枝に引き継がれる可能性があるよ。

木が成長すると、SAMは最終的に枝になる新しい細胞を生成するんだ。新しい枝が形成されるたびに、少数の前駆細胞から生まれる。だから、枝が形成されるにつれて、特定の遺伝的変化がより一般的になる可能性があるんだ。

いくつかの研究の推定によると、これらのエピ突然変異は通常の遺伝的突然変異よりもかなり頻繁に起こる可能性があるんだ。例えば、ある樹種では、固定されたエピ突然変異が遺伝的突然変異よりもはるかに高い頻度で起こるんだ。

エピ突然変異に影響を与える要因

科学者たちは、これらのエピ突然変異の原因と、なぜ特定の速度で発生するのかを特定しようとしているんだ。特定の酵素、メチルトランスフェラーゼの活動がDNAメチル化の維持に関与しているよ。もしこれらの酵素が正しく機能しないと、DNAにメチル化が適用される方法が変わる可能性があるんだ。

エピ突然変異が起こる理由についてはさまざまな理論があるんだ。一つの理論では、木が速く成長するにつれて、エピ突然変異も増えるって言われてるんだ。これを「細胞分裂仮説」と呼ぶんだ。一方で、別の理論では、エピ突然変異の速度は成長の速さよりも木の年齢に依存するかもしれないって提案されてる。

成長仮説の検証

これらの理論を調べるために、ヨーロッパブナに関する長期的な研究が行われたんだ。この研究では、木を間伐して異なる成長率を持つ地域が対象になったよ。成長が遅い木と速い木を比較することで、研究者たちはエピ突然変異率に関するデータを集めることができたんだ。

何年も木を観察した結果、成長が速い木はCGエピ突然変異の率が高いことが分かったよ。つまり、木が速く成長するほど、遺伝的変化をより早く蓄積するようだね。

成長と細胞分裂の観察

間伐が成長特性にどのように影響するかを理解するために、二つの特定の木が詳細に研究されたんだ。どちらの木も高さは似ていたけど、一つの木は幹がかなり太かったんだ。これは、成長が速い木が水を運ぶ役割を持つ木の部分である木部でより多くの細胞を生成していることを示しているよ。

研究者たちは毎年の成長リングで生成された細胞の数を調べたんだ。彼らは成長が速い木が遅い木よりも多くの細胞を持っていることを発見したよ。これは、速い成長が細胞分裂の増加に関連していることを示唆しているんだ。

DNA分析の重要性

遺伝的変化をよりよく理解するために、科学者たちは高度なDNAシーケンシング技術を使って両方の木の葉サンプルを分析したんだ。彼らは特定の酵素によって通常メンテナンスされるCGサイトに特に焦点を当てて、メチル化パターンの違いを特定しようとしたんだ。

解析の結果、成長の速い木はCGエピ突然変異の率が高いことが分かったよ。これは、成長が加速すると遺伝的変化が起こりやすくなるという考えを強化しているんだ。

ゲノムボディメチル化の理解

研究者たちは特に、通常安定していて他のメチル化経路の影響をあまり受けない遺伝子体メチル化(gbM)遺伝子に興味を持っているんだ。これらの遺伝子に特に注目することで、成長がエピ突然変異率を高める証拠を確認しようとしているんだ。

これらのgbM遺伝子に焦点を当てたとき、二つの木の間にさらに強い違いが見られたよ。結果は、成長が速い木がかなり高いCGエピ突然変異率を持っていることを示していたんだ。これは成長率と遺伝的変化との明らかな関係を示唆しているよ。

エピジェネティック変化の全体像

木の成長がエピジェネティック変化にどのように関連しているかを理解することは、植物生物学にとって重要な意味を持つんだ。これらの変化は、時間とともに木の個体群内に変異をもたらすことがあるからね。この研究は、成長が速い木が将来の世代により多くのエピジェネティックな変異を引き継ぐ可能性があることを示しているよ。

成長率や環境要因がエピジェネティック多様性にどのように影響するかを調査することは重要なんだ。この情報は、木がどのように適応し、変化する条件の中で生き残るかを学ぶ上で、保全活動や森林管理戦略にも役立つかもしれないよ。

まとめ

要するに、ヨーロッパブナの研究は、成長率が木の遺伝的変化にどのように影響するかについての洞察を提供してくれるんだ。これらの変化に寄与する要因を理解することで、科学者たちは木が環境とどのように相互作用するかについて、より明確なイメージを得ることができるんだ。この洞察は、木の生物学に光を当てるだけでなく、森林管理や保全活動における新たな研究の道を開くんだ。

長生きする生物を研究し続けることで、成長、遺伝子、そして森林を形作る環境要因の間の複雑な関係をもっと明らかにしていくよ。

オリジナルソース

タイトル: Accelerated growth increases the somatic epimutation rate in trees

概要: Trees are critical components of ecosystems and of major economic importance. Due to their extraordinary longevity and well-defined modular architecture they have also emerged as model systems to study the long-term accumulation of somatic mutations in plants. Coupled with retrospective life-history and environmental data, trees can offer unique insights into mutational processes that would be difficult to obtain with prospective studies. In addition to genetic mutations, somatic epimutations in the form of stochastic gains and losses of DNA cytosine methylation have been shown to accumulate rapidly during ontogeny. One hypothesis is that somatic epimutations originate from DNA methylation maintenance errors during mitotic cell divisions, which would predict that their rate of accumulation scales with growth rate, rather than with age. Here we test this hypothesis in European beech. We analyzed one of the oldest continuously measured experimental plots in the world. The plot contains an even-aged beech stand that was established in 1822 and monitored for growth at regular intervals until the present. Starting [~]150 years ago, alternative thinning strategies were applied to subplots of this experiment, resulting in differential stem growth rates among trees. We show that accelerated growth significantly increased the per-year somatic epimutation rate at CG dinucleotides, and that this effect is accompanied by differences in cell division rates. Hence, faster growth elevates the chances for methylation maintenance errors during DNA replication per unit time. As somatic CG epimutations can be stably inherited to subsequent generations in plants, our insights have direct ecological and evolutionary implications.

著者: Frank Johannes, M. Zhou, G. Schmied, M. Bradatsch, G. A. Resente, R. R. Hazarika, I. Kakoulidou, M. Costa, M. Serra, E. Uhl, R. J. Schmitz, T. Hilmers, A. T. Caicoya, A. Crivellaro, H. Pretzsch

最終更新: 2024-05-16 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.07.592680

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.07.592680.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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