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# 生物学# ゲノミクス

人間の脳の発達で新しいRNAタイプが発見された

研究によると、脳の健康や障害に関連する多様なRNAタイプがあるんだって。

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脳研究におけるRNAの多様脳研究におけるRNAの多様についての洞察を明らかにした。RNAの種類に関する新しい発見が脳の健康
目次

代替スプライシングは、1つの遺伝子が複数のタイプのRNAを生み出すプロセスだよ。これは、異なる種類のRNAが異なるタンパク質の生成につながるから重要なんだ。このプロセスは特に脳の発達において重要で、さまざまな脳の障害とも関連しているんだ。最近の技術の進歩のおかげで、これらの異なるタイプのRNAを見るのが簡単になって、病気に関与する可能性のある新しい遺伝的特徴を特定するのに役立っているんだ。

研究の概要

この研究では、研究者たちがオックスフォードナノポアテクノロジーズ(ONT)シーケンシングという新しい技術を使って人間の皮質からRNAを分析したんだ。47人のドナーからサンプルを集めて、妊娠中から高齢者まで広い年齢層をカバーしたんだ。このアプローチで大量のデータが集まり、数百万の高品質なRNAリードが得られたんだ。

研究者たちは、既知の遺伝子から生成されたRNAの数と種類に注目したんだ。驚くべきことに、多くの遺伝子が1つ以上のRNAタイプを生成していることが明らかになったんだ。一部の遺伝子では、ユニークなRNAの数が非常に多く、これらの遺伝子がどれだけ多様に表現されているかを示しているんだ。

RNAタイプの多様性

特定されたRNAタイプの中には、新しいものがたくさんあって、既存の遺伝子データベースには見つからなかったんだ。これらの新しい転写産物は、一般的には既知のものより少ないけど、それでも遺伝子発現について貴重な情報を提供しているんだ。たとえば、遺伝子HNRNPKは3,000以上の異なるRNAタイプを生成していて、RNA生成がどれだけ複雑かを示しているんだ。

研究者たちは、自分たちの研究結果をオンラインデータベースに公開して、脳の機能や病気を研究したい他の科学者が利用できるようにしたんだ。

発達中のRNAの変化

代替スプライシングは特に脳の発達中に重要なんだ。研究者たちは、妊娠中と出生後のサンプルからRNAを調べて、発達が進むにつれてRNAタイプがどう変わるかを見たんだ。特定のRNAタイプの数は、これら2つの段階で大きく異なり、いくつかのタイプは妊娠中のサンプルにしか現れず、他のものは出生後のサンプルにだけ現れたんだ。

全体的に、多くの遺伝子は妊娠中と出生後の段階で異なる量のRNAタイプを示していて、成長に伴う遺伝子発現の進化を表しているんだ。すべての遺伝子が異なる年齢で同じセットのRNAタイプを発現するわけではないけど、一部はかなりの違いを示していたんだ。

代替スプライシングイベントと融合転写産物

研究では、RNAタイプの多様性を生み出す主要な方法である代替スプライシングに関連するさまざまなイベントも見つかったんだ。これには、RNAの特定のセクションを飛ばしたり、異なる始まりや終わりのセクションを使ったり、通常は切り取られる部分を保持したりすることが含まれているんだ。これらのイベントは、タンパク質がどのように作られるかに寄与しているから重要なんだ。

さらに、研究者たちは複数の遺伝子の部分を組み合わせた融合転写産物も発見したんだ。これらの転写産物は稀だと思われていたけど、研究によって多くの例が明らかになって、遺伝子機能に大きな影響を与える可能性があるんだ。

新しい転写産物とタンパク質の生成

新しく特定されたRNAタイプのうち、かなりの部分がタンパク質を生成する高い可能性があることがわかったんだ。これは、タンパク質を測定する方法である質量分析を使ってさらに確認されたんだ。研究者たちは、多くの新たに特定されたRNAが実際に人間の皮質でタンパク質に翻訳される証拠を見つけたんだ。

たとえば、いくつかの遺伝子に関連するタンパク質が病気に関与していることがわかっていて、これらの新しいRNAタイプが機能的で、健康や病気に関与している可能性があることが確認されたんだ。

男性と女性の違い

研究者たちは、男性と女性のRNA発現の潜在的な違いも調べたんだ。性別に基づいて異なる発現を示す少数のRNAタイプが特定されたんだ。これらの多くは性染色体に位置する遺伝子に関連していたけど、他の遺伝子でも顕著な違いが見つかったんだ。

翻訳されない領域の役割を解明する

研究は、翻訳されない領域(UTR)と呼ばれるRNAの部分が生成されるRNAの多様性にかなりの影響を与えることを示していたんだ。UTRは、タンパク質をコードしないRNAのセクションだけど、遺伝子の発現に影響を与えることがあるんだ。研究者たちは、これらのUTRの長さが妊娠中と出生後のサンプル間で顕著に異なることを見つけて、異なる発達段階で遺伝子発現に影響を与えていることを示唆したんだ。

神経発達障害を理解する

不適切なRNAスプライシングと脳障害の関連を考慮して、研究者たちは自閉症や統合失調症のような神経発達条件に関連する特定の遺伝子に分析を拡大したんだ。彼らは追加のターゲットシーケンシングを使ってこれらの遺伝子についてより詳細なデータを集めて、関連する新しいRNAタイプの豊富な情報を見つけたんだ。

彼らの発見は、これらの新しいRNAタイプが神経発達障害に寄与する遺伝的変異を持つ可能性があることを示唆しているんだ。これは特に重要で、RNAの多様性を理解することで、新しいバイオマーカーや治療ターゲットを特定するのに役立つかもしれないからなんだ。

結論:この研究の重要性

この研究は、人間の脳での遺伝子発現とRNA生成の複雑さに関する重要な洞察を提供しているんだ。何千もの新しいRNAタイプを特定し、発達中にRNA発現がどう変わるかを明らかにすることで、脳内の遺伝子調節の複雑な性質を強調しているんだ。この発見は、脳障害を理解する上でRNAの多様性がどれほど関連しているかを示し、これらの条件の遺伝的基盤に関するさらなる研究の道を開いているんだ。

この研究を通じて作成された皮質転写産物の包括的な地図は、科学者にとって貴重なリソースとなり、脳生物学や病気メカニズムに関する新しい発見につながるかもしれないんだ。この研究を通じて、遺伝子が私たちの生物学にどのように影響を与え、健康にどのように関与するかについてより深く理解できるようになるんだ。

オリジナルソース

タイトル: An atlas of expressed transcripts in the prenatal and postnatal human cortex

概要: Alternative splicing is a post-transcriptional mechanism that increases the diversity of expressed transcripts and plays an important role in regulating gene expression in the developing central nervous system. We used long-read transcriptome sequencing to characterise the structure and abundance of full-length transcripts in the human cortex from donors aged 6 weeks post-conception to 83 years old. We identified thousands of novel transcripts, with dramatic differences in the diversity of expressed transcripts between prenatal and postnatal cortex. A large proportion of these previously uncharacterised transcripts have high coding potential, with corresponding peptides detected in proteomic data. Novel putative coding sequences are highly conserved and overlap de novo mutations in genes linked with neurodevelopmental disorders in individuals with relevant clinical phenotypes. Our findings underscore the potential of novel coding sequences to harbor clinically relevant variants, offering new insights into the genetic architecture of human disease. Our cortical transcript annotations are available as a resource to the research community via an online database.

著者: Jonathan Mill, R. Bamford, S. K. Leung, V. K. Chundru, A. R. Jeffries, J. Davies, A. Franklin, X. Chen, A. McQuillin, N. Bass, APEX Consortium, E. Walker, P. A. ONeill, E. Pishva, E. Dempster, E. Hannon, C. Wright

最終更新: 2024-05-26 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.24.595768

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.24.595768.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

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