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# 生物学# 生態学

新しいモデルが種の分布の理解を深める

新しいモデルが生態系全体の種の豊富さのパターンを明らかにしてるよ。

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目次

種の豊富さ分布(SAD)は、生態学の概念で、コミュニティ内にどれだけの個体がいるかを示してるんだ。これを見てみると、少数の種はすごく一般的だけど、多くの他の種は珍しいってパターンがわかる。このパターンは空洞の曲線として示されることが多くて、森や海、微生物の生息地など、いろんな生態系に現れるんだ。

この空洞の曲線のパターンは、生物の種類やコミュニティの大きさに関わらず、これらのコミュニティを形成する共通のルールや原則があることを示唆してる。SADの形は、種が集まってコミュニティを形成するときに起こる重要な生態的プロセスを反映していると考えられてる。

SADの重要性

SADを研究するのは、多様性を理解するためにめっちゃ大事。科学者たちは、いろんな生物における分布を正確に説明できるモデルを探してるんだ。有名なモデルには、ログ系列、ログノーマル、パワーローがある。それぞれのモデルは、特定の環境における種の分布を解釈するための方法が違ってる。

ログノーマルモデルは多くの研究でうまくフィットするからよく使われるんだけど、微生物コミュニティに関しては、必ずしも完全な絵を描けるわけじゃないって研究者たちは発見してる。実際、いろんな生物のタイプによってSADのパターンが違うかもしれないってことが考えられてる。このことは、すべての生物に共通する自然のルールがあるのかどうかを疑問視させる。

パワーベンドモデルのテスト

この疑問に答えるために、科学者たちは「パワーベンド」という新しいモデルが、すべての生物に共通するモデルとして役立つかをテストした。彼らは動物、植物、微生物を含む大量のデータを見て、このモデルが異なるコミュニティで成り立つかどうか調べたんだ。

パワーベンドモデルは、ほとんどの種が特定の分布形状に従うけど、最も一般的な種の個体数には上限があるってアイデアに基づいてる。この特徴がパワーベンドモデルをユニークで、他のモデルよりも正確な可能性がある理由なんだ。

研究者たちは、パワーベンドモデルが特に動物や植物のコミュニティのパターンを説明するのが得意だってことを見つけた。ほかのモデルと比べたとき、種の豊富さのデータの変動をより高い割合で説明できたんだ。

微生物に注目

微生物コミュニティは、その小ささと数の多さから違った挑戦を提供する。これらのコミュニティを効果的に研究するために、研究者たちはしばしば16S rRNAシーケンシングって技術を使って、異なるタイプの微生物を特定するんだ。ただ、シーケンシングから得られるリードを数えても、必ずしも個々の微生物の正確な数を反映してるわけじゃない。

以前の研究では、微生物コミュニティに対してはログノーマルモデルが最もよく機能しているように見えたけど、微生物のサンプリングの複雑さを考慮に入れていなかった。研究者たちが、サンプリングの誤差を取り入れたパワーベンドモデルを使ったとき、微生物データに非常によくフィットしたってことがわかった。実際、パワーベンドモデルは多くのケースでログノーマルモデルよりも優れてたんだ。

重要な指標を分析

モデルが観察データにどれだけフィットしているかを理解するために、研究者たちは均等さ(種を通じて個体がどれだけ均等に分布しているか)、優占(最も一般的な種に属する個体数)、希少性(珍しい種の数)などの追加の指標を見た。パワーベンドモデルは、他のモデルと比べてこれらの重要な側面を捉えるのが得意だった。

ログノーマルモデルは全体の種の豊富さにはフィットするかもしれないけど、個々の種の優占や希少性を正確に表現するのには苦労することが多い。しかし、パワーベンドモデルはこれらの追加の指標を効果的に考慮することができた。

生物多様性推定への影響

多くの研究者たちはSADモデルを使ってコミュニティ内の種の総数を推定するんだ。たとえば、ログノーマルモデルは地球上の微生物種の総数を推定するために適用されてきた。ただ、最近の研究の結果は、ログノーマルモデルが真の値からかなり乖離していることを明らかにしてる。

研究者たちが微生物コミュニティに対してパワーベンドモデルを使って推定を試みたとき、ログノーマルモデルを使った予測が桁違いに外れていることを発見した。この不一致は、ログノーマルモデルにのみ頼ると、生物多様性の推定に重大な誤りを引き起こす可能性があることを示唆してる。

大きな視点

パワーベンドモデルが異なる生物のタイプにおけるSADを統一できることがわかったのは、自然界に普遍的な生態的原則が働いている可能性を支持するものだ。モデルはコミュニティの形成の背後にあるプロセスを明示的には示さないけど、生態的パターンを駆動する要因について貴重な洞察を提供してくれる。

たとえば、環境における資源の制限が種の競争や相互作用にどのように影響を与えるかを理解するのは重要だよ。パワーベンドモデルは、資源の競争のような決定的なプロセスと、ランダムな出来事のような確率的なプロセスの両方がコミュニティの形成に影響を与えることを示唆してる。

結論

種の豊富さ分布の研究は、生物多様性を理解する上で重要なんだ。パワーベンドモデルは、植物、動物、微生物など、さまざまな生態系に見られるパターンを説明するための有望なツールとして浮上してきた。このモデルは種の分布を正確に考慮することで、生態的ダイナミクスのより明確な絵を提供してくれる。

科学者たちがSADモデルを探求し続ける中で、得られる洞察は保全活動や生態系が変化にどう反応するかを予測するのに役立つかもしれない。多様な生物の共通パターンを認識することで、地球上の複雑な生命のネットワークをより深く理解する手助けになるかもしれないね。

オリジナルソース

タイトル: A unifying model of species abundance distribution

概要: The species abundance distribution (SAD) is one of the most fundamental and best-studied macroecological patterns at the core of any biodiversity theory. Remarkably, almost every community investigated to date shows a hollow curve, indicative of the presence of many rare species and a few abundant species. While the precise nature of SAD is believed to reflect fundamental ecological processes underlying community assembly, ecologists have yet to identify a single model that comprehensively explains all SADs. Recent studies using large datasets suggested that logseries best describes animal and plant communities1,2 while lognormal is the best model for microbes3, thereby challenging the notion of a unifying SAD model across the tree of life. Using a large dataset of [~]30,000 globally distributed communities spanning animals, plants and microbes from diverse environments, here we show that powerbend distribution, predicted by a maximum information entropy-based theory of ecology, emerges as a unifying model that accurately captures SADs of all life forms, habitats and abundance scales, supporting the existence of universal ecological principles. Our findings reject the notion of pure neutrality and support the idea that community assembly is driven by both random fluctuations and deterministic mechanisms, such as interspecific trait variation and resource competition. We also show that the previously estimated one trillion microbial species existing on Earth might be orders of magnitude off.

著者: Martin Wu, Y. Gao, A. Abdullah

最終更新: 2024-06-17 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.14.599104

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.14.599104.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

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