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# 物理学# 光学# 生物物理学

生物研究のための高速イメージングの進展

新しい画像法で小さな泳ぎ手の速い動きを詳しく捉えた。

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生物学における高速イメージ生物学における高速イメージングのブレイクスルー跡できるようになったよ。新しい技術で小さな生物をリアルタイムで追
目次

イメージング技術は、3D環境で素早く起こる生物学的プロセスを研究するのに重要なんだ。特に小さな泳ぎを持つ生物、例えばバクテリアが周りの濃い液体とどう相互作用するかを明確に見るのが難しいっていう課題がある。それに対処するために、こういった早い動きを詳細にキャッチできる新しいイメージング手法が必要だよ。

現在のイメージング技術の問題点

多くの現在のイメージング方法、例えば蛍光顕微鏡は生物学で人気だけど、欠点もある。たとえば、観察している生きた細胞に時間が経つとダメージを与えることがあって、観察できる時間が制限されちゃうんだ。一部の解決策としては、量子ドットみたいな特別な小さな粒子を使う方法もあるけど、これも扱うのが難しいことがある。

最近、研究者たちは定量位相イメージング(QPI)というイメージングの一種に注目してる。QPIはサンプルによって引き起こされる光の変化を測定できて、害のある蛍光マーカーを使わずに済むんだ。これにより、蛍光イメージングに伴う問題、例えば信号レベルが低かったり、サンプルにダメージを与えたりするのを避けられるかもしれない。

光回折トモグラフィの理解

この分野で有望な技術は光回折トモグラフィ(ODT)って呼ばれるものだ。ODTは、サンプルに対して異なる角度からコヒーレントな光を照射して3D画像を作る仕組み。光が異なる材料を通過する様子を知ることができるから、光散乱が多いサンプルのイメージングには有用なんだ。

でも、従来のODTは、多くの画像を集めないと高品質な3Dビューを作れないから遅いっていう欠点があるね。実際、100枚以上の画像を集める必要があることもあって、他の方法の2倍も時間がかかる。これは速く動く物体を研究する上で大きな制約なんだ。

新しいアプローチ:フーリエ合成光回折トモグラフィ

このスピードの問題を解決するために、フーリエ合成光回折トモグラフィ(FS-ODT)という新しい方法が開発されたよ。FS-ODTは光の複数の角度をまとめて1枚の画像にして、広い視野を作りつつイメージングのプロセスを早めるんだ。この技術では、毎秒何千フレームものデータを集められるから、小さな泳ぎの動きをキャッチするのに十分な速さなんだ。

FS-ODTはデジタルマイクロミラー装置(DMD)っていう機器を使って光のパターンを制御し形を整えてる。DMDをイメージングセットアップの特定の位置に置くことで、1枚の画像で多様な光の角度や位置を作り出せるんだ。これは、DMDに表示する小さな光点を簡単に調整することで実現される。

FS-ODTのメリット

FS-ODTの主な利点は、各画像でより多くの情報を集められるところ。複数の光の角度や位置を組み合わせることで、全体のイメージングプロセスを早められるんだ。研究者たちは、周りの環境に関する詳細を失うことなく、速く動く物体を観察できるよ。

FS-ODTは既知の組成や小さな泳ぎのバクテリアなど、さまざまなサンプルでテストされてきた。結果は、この方法がサンプルの内部構造を正確に再構築できることを示していて、そのダイナミクスを理解するために貴重な洞察を提供している。

計算技術の重要性

FS-ODT法が生成する画像は複雑になるにつれて、データを処理し解釈するために高度な計算技術も必要になる。収集したデータに基づいて画像を正確に再構築するためには特別なアルゴリズムが必要なんだ。研究者たちは、この画像再構築の課題を解決するための新しい方法を開発していて、重なった光パターンによって複雑になることもある。

一つの重要なアプローチは、前の結果に基づいて画像を改善する反復アルゴリズムを使うこと。これらのアルゴリズムは、結果を安定させるために正則化技術を適用することもできて、より物理的に正確な再構築を促進するんだ。

FS-ODTイメージング実験の結果

FS-ODTは、さまざまな実験を通じてその能力を示してきた。特定のプロティストのような固定サンプルがイメージングされて、使用された角度多重化に関する再構築の質が評価された。結果は、異なる多重化のレベルが異なる詳細度や精度をもたらすことを示している。

拡散するマイクロスフィアや活発なバクテリアなどの動的サンプルも研究された。FS-ODTはこれらのサンプルの動きを効果的に追跡して、複雑な環境での運動性を理解するためのデータを提供している。

リアルタイム追跡と流体力学的研究

FS-ODTの重要な応用の一つは、バクテリアのような微生物がさまざまな液体中でどのように動くかを研究することだよ。速いイメージングレートを持つFS-ODTは、これらの小さな泳ぎの動きをリアルタイムで観察できるんだ。こういった生物の動きを理解することは、彼らの環境での行動や相互作用に関する洞察を提供してくれる。

小さな粒子が液体中でどのように拡散するかを観察することで、科学者たちはこれらの物体の周りで働く力についてもっと学べるんだ。こういった研究は、境界や他の粒子の存在が泳ぐ生物の動きにどう影響するかを明らかにしてくれる。

課題と今後の方向性

FS-ODTは大きな可能性を示しているけど、まだ越えなきゃいけない課題もある。イメージングスピードをさらに向上させたり、より高度な計算再構築技術を開発することは、今後の重要な作業分野だね。

例えば、より速いDMDモデルに移行すれば、全体のイメージングレートが大幅に向上する可能性がある。研究者たちは、深層学習技術を使って画像の質を改善し、分析プロセスを早める可能性も見ているんだ。

結論

FS-ODTは生物学研究のためのイメージング技術の進展を示している。速くて詳細な動的サンプルのイメージングを可能にすることで、この方法は生物学や物理学における新しい発見への扉を開いてくれるんだ。この分野の継続的な発展は、小さな生物の複雑な行動や動的環境内での相互作用について、さらなる洞察をもたらすだろうね。

オリジナルソース

タイトル: Fourier synthesis optical diffraction tomography for kilohertz rate volumetric imaging

概要: Many biological and soft matter processes occur at high speeds in complex 3D environments, and developing imaging techniques capable of elucidating their dynamics is an outstanding experimental challenge. Here, we introduce Fourier Synthesis Optical Diffraction Tomography (FS-ODT), a novel approach for high-speed quantitative phase imaging capable of recording the 3D refractive index at kilohertz rates. FS-ODT introduces new pattern generation and inverse computational strategies that multiplex tens of illumination angles in a single tomogram, dramatically increasing the volumetric imaging rate. We validate FS-ODT performance by imaging samples of known composition and accurately recovering the refractive index for increasing pattern complexity. We further demonstrate the capabilities of FS-ODT for probing complex systems by studying the hindered diffusion of colloids in solution and the motility of single-cellular bacterial swimmers. We believe that FS-ODT is a promising approach for unlocking challenging imaging regimes in biophysics and soft matter that have been little explored, including understanding the physical interactions of colloids and microswimmers with their viscous 3D environment and the interplay between these stimuli and the molecular response of biological systems.

著者: Peter T. Brown, Nikta Jabbarzadeh, Aidan Pintuff, Luis Meneses, Ekaterina Monakhova, Rory Kruithoff, Navish Wadhwa, Domenico F. Galati, Douglas P. Shepherd

最終更新: 2024-05-08 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://arxiv.org/abs/2309.16912

ソースPDF: https://arxiv.org/pdf/2309.16912

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた arxiv に感謝します。

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