ELAVタンパク質の円形RNA形成における役割
ELAVタンパク質が神経発達におけるcircRNAのレベルにどんな影響を与えるかを探る。
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円環RNA(circRNA)は、連続したループを形成するRNAの一種だよ。動物を含む多くの生物に存在していて、特定の組織や発達の段階で生成されて、神経系に多く見られるんだ。circRNAは、脳の機能に関与する遺伝子から生まれる。
科学者たちは、通常のRNAと比べてcircRNAの役割についてはあまり知らないけど、研究によると脳のいろんな活動に不可欠な存在なんだ。脳の発達、老化、学習、適応力などが含まれるよ。例えば、Cdr1asっていう特定のcircRNAは、感覚運動ゲーティングに関連していて、いくつかの人間のメンタルヘルスの問題とも関係してるんだ。さらに、circRNAは、依存症や脳の変性といった状態で異なる発現レベルを示すことがあって、これがこれらの障害の指標になり得るね。
circRNAは遺伝子発現の過程で形成されて、特定のRNAの部分が円環状に接続されるんだ。これは、RNAのスタート地点(5'スプライスサイト)を終わりの少し前の地点(3'スプライスサイト)に戻してつなげることで作られる。この円環状の接続が、従来の線状RNAとは違うユニークな構造を作り出すんだよ。circRNAの形成は、特定のRNA結合タンパク質に依存していて、これがRNA分子が異なる組織や発達段階でどう生成されるかに影響を与えるんだ。
ELAVタンパク質の役割
ELAV/Huタンパク質は神経系で重要な役割を果たすタンパク質のグループだよ。その中の一つ、ELAVっていうタンパク質は、神経細胞のRNAレベルを発達させたり維持したりするのに必要で、これは異なるRNAバージョンを同じ遺伝子から生成するプロセス、つまり選択的スプライシングに関与してる。ELAVがなければ、胚の発達に問題が出る可能性があるんだ。
研究者たちは、ELAVタンパク質が神経系での円環RNAの生成にも関与しているかもしれないと考えているよ。最近の研究では、ELAVタンパク質が神経細胞におけるcircRNAの発現を調整する重要な役割を果たしていることが示唆されていて、circRNA形成のメカニズムについての重要な洞察を提供しているんだ。
ショウジョウバエの胚におけるcircRNAの理解
研究者たちは、神経特有のcircRNAを調べるために、ショウジョウバエの胚をモデルとして使用したよ。ELAV遺伝子に変異を持つ異なる遺伝的系統のハエを作成して、特定の発達段階で胚を集めたんだ。研究者たちは、細胞を健康な神経細胞、ELAVが欠けている神経細胞、非神経細胞の3つのグループに分けて、これらの細胞からRNAを分析したんだ。
結果は、約400のcircRNAが非神経細胞に比べて神経細胞でより豊富であることを示したよ。これらのcircRNAのほとんどは、脳の機能に関連する遺伝子から来ていて、特にシナプス活動に関与しているものが多かった。この発見は、マウスの以前の研究とも一致していて、神経系におけるcircRNAの機能的役割を確認するものだったんだ。
ELAVの神経細胞のcircRNA発現への影響
研究者たちは、ELAVが神経細胞のcircRNAの発現に大きく影響していることを発見したよ。健康な神経細胞とELAVが欠けている神経細胞のcircRNAのレベルを比較したところ、ほとんどの神経細胞のcircRNAはこのタンパク質がないとダウンレギュレートされていたんだ。さらに分析した結果、もう一つのタンパク質FNEの欠如がこの効果を強めることがわかったよ。
ELAVをショウジョウバエのS2細胞に導入したとき、ELAVが自然に非常に少ない細胞タイプなんだけど、その結果circRNAのレベルが増加したんだ。これから、ELAVがcircRNAの発現を促進する鍵となる要因だってわかったよ。
ELAVがRNAに直接結合する
ELAVが神経細胞のcircRNAと直接相互作用するか調べるために、研究者たちはハエの頭からELAVに結合したRNA複合体を分離する実験を行ったんだ。ELAVは成熟したcircRNAには直接結合しないことがわかったけど、これらのcircRNAを生成する遺伝子の前駆体mRNAには結合したことがわかったよ。これから、ELAVはRNAの生成過程で円環化プロセスを助ける役割を果たしている可能性が高いね。
バックスプライシングの促進
研究者たちは、ELAVがcircRNAを生成するバックスプライシングを強化する役割を担っていると仮定しているよ。ELAVはcircRNAのバックスプライス接合部の周りにある特定のイントロン(コーディングされていない領域)に結合することがわかった。これが線状スプライシングの効率を下げて、バックスプライシングがもっと起こりやすい状況を作るかもしれないんだ。
調査中に、circRNAに関連する長いイントロンが効率的にスプライスされていないことに気づいたよ。この非効率性が、バックスプライシングが発生するためのより多くの機会を作り出し、circRNAの生成につながるんだ。
結論
この研究は、ELAVが神経細胞のcircRNA合成における中心的な役割を果たしていることを示しているよ。神経系におけるELAVの発現は、この組織に見られる高レベルのcircRNAにとって重要なんだ。ELAVは特定の領域で前駆体mRNAに結合して、circRNAの形成を促進しつつ、長いイントロンの線状スプライシングを抑制しているんだ。このプロセスは、適切な脳の発達と機能にとっておそらく不可欠なものだよ。
ショウジョウバエのELAVタンパク質と人間に見られるものの類似性を考えると、他の種でも似たようなメカニズムが働いている可能性が高いね。この発見は、circRNAが神経系で重要な専門的な機能を持っている可能性があることを示唆しているんだ。
今後の研究では、さまざまな脳タイプにおけるcircRNAの発現を単一細胞レベルで探ることが有益だと思う。これが脳の発達におけるcircRNAの役割や神経疾患への寄与を理解するためのブレークスルーにつながるかもしれないね。こうした洞察はRNA生物学や健康と病気におけるその影響についての理解を深めることになるよ。
タイトル: ELAV mediates circular RNA biogenesis in neurons
概要: Circular RNAs (circRNAs) arise from back-splicing of precursor RNAs and accumulate in the nervous system of animals, where they are thought to regulate gene expression and synaptic function. Here, we show that neuronal circRNA biosynthesis is mediated by the pan-neuronal RNA-binding protein ELAV. In Drosophila embryos, we characterize the circRNA landscape in normal and elav mutant neurons. We find that neuronal circRNAs are globally (>75%) depleted upon ELAV knockout, and induction of ELAV expression drives ectopic RNA circularization. In brain tissue, ELAV binds to pre-mRNA introns flanking putative circRNAs and decreases efficiency of linear splicing in favor of intron pairing at reverse complementary matches, inducing circularization. Together, our data demonstrate that ELAV directly modulates splicing decisions to generate the neuronal circRNA landscape.
著者: Valerie Hilgers, C. Alfonso-Gonzalez, S. Holec, S. Gorey, M. Shi, M. Rauer, J. Carrasco, S. Tsagkris
最終更新: 2024-06-22 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.22.600180
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.22.600180.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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