果実バエの熱耐性の遺伝学
研究が示す、ショウジョウバエの熱耐性に影響する遺伝的要因。
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目次
過去100年間で、地球の温度は約1.1°C上昇したんだ。でも、グローバルウォーミングの影響はここ30年でより顕著になってきた。この温度の上昇は、熱波や霜などの極端な天候イベントがより頻繁に強烈になる原因となり、動植物の自然な個体群に圧力をかけているんだ。これらの変化は、種がどこに住むかや、時間の経過とともにどれだけうまく生き残れるかを変えることがある。変温動物、つまり冷血動物は特に影響を受けやすいんだ。なぜなら、彼らの体温はしばしばその限界に近いから。これらの動物が変わる温度に遺伝的に適応できるかどうかを調べることが重要で、特に彼らの熱耐性に関してね。
熱耐性と遺伝的要因
熱耐性っていうのは、有機体が高温や低温に耐えられる能力のことだよ。熱耐性をより理解するためには、有機体が耐えられる温度の上限を正確に測る方法が必要なんだ。でも、どの方法がベストかについては議論があって、異なる実験手順は異なる結果をもたらすことがあるから、比較が難しくなるんだよね。
一般的に、上限の熱耐性を評価するためには、静的アッセイと動的アッセイの二つの主な技術が使われる。静的アッセイでは、有機体を一定の温度で機能できなくなるまで維持する。一方、動的アッセイでは、温度が徐々に上昇して、有機体が機能を失うまで測定する。試験時間が長くなると、食料や水の制限など他の実験要因が結果に影響を与えて、熱耐性の真の遺伝率を推定するのが難しくなるんだ。熱耐性を測定する方法を標準化するために、研究者たちは熱死時間(TDT)曲線を使うことを提案している。このアプローチは、温度と熱ストレスにさらされる期間の両方を考慮するんだ。
TDT曲線の可能性にもかかわらず、これらの曲線に影響を与える遺伝的要因についてはまだ十分な情報がない。ある有機体の熱耐性に寄与する遺伝子を特定することは挑戦の一部に過ぎない。それに加えて、これらの遺伝子が環境条件とどのように相互作用するかを理解することも重要なんだ。異なる遺伝子型は、環境の変化に対して異なる反応を示すことが知られていて、これは遺伝子型と環境の相互作用と呼ばれる。この相互作用は、種が多様な条件に適応して進化できる理由を説明するのに役立つんだ。
研究目的
この研究では、熱耐性に関連する遺伝的要因をさまざまな熱環境と両性で調べるために、特定の果実バエのグループ、ドロソフィラ・メラノガスターを利用した。気候変動に応じて熱耐性がどのように進化するかを評価するのが目的で、熱耐性に関連する遺伝的変異、遺伝率、これらの要因の相互作用を調査した。研究者たちは、熱耐性に関連する遺伝的変異と候補遺伝子を探し、特定の遺伝子についての機能テストを行ってその役割を探求したんだ。
使用された方法
ドロソフィラの系統
この研究では、ドロソフィラ遺伝子参照パネル(DGRP)から100の同遺伝子系統を利用した。これらの系統は、ノースカロライナ州ローリーで採集された雌からの近交によって作成された。果実バエは、25°Cで12時間の明暗サイクルの制御された環境で飼育された。バエの餌には、新鮮なイースト、グルコース、小麦粉、アガー、ニパギン、プロピオン酸が含まれていた。新たに出現したバエは2日ごとに性別で仕分けされ、テストに使用されるのは4〜6日齢のものだった。
熱耐性アッセイ
各DGRP系統について、5匹のオスと5匹のメスが、37°C、38°C、39°C、40°Cの4つの異なる温度で熱によるノックダウン時間をテストされた。この研究で使われたバエの数が多いため、実験は12回に分けて行われた。個々のバエは温度制御されたチャンバー内の96ウェルプレートのウェルに配置された。ウェブカメラがテストを記録し、Pythonスクリプトが映像を分析して各バエが動かなくなった時間を特定した。この方法で、各バエが崩れる前に熱にさらされていた時間を迅速に測定できたんだ。
定量的遺伝分析
研究者たちは、熱によるノックダウン時間を分析し、さまざまな要因が全体の結果に与える影響を評価するために、統計モデルを使用した。このモデルは、性差や実験の影響を考慮に入れているんだ。異なるDGRP系統からのデータを評価することで、研究者たちは熱耐性の遺伝的変異と遺伝率を推定できた。
熱耐性に関する発見
熱によるノックダウン時間
バエが熱ストレスに屈するまでの時間は、テストされた温度によって大きく変わった。温度が上がるにつれて、崩れるまでの平均時間は短くなった。この研究では、熱によるノックダウン時間はバエの遺伝子型、性別、さらにはさらされた温度に大きく依存していることがわかった。低温でテストされたメスはオスよりも熱耐性が高い一方で、極端な温度ではオスの方が高い耐性を示したんだ。
異なる温度間で重要な遺伝的相関が観察されて、熱耐性に影響を与えるいくつかの遺伝的要因が環境を超えて一貫していることが示唆された。しかし、遺伝的反応の変動は、遺伝子型が温度によって異なる反応を示すことを示している。
熱死時間曲線
研究者たちは果実バエのTDT曲線を計算して、熱耐性の限界の詳細な図を提供した。これらの曲線は、オスが一般的にメスよりも高い臨界最大温度(CTmax)を持っていることを明らかにしたが、メスはあまり極端でない温度でより高い耐性を持っているかもしれない。
CTmaxと熱感受性の遺伝率の推定は、遺伝的変異がこれらの特性に役割を果たしていることを示した。しかし、各系統と性別ごとのデータが限られているため、二つの性別を直接比較するのは難しかったんだ。
遺伝的変異と候補遺伝子
この研究では、熱耐性に関連する多数の遺伝的変異が特定された。これらの変異の多くはDNAの非コーディング領域にあり、遺伝子の発現や有機体が熱ストレスにどのように反応するかに影響を与える可能性がある。この研究は、果実バエの自然個体群を調査した以前の研究でも見つかった熱耐性に関連する候補遺伝子のいくつかを強調した。
興味深いことに、特定された多くの候補遺伝子は地理的な位置や季節の変化に基づいて変異を示し、環境ストレスによる選択圧を受けていることを示唆している。
熱耐性における性差
この研究では、熱耐性がオスとメスのバエの間で異なることが観察され、これはテストされた温度に依存するようだ。メスは低温でより良いパフォーマンスを示し、オスは高温で優位性を持っていた。これは、各性別の熱ストレスへの対処能力が、さまざまな環境での生存を決定する可能性があることを示しているんだ。
研究は、熱耐性の性差を理解することで、個体群が変わる気候にどのように適応できるかを説明するのに役立つかもしれないと示唆している。この発見は、種が進行中の気候変動にどのように反応するかをより良く予測するために、これらの違いを研究する重要性を示している。
研究結果の意義
この研究の結果は、ドロソフィラ・メラノガスターのような種が気候変動の圧力にどのように対処できるかを理解する上で重要だ。特定された遺伝的変異と熱耐性の可塑性は、これらのバエの適応反応に寄与し、彼らが将来的に生存する可能性についての予測に役立つかもしれない。
研究は、熱耐性の遺伝的基盤や、これらの遺伝的要因と環境条件との相互作用についてのさらなる研究の重要性を強調している。気候変動が温度や天候パターンに影響を及ぼし続ける中、種がどのように適応するかを理解することは、保護や管理戦略にとって非常に重要だよ。
結論
要するに、この研究は果実バエにおける熱耐性の遺伝的構造について貴重な洞察を提供している。遺伝的要因と環境の相互作用が、種が温度の変化にどのように適応するかを形成する重要性を強調しているんだ。熱耐性における性差は、これらの適応の複雑さと、急速に変わる世界での生存に対する潜在的な影響を浮き彫りにしている。遺伝的変異とその環境要因との関係を引き続き検討することは、気候変動に直面した種の未来を予測するために不可欠だよ。
タイトル: Genetic architecture of the thermal tolerance landscape of Drosophila melanogaster
概要: Increased environmental temperatures associated with global warming strongly impact the natural populations of ectothermic species. Therefore, it is crucial to understand the genetic foundations and evolutionary potential of heat tolerance. However, heat tolerance and its genetic components depend on the methodology, making it difficult to predict the adaptive responses to global warming. Here, we measured the knockdown time for 100 lines from the Drosophila Genetic Reference Panel (DGRP) at four different static temperatures, and we estimated their thermal death time (TDT) curves, which incorporate the magnitude and the time of exposure to thermal stress. Through quantitative genetic analyses, it was observed that the knockdown time showed a significant heritability at different temperatures and that its genetic correlations decreased as temperatures were dissimilar. Significant genotype-by-sex and genotype-by-environment interactions were noted for knockdown time. We also discovered heritable variation for the two parameters of TDT: CTmax and thermal sensitivity. Taking advantage of the DGRP, we performed a GWAS and identified multiple variants positively associated with the TDT parameters, which map to genes related to signaling and developmental functions. We performed functional validations for some candidate genes using RNAi, which revealed that genes such as mam, KNCQ, or robo3 affect the knockdown time at a specific temperature but are not associated with the TDT parameters. Ultimately, the thermal tolerance landscape must possess the ability to adapt to the selective pressures caused by global warming. Genetic variation of phenotypic plasticity and sexually antagonistic pleiotropy should also facilitate the adaptive process and maintain the genetic diversity in Drosophila populations.
著者: Luis E. Castaneda, F. Pinilla, J. Soto, P. E. Olguin
最終更新: 2024-07-03 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.01.601629
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.01.601629.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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