真菌の脅威と殺人酵母
農業や健康における真菌感染対策としてのキラー酵母の役割を探る。
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真菌感染は植物や人間にとって深刻な問題なんだ。真菌は作物に大きなダメージを与えることがあって、毎年世界中の作物の約3分の1が真菌病で失われてるんだ。さらに、果物や乳製品を含む食べ物の腐敗の約25%も真菌が原因なんだよ。これらの病原体は農業だけじゃなく、食の安全性や保存にも影響を与えるんだ。
ボトリティス・シネレアやペニシリウム・ディジタタム、ジオトリチャム・カンディダムなどの特定の真菌が作物に影響を与えることが知られてる。食べ物の腐敗には、ジゴサッカロミセスやペニシリウムなどの種が一般的な犯人だ。また、発酵飲料業界でも真菌の影響を受けていて、ブレットアノマイセスが特に問題になってる。
人間の健康に関しては、毎年推定380万人が真菌感染で亡くなってるんだ。特に免疫が弱っている人、例えばHIV患者や化学療法中の患者、COVID-19から回復中の人には特に心配だよ。人間に健康問題を引き起こす一般的な真菌には、カンジダ・アルビカンスや最近注目を集めてるカンジダ・アウリスがあるんだ。これらは複数の治療に対する抵抗性を持ってるからね。
抗真菌剤の必要性
真菌感染と戦うためには、抗真菌剤が4つの主要なタイプがあるんだ:アゾール、エキノカンディン、ポリエン、ピリミジン類似体。でも、多くの真菌がこれらの治療に対して耐性を持つようになってきてる。アゾールは農業でよく使われていて、真菌害虫に対して効果的だったけど、その過剰使用が真菌耐性の増加を招いてるんだ。
アムホテリシンBというポリエンは臨床現場でよく使われるけど、効果が不十分だったり毒性があったりすることがあるから、新しい効果的な抗真菌剤が求められてるんだ。
最近は、他の真菌を抑制できるさまざまな化合物を生成する酵母の利用に対する関心が高まってる。特定の酵母は、真菌の発生をコントロールするための可能なエージェントとしてすでに研究されているんだ。これらの酵母は、環境から鉄を捕えるサイデロフォアと呼ばれる物質を生成し、競争する真菌にとって利用可能な鉄を減らすんだ。また、他の真菌を直接殺すことができるタンパク質、いわゆるキラートキシンを分泌することもできる。
キラー酵母の役割
キラー酵母は新しい抗真菌治療の開発においてユニークな機会を提供してくれるんだ。これらの酵母は異なる作用機序を持つさまざまなタンパク質を生成することができるけど、知られている多くのキラートキシンには、効果的に働く条件や活動範囲が狭いといった制限があるんだ。
新しいキラー酵母を見つけるために、研究者は様々な環境から酵母を単離して、その抗真菌特性をテストしてる。ただ、本物のキラー酵母と他の化合物を生成するものを区別するのが難しいこともあるんだ。
目標は、これらのキラー酵母を特定し利用するための体系的な方法を作ることだよ。これには、酵母を単離するだけじゃなく、彼らが生成する化合物の種類や、それらの化合物が様々な真菌病原体に対してどれだけ効果的かを見極めることも含まれるんだ。
抗真菌酵母の発見
抗真菌酵母を見つけるために、水、土、植物などのさまざまな自然ソースからサンプルを集めるんだ。単離した後、酵母は知られている真菌病原体に対して抑制効果があるかテストされるんだ。体系的なアプローチで、これらの酵母をその活性や生成する化合物に基づいて分類するのが役立つんだ。
一つのアプローチでは、環境サンプルを集めて、特定の成長媒体で酵母を育てるんだ。一定の時間が経った後、酵母を様々な真菌に対してスクリーニングして成長を抑制できるかを確認するんだ。
酵母コレクションのスクリーニング
この体系的なアプローチを使って、研究者はどの酵母が抗真菌性を持っているかを特定できるんだ。大規模な酵母コレクションを確立することで、将来の研究にも役立つんだ。このコレクションは、様々な環境における酵母の多様性についての洞察も提供してくれる。
研究者は、真菌の成長を抑制する能力に基づいて酵母を分類することができるんだ。これには、どの真菌種に対して酵母がどれだけ効果的であったかを見て、活動のパターンを確認することが含まれるんだ。
抗真菌活性の特性評価
潜在的なキラー酵母が特定されたら、その抗真菌活性を特性評価することが重要なんだ。これには、酵母が最も効果的に働く条件、例えばpHレベルや温度を特定することが含まれるんだ。一部の酵母は低pHレベルや特定の温度では効果的で、農業環境での利点になるかもしれないんだ。
実験室テストでは、様々な条件で酵母を育てて、その真菌成長に対する影響を観察できるんだ。結果を比較することで、さらなる研究に向けた最も有望な候補を決定できるんだ。
酵母の多様性を探る
酵母種の多様性はとても広いんだ。研究では、分離したサンプルを遺伝情報や抗真菌能力に基づいてグループ化することができるんだ。この多様性は、酵母が環境とどのように相互作用するかを理解するだけじゃなく、新しい抗真菌化合物の開発のためのテンプレートを特定するのにも重要なんだ。
一部の酵母は、特有の作用機序を持っていたり、特定の真菌に対して効果的に働く化合物を生成することがあるんだ。この多様性を探ることで、農業や医療において重要な応用を持つ新しい抗真菌薬を発見できるかもしれないんだ。
農業における応用
キラー酵母は、化学殺虫剤だけに頼らずに真菌病を制御する自然な方法を提供することで、農業に大きな影響を与える可能性があるんだ。もし特定の酵母が作物の真菌成長を抑制できれば、ボトリティス・シネレアのような病原体から植物を守るために使えるかもしれないんだ。
酵母を生物的防除手段として使うことで、健康な植物が育ち、化学薬品の使用が減少し、最終的には安全な食品を提供できるようになるんだ。さらに、これらの酵母が既存の農業慣行に取り入れられれば、より持続可能な農業方法につながる可能性があるんだ。
医療における応用
医療の分野では、キラー酵母の利用が人間の真菌感染治療の選択肢としての可能性を提供してくれるんだ。感染を引き起こす真菌の多くは、従来の抗真菌剤に対して耐性を持ちつつあるから、キラー酵母が生成する化合物を利用することで、耐性株に対して効果的な新しい治療法を開発することができるかもしれないんだ。
目標は、特定の病原体をターゲットにした抗真菌治療法を作ることで、副作用のリスクを減らし、真菌感染の患者に対するより効果的な結果を促進することなんだ。
次のステップ
次のステップは、キラー酵母が真菌を抑制するメカニズムをさらに理解するための研究だよ。これには、抗真菌活性に関与する具体的なタンパク質や化合物を特定することが含まれるんだ。
遺伝子や分子技術の進展により、研究者たちはキラー酵母の可能性を探求できるようになり、新しい抗真菌治療や様々な産業での応用に道を開くことができるんだ。
結論
真菌病原体は、植物や人間に対して大きな脅威をもたらして、農業に損失を与えたり深刻な健康問題を引き起こしたりするんだ。キラー酵母の可能性を探ることは、新しい抗真菌薬を発見するチャンスを提供してくれるんだ。酵母を単離し研究する体系的なアプローチを取ることで、農業や医療に応用できる効果的な化合物を特定できるんだ。
この研究に投資することで、耐性真菌感染に対する新しい治療法を開発する可能性があり、持続可能な農業慣行を促進できるかもしれないんだ。抗真菌剤の未来は、私たちの環境にすでに存在する酵母のユニークな特性にあるかもしれないし、それが作物を守り、人間の健康を改善するのに役立つんだ。
タイトル: The antifungal capacity of a 681-membered collection of environmental yeast isolates
概要: Fungal pathogens threaten human health and food security, with resistance reported across limited antifungal classes. Novel strategies to control these pathogens and food spoilers are urgently needed. Environmental yeasts provide a functionally diverse, yet underexploited potential for fungal control based on their natural competition via the secretion of iron siderophores, killer toxins (proteins) or other small molecules like volatile organic compounds or biosurfactants. However, there is a lack of standardized workflows to systematically access application- relevant yeast-based compounds and understand their molecular functioning. Towards this goal, we developed a workflow to identify and characterize yeast isolates that are active against relevant human and plant pathogens and spoilage yeasts, herein focusing on discovering yeasts that produce potential killer toxins. The workflow includes the classification of the secreted molecules and cross-comparison of their antifungal capacity using an independent calibrant. Our workflow delivered a collection of 681 yeasts of which 212 isolates (31%) displayed antagonism against at least one of our target strains. While 50% of the active yeasts showed iron-depended antagonism, likely due to siderophore production, more than 25% are potentially secreting a toxic protein. Those killer yeast candidates clustered within ten species, showed target profiles from narrow- to broad spectrum, and several showed a broad pH and temperature activity profile. Given the tools for yeast biotechnology and protein engineering available, our collection offers a foundation for genetic and molecular characterization of antifungal phenotypes, with potential for future exploitation. The scalable workflow can screen other yeast collections or adjust for different antifungal compounds.
著者: Sonja Billerbeck, A. Macia Valero, F. Tabatabaeifar
最終更新: 2024-07-31 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.29.605670
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.29.605670.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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