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大腸がん再発リスクを評価する新しい方法

ctDNAとディープラーニングを組み合わせることで、大腸癌の再発予測が向上するよ。

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大腸癌リスク予測方法大腸癌リスク予測方法る。革新的なアプローチががん治療戦略を強化す
目次

大腸癌 (CRC) は大きな健康問題で、世界中でがんによる死亡原因のトップの一つなんだ。特定のステージの CRC 患者には、通常、腫瘍を取り除く手術が行われるんだけど、手術や他の治療法で進展が見られても、多くの患者ががんの再発を経験するんだ。実際、手術後にがんが再発する患者は 30% 以上いるんだよ。

再発したがんを持つ人は、病気で亡くなるリスクがかなり高くなるから、こういう患者を早期に特定する方法を見つけることが、フォローアップの治療計画を立てる上でとても重要なんだ。今のところ、再発リスクを評価するためのシステムがあって、主に画像検査、臨床的特徴、いくつかの分子情報に基づいているんだけど、これらの方法はあまり効果的じゃないんだ。それに、腫瘍マーカー、例えば腫瘍マーカーの一つである癌胎児性抗原 (CEA) をモニタリングすることも、再発を確実に検出するには精度が足りないんだよ。

ステージ II の CRC 患者に関しては、手術後に追加の化学療法を使用するかどうかの判断は、さまざまながん団体から提供される異なるリスク評価ガイドラインに依存することがあるんだ。特に、このステージにおける化学療法の利点が明確に証明されていないから、再発リスクをより正確に予測するための具体的なシステムが必要なんだよ。

新しい指標としてバイオマーカーが必要で、がんの再発をより正確に予測するために重要だよ。その中でも最も有望な新しいバイオマーカーの一つが循環腫瘍 DNA (CtDNA) なんだ。これは簡単な血液サンプルから検査できて、手術後に残ったがん細胞を検出するのに役立つんだ。それに、手術後に ctDNA が見つかると、がんが再発する可能性が高いことを示すことができるんだ。

研究によれば、ctDNA は主腫瘍を取り除いた後、わずか 4 週間で残存疾患の存在を示すことができるんだ。でも、ctDNA のレベルを知るだけではがんの全体像は把握できないんだ。がん細胞のタイプやグレード、腫瘍が周囲とどう相互作用しているかなどの重要な腫瘍の特徴は、予後に影響を与えるもので、伝統的な組織病理によって確認できるんだ。

大腸癌におけるディープラーニングの役割

ディープラーニング (DL) は、大量のデータを迅速かつ効率的に分析できる人工知能の一種なんだ。がんの分野では、DL は日常的な臨床データから有用な情報を抽出する可能性を示しているんだ。特に、DL モデルは腫瘍の画像を分析して、患者の生存に関連する特徴を評価できるから、現在のリスク評価システムよりも良い場合もあるんだよ。

DLを使うことで、研究者は腫瘍が特定の遺伝的特徴を持っているかどうかや、どれくらい治療に反応するかといった重要なデータを日常的な病理スライドから収集できるんだ。DL は ctDNA 単独では明らかにできない貴重な生物学的詳細を病理画像から抽出する能力があるから、研究者たちは ctDNA の分析と腫瘍形態の評価のために DL を組み合わせることで、がん再発の予測を大幅に向上させられると提案しているんだ。

この研究の目的は、標準組織画像から得られた DL ベースのリスクスコアと ctDNA 情報を統合して、CRC の患者の分類と再発予測を向上させることなんだ。

研究概要

この研究では、ドイツと日本の2つの大きな患者グループからの腫瘍画像を分析したんだ。最初のグループは DACHS 研究と呼ばれ、1700枚以上の画像があり、同数の患者が含まれているんだ。一方、GALAXY 試験のグループは1500枚以上の画像が収集されたんだ。この 2 つのグループのデータが DL モデルのトレーニングと検証に使用されたんだ。

GALAXY 試験では、手術から 4 週間後に ctDNA が調べられたんだ。特定の遺伝的変化が ctDNA に見つかると、その患者は MRD 陽性と分類されたよ。1555人中、約241人が MRD 陽性で、再発のリスクが高いことを示しているんだ。

研究で使用された方法

データ収集と準備

研究は、腫瘍の特徴を特定するのに役立つ特定の染料で染められた腫瘍画像を収集することから始まったんだ。画像は分析をしやすくするために小さな部分に切り取られたんだ。ほとんど関係のない背景情報が主に含まれるパッチは、価値のある腫瘍情報に分析が集中するように取り除かれたよ。

DL 分析のために画像を準備するために、研究者たちは染色プロセスによって導入されたバイアスを排除するためにパッチの色を調整したんだ。その後、公開されている画像処理用のパイプラインを使って、結果を再現可能にしたんだ。

DL モデルの開発

研究者たちは、準備した画像を分析するためにトランスフォーマーと呼ばれる特別な DL モデルを使用したんだ。まず、組織画像から特徴を認識できるようにモデルをトレーニングしたんだ。DACHS 研究のデータをトレーニングに使い、GALAXY 研究のデータは検証のために保持されたよ。

モデルは、治療後にがんが再発するまでの時間を測る無病生存期間 (DFS) に基づいて患者の結果を識別することに重点を置いたんだ。トレーニングの後、モデルは GALAXY 試験の患者における再発リスクを予測するために使われたんだ。

結果の分析

研究者たちは、DL モデルの結果と ctDNA 情報を分析して、これら二つを組み合わせることで患者のリスク分類が改善されるかどうかを見たんだ。患者はモデルによって生成された DL スコアに基づいて、高リスクグループと低リスクグループに分けられたよ。

生存分析が行われて、DL リスクスコアが患者の結果とどう相関するかが調べられたんだ。この分析は、グループ間の再発リスクの違いを強調するのに役立ち、その後、ctDNA 評価の結果と比較されたんだ。

研究の結果

研究の結果、DL モデルはがんの再発の可能性に基づいて患者を高リスクグループと低リスクグループに効果的に分類できることがわかったんだ。DL メソッドで高リスクと分類された患者は、低リスクと分類された患者に比べて再発の可能性が大幅に高かったよ。

特に、19.8% の患者が高リスクに分類され、残りの 80.2% は低リスクだったんだ。高リスクとラベル付けされた患者は DFS の率も悪くて、がんの再発を経験する可能性が高いことを示していたよ。

ctDNA 単独を使った場合、約 15.5% の患者が MRD 陽性だったんだ。でも、研究は DL スコアと MRD 状態を統合することで、より包括的なリスク評価ができることを示したんだ。

補助化学療法の影響

研究が扱った重要な質問の一つは、DL リスクスコアが手術後に追加の化学療法の恩恵を受ける患者を特定するのに役立つかどうかだったんだ。結果は、DL モデルで高リスクと識別された患者が化学療法を受けた際に、結果が改善されたことを示したんだ。MRD 陽性の患者の中でもそうだったんだ。

興味深いことに、MRD 陰性のグループでも、高リスクと分類された患者は化学療法を受けることで大きな利益を示したんだ。これは、DL スコアリングシステムが ctDNA 単独の標準的な指標では見落とされるかもしれない個々の患者を特定できることを示唆しているんだよ。

形態学的分析と予測

この研究では、DL モデルが患者の結果に関連する特定の腫瘍の特徴をいかに特定できるかも探求したんだ。DL モデルによって検出された形態学的特徴が、特定の遺伝子変異やマイクロサテライト不安定性の存在といった既知の予後指標と相関していることがわかったんだ。

モデルは、腫瘍画像の中からその挙動や再発の可能性を示す特徴を認識することを学んだんだ。その際、人間の入力なしで何を探すべきかをトレーニングしていたんだけどね。

結論

要するに、DL ベースのリスクスコアと ctDNA 測定の統合は、大腸癌患者の再発リスクを評価するための新しい有望なアプローチを提供しているんだ。この二重分析は、追加療法のための患者の選択を改善することができ、最も利点がある患者が治療を受けられるようにして、低リスクの患者に不要な介入を最小限に抑えることができるんだ。

さらなる研究が臨床環境でのこれらの発見を確認するために必要だけど、研究はがんの予後と患者ケアを向上させるための重要な一歩を示しているんだ。現代の技術を活用することで、医療提供者は大腸癌に対するより正確で効果的な治療に向けて進んで、最終的には患者の結果や生活の質を向上させることを目指しているんだ。

オリジナルソース

タイトル: HIBRID: Histology and ct-DNA based Risk-stratification with Deep Learning

概要: BackgroundAlthough surgical resection is the standard therapy for stage II/III colorectal cancer (CRC), recurrence rates exceed 30%. Circulating tumor DNA (ctDNA) emerged as a promising recurrence predictor, detecting molecular residual disease (MRD). However, spatial information about the tumor and its microenvironment is not directly measured by ctDNA. Deep Learning (DL) can predict prognosis directly from routine histopathology slides. MethodsWe developed a DL pipeline utilizing vision transformers to predict disease-free survival (DFS) based on histological hematoxylin & eosin (H&E) stained whole slide images (WSIs) from patients with resectable stage II-IV CRC. This model was trained on the DACHS cohort (n=1766) and independently validated on the GALAXY cohort (n=1555). Patients were categorized into high- or low-risk groups based on the DL-prediction scores. In the GALAXY cohort, the DL-scores were combined with the four-weeks post-surgery MRD status measured by ctDNA for prognostic stratification. ResultsIn GALAXY, the DL-model categorized 307 patients as DL high-risk and 1248 patients as DL low-risk (p

著者: Jakob Nikolas Kather, C. M. L. Loeffler, H. Bando, S. Sainath, H. S. Muti, X. Jiang, M. van Treeck, N. G. Reitsam, Z. I. Carrero, T. Nishikawa, T. Misumi, S. Mishima, D. Kotani, H. Taniguchi, I. Takemasa, T. Kato, E. Oki, T. Yuan, D. Wankhede, S. Foersch, H. Brenner, M. Hoffmeister, Y. Nakamura, T. Yoshino

最終更新: 2024-07-23 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.07.23.24310822

ソースPDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.07.23.24310822.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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