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# 生物学# 微生物学

結核菌の抗生物質耐性に関する新しい知見

研究が結核を引き起こす細菌の抗生物質耐性メカニズムを明らかにした。

Babak Javid, J. Wu, S. Chaudhuri, S. C. Feid, M. Pan, Q. Kawaji, G. Liu

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目次

抗生物薬の耐性ってのは、細菌が抗生物薬があるのに生き残ることだよ。いくつかの細菌は遺伝子的な要因で抗生物薬に弱いけど、それでも薬で殺されるのを防ぐことができるんだ。これって、感染症の治療を難しくするから重要なんだよね。

特に強いことで知られている細菌の一つが、結核を引き起こすMycobacterium tuberculosisなんだ。この細菌の中で新しい抗生物薬耐性の形が見つかったんだけど、それはリファンピシンっていう抗生物薬に対する反応に関係してるんだ。この耐性のタイプはRNAポリメラーゼ特異的表現型耐性(RSPR)って呼ばれてる。抗生物薬を避けるために眠ったような状態に入る細菌もいるけど、RSPRを持つ細菌は、高いリファンピシンのレベルにさらされても成長し続けることができるんだ。

RSPRの仕組み

研究者たちは、Mycobacterium tuberculosisがRSPRを発展させるのを助ける二つの主要なプロセスを特定したんだ。その一つは、細菌がタンパク質を作るときのミスに関係してる。通常、細菌はタンパク質を作るための特定の道具を持ってるけど、Mycobacterium tuberculosisにはこれを正しくするために必要なタンパク質が不足してるんだ。そこで、彼らは特定の方法でミスをすることがあるんだけど、特にグルタミンとアスパラギンに関してなんだ。

間違えて一方を他方と交換しちゃうと、リファンピシンのターゲットの重要な部分が変わっちゃう。この微妙な変化が、抗生物薬が使われてる時でも細菌が生き残ることを可能にするんだ。

反撃の方法を見つける

このことに気づいた研究者たちは、Mycobacterium tuberculosisがどうやってミスをするかを邪魔できれば、リファンピシンの効果を高められるかもって思ったんだ。そして、これらのミスを減らしてリファンピシンの効果を強化する可能性のあるカスガマイシンっていう化合物を発見したんだけど、さらに助けてくれる化合物を探したいと思ってたんだ。

その目標を達成するために、彼らは合成化合物の大きなコレクションを系統的にスクリーニングして、Mycobacterium tuberculosisの作り出すミスを減らせる化合物があるかを調べたんだ。これらの化合物がどれくらい効果があるかを追跡するための特別なシステムを開発した。目標は、抗生物薬が細菌ともっと効果的に戦えるように手助けできる化合物を見つけることなんだ。

新しい化合物を探す

スクリーニングの過程で、研究者たちは効果がありそうな化合物をいくつか見つけたんだ。その中には、ベンゾ[d]イソキサゾール-4,7-ジオンと呼ばれる一連の化合物が含まれてた。これらの化合物の中で一番効果的なものは、誤適応プロセスを減らして、リファンピシンのMycobacterium tuberculosisに対する効果を向上させることができたんだ。

研究者たちは、より安全でより効果的な化合物を探すために、化合物を改良し続けて、元の化合物のアナログを作ってテストしたんだ。その結果、初期の発見よりも効果的な有望な候補がいくつか出てきたんだ。

化合物の機能を解明

一番有望な候補が特定された後、次のステップはこれらの化合物がどのように働くかを正確に理解することだったんだ。研究者たちは、化合物が細菌内のどのタンパク質に結合するかを見る技術を使ったんだ。目的は、化合物によってどの部分の細菌が影響を受けたのかを明らかにすることなんだ。

このプロセスを通じて、30Sリボソームタンパク質S5という特定のタンパク質が彼らの化合物の主要ターゲットであることが分かったんだ。このタンパク質は、細菌がタンパク質を作るのを助ける重要な役割を果たしてる。S5の機能を邪魔することで、化合物がタンパク質を作るミスを減らせるから、細菌は抗生物薬に対してより敏感になるんだ。

治療への影響

これらの発見は結核の治療を改善する大きな可能性を秘めてる。標準的な治療は通常6ヶ月続くけど、新しい化合物がリファンピシンの効果を高めることで、治療期間が短くなるかもしれないんだ。

この研究は結核の対策だけじゃなくて、細菌が抗生物薬の治療にどのように抵抗するかを理解するためにも重要なんだ。この耐性を減らす方法を見つけることで、医療従事者は頑固な感染症を排除するためのより効果的な治療法を開発できるかもしれないんだ。

今後の方向性

今後の研究には探求すべきことがたくさんあるんだ。リボソームタンパク質が抗生物薬とどのように相互作用するか、細菌の翻訳がどのように操作できるかを理解することは、将来の研究の重要な側面なんだ。この知識は、抗生物薬耐性の細菌と戦うための新しい戦略の開発につながるかもしれないんだ。

さらに、化合物をスクリーニングして特定するために開発された方法は、他の細菌感染にも適用できるから、この研究の影響を広げることができるんだ。これらの分野を引き続き調査することで、研究者は抗生物薬耐性、つまり成長する世界的な健康の脅威に対抗する手助けができるんだ。

結論

抗生物薬耐性は厄介な問題で、特にMycobacterium tuberculosisみたいな細菌にとってはね。新しい耐性のメカニズムを解明し、これらのプロセスに対抗できる化合物を特定することで、治療の改善への希望が見えてくるんだ。この継続的な研究は、細菌の生物学を理解することの重要性と、感染症に対する革新的な解決策の可能性を強調してるんだ。

細菌の中の特定のタンパク質やプロセスがターゲットにできることを認識することで、現代医学の最も緊急な問題、すなわち抗生物薬耐性に取り組む道が開けるんだ。この分野での一歩一歩が、より効果的な治療に近づくことを意味してて、世界中の命を救ったり健康改善につながるかもしれないんだ。

オリジナルソース

タイトル: Medicinal chemistry of benzoisoxazole-4,7-dione analogues identifies the ribosomal small subunit as a target for specific mycobacterial translational fidelity

概要: Mycobacteria have high rates of error in the translation of glutamine and asparagine codons due to a two-step indirect tRNA aminoacylation pathway involving the essential amidotransferase GatCAB. This specific mycobacterial mistranslation is both necessary and sufficient for tolerance to the antibiotic rifampicin. Furthermore, we identified the natural product kasugamycin as a small molecule that could decrease this type of translational error, and potentiate rifampicin-mediated killing of mycobacteria, but whether other small molecules can decrease this specific type of mistranslation is unknown. We screened a library of synthetic small molecules using a pathway-specific whole-cell screen in a reporter strain of Mycobacterium smegmatis for their ability to decrease specific mycobacterial mistranslation. We synthesized 110 analogs of a parent hit compound and analyzed their bioactivity. To identify the cellular target of the compounds, we biotinylated active and inactive analogs and performed pull-down and mass-spectrometry of bound cellular proteins. We identified benzo[d]isoxazole-4,7-diones as a class of small molecules able to decrease mycobacterial mistranslation. Of the 110 analogs synthesized, we identified 10 with superior potency to the parent compound and analyzed the compounds to infer structure-activity relationships. Pull-down and mass spectrometry of bound cellular proteins identified RpS5 as a potential target of active compounds. Our study identified synthetic small molecules able to decrease mycobacterial mistranslation and confirmed that the small ribosomal subunit can be targeted to decrease mistranslation rates arising from physiologically mischarged tRNAs. Targeting mistranslation may be a potentially attractive means of targeting antibiotic-tolerant bacteria.

著者: Babak Javid, J. Wu, S. Chaudhuri, S. C. Feid, M. Pan, Q. Kawaji, G. Liu

最終更新: 2024-10-21 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.20.619312

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.20.619312.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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