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# 生物学 # 分子生物学

生殖におけるBamの役割:胚系幹細胞

バム遺伝子がショウジョウバエの繁殖にどう影響するかを探ろう。

Luke R Arnce, Jaclyn E Bubnell, Charles F Aquadro

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バムのハエの繁殖における役 バムのハエの繁殖における役 る。 バムが果実バエの配偶子に与える影響を調べ
目次

動物が繁殖する時、卵や精子を作るために特別なタイプの幹細胞に頼ってるんだ。それが生殖幹細胞(GSC)って呼ばれるやつ。GSCを地元のスポーツクラブのオールスターチームみたいに考えてみて。GSCは分裂してもっとGSCを作ったり、最終的に人生の大ゲームに参加する選手(卵や精子)を作るんだ。もしGSCがちゃんと働かなかったら、チーム全体がベンチに座ることになって、不妊につながるんだ。

バッグ・オブ・マーブルズ(bam)の役割

このプロセスのキープレイヤーの一つが、「バッグ・オブ・マーブルズ」っていう遺伝子、略してbam。bamはゲームを指揮するコーチみたいな存在。GSCがいつもっとGSCを作るか、いつ卵や精子を作り始めるかを決めるのを助けるタンパク質を生成するんだ。bamは複雑な構造を持ってて、ちょっと乱れた髪型みたい。散らかった部分と整理された部分があるんだ。

雌のショウジョウバエでは、GSCは周りの細胞からの信号によって制御されてる。GSCが分裂すると、新しい細胞の一つが残ってGSCのままで、もう一つの細胞は卵に成長し始める。bamは新しい細胞がホームベースから離れると活性化する。その後、bgcnっていう別のタンパク質とチームを組んで、その細胞が卵に成長し続けるのを確実にするんだ。

雄のショウジョウバエでは、ルールが少し変わる。ここでは、bamの仕事は精子細胞が最終段階の発達を完了するのを助けること。まるでサイドラインから叫ぶコーチみたいに、bamは時が来たら精子を作り始めるように細胞にシグナルを送るんだ。

調節の重要性

GSCがどのように、いつ分裂するかを調節するのはめちゃ重要。bamが正しく機能していないと、GSCが多すぎる状況になっちゃって、ゲームのスタンドが混雑してるのにフィールドには選手がいない(つまり、ショウジョウバエが繁殖できない)ってことになる。

おもしろいことに、bam遺伝子はすべてのショウジョウバエの種で同じじゃないんだ。いくつかの種はそれなしでやっていけるけど、他の種は繁殖するためにそれにかなり依存してる。この変異は、進化がこれらの遺伝子やその機能をどう形作っているのかって疑問を生むね。

進化とbamの多様性

時が経つにつれて、bamはさまざまなショウジョウバエの種でかなりの変化を遂げてきた。これは、電話ゲームのようなもので、元のメッセージが新しい参加者ごとに歪んでいく感じ。実際、二つの近縁種の間では、bamのアミノ酸のうち60個が異なる可能性がある。これはbamが急速に進化していることを示してる。

科学者たちは、bamの変異は自然選択によるものだと考えている。これらの変化が、異なる環境の新しい挑戦にbamが適応するのを助けているってことだ。要するに、「適者生存」ってわけ。

bamの構造を詳しく見る

bam自体は、構造の多くが無秩序なため、研究するのがちょっと難しい。ただ、新しい人工知能を使ったクールな技術のおかげで、科学者たちはbamが三次元でどう見えるかを予測できるようになったんだ。このプロセスは、パズルの欠けている部品や合わない部分をはめ込むような感じだね。

異なる種の比較

さまざまなショウジョウバエの種でbamを研究することで、進化の仕組みをたくさん知ることができる。例えば、普通のショウジョウバエ(D. melanogaster)では、bamが卵や精子を作るのに重要な役割を果たしている。でも、別の種(D. teissieri)では、bamはあまり重要な役割を果たしていないみたい。この違いは、ゴールを決められるチームメンバーとただ立っているだけのメンバーがいるようなもので、時には出てくるかどうかの問題なんだ。

異なる種のbamタンパク質の予測される形や機能を比較することで、なぜいくつかの種がbamに依存し、他の種はそうでないのかについての手がかりを集められるんだ。

bamが他のタンパク質とどう連携するか

bamは一人じゃない; 仲間のbgcnがいるんだ。このタンパク質たちが一緒になることで、GSCが正しく発達するのを確実にするんだ。これをダンスパートナーシップと考えてみて; bamがリードするけど、bgcnがリズムを維持するのが必要なんだよ。

これらのタンパク質が相互作用する方法は、機能にとって重要で、特定の領域でよりしっかりと結びつくかもしれない。接続が弱いと、GSCの機能に影響を及ぼすかもしれない。

水素結合と構造

これらのタンパク質が一緒にくっつく方法には、水素結合と呼ばれる小さな力が関与してる。これはすべてを所定の位置に保つための見えない接着剤のようなものだ。この結合を調べることで、科学者たちはbamとbgcnがどれだけうまく一緒に働くか、そしてこのことが異なる種でどう変わるかについてもっと学べるんだ。

機能の違いを理解する

bam遺伝子とタンパク質のすべての違いにもかかわらず、いくつかの研究では、調べた4種のショウジョウバエすべてでbamとbgcnの基本的な構造は大部分同じであることが示されてる。つまり、bamがちょっと違って見えても、同じ仕事をしようとしてるってこと。

もしbamの仕事が種ごとに大きく異なるなら、それはbamの構造が変わったからではなくて、期待される役割や任務が異なるからかもしれない。有名な選手がフィールドで違うポジションを取らなきゃいけないこともあるんだ、たとえ同じスキルを持っていても。

結論: 大きな絵

bamの構造が異なるショウジョウバエの種で保存されているかもしれないけど、その役割はそうじゃない。機能の違いは、環境や他のタンパク質との追加の相互作用など、他の要因から生じる可能性がある。これを理解することで、科学者たちはこれらの生き物が時間を経てどのように繁殖を適応させてきたのかを明らかにするのに役立つんだ。

だから、ショウジョウバエの世界が回る中、bamはこのチームの重要な選手であり続ける。ある種で先頭を切っているか、別の種で出ていないかに関わらず、常に生命の繊細なダンスの中で役割を果たしている。そして、良いコーチのように、それは適応し進化して常に選手たちをゲームに参加させ続けるんだ。

オリジナルソース

タイトル: Comparative Analysis of Drosophila Bam and Bgcn Sequences and Predicted Protein Structural Evolution

概要: The protein encoded by the Drosophila melanogaster gene bag of marbles (bam) plays an essential role in early gametogenesis by complexing with the gene product of benign gonial cell neoplasm (bgcn) to promote germline stem cell daughter differentiation in males and females. Here, we compared the AlphaFold2 and AlphaFold Multimer predicted structures of Bam protein and the Bam:Bgcn protein complex between D. melanogaster, D. simulans, and D. yakuba, where bam is necessary in gametogenesis to that in D. teissieri, where it is not. Despite significant sequence divergence, we find very little evidence of significant structural differences in high confidence regions of the structures across the four species. This suggests that Bam structure is unlikely to be a direct cause of its functional differences between species and that Bam may simply not be integrated in an essential manner for GSC differentiation in D. teissieri. Patterns of positive selection and significant amino acid diversification across species is consistent with the Selection, Pleiotropy, and Compensation (SPC) model, where detected selection at bam is consistent with adaptive change in one major trait followed by positively selected compensatory changes for pleiotropic effects (in this case perhaps preserving structure). In the case of bam, we suggest that the major trait could be genetic interaction with the endosymbiotic bacteria Wolbachia pipientis. Following up on detected signals of positive selection and comparative structural analysis could provide insight into the distribution of a primary adaptive change versus compensatory changes following a primary change.

著者: Luke R Arnce, Jaclyn E Bubnell, Charles F Aquadro

最終更新: 2024-12-18 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.17.628990

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.17.628990.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

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