Sincronizzazione nello Sviluppo Embrionale
Uno studio svela come le cellule si sincronizzano durante lo sviluppo, influenzando la formazione dei tessuti.
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Indice
La Sincronizzazione è un concetto chiave che si presenta in molte aree della scienza, compresa la biologia. Uno degli esempi più affascinanti di sincronizzazione avviene durante lo sviluppo degli embrioni vertebrati. In questo processo, gruppi di cellule nel mesoderma, che è uno degli strati formati durante lo sviluppo embrionale, iniziano a coordinare le loro attività. Queste cellule si comportano in modo ritmico che influisce sulla loro crescita e sull'organizzazione in strutture come la colonna vertebrale.
L'Orologio della Segmentazione
Un aspetto specifico di questa sincronizzazione è l'orologio della segmentazione, un sistema che aiuta a formare i Somiti. I somiti sono i mattoni per strutture come le vertebre, i muscoli e la pelle. L'orologio della segmentazione opera attraverso un meccanismo molecolare in cui le cellule accendono e spengono ripetutamente alcuni geni in modo ritmico. Negli anni, la ricerca ha dimostrato che diversi percorsi di segnalazione e proteine sono cruciali per questo processo.
Uno dei percorsi chiave coinvolti si chiama Via di segnalazione Notch. Questo percorso è stato trovato operativo in molte specie diverse, comprese le galline, i topi, i pesci zebra e i serpenti. L'attività della via Notch aiuta le cellule a comunicare tra di loro, permettendo loro di rimanere sincronizzate. Questo avviene attraverso un meccanismo di feedback che coinvolge proteine note come la famiglia Hes. Queste proteine regolano quando i geni vengono attivati o disattivati, mantenendo il comportamento ritmico delle cellule.
Domande sulla Sincronizzazione
Sebbene gli scienziati abbiano fatto progressi significativi nella comprensione dei dettagli su come funzionano questi oscillatori molecolari, ci sono ancora alcune domande di base senza risposta. Ad esempio, come fanno le cellule a sapere cosa stanno facendo le loro vicine? Accelerano o rallentano in base all'attività delle cellule vicine? Inoltre, la comunicazione tra le cellule è uguale, o cambia a seconda della situazione?
Per indagare queste domande, i ricercatori hanno cercato di scoprire le regole della sincronizzazione tra due oscillatori che hanno comportamenti simili ma leggermente diversi. Hanno usato un modello teorico chiamato modello Kuramoto, che è popolare nello studio della sincronizzazione. Secondo questo modello, due oscillatori regolano le loro fasi attraverso un tipo di connessione che può sia aiutare a allinearli che creare una differenza tra di loro.
Approccio Sperimentale
Per testare le loro idee, i ricercatori hanno progettato un esperimento utilizzando un metodo chiamato Assay di Randomizzazione per Input Basso (RAFL). In questo setup, hanno preso cellule da due diversi embrioni e le hanno mescolate insieme tenendo traccia delle loro fasi originali. Questo ha reso possibile osservare come si comportavano le cellule miste nel tempo e come cambiava il loro ritmo.
I ricercatori hanno monitorato le oscillazioni in tempo reale e confrontato i comportamenti del gruppo di cellule miste con i gruppi non mescolati. Questo ha permesso loro di indagare gli effetti della sincronizzazione in modo controllato.
Risultati sulle Dinamiche di Sincronizzazione
Attraverso i loro esperimenti, i ricercatori hanno trovato alcuni schemi interessanti. In molti casi, quando mescolavano cellule di diversi embrioni, un gruppo di cellule dominava e tirava l'altro gruppo verso la sincronizzazione con il suo ritmo. Questo risultato è stato sorprendente perché suggeriva che ci fosse uno squilibrio nel modo in cui avviene la sincronizzazione. Il gruppo di cellule "vincitore" manteneva il suo ritmo, mentre il gruppo "perdente" regolava la sua attività per allinearsi al vincitore.
Questa cosiddetta sincronizzazione "tu vinci tutto" non era prevista dal modello Kuramoto, che prediceva un risultato diverso in cui entrambi gli oscillatori avrebbero mediato le loro fasi. Nei casi in cui gli oscillatori erano quasi in fasi opposte, il gruppo perdente spostava la sua fase drammaticamente per allinearsi con il gruppo vincente.
Modellizzazione Teorica delle Regole di Accoppiamento
Per comprendere meglio questa forma insolita di sincronizzazione, i ricercatori si sono rivolti alla modellizzazione matematica. Hanno creato un modello semplificato che catturava il comportamento degli oscillatori nel gruppo misto. Questo nuovo modello, chiamato modello Kuramoto Rettificato (ReKu), è stato progettato per tenere conto dell'asimmetria osservata negli esperimenti.
In questo modello, la risposta degli oscillatori l'uno all'altro non era uniforme. Invece, privilegiava un Oscillatore rispetto all'altro, in base alle loro fasi iniziali. Il modello permetteva la possibilità che un oscillatore potesse rimanere invariato mentre l'altro si adattava al suo ritmo. Questa doppia asimmetria nelle regole di accoppiamento ha aiutato a spiegare il dominio visto nei dati sperimentali.
Indagare Altri Modelli
Sebbene il modello ReKu si adattasse bene alle osservazioni sperimentali, i ricercatori hanno anche esaminato altri modelli di accoppiamento per vedere se potessero spiegare i risultati. Un'alternativa era il modello Kuramoto-Sakaguchi (KS), che introduce uno spostamento di fase nell'accoppiamento. Tuttavia, questo modello non teneva conto del comportamento osservato negli esperimenti, specialmente per gli spostamenti di fase vicini a fasi opposte.
Un'altra alternativa era il modello di accoppiamento pulsato, in cui un oscillatore invia segnali forti solo in determinate fasi. Anche se questo potrebbe portare a sincronizzazione, richiedeva un accoppiamento molto forte per ottenere risultati simili a quelli degli esperimenti. Così, i ricercatori hanno concluso che la doppia asimmetria nel modello ReKu era essenziale per spiegare le dinamiche di sincronizzazione osservate.
Collegare i Risultati al Contesto Biologico
Questi risultati hanno implicazioni più ampie per comprendere come funziona la sincronizzazione nei sistemi viventi. Negli embrioni viventi, mentre le cellule si sviluppano, i loro comportamenti ritmici possono cambiare nel tempo. Questo porta a schemi che possono influenzare come si formano strutture come la spina dorsale e i muscoli.
Interessante notare, mentre gli esperimenti hanno mostrato che le cellule potevano regolare i loro ritmi per sincronizzarsi, questo potrebbe non significare necessariamente che la stessa cosa accada in vivo (in un organismo vivente). I processi negli embrioni reali potrebbero coinvolgere interazioni più complesse, dove l'organizzazione spaziale delle cellule influisce su come si sincronizzano.
In generale, la ricerca sottolinea l'importanza di studiare questi meccanismi di sincronizzazione negli embrioni. Fornisce intuizioni sulla comunicazione cellulare e su come i comportamenti individuali possano portare ad azioni coordinate in gruppi di cellule, essenziali per un corretto sviluppo. Comprendere questi meccanismi potrebbe anche aprire nuove strade per esplorare come processi simili si verificano in altri sistemi biologici al di fuori dello sviluppo embrionale.
Titolo: Nonreciprocal synchronization in embryonic oscillator ensembles
Estratto: Synchronization of coupled oscillators is a universal phenomenon encountered across different scales and contexts e.g., chemical wave patterns, superconductors and the unison applause we witness in concert halls. The existence of common underlying coupling rules define universality classes, revealing a fundamental sameness between seemingly distinct systems. Identifying rules of synchronization in any particular setting is hence of paramount relevance. Here, we address the coupling rules within an embryonic oscillator ensemble linked to vertebrate embryo body axis segmentation. In vertebrates, the periodic segmentation of the body axis involves synchronized signaling oscillations in cells within the presomitic mesoderm (PSM), from which somites, the pre-vertebrae, form. At the molecular level, it is known that intact Notch-signaling and cell-to-cell contact is required for synchronization between PSM cells. However, an understanding of the coupling rules is still lacking. To identify these, we develop a novel experimental assay that enables direct quantification of synchronization dynamics within mixtures of oscillating cell ensembles, for which the initial input frequency and phase distribution are known. Our results reveal a "winner-takes-it-all" synchronization outcome i.e., the emerging collective rhythm matches one of the input rhythms. Using a combination of theory and experimental validation, we develop a new coupling model, the "Rectified Kuramoto" (ReKu) model, characterized by a phase-dependent, non-reciprocal interaction in the coupling of oscillatory cells. Such non-reciprocal synchronization rules reveal fundamental similarities between embryonic oscillators and a class of collective behaviours seen in neurons and fireflies, where higher level computations are performed and linked to non-reciprocal synchronization.
Autori: Alexander Aulehla, C. Ho, L. Jutras-Dube, M. Zhao, G. Mönke, I. Z. Kiss, P. Francois
Ultimo aggiornamento: 2024-01-31 00:00:00
Lingua: English
URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.29.577856
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.29.577856.full.pdf
Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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