Avancées dans la thérapie par cellules T pour le cancer
Se concentrer sur les mutations KRAS pour améliorer les options de traitement du cancer.
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Le traitement du cancer, c'est un domaine super complexe, et une méthode qui semble prometteuse, c'est la thérapie par cellules T adoptives. Cette approche utilise des cellules T, un type de globule blanc, qui peuvent identifier et combattre le cancer de manière ciblée. Les chercheurs se concentrent sur une stratégie qui vise les 'néoantigènes publics.' Ce sont des marqueurs uniques qui apparaissent à cause de changements génétiques communs, comme des mutations dans des gènes spécifiques trouvés dans différents types de cancers et chez divers patients.
Un domaine d'intérêt particulier est le gène KRAS, qui peut avoir des mutations comme G12D et G12V. Des études ont montré que l’infusion de cellules T qui reconnaissent la mutation G12D peut aider à réduire les tumeurs chez des patients atteints de cancer métastatique. Cependant, une limite de cette approche, c'est le faible pourcentage de personnes qui ont l'antigène leucocytaire humain (HLA) spécifique nécessaire pour ces thérapies, ce qui signifie que tout le monde ne peut pas en bénéficier.
Pour rendre ces thérapies plus accessibles, les chercheurs doivent trouver des récepteurs de cellules T (TCR) qui peuvent cibler d'autres mutations dans KRAS et fonctionner avec différents types d'HLA. En plus, il est essentiel de comprendre comment ces TCR peuvent identifier les néoantigènes, surtout quand ces néoantigènes sont à peine différents des protéines normales du corps.
Le Défi d'Identifier des TCR Efficaces
Des TCR qui peuvent cibler spécifiquement le mutant KRAS ont été trouvés dans des cellules T prélevées sur des tumeurs de patients et sur des donneurs sains. Une autre méthode consiste à utiliser des souris modifiées pour exprimer certains types d'HLA. Dans ces souris, les chercheurs peuvent trouver des TCR qui ciblent spécifiquement les mutations KRAS après vaccination.
Par exemple, des scientifiques ont découvert un TCR qui reconnaît spécifiquement la mutation G12V dans KRAS. Ce TCR a montré la capacité de réagir à une gamme de tumeurs qui ont aussi la mutation G12V, ce qui démontre son potentiel pour le traitement du cancer. Cependant, il y a des défis à prendre en compte. Même avec un TCR qui peut reconnaître la mutation G12V, seul un nombre limité de patients peut avoir le bon type d'HLA pour que ce traitement fonctionne efficacement.
Méthodologie de Recherche
Dans une étude, les chercheurs ont cherché un TCR spécifique à G12V chez des souris génétiquement modifiées pour exprimer l'HLA-A3, qui est un type courant d'HLA. Les souris ont été vaccinées avec un virus portant la mutation G12V et ensuite traitées avec des vaccins supplémentaires à base d'ARNm. Après plusieurs semaines, les scientifiques ont prélevé les cellules T de ces souris et les ont stimulées avec des Peptides contenant la mutation G12V pour identifier les cellules T réactives.
À travers ce processus, les scientifiques ont trouvé des cellules T qui étaient particulièrement réactives au peptide G12V. Ils ont ensuite analysé la composition génétique de ces cellules T pour identifier les TCR spécifiques qu'elles utilisaient. En comprenant la structure et la fonction de ces TCR, les chercheurs peuvent concevoir des thérapies plus efficaces.
Comprendre les Caractéristiques Structurales
Les chercheurs ont poursuivi leur travail en examinant comment le TCR G12V interagit au niveau moléculaire avec le peptide G12V-KRAS. Ils ont découvert que le TCR se lie spécifiquement à la mutation G12V et pas à la version normale de la protéine KRAS. Cette interaction spécifique était super importante car elle signifie que le TCR peut faire la différence entre les cellules saines et cancéreuses.
Dans leurs études, les chercheurs ont créé des structures cristallines du TCR interagissant avec le peptide G12V. Ils ont constaté que la forme du peptide était modifiée lorsqu'elle contenait la mutation G12V, changeant ainsi la façon dont elle s'insère dans la groove de liaison de la molécule HLA. Cette altération joue un rôle significatif dans la façon dont le TCR reconnaît le peptide muté.
Le Rôle de l'Affinité dans la Fonction des TCR
Un autre aspect important de l'efficacité du TCR est son affinité, ou à quel point il se fixe à sa cible. Les chercheurs ont mesuré la force de liaison de leur TCR G12V au peptide G12V en présence de HLA-A3. Ils ont trouvé que, même si le TCR pouvait se lier au peptide G12V, son affinité était relativement faible par rapport à d'autres TCR ciblant d'autres mutations KRAS.
Cette affinité plus faible pourrait poser un défi dans un cadre clinique où le nombre de peptides Mutants présentés sur les cellules cancéreuses pourrait être limité. La recherche a suggéré que les TCR doivent avoir le bon équilibre d'affinité pour fonctionner efficacement, ce qui est souvent appelé la 'zone de goldilocks' - l'idée que les TCR ne doivent ni se lier trop faiblement ni trop fortement.
Explorer des Améliorations Potentielles
Le travail continue pour améliorer les TCR afin qu'ils puissent mieux se lier à leurs cibles. Les chercheurs ont expérimenté des changements dans la structure du TCR pour voir si cela augmenterait sa capacité à reconnaître la mutation G12V. Certaines modifications ont aidé à une petite mesure le TCR à se lier au peptide G12V. Cependant, ces changements n'ont pas significativement amélioré la fonction du TCR à des concentrations plus faibles du peptide cible, ce qui est là où beaucoup d'applications cliniques réelles peuvent se produire.
Malgré ces limitations, le TCR spécifique à G12V identifié chez des souris transgéniques HLA-A3 représente un point de départ précieux. Il constitue une preuve de concept pour cibler les néoantigènes avec la thérapie TCR.
Conclusion
Les néoantigènes publics, comme ceux causés par des mutations KRAS, représentent une piste prometteuse pour développer des traitements du cancer de précision. Cependant, l'efficacité des thérapies ciblant ces néoantigènes est fortement influencée par les polymorphismes HLA, qui déterminent si un TCR donné peut agir sur le cancer d'un patient.
Alors que les chercheurs poursuivent leur travail, ils visent non seulement à identifier plus de TCR capables de cibler ces mutations, mais aussi à améliorer leur efficacité. En acquérant des connaissances sur les fondements moléculaires de la reconnaissance et des affinités des TCR, ils espèrent développer des thérapies qui peuvent s'adresser à une population de patients plus large et, finalement, améliorer le traitement du cancer.
Le chemin pour affiner la thérapie par cellules T pour le cancer est en cours, chaque découverte contribuant à une meilleure compréhension de la façon de tirer parti du potentiel du système immunitaire. Grâce à des études minutieuses et à l'innovation, il pourrait y avoir de meilleures perspectives à l'horizon dans la lutte contre le cancer.
Titre: Identification and Structural Characterization of a mutant KRAS-G12V specific TCR restricted by HLA-A3
Résumé: Mutations in KRAS are some of the most common across multiple cancer types and are thus attractive targets for therapy. Recent studies demonstrated that mutant KRAS generates immunogenic neoantigens that can be targeted in adoptive T cell therapy in metastatic diseases. To expand mutant KRAS specific immunotherapies, it is critical to identify additional HLA-I allotypes that can present KRAS neoantigens and their cognate T cell receptors (TCR). Here, we identified a murine TCR specific to a KRAS-G12V neoantigen (7VVVGAVGVGK16) using a vaccination approach with transgenic mice expressing the common HLA-I allotype, HLA-A*03:01 (HLA-A3). This TCR demonstrated exquisite specificity for mutant G12V and not Wt KRAS peptides. To investigate the molecular basis for neoantigen recognition by This TCR, we determined its structure in complex with HLA-A3(G12V). G12V-TCR CDR3{beta} and CDR1 {beta} formed a hydrophobic pocket to interact with p6 Val of the G12V but not Wt KRAS peptide. To improve the tumor sensitivity of This TCR, we designed rational substitutions to improve TCR:HLA-A3 contacts. Two substitutions exhibited modest improvements in TCR binding to HLA-A3 (G12V), but did not sufficiently improve T cell sensitivity for further clinical development. Our study provides mechanistic insight into how TCRs detect neoantigens and reveals the challenges in targeting KRAS-G12V mutations. [203]
Auteurs: Malcolm John Wyness Sim, K.-i. Hanada, Z. S. Stotz, Z. Yu, J. Lu, P. Brennan, M. Quastel, G. Gillespie, E. O. Long, J. C. Yang, P. D. Sun
Dernière mise à jour: 2024-02-07 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.01.578367
Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.01.578367.full.pdf
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