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MoViT : Transformer l'analyse d'images médicales

Un nouveau modèle réduit les besoins en données dans l'analyse d'images médicales.

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L'analyse d'images médicales est super importante dans le domaine de la santé, où les docs s'appuient sur des images provenant de technologies comme l'IRM et les scanners CT pour diagnostiquer et traiter les patients. Récemment, un modèle appelé Vision Transformers (ViT) a pris de l'ampleur dans ce domaine. Les Vision Transformers peuvent analyser les images efficacement en capturant les relations entre les différentes parties d'une image. Cependant, ces modèles ont généralement besoin de beaucoup de données d'entraînement pour bien apprendre. C'est un vrai défi en imagerie médicale parce que récolter et annoter des données peut être compliqué et long.

Le défi des besoins en données

Comparé aux modèles traditionnels connus sous le nom de réseaux neuronaux convolutifs (CNN), les Vision Transformers ont besoin de beaucoup plus de données d'entraînement. C'est surtout parce qu'ils ont un plus grand nombre de paramètres, ce qui les rend plus complexes et gourmands en données. Dans les milieux médicaux, ce besoin de gros ensembles de données peut freiner les progrès parce que la collecte de données et les régulations sur la confidentialité limitent la quantité de données d'entraînement disponibles.

MoViT : une nouvelle solution

Pour répondre au défi du manque de données, un nouveau modèle appelé Memorizing Vision Transformer (MoViT) a été développé. L'idée derrière MoViT s'inspire de la manière dont les humains prennent des décisions basées sur des expériences passées. Au lieu d'avoir besoin d'une énorme quantité de nouvelles données pour l'entraînement, MoViT utilise un système de mémoire pour stocker et rappeler les informations importantes apprises au fil du temps.

MoViT garde une trace des instantanés d'attention pendant l'entraînement, ce qui lui permet de revenir sur des informations importantes quand il fait des prédictions. Cette mémoire aide le modèle à bien fonctionner même s'il n'a qu'une petite quantité de données d'entraînement.

Composants clés de MoViT

MoViT a plusieurs fonctionnalités importantes qui le rendent efficace pour l'analyse d'images médicales :

  1. Stockage de mémoire externe : Pendant l'entraînement, MoViT crée une mémoire externe qui conserve des instantanés d'informations importantes. Cela permet au modèle d'accéder à des faits appris précédemment, améliorant ses capacités de prise de décision.

  2. Méthode de mise à jour de la mémoire : MoViT a une manière unique de mettre à jour sa mémoire, veillant à ce qu'il n'oublie pas des informations importantes tout en apprenant de nouvelles choses. Cette méthode accumule les anciens instantanés et optimise les données stockées, évitant au modèle de trop s'adapter, ce qui peut se produire lorsqu'un modèle se concentre trop sur les données d'entraînement et performe mal sur de nouvelles données.

  3. Apprentissage d'attention prototypique : Après l'entraînement, MoViT distille sa mémoire stockée en un ensemble plus petit de faits représentatifs. Ce processus permet au modèle de fonctionner plus rapidement pendant la phase de prédiction en utilisant moins de points de données sans perdre d'informations importantes.

Test de MoViT

MoViT a été testé sur deux types différents de jeux de données d'images médicales : un jeu de données public d'images d'histologie et un jeu de données interne d'IRM. Les résultats ont montré que MoViT a surpassé les modèles de transformateurs traditionnels, surtout quand il y avait peu de données annotées disponibles.

Dans le jeu de données d'histologie, MoViT a réussi à obtenir des résultats similaires à ceux des modèles entraînés sur l'ensemble du jeu de données tout en utilisant seulement une fraction des données d'entraînement. C'était particulièrement impressionnant compte tenu du fait que n'utiliser qu'une petite quantité de données d'entraînement est courant en analyse médicale.

Sur le jeu de données IRM, MoViT a également bien performé selon différents critères d'évaluation, montrant sa capacité à distinguer avec précision les tumeurs malignes des tissus normaux.

Avantages de MoViT

MoViT a plusieurs avantages clés :

  • Besoins en données réduits : En utilisant la mémoire, MoViT nécessite moins de données d'entraînement pour atteindre de bonnes performances. C'est particulièrement bénéfique dans le domaine médical où les données peuvent être rares.

  • Intégration flexible : MoViT peut facilement être ajouté aux modèles de Vision Transformer existants, ce qui en fait une option polyvalente pour améliorer l'analyse d'images.

  • Performance stable : MoViT montre une performance plus cohérente que les modèles traditionnels, réduisant les fluctuations des résultats même avec des quantités de données variées.

  • Efficacité d'apprentissage : Avec son approche basée sur la mémoire, MoViT conserve des connaissances importantes sans surcharger le modèle avec des informations inutiles.

Directions futures

En regardant vers l'avenir, il y a un potentiel pour que MoViT soit combiné avec des réseaux convolutifs traditionnels. Cette approche hybride viserait à tirer parti des forces des deux modèles, ce qui pourrait conduire à des performances encore meilleures dans les tâches d'analyse d'images médicales.

De plus, des recherches continues peuvent explorer des moyens d'améliorer les systèmes de mémoire et les méthodes de mise à jour de MoViT pour augmenter encore son efficacité et son efficacité.

Conclusion

MoViT représente un pas en avant significatif dans le domaine de l'analyse des images médicales. En intégrant efficacement la mémoire dans le processus d'entraînement, cela réduit le besoin d'ensembles de données étendus tout en maintenant de bonnes performances. Cette avancée offre des promesses pour améliorer les capacités de diagnostic dans le secteur de la santé et pour faire face aux défis persistants du manque de données. À mesure que le domaine évolue, des modèles comme MoViT pourraient jouer un rôle crucial dans la rationalisation de l'analyse d'images médicales et l'amélioration des résultats des patients.

Source originale

Titre: MoViT: Memorizing Vision Transformers for Medical Image Analysis

Résumé: The synergy of long-range dependencies from transformers and local representations of image content from convolutional neural networks (CNNs) has led to advanced architectures and increased performance for various medical image analysis tasks due to their complementary benefits. However, compared with CNNs, transformers require considerably more training data, due to a larger number of parameters and an absence of inductive bias. The need for increasingly large datasets continues to be problematic, particularly in the context of medical imaging, where both annotation efforts and data protection result in limited data availability. In this work, inspired by the human decision-making process of correlating new evidence with previously memorized experience, we propose a Memorizing Vision Transformer (MoViT) to alleviate the need for large-scale datasets to successfully train and deploy transformer-based architectures. MoViT leverages an external memory structure to cache history attention snapshots during the training stage. To prevent overfitting, we incorporate an innovative memory update scheme, attention temporal moving average, to update the stored external memories with the historical moving average. For inference speedup, we design a prototypical attention learning method to distill the external memory into smaller representative subsets. We evaluate our method on a public histology image dataset and an in-house MRI dataset, demonstrating that MoViT applied to varied medical image analysis tasks, can outperform vanilla transformer models across varied data regimes, especially in cases where only a small amount of annotated data is available. More importantly, MoViT can reach a competitive performance of ViT with only 3.0% of the training data.

Auteurs: Yiqing Shen, Pengfei Guo, Jingpu Wu, Qianqi Huang, Nhat Le, Jinyuan Zhou, Shanshan Jiang, Mathias Unberath

Dernière mise à jour: 2023-09-29 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://arxiv.org/abs/2303.15553

Source PDF: https://arxiv.org/pdf/2303.15553

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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