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SignalGPT : Un nouvel outil pour l'analyse des signaux médicaux

SignalGPT aide le secteur de la santé en interprétant les signaux biomédicaux en texte clair.

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La croissance rapide de la technologie a entraîné des changements importants dans notre façon d'utiliser les modèles de langage dans divers domaines, en particulier dans la santé. Un des développements clés est la montée des Transformers Pré-entraînés Génératifs (GPT). Ces modèles sont devenus populaires très vite et sont adoptés dans plein de domaines à travers le monde. Les chercheurs étudient pourquoi ces modèles fonctionnent si bien, certains se concentrant sur des améliorations de leur conception et d’autres examinant les grandes quantités de données d’entraînement utilisées pour les développer.

De nombreuses études ont utilisé des modèles comme GPT-3 pour des tâches qui impliquent la compréhension et le traitement du langage naturel. Ces études montrent que ces modèles de langage ont le potentiel de s’attaquer à des tâches compliquées dans des domaines spécifiques. Des modèles comme GPT-4 ont même des fonctionnalités qui leur permettent de gérer différents types d’informations en même temps. Cependant, malgré leur puissance, il est clair qu'il y a encore des lacunes dans l’application de ces modèles dans le domaine médical. Par exemple, on remarque un manque d’ingénieurs qualifiés capables de convertir efficacement les Signaux biomédicaux en texte, ce qui est nécessaire pour créer des rapports liés aux tests et procédures médicales.

Des études récentes ont mis en avant certaines façons dont le GPT peut être utilisé dans le secteur de la santé. Par exemple, une étude a montré comment ChatGPT a été utilisé dans un programme d'auto-évaluation de connaissances médicales, aidant les médecins à réduire la quantité de documentation qu'ils avaient à faire en fournissant des informations en temps utile. D'autres recherches ont suggéré que ChatGPT pouvait aider à générer des notes médicales à partir de consultations et à interpréter des images radiologiques. Cependant, la plupart de ces travaux se concentrent sur des tâches de langage naturel ou d'images plutôt que sur l'interprétation de signaux médicaux, même si la préparation de rapports pour ces signaux implique des tâches similaires.

Les recherches actuelles qui relient le traitement du langage naturel au traitement de signaux biologiques traitent souvent les signaux comme du langage. L'objectif est d'utiliser des modèles de langage pour aider les ordinateurs à apprendre à comprendre différentes caractéristiques des signaux. De nombreuses études antérieures ont montré l'importance d'extraire des caractéristiques des signaux ECG (électrocardiogramme) pour aider à identifier les maladies cardiaques. La plupart de ces recherches combinent les caractéristiques des signaux avec des techniques d'apprentissage automatique pour analyser les données de manière efficace.

Il existe une solide collection de connaissances cliniques et académiques qui peut être exploitée pour améliorer l'utilisation des modèles de langage dans le domaine médical. Ce corpus de connaissances en croissance peut aider à simplifier la communication entre machines et professionnels de la santé. Par exemple, des dispositifs ECG avancés pourraient grandement bénéficier de recevoir des analyses préliminaires ou des secondes opinions de l'IA, surtout dans des environnements d'urgence chargés ou pour des médecins en formation.

La facilité d'utilisation, le faible coût et l'adaptabilité rapide des modèles de langage les rendent adaptés aux applications de santé. L'intégration de ces modèles dans les milieux médicaux peut agir comme un assistant pour les experts, leur facilitant la réalisation de leurs tâches. Les développements récents ont montré une augmentation remarquable de la taille et des capacités de ces modèles de langage, beaucoup d'entre eux étant maintenant accessibles au public. Cependant, il est essentiel de noter que le fait d'avoir plus de paramètres ne garantit pas toujours de meilleurs résultats ; la source et la qualité des données d'entraînement sont également très importantes.

Dans ce contexte, nous présentons SignalGPT, un système qui utilise les avancées des modèles de langage pour aider à l'analyse et à l'interprétation de divers signaux physiologiques, y compris l'ECG, l'EEG (électroencéphalogramme) et d'autres. Le système fusionne un modèle semblable à ChatGPT avec un processus dédié à la gestion des signaux biomédicaux.

SignalGPT est capable de traiter une variété de données médicales et de les convertir en descriptions textuelles claires. Bien que le système soit simple pour les signaux ECG, l'interprétation des signaux EEG est plus complexe. Il est important de préciser que SignalGPT n'est pas conçu pour diagnostiquer des conditions mais plutôt pour aider à fournir des interprétations. Une fois le signal traité en une description, cette description est envoyée au modèle ChatGPT ajusté. Le modèle évalue ensuite la description et prend en compte des détails comme le sexe, l'âge et d'autres informations de santé pertinentes pour fournir ses interprétations. Les expériences initiales avec des signaux ECG ont montré que cette approche était prometteuse.

Bien qu'il y ait eu des progrès notables dans l'imagerie et les systèmes d'IA généralistes, SignalGPT se distingue en se concentrant spécifiquement sur les signaux biomédicaux, comblant une lacune que d'autres systèmes n'ont pas abordée. En combinant de grands modèles de langage avec un traitement biomédical spécialisé, SignalGPT offre un outil unique pour que les professionnels de santé puissent tirer des enseignements des signaux médicaux.

SignalGPT fonctionne comme un assistant pour les cliniciens, aidant à interpréter les signaux biomédicaux. Le système comprend un contrôleur (similaire à ChatGPT) et un pipeline de traitement de signal. Le contrôleur détermine le moteur de traitement approprié en fonction du type de signal entrant. Il analyse aussi les descriptions générées à partir des signaux, s'appuyant sur son entraînement étendu et apprenant des retours des humains.

Le système fonctionne en cinq étapes. D'abord, il collecte des informations essentielles sur le patient comme le sexe et l'âge pour améliorer la précision de ses analyses. Ensuite, il utilise ces informations pour identifier et diriger le signal biomédical vers le moteur de traitement approprié. Les données de signal pertinentes sont ensuite importées, prétraitées et reconnues pour générer des prédictions et des descriptions objectives du signal.

Le texte généré par le moteur de traitement est renvoyé au contrôleur pour évaluation. Cette intégration aide le système à affiner encore plus sa sortie. La réponse de l'analyse inclut un résumé, accessible aux utilisateurs via une interface.

Pour confirmer l’efficacité de SignalGPT, des expériences utilisant des données ECG ont été menées. Les entrées directes de données ECG brutes dans ChatGPT n'ont pas donné de résultats utiles, car ce modèle de langage a du mal à lire des signaux bruts. Au lieu de cela, l'entrée de résumés descriptifs des signaux ECG s'est révélée bénéfique. L’étude a utilisé un jeu de données ECG provenant d'un réseau de télésanté, soigneusement organisé et annoté.

Le moteur ECG au sein de SignalGPT comprend des modèles conçus pour convertir les données de signal en texte lisible et pour prédire les anomalies dans les lectures ECG. Le système utilise des techniques de prétraitement et d'extraction de caractéristiques pour s'assurer que les descriptions fournies au modèle de langage sont précises et factuelles.

Pour évaluer la performance de SignalGPT, les résultats ont montré qu'il a atteint des taux de sensibilité impressionnants pour identifier diverses anomalies ECG. En revanche, l'utilisation seule de ChatGPT pour ces tâches a donné des résultats moins précis. La combinaison du traitement des signaux de SignalGPT avec les capacités avancées du modèle de langage améliore significativement la précision de l'analyse ECG.

En conclusion, SignalGPT est un système collaboratif qui allie le traitement des signaux biomédicaux à un modèle de langage. Ce système promet d'améliorer le diagnostic clinique et la planification des traitements. En prenant en charge certaines tâches d'analyse, SignalGPT soulage la pression sur les professionnels de santé, leur permettant de se concentrer sur d'autres aspects importants des soins aux patients.

Le système démontre la capacité à reconnaître des modèles complexes au sein de grands ensembles de données, ce qui est crucial dans l'interprétation des signaux médicaux. Alors que les données médicales continuent de croître en complexité, des outils comme SignalGPT peuvent jouer un rôle vital dans l'identification d'informations critiques qui pourraient autrement passer inaperçues.

Globalement, le développement de SignalGPT marque une avancée significative dans le domaine du traitement des signaux médicaux. Il peut améliorer la rapidité et la précision des interprétations médicales préliminaires, bénéficiant finalement aux résultats pour les patients. Cependant, bien que prometteur, l’efficacité de SignalGPT repose fortement sur la qualité des modèles prédictifs qu'il utilise. Optimiser ces modèles est crucial pour maximiser les avantages du système.

Alors que le débat autour de la fiabilité des modèles de langage en médecine se poursuit, intégrer des fonctionnalités qui facilitent l’interaction entre les systèmes d’IA et les professionnels de santé pourrait ouvrir de nouvelles possibilités pour améliorer l’aspect administratif des pratiques médicales. SignalGPT illustre le potentiel d'utiliser des technologies d'IA avancées pour soutenir les professionnels de santé, ouvrant la voie à de meilleurs soins aux patients et à de meilleurs résultats.

Source originale

Titre: BioSignal Copilot: Leveraging the power of LLMs in drafting reports for biomedical signals

Résumé: Recent advances in Large Language Models (LLMs) have shown great potential in various domains, particularly in processing text-based data. However, their applicability to biomedical time-series signals (e.g. electrograms) remains largely unexplored due to the lack of a signal-to-text (sequence) engine to harness the power of LLMs. The application of biosignals has been growing due to the improvements in the reliability, noise and performance of front-end sensing, and back-end signal processing, despite lowering the number of sensing components (e.g. electrodes) needed for effective and long-term use (e.g. in wearable or implantable devices). One of the most reliable techniques used in clinical settings is producing a technical/clinical report on the quality and features of collected data and using that alongside a set of auxiliary or complementary data (e.g. imaging, blood tests, medical records). This work addresses the missing puzzle in implementing conversational artificial intelligence (AI), a reliable, technical and clinically relevant signal-to-text (Sig2Txt) engine. While medical foundation models can be expected, reports of Sig2Txt engine in large scale can be utilised in years to come to develop foundational models for a unified purpose. In this work, we propose a system (SignalGPT or BioSignal Copilot) that reduces medical signals to a freestyle or formatted clinical, technical report close to a brief clinical report capturing key features and characterisation of input signal. In its ideal form, this system provides the tool necessary to produce the technical input sequence necessary for LLMs as a step toward using AI in the medical and clinical domains as an assistant to clinicians and patients. To the best of our knowledge, this is the first system for bioSig2Txt generation, and the idea can be used in other domains as well to produce technical reports to harness the power of LLMs. This method also improves the interpretability and tracking (history) of information into and out of the AI models. We did implement this aspect through a buffer in our system. As a preliminary step, we verify the feasibility of the BioSignal Copilot (SignalGPT) using a clinical ECG dataset to demonstrate the advantages of the proposed system. In this feasibility study, we used prompts and fine-tuning to prevent fluctuations in response. The combination of biosignal processing and natural language processing offers a promising solution that improves the interpretability of the results obtained from AI, which also leverages the rapid growth of LLMs.

Auteurs: Omid Kavehei, C. Liu, Y. Ma, K. Kothur, A. Nikpour

Dernière mise à jour: 2023-07-06 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.06.28.23291916

Source PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.06.28.23291916.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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