Améliorer les calculs de matrices creuses
Un système qui optimise les calculs pour les matrices creuses en utilisant un stockage bloqué.
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Table des matières
Les Matrices creuses sont super importantes dans plein de domaines, comme l'apprentissage machine et le calcul scientifique. Ces matrices contiennent souvent plein de zéros, ce qui fait que les méthodes traditionnelles pour les stocker et les utiliser peuvent faire perdre de la mémoire et de la puissance de traitement. Pour y remédier, on utilise des formats de stockage spéciaux qui ne gardent la trace que des éléments non nuls. Mais ça peut rendre l'accès à ces éléments plus compliqué, ce qui peut ralentir les calculs.
Dans cet article, on va se pencher sur un système conçu pour rendre la gestion des matrices creuses plus efficace. L'idée principale, c'est de créer des boucles régulières qui peuvent calculer directement des valeurs en utilisant la structure de la matrice creuse. En organisant la façon dont on fait ces calculs, on peut réduire le travail fait sur les éléments nuls et accélérer les calculs.
Contexte
Les matrices creuses sont des matrices où la plupart des éléments sont zéro. À cause de ça, elles nécessitent un handling spécial comparé aux matrices denses, où la plupart des éléments ne sont pas nuls. Les méthodes traditionnelles de stockage de matrices mènent souvent à un espace et des calculs gaspillés.
Il existe plusieurs formats de stockage créés spécifiquement pour les matrices creuses. Deux formats courants sont Compressed Sparse Row (CSR) et Coordinate List (COO). Ces formats ne stockent que les éléments non nuls, avec leurs positions dans la matrice, ce qui peut économiser de l'espace. Cependant, les calculs avec ces formats peuvent mener à des schémas d'accès mémoire irréguliers, rendant les choses moins efficaces, surtout dans des environnements de calcul parallèle.
Les systèmes existants qui gèrent les matrices creuses se concentrent souvent sur deux étapes principales : inspecter la matrice pour voir sa structure, puis exécuter du code qui utilise cette structure. Bien que cette méthode puisse avoir des avantages, elle ne profite pas pleinement du potentiel des motifs spécifiques de matrices, ce qui signifie qu'on rate certaines opportunités d'optimisation.
Système Proposé
Le système qu'on propose fonctionne avec des matrices creuses stockées dans un format bloqué. Ça signifie que la matrice est divisée en blocs, ce qui peut faciliter le traitement. L'idée clé, c'est de générer du code efficace qui utilise ces blocs, permettant des calculs simples même si certains éléments sont nuls.
Structure des Blocs
Dans notre approche, on se concentre sur la création de boucles régulières pour les calculs qui peuvent sauter les zéros sans perdre en performance. Ça se fait en optimisant la façon dont les calculs sont organisés, ce qui peut mener à des améliorations de vitesse significatives.
Quand une matrice creuse est stockée en format bloqué, c'est plus facile d'identifier et de travailler avec des régions denses d'éléments non nuls. En concentrant les calculs sur ces régions, on minimise le besoin de calculer des valeurs sur des éléments nuls. Le résultat, c'est un processus de génération de code plus efficace qui peut gérer différentes structures de matrices.
Génération de Code Efficace
Notre système utilise un processus de compilation en plusieurs étapes qui aide à générer un code optimisé à partir de la structure de la matrice creuse. En gros, les étapes incluent l'analyse de la matrice, la création d'un code sur mesure basé sur les opérations de l'utilisateur, puis l'optimisation de ce code avant de l'exécuter.
Le code généré consiste en des boucles imbriquées conçues pour réaliser des calculs sur la matrice. Cette structure aide à utiliser efficacement les capacités modernes de calcul, permettant des techniques comme la vectorisation, qui peuvent encore accélérer les calculs.
Stratégies d'Exécution
La performance de notre système vient de sa capacité à s'adapter à la structure de la matrice pendant l'exécution. En décomposant les opérations matricielles en tâches plus simples, le code peut s'exécuter plus rapidement et tirer parti du matériel sous-jacent.
Gestion des Blocs Creux
Le design de notre système lui permet de travailler avec des blocs de la matrice. Chaque bloc est traité comme une unité de calcul séparée, et les boucles générées sont optimisées pour ces blocs. Ça veut dire que le système peut rapidement changer de focus entre les blocs, permettant d'utiliser les données plus efficacement.
Cette méthode d'opération contraste avec certains systèmes existants qui s'appuient beaucoup sur des heuristiques spécifiques ou des schémas fixes. Au lieu de ça, notre approche permet plus de flexibilité pour s'attaquer aux complexités des matrices creuses.
Exécution Parallèle
Un autre avantage de notre système, c'est sa capacité à exécuter des calculs en parallèle. En analysant la structure de la matrice creuse, on peut regrouper les tâches efficacement, permettant à plusieurs calculs de se faire simultanément. C'est particulièrement bénéfique pour les grandes matrices, où le volume de calculs peut être conséquent.
Évaluation de la Performance
Pour comprendre comment notre système fonctionne bien, on a fait des tests en le comparant à d'autres systèmes à la pointe de la technologie. On s'est concentré sur deux opérations principales qu'on réalise typiquement sur des matrices creuses : la multiplication Matrice-Vecteur Creuse (SpMV) et la multiplication Matrice-Matrice Creuse (SpMM).
Performance SpMV
Dans nos tests, on a trouvé que notre système était meilleur que les approches existantes pour l'opération SpMV. La raison clé de ce gain de performance était due à une meilleure gestion des blocs denses. Les boucles générées permettaient un accès mémoire efficace et réduisaient le surcoût par rapport à d'autres méthodes.
En comparant les temps d'exécution, notre système a montré des réductions significatives du temps d'exécution, surtout dans les scénarios où la matrice contenait moins d'éléments non nuls. Dans ces cas, le gain de vitesse était remarquable, montrant l'efficacité de notre approche.
Performance SpMM
Des résultats similaires ont été observés avec les opérations SpMM. La capacité de générer des boucles optimisées pour les régions denses d'une matrice creuse a donné à notre système un avantage sur les méthodes traditionnelles. Cette adaptation à la structure de la matrice a permis à notre système d'obtenir une meilleure performance grâce à une génération de code réfléchie et des stratégies d'exécution.
Encore une fois, à mesure que le nombre de blocs denses augmentait, les avantages de notre approche devenaient encore plus clairs, menant à des améliorations constantes par rapport aux autres systèmes à la pointe de la technologie.
Conclusion
Les avancées dans la gestion des matrices creuses grâce à notre système apportent des améliorations significatives par rapport aux méthodes traditionnelles. En se concentrant sur la structure spécifique des matrices et en optimisant la façon dont les calculs sont effectués, on peut améliorer la performance de manière significative.
L'utilisation par notre système de formats de stockage bloqués, combinée à des stratégies de génération de code intelligentes, permet des calculs efficaces qui minimisent l'impact des éléments nuls. C'est particulièrement utile dans plein d'applications, de l'apprentissage machine au calcul scientifique, où gérer efficacement de gros jeux de données est crucial.
En regardant vers l'avenir, il y a encore plein d'opportunités pour un raffinement et une amélioration supplémentaires. Notre approche pose les bases pour explorer des opérations matricielles plus complexes et pourrait conduire à des performances encore plus rapides dans les développements futurs. En résumé, l'accent mis sur la structure et l'exécution efficace ouvre la voie à une meilleure gestion des matrices creuses, ce qui mène finalement à une amélioration des performances dans diverses tâches computationnelles.
Titre: SABLE: Staging Blocked Evaluation of Sparse Matrix Computations
Résumé: Sparse Matrices found in the real world often have some structure in their distribution of dense elements. While existing techniques specialize the generated code for the structure of matrices, their generality misses optimization opportunities. We propose a system that -- if the sparse matrix is stored in a blocked storage format -- can adapt its code generation strategy depending on the structure of the sparse matrix. Our system SABLE performs a specified computation over every element of {\em mostly} dense blocks instead of avoiding computing any sparse element and achieving regularity in generated code while having special treatment for hyper-sparse blocks (ie, blocks with very few dense elements). SABLE is extensible, providing a block iterator for users to express any computation over these non-empty blocks. We demonstrate that our approach can significantly accelerate SpMV and SpMM operations, surpassing the performance of state-of-the-art systems like Partially-Strided Codelets and Sparse Register Tiling.
Auteurs: Pratyush Das, Adhitha Dias, Anxhelo Xhebraj, Artem Pelenitsyn, Kirshanthan Sundararajah, Milind Kulkarni
Dernière mise à jour: 2024-09-16 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://arxiv.org/abs/2407.00829
Source PDF: https://arxiv.org/pdf/2407.00829
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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