Lien entre le gène SLC6A1 et les troubles du neurodéveloppement
Les mutations SLC6A1 affectent le fonctionnement du cerveau, entraînant épilepsie et défis de développement.
Michael F Wangler, K. Jay, N. Gogate, K. Ezell, J. Andrews, S. Jangam, P. Hall, H. Pan, K. Pham, R. German, V. Gomez, E. Jellinek-Russo, E. Storch, S. YAMAMOTO, O. Kanca, H. J. Bellen, H. Dierick, J. Cogan, J. A. Phillips, R. Hamid, T. Cassini, L. Rives, J. E. Posey
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Table des matières
- Lien avec l’épilepsie et les troubles du développement
- Symptômes et défis
- Variantes génétiques et leur impact
- Études de cas et évaluations
- Méthodes de recherche
- Importance d'une évaluation approfondie
- Drosophile comme organisme modèle
- Évaluations des crises chez la drosophile
- Études sur le comportement de sommeil
- Résultats et conclusion
- Directions futures
- Source originale
- Liens de référence
SLC6A1 est un gène super important pour que le cerveau fonctionne correctement. Il produit une protéine qui aide à contrôler les niveaux d’acide γ-aminobutyrique (GABA), un neurotransmetteur clé qui inhibe ou ralentit l’activité nerveuse. Le GABA est vital pour équilibrer l’activité cérébrale et est impliqué dans la régulation de l’humeur, de l’anxiété et du sommeil. Des problèmes avec les niveaux de GABA peuvent entraîner divers problèmes neurologiques, y compris des Crises et des troubles du développement.
Lien avec l’épilepsie et les troubles du développement
Des mutations dans SLC6A1 ont été associées à divers problèmes de santé, notamment un type d’épilepsie appelé épilepsie myoclonique-atonique (MAE). Cette condition entraîne des contractions musculaires soudaines et une perte de tonus musculaire. En plus de la MAE, les mutations de SLC6A1 ont été liées à un nouveau groupe de conditions appelées troubles du développement liés à SLC6A1. Ces troubles peuvent provoquer divers symptômes, y compris des Retards de développement, une déficience intellectuelle, des difficultés de communication et des problèmes de comportement.
Symptômes et défis
Une étude a révélé que les symptômes les plus courants associés aux troubles liés à SLC6A1 comprennent :
- Crises : Elles touchent environ 91% des personnes ayant des mutations SLC6A1.
- Retards de développement : Environ 82% des personnes concernées connaissent des retards dans leur développement.
- D'autres symptômes peuvent inclure des difficultés de mouvement, de langage, de comportement, de sommeil, ainsi que des troubles du spectre autistique (TSA) ou un trouble de déficit de l’attention avec ou sans hyperactivité (TDAH).
La large gamme de symptômes rend difficile pour les médecins de diagnostiquer et traiter ces troubles efficacement. De nombreux traitements visent à gérer les symptômes au fur et à mesure qu'ils apparaissent, plutôt qu'à s'attaquer à la cause sous-jacente.
Variantes génétiques et leur impact
Des recherches montrent que les personnes ayant des troubles liés à SLC6A1 ont souvent des changements génétiques spécifiques, en particulier des variantes non-sens. Ces changements peuvent conduire à des versions moins efficaces ou complètement non fonctionnelles de la protéine de transporteur de GABA, ce qui aboutit à des niveaux de GABA incorrects dans le cerveau. Cela peut entraîner les symptômes observés chez les personnes concernées.
Dans certains cas, des individus portent des mutations qui permettent une fonction partielle de la protéine, entraînant une présentation des symptômes plus légère. Cette variabilité dans la manifestation des symptômes-parfois légère, parfois sévère-dépend non seulement de la mutation spécifique mais aussi d'autres facteurs génétiques ou environnementaux.
Études de cas et évaluations
Un cas particulier concernait une personne identifiée grâce à un réseau médical connu sous le nom de Réseau des Maladies Non Diagnostiquées (UDN). Cette personne avait une variante dans le gène SLC6A1 qui n’avait pas été complètement classifiée, signifiant que son importance était incertaine. L'individu a présenté plusieurs symptômes, y compris de l'épilepsie et des problèmes de développement. D'autres études familiales ont révélé que des frères et sœurs avaient également la même variante, mais avec des symptômes variés, montrant comment le même changement génétique peut affecter les gens différemment.
Pour mieux comprendre les implications de cette découverte génétique, les chercheurs ont comparé l'individu concerné (UF1) à un groupe d'autres avec des variantes SLC6A1 confirmées à travers une évaluation clinique détaillée, qui a impliqué une approche multifacette. Cela comprenait des tests génétiques, des évaluations neurologiques et la collecte d'histoires de santé familiale détaillées.
Méthodes de recherche
Les chercheurs ont utilisé des méthodes standardisées pour évaluer l'état des individus. Ils ont catégorisé les symptômes et compilé des données dans une base de données, permettant ainsi des comparaisons efficaces entre les individus. Les évaluations cliniques ont utilisé un questionnaire complet couvrant différents domaines de développement et de fonctionnement, tels que les compétences cognitives, le langage et le comportement.
Importance d'une évaluation approfondie
La complexité des troubles liés à SLC6A1 a exigé des évaluations et des comparaisons approfondies. Parmi les individus étudiés, il était essentiel d'analyser des phénotypes spécifiques-traits observables ou symptômes-associés à la variante génétique. Cela a été réalisé par diverses méthodes statistiques pour analyser les similarités et les différences parmi les cas.
Drosophile comme organisme modèle
Pour approfondir l’étude des effets des variantes SLC6A1, les chercheurs ont utilisé la drosophile, communément appelée mouche des fruits, comme organisme modèle. Les mouches des fruits partagent des voies génétiques et certaines similitudes fonctionnelles avec les humains, en particulier sur la façon dont les gènes influencent les comportements et les processus neurologiques. Cela permet aux scientifiques d'étudier l'impact des mutations spécifiques dans un environnement contrôlé.
Les chercheurs ont modifié des mouches des fruits pour exprimer des variantes humaines de SLC6A1, afin d'observer comment ces mutations affectaient le comportement, notamment en matière d'activité épileptique et de motifs de sommeil. Cette approche a permis d'étudier directement les effets biologiques des mutations géniques et d’évaluer les résultats fonctionnels des différentes variantes génétiques.
Évaluations des crises chez la drosophile
Un des points importants était de comprendre comment ces variantes génétiques influencent la susceptibilité aux crises. Les chercheurs ont soumis les mouches à un stress mécanique pour évaluer leurs réponses aux crises. Notamment, ils ont découvert que les mouches exprimant certaines mutations SLC6A1, y compris la variante nouvellement étudiée p.(A334S), affichaient une activité épileptique altérée par rapport aux mouches sans ces mutations.
Études sur le comportement de sommeil
En plus des crises, les chercheurs ont examiné comment les mutations SLC6A1 affectaient le sommeil chez les mouches des fruits. Le sommeil est une fonction critique qui peut être impactée par les niveaux de GABA. Ils ont observé que les mouches avec des variantes génétiques spécifiques montraient une latence de sommeil réduite-ce qui signifie qu'elles s'endormaient plus rapidement que la normale-et que leurs motifs de sommeil étaient perturbés.
L'étude a révélé que si le fonctionnement normal du gène SLC6A1 favorise des motifs de sommeil stables, les altérations dues aux mutations entraînaient des comportements de sommeil fragmentés et perturbés, reflétant les problèmes de sommeil observés chez les individus concernés.
Résultats et conclusion
La recherche a confirmé que la variante p.(A334S) dans SLC6A1 représente un allèle de perte de fonction hypomorphe. Cela signifie qu'elle réduit la fonctionnalité globale de la protéine, contribuant aux symptômes associés au trouble. La variabilité observée parmi les individus avec des changements génétiques similaires indique que d'autres facteurs jouent probablement un rôle dans la détermination de la gravité des symptômes.
Cette étude a souligné l'importance d'évaluations génétiques complètes et d'études fonctionnelles pour comprendre l'impact des variantes génétiques. Identifier la nature spécifique de ces mutations ouvre la voie à des thérapies ciblées potentielles qui pourraient améliorer la gestion des symptômes pour les personnes ayant des troubles liés à SLC6A1.
Directions futures
Les recherches futures pourraient se concentrer sur l’exploration d’autres facteurs génétiques ou environnementaux qui influencent l’expression des troubles liés à SLC6A1. Comprendre le paysage génétique plus large à travers des études plus approfondies aidera à déterminer comment ces facteurs interagissent avec les mutations connues et pourrait informer d'éventuelles approches thérapeutiques pour ceux qui sont touchés.
En résumé, ce travail met en avant l'importance d'un phénotypage clinique approfondi et d'études fonctionnelles pour résoudre les variantes d'importance incertaine au sein de gènes de maladies connus comme SLC6A1. Les résultats soulignent le potentiel d'interventions ciblées dans la gestion de l'épilepsie et des troubles du développement liés à ce gène.
Titre: Resolution of SLC6A1 variable expressivity in a multi-generational family using deep clinical phenotyping and Drosophila models
Résumé: PurposeVariants in SLC6A1 result in a rare neurodevelopmental disorder characterized by a variable clinical presentation of symptoms including developmental delay, epilepsy, motor dysfunction, and autism spectrum disorder. SLC6A1 haploinsufficiency has been confirmed as the predominant pathway of SLC6A1-related neurodevelopmental disorders (NDDs), however, the molecular mechanism underlying the variable clinical presentation remains unclear. MethodsHere, through work of the Undiagnosed Diseases Network, we identify an undiagnosed individual with an inherited p.(A334S) variant of uncertain significance. To resolve this case and better understand the variable expressivity with SLC6A1, we assess the phenotypes of the proband with a cohort of cases diagnosed with SLC6A1-related NDDs. We then create an allelic series in the Drosophila melanogaster to functionally characterize case variants. ResultsWe identify significant clinical overlap between the unsolved case and confirmed cases of SLC6A1-related NDDs and find a mild to severe clinical presentation associated with missense variants. We confirm phenotypes in flies expressing SLC6A1 variants consistent with a partial loss-of-function mechanism. ConclusionWe conclude that the p.(A334S) variant is a hypomorphic allele and begin to elucidate the underlying variability in SLC6A1-related NDDs. These insights will inform clinical diagnosis, prognosis, treatment and inform therapeutic design for those living with SLC6A1- related NDDs.
Auteurs: Michael F Wangler, K. Jay, N. Gogate, K. Ezell, J. Andrews, S. Jangam, P. Hall, H. Pan, K. Pham, R. German, V. Gomez, E. Jellinek-Russo, E. Storch, S. YAMAMOTO, O. Kanca, H. J. Bellen, H. Dierick, J. Cogan, J. A. Phillips, R. Hamid, T. Cassini, L. Rives, J. E. Posey
Dernière mise à jour: 2024-09-28 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.09.27.24314092
Source PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.09.27.24314092.full.pdf
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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