Adapter la physique des hautes énergies aux nouvelles plateformes de calcul
Les chercheurs en physique des particules optimisent des logiciels pour différents ressources informatiques.
Hammad Ather, Sophie Berkman, Giuseppe Cerati, Matti Kortelainen, Ka Hei Martin Kwok, Steven Lantz, Seyong Lee, Boyana Norris, Michael Reid, Allison Reinsvold Hall, Daniel Riley, Alexei Strelchenko, Cong Wang
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Table des matières
- L'Importance du Code Portable
- L'Évolution de l'Informatique en PHE
- Le Défi de la Portabilité des Logiciels vers les GPU
- Le Rôle des Outils de Portabilité
- Comparaison des Performances
- CPU vs. GPU en PHE
- Exploration des Algorithmes de Référence
- Résultats des Tests des Outils de Portabilité
- Impact des Choix de Compilateur
- Considérations sur la Gestion de la Mémoire
- Vers l'Avenir : L'Avenir de la Portabilité en PHE
- Conclusion
- Source originale
- Liens de référence
Les expériences de physique des hautes énergies (PHE) poussent sans cesse les limites dans leur recherche de vérités fondamentales sur l'univers. Ces expériences génèrent d'énormes quantités de données provenant des collisions de particules et ont besoin de ressources informatiques puissantes pour analyser ces données. Traditionnellement, elles ont compté sur des processeurs informatiques classiques, mais à mesure que les expériences deviennent plus complexes et que le volume de données augmente, le besoin de plateformes informatiques plus avancées et variées devient évident.
Pour répondre à ces demandes croissantes, les chercheurs en PHE explorent comment utiliser efficacement différents types de ressources informatiques, y compris les unités de traitement graphique (GPU). Le défi réside dans le fait de s'assurer que le logiciel utilisé dans les expériences peut fonctionner efficacement sur ces configurations matérielles diverses.
L'Importance du Code Portable
Avec l'amélioration des technologies informatiques, la capacité à exécuter le même logiciel sur différents systèmes devient de plus en plus importante. Cette Portabilité permet aux chercheurs de tirer parti de diverses ressources informatiques sans avoir à réécrire leur logiciel pour chaque nouveau système. Dans le domaine de la PHE, l’utilisation de code portable est essentielle pour suivre le rythme des changements rapides dans la technologie informatique.
Les solutions de portabilité aident à maintenir une base de code unique qui fonctionne sur plusieurs types de matériel. Cela signifie que les chercheurs peuvent se concentrer sur la science plutôt que de passer trop de temps à adapter leur code pour différents systèmes. Une variété d'outils et de bibliothèques existent pour aider à atteindre cet objectif.
L'Évolution de l'Informatique en PHE
La physique des hautes énergies a évolué de manière significative au fil des ans. Les premières expériences dépendaient principalement des processeurs informatiques classiques. Ces processeurs pouvaient effectuer les calculs nécessaires, mais avaient du mal avec l'augmentation du volume de données généré par les expériences de PHE.
Au fur et à mesure que les exigences de données croissaient, les chercheurs se sont tournés vers des centres de calcul haute performance (HPC). Ces centres offrent un accès à un plus grand pool de ressources informatiques, y compris les CPU et les GPU. L'utilisation des GPU est devenue particulièrement importante car ces unités sont conçues pour gérer de nombreuses tâches simultanément, ce qui les rend bien adaptées aux types de calculs requis dans les expériences de PHE.
Le Défi de la Portabilité des Logiciels vers les GPU
Déplacer des algorithmes PHE existants vers des GPU n'est pas une tâche simple. Ce processus nécessite souvent une réécriture significative du code en raison des différences de fonctionnement entre les GPU et les CPU. Par exemple, les modèles de programmation utilisés pour les CPU peuvent ne pas fonctionner directement sur les GPU, et vice versa.
Les efforts initiaux pour porter des algorithmes sur les GPU impliquaient généralement de réécrire le code pour utiliser des langages de programmation spécifiques aux GPU, comme CUDA (pour les GPU NVIDIA) ou HIP (pour les GPU AMD). Cela peut être un processus laborieux et peut seulement permettre au code de s'exécuter sur un type de GPU. De plus, optimiser les Performances lors du passage à une autre plateforme matérielle peut être un vrai casse-tête.
Le Rôle des Outils de Portabilité
Pour résoudre les problèmes de portage de code, plusieurs outils ont été développés pour faciliter l'exécution du même code sur plusieurs architectures. Ces outils peuvent prendre différentes formes, y compris des bibliothèques, des directives de compilateur et des frameworks autonomes.
Parmi les outils de portabilité les plus populaires en PHE, on trouve :
Kokkos : Une bibliothèque de programmation qui aide à écrire du code pouvant fonctionner sur différentes plateformes informatiques. Elle propose diverses façons de gérer les données et d'exécuter le code, aidant à rationaliser le processus d'adaptation des algorithmes pour différents matériels.
Alpaka : Une bibliothèque qui se concentre sur l'obtention de performances à travers différentes architectures. Elle utilise une approche de programmation par modèles, permettant aux développeurs d'écrire du code pouvant être compilé pour différents types de matériel.
OpenMP et OpenACC : Ce sont des modèles de programmation basés sur des directives qui permettent aux développeurs d'annoter leur code existant, aidant les compilateurs à comprendre comment paralléliser le code et gérer les données sur différents matériels.
SYCL : Un modèle de programmation qui vise à simplifier l'écriture de code pour des systèmes hétérogènes, permettant aux développeurs d'utiliser des langages de programmation standards tout en ciblant divers types de matériel.
Politiques d'Exécution C++ Standard : Introduites dans C++17, ces politiques fournissent un moyen d'exprimer l'exécution parallèle dans les bibliothèques C++ existantes, permettant une plus grande flexibilité sur la manière dont le code est exécuté sur différents systèmes.
Comparaison des Performances
Pour déterminer l'efficacité de ces solutions de portabilité, les chercheurs créent souvent des algorithmes de référence. Ces benchmarks servent de tests pour mesurer la performance des différents outils de portabilité sur des calculs spécifiques.
Dans des études récentes, les chercheurs ont utilisé des algorithmes de référence autonomes qui imitent le traitement impliqué dans les expériences de PHE. Ils se sont concentrés sur des aspects tels que la propagation des traces et les mises à jour, qui sont des étapes critiques pour analyser les interactions des particules.
Ces benchmarks ont été mis en œuvre de différentes manières en utilisant les différentes solutions de portabilité. Chaque solution a été testée sur plusieurs types de matériels informatiques, y compris différentes marques et architectures de CPU et GPU.
Les résultats ont montré que, bien que beaucoup de solutions de portabilité offraient des niveaux de performance similaires par rapport aux mises en œuvre traditionnelles, atteindre des performances optimales n'était souvent pas facile. Chaque solution nécessitait une compréhension approfondie à la fois de l'algorithme utilisé et des caractéristiques du matériel sous-jacent pour exploiter pleinement ses capacités.
CPU vs. GPU en PHE
Lors de la comparaison des CPU et des GPU, plusieurs facteurs entrent en jeu :
Puissance de calcul : Les GPU sont généralement mieux adaptés aux tâches nécessitant un traitement parallèle en raison de leur conception. Ils peuvent gérer de nombreux calculs simples simultanément, ce qui est souvent nécessaire dans l'analyse de données PHE.
Volume de données : Alors que les expériences de PHE génèrent d'énormes quantités de données, la capacité à traiter ces données rapidement est cruciale. Bien que les CPU puissent bien gérer des calculs complexes, les GPU ont souvent des performances plus rapides pour les tâches pouvant être divisées en parties plus petites.
Temps de développement : Porter du code des CPU vers les GPU peut prendre du temps, nécessitant souvent une refonte complète des algorithmes existants. Donc, les chercheurs doivent peser les avantages de performances plus rapides par rapport au temps passé sur l'adaptation du code.
Exploration des Algorithmes de Référence
Les benchmarks utilisés pour évaluer la performance des outils de portabilité impliquaient deux étapes clés dans la reconstruction des traces : la propagation des traces et la mise à jour de Kalman. Chaque étape nécessite des calculs intensifs pour analyser la trajectoire des particules chargées.
Les benchmarks étaient conçus pour fonctionner à la fois avec des CPU et des GPU, évaluant comment chaque outil de portabilité a adapté les algorithmes pour les différents types de matériel. En se concentrant sur la reconstruction des traces, les chercheurs pouvaient évaluer efficacement la performance des différents systèmes sous la même charge de travail.
Résultats des Tests des Outils de Portabilité
Les résultats de performance des différentes solutions de portabilité ont montré que la plupart des outils pouvaient produire des résultats dans une plage similaire à celle des mises en œuvre natives. Cependant, atteindre cela nécessitait un réglage soigné et des optimisations basées sur l'architecture spécifique utilisée.
Pour les mises en œuvre GPU, des outils tels que Kokkos et Alpaka se sont révélés efficaces pour fournir des performances proches de celles des mises en œuvre natives en CUDA. Cependant, les deux outils nécessitaient encore un travail significatif en termes d'optimisation et de configuration pour obtenir les résultats souhaités.
Les solutions basées sur des directives, OpenMP et OpenACC, offraient un moyen plus simple de porter le code existant sur les CPU pour qu'il fonctionne sur les GPU. Bien qu'elles ne puissent pas toujours égaler les performances des langages de programmation GPU spécialisés, elles permettaient une transition plus progressive avec moins d'efforts de développement initiaux.
L'implémentation SYCL offrait un moyen facile d'intégrer le code GPU dans les applications C++ existantes. Cependant, les performances avaient tendance à être inférieures par rapport à d'autres options en raison de sa dépendance à divers optimisations de compilateur.
Impact des Choix de Compilateur
Le choix du compilateur peut avoir un impact significatif sur les performances des mises en œuvre portables. Différents compilateurs offrent différents niveaux d'optimisation et de support pour des fonctionnalités matérielles spécifiques, entraînant des écarts notables dans les temps d'exécution.
Par exemple, certains compilateurs peuvent rencontrer des difficultés à gérer certaines tâches de Gestion de la mémoire, tandis que d'autres pourraient offrir des solutions efficaces pour optimiser le transfert de données entre les CPU et les GPU. Par conséquent, les chercheurs sont encouragés à tester régulièrement leurs mises en œuvre avec les dernières versions de compilateurs pour tirer parti des améliorations continues des outils.
Considérations sur la Gestion de la Mémoire
Une gestion efficace de la mémoire est cruciale pour optimiser les performances dans les applications portables. Par exemple, des techniques comme le pré-assignement de mémoire peuvent considérablement améliorer les vitesses de transfert de données entre la mémoire CPU et GPU.
En s'assurant que les données nécessaires sont prêtes à l'accès lorsqu'elles sont nécessaires, les développeurs peuvent minimiser le temps passé à attendre que les opérations de mémoire se terminent. Ces stratégies de gestion de la mémoire peuvent conduire à d'importants gains de débit, en particulier dans les mises en œuvre GPU.
Vers l'Avenir : L'Avenir de la Portabilité en PHE
À mesure que les expériences PHE continuent d'évoluer, il y a un besoin croissant de solutions de portabilité efficaces qui peuvent s'adapter à de nouveaux matériels et paradigmes informatiques. Le développement de nouveaux outils et frameworks sera vital pour maintenir les progrès réalisés dans le domaine de la physique des hautes énergies.
Dans les années à venir, les scientifiques verront probablement de nouvelles avancées dans les outils de portabilité, menant à de meilleures performances cross-platform et à une meilleure convivialité. La collaboration continue entre les développeurs, les chercheurs et les centres de calcul jouera un rôle crucial dans l'avancement de ces innovations.
De plus, à mesure que de nouvelles architectures informatiques apparaissent et que les systèmes existants sont mis à jour, les chercheurs en PHE bénéficieront d'un ensemble robuste d'outils de portabilité à leur disposition. Cela garantira qu'ils peuvent suivre le rythme des demandes toujours croissantes placées sur leurs ressources informatiques, leur permettant d'explorer plus en profondeur les mystères de l'univers.
Conclusion
Une informatique efficace est au cœur des expériences de physique des hautes énergies. À mesure que le domaine de l'analyse des données devient plus complexe, les chercheurs cherchent activement des moyens de tirer parti de ressources informatiques diverses. S'assurer que le logiciel peut fonctionner efficacement sur plusieurs plateformes est crucial pour maintenir le rythme de la découverte scientifique.
Les défis de déplacer des algorithmes existants vers de nouvelles architectures sont significatifs, mais le développement de solutions de portabilité offre des voies prometteuses. Ces outils facilitent non seulement la transition vers les GPU mais aident aussi à garantir que les chercheurs peuvent continuer à se concentrer sur leur objectif principal : comprendre la nature fondamentale de notre univers. En investissant dans la portabilité et l'adaptation, le domaine de la physique des hautes énergies peut continuer à prospérer dans cette ère passionnante et riche en données.
Titre: Exploring code portability solutions for HEP with a particle tracking test code
Résumé: Traditionally, high energy physics (HEP) experiments have relied on x86 CPUs for the majority of their significant computing needs. As the field looks ahead to the next generation of experiments such as DUNE and the High-Luminosity LHC, the computing demands are expected to increase dramatically. To cope with this increase, it will be necessary to take advantage of all available computing resources, including GPUs from different vendors. A broad landscape of code portability tools -- including compiler pragma-based approaches, abstraction libraries, and other tools -- allow the same source code to run efficiently on multiple architectures. In this paper, we use a test code taken from a HEP tracking algorithm to compare the performance and experience of implementing different portability solutions.
Auteurs: Hammad Ather, Sophie Berkman, Giuseppe Cerati, Matti Kortelainen, Ka Hei Martin Kwok, Steven Lantz, Seyong Lee, Boyana Norris, Michael Reid, Allison Reinsvold Hall, Daniel Riley, Alexei Strelchenko, Cong Wang
Dernière mise à jour: 2024-09-13 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://arxiv.org/abs/2409.09228
Source PDF: https://arxiv.org/pdf/2409.09228
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.
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Liens de référence
- https://www.ctan.org/
- https://zendesk.frontiersin.org/hc/en-us/articles/360017860337-Frontiers-Reference-Styles-by-Journal
- https://wlcg.web.cern.ch/using-wlcg/monitoring-visualisation/monthly-stats
- https://github.com/intel/llvm/tree/70c2dc6dcf73f645248aa7c70c8cefdabf37e9b7
- https://www.overleaf.com/project/63bf2bc358cc778b832ce13elts
- https://www.frontiersin.org/about/policies-and-publication-ethics#AuthorshipAuthorResponsibilities
- https://energy.gov/downloads/doe-public-access-plan
- https://github.com/cerati/p2z-tests/releases/tag/v1.0
- https://github.com/cerati/p2r-tests/releases/tag/v1.0
- https://www.frontiersin.org/about/author-guidelines#AvailabilityofData