Forschung an Obstfliegen gibt Einblicke in die Parkinson-Krankheit
Die Studie nutzt Fruchtfliegen, um Bewegungen im Zusammenhang mit Parkinson zu verstehen.
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Inhaltsverzeichnis
Die Parkinson-Krankheit (PD) ist eine Erkrankung, die das Gehirn betrifft und zu Bewegungsproblemen führt. Sie entsteht durch den Verlust bestimmter Nervenzellen im Gehirn, die einen chemischen Stoff namens Dopamin produzieren. Dieser Verlust kann Symptome wie Zittern, Steifheit und Schwierigkeiten mit Gleichgewicht und Koordination nach sich ziehen. Im Laufe der Jahre hat die Zahl der Menschen, bei denen PD diagnostiziert wurde, zugenommen.
Forscher haben herausgefunden, dass ein Hauptgrund für PD die Schädigung von Neuronen (Nervenzellen) in einem bestimmten Teil des Gehirns ist, der als Substantia nigra bezeichnet wird. Dieser Bereich ist entscheidend für die Steuerung der Bewegungen. Ausserdem haben Wissenschaftler abnormale Strukturen, sogenannte Lewy-Körper, im Gehirn von Menschen mit PD identifiziert. Diese Körper bestehen aus einem Protein namens Alpha-Synuclein, das falsch gefaltet ist.
Um PD zu studieren, verwenden Wissenschaftler oft eine kleine Fruchtfliege, bekannt als Drosophila Melanogaster, als Modellorganismus. Durch bestimmte genetische Veränderungen, wie z.B. eine spezifische Mutation im Alpha-Synuclein-Gen, können sie Fruchtfliegen erzeugen, die die Erkrankung nachahmen. So können Forscher untersuchen, wie PD sich entwickelt und die Bewegung beeinflusst.
Vorteile der Verwendung von Fruchtfliegen
Die Verwendung von Fruchtfliegen in der Forschung hat im Vergleich zu anderen Tiermodellen wie Mäusen oder Affen mehrere Vorteile. Fruchtfliegen sind kleiner, vermehren sich schnell und zeigen klare physische und Verhaltensänderungen, die man beobachten kann. Allerdings kann es schwierig sein, ihr Verhalten zu studieren, wegen der Einschränkungen aktueller Beobachtungstechniken. Daher brauchen Forscher bessere Methoden, um verschiedene Verhaltensweisen bei Fruchtfliegen zu klassifizieren und zu messen.
Kürzlich wurden verschiedene Softwaretools entwickelt, die Wissenschaftlern helfen, die Bewegungen von Fruchtfliegen zu verfolgen und zu analysieren. Diese Tools erleichtern es, das Verhalten der Fruchtfliegen zu verstehen und können Licht auf die Auswirkungen von PD werfen.
Forschungsübersicht
In dieser Studie verglichen die Forscher normale Fruchtfliegen mit denen, die die E46K-Mutation im Alpha-Synuclein-Gen haben, die mit PD assoziiert ist. Sie wollten die spontanen Bewegungen dieser beiden Fliegenarten klassifizieren und besser verstehen, wie PD das Verhalten beeinflusst.
Um die Bewegungen zu analysieren, verwendeten die Forscher eine Software namens DeepLabCut, die hilft, die Position der Körperteile der Fruchtfliegen zu verfolgen, ohne physische Marker verwenden zu müssen. Diese Software ermöglichte es den Forschern, detaillierte Informationen über die Körperhaltung zu sammeln, während die Fliegen in einer speziell gestalteten Falle liefen.
Durch die Verarbeitung der gesammelten Daten erstellten die Forscher ein System, um PD bei Fruchtfliegen basierend auf ihren Bewegungen und Verhaltensweisen zu diagnostizieren. Dieses Tool soll eine zuverlässige Möglichkeit bieten, die neuronalen Mechanismen hinter PD bei Fruchtfliegen zu bewerten.
Studienmaterialien und -methoden
Die Studie umfasste zwei Arten von Fruchtfliegen: eine normale Linie namens Oregon R und die genetisch veränderte Linie mit der E46K-Mutation. Beide Typen wurden unter kontrollierten Bedingungen gehalten, um die Genauigkeit der Experimente sicherzustellen.
Die Forscher zeichneten die Bewegungen der Fruchtfliegen mit einem Mikroskop-Setup auf und nahmen Videos ihrer Aktivitäten auf. Sie sammelten insgesamt 40 Videos zur Analyse. Für die Datenanalyse verwendeten sie DeepLabCut, passten die Videos für eine bessere Effizienz an und extrahierten wichtige Frames, um die Software zu trainieren, die Körperbewegungen zu verfolgen.
Mit der trainierten Software konnten die Forscher neun spezifische Körperteile der Fruchtfliegen verfolgen. Jedes Körperteil lieferte Daten zu Bewegungsbahnen, die die Forscher weiter verarbeiteten, um zu bewerten, wie sich die Fliegen bewegten.
Bewegungsdaten analysieren
Die Forscher erstellten Heatmaps, um die Bewegungsmuster der Fruchtfliegen zu visualisieren. Sie berechneten verschiedene Merkmale wie Geschwindigkeit und Beschleunigung, um die Unterschiede zwischen normalen und PD-betroffenen Fliegen zu analysieren. Allerdings fanden sie heraus, dass grundlegende kinematische Masse allein nicht ausreichten, um die beiden Gruppen effektiv zu unterscheiden.
Bedeutende Verhaltensunterschiede
Während grundlegende Bewegungsdaten keinen klaren Unterschied zwischen den beiden Gruppen zeigten, offenbarte die Studie bemerkenswerte Unterschiede in spezifischen Verhaltensweisen. PD-Fruchtfliegen zeigten stereotype Bewegungen, die sie von ihren normalen Gefährten abhoben. Die Forscher identifizierten zehn unterschiedliche Bewegungsmuster, wobei zwei spezifische Typen, die mit PD in Verbindung stehen, besonders hervorstachen: ein Typ, der mit Reibbewegungen der Vorderbeine verbunden war, und ein anderer, der schnelle seitliche Bewegungen anzeigte.
Diese Ergebnisse deuteten darauf hin, dass, obwohl Geschwindigkeit und Beschleunigung ähnlich waren, die Art und Weise, wie die Fliegen ihre Gliedmassen benutzten, wichtige Unterschiede im Zusammenhang mit PD offenbarte.
Diagnose-System aufbauen
Um das Verständnis des Verhaltens von Fruchtfliegen in Bezug auf PD weiter zu verbessern, entwickelten die Forscher ein tiefenlernbasiertes System zur Diagnose der Erkrankung. Dieses System kombinierte verschiedene Bewegungsmerkmale und -muster, um die Fruchtfliegen genau zu klassifizieren.
Mit verschiedenen Machine-Learning-Modellen wollten die Forscher die normalen Fliegen von denen, die von PD betroffen sind, basierend auf ihrem Verhalten trennen. Das Fine Tree-Modell schnitt am besten ab und erzielte ein hohes Genauigkeitsniveau bei der korrekten Diagnose der Erkrankung. Das zeigt vielversprechende Ansätze für zukünftige Forschung und Diagnose von PD in komplexeren Umgebungen.
Fazit
Die Parkinson-Krankheit betrifft weltweit Millionen und kann die Lebensqualität erheblich beeinträchtigen. Diese Studie hebt die Verwendung von Drosophila melanogaster als leistungsstarkes Modell zur Erforschung von PD hervor. Durch den Einsatz moderner Technologie und Software zur Bewegungsverfolgung können Wissenschaftler bessere Einblicke in die Mechanismen der Krankheit gewinnen.
Das in dieser Forschung entwickelte Diagnosesystem hat das Potenzial, ein wertvolles Werkzeug für künftige Studien zu sein, um genauere Beobachtungen und Bewertungen von PD-bezogenen Verhaltensweisen zu ermöglichen. Während unser Verständnis von PD sich verbessert, können wir auf bessere Behandlungen und Lösungen für diejenigen hoffen, die von dieser herausfordernden Erkrankung betroffen sind.
Titel: Deep Learning Behavioral Phenotyping System in the Diagnosis of Parkinson's Disease with Drosophila melanogaster
Zusammenfassung: Drosophila Melanogaster is widely used as animal models for Parkinsons disease (PD) research. Because of the complexity of MoCap and quantitative assessment among Drosophila Melanogaster, however, there is a technical issue that identify PD symptoms within drosophila based on objective spontaneous behavioral characteristics. Here, we developed a deep learning framework generated from kinematic features of body posture and motion between wildtype and SNCAE46K mutant drosophila genetically modeled {square}-Syn, supporting clustering and classification of PD individuals. We record locomotor activity in a 3D-printed trap, and utilize the pre-analysis pose estimation software DeepLabCut (DLC) to calculate and generate numerical data representing the motion speed, tremor frequency, and limb motion of Drosophila Melanogaster. By plugging these data as the input, the diagnosis result (1/0) representing PD or WT as the output. Our result provides a toolbox which would be valuable in the investigation of PD progressing and pharmacotherapeutic drug development.
Autoren: Kang Huang, K. Dong, A. Burch
Letzte Aktualisierung: 2024-02-24 00:00:00
Sprache: English
Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.23.581846
Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.23.581846.full.pdf
Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
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