Die Auswirkungen von PITAR auf das Fortschreiten von Glioblastomen
Forschung zeigt, wie PITAR Glioblastom beeinflusst, indem es p53 hemmt.
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Inhaltsverzeichnis
Lange Zeit dachte man, dass Teile unserer DNA nutzlos seien, oft als "Junk-DNA" bezeichnet. Aber die Forschung hat gezeigt, dass viele dieser Segmente tatsächlich wichtig sind und in lange nicht-codierende RNAs (LncRNAs) umgewandelt werden. Diese lncRNAs spielen eine wichtige Rolle in verschiedenen biologischen Prozessen und sind mit Krankheiten, einschliesslich Krebs, verbunden.
LncRNAs sind länger als 500 Basenpaare und haben spezielle Eigenschaften, die sie einzigartig machen. Sie können auf unterschiedliche Weise mit DNA, RNA und Proteinen interagieren und das Verhalten und die Funktionen von Zellen beeinflussen. Sie helfen dabei, die Struktur der Chromatin zu modifizieren, was das Material ist, aus dem Chromosomen bestehen, und sie steuern die Aktivität bestimmter zellulärer Strukturen ohne Membranen. Ausserdem beeinflussen sie die Stabilität und Translation von messenger RNAs (mRNAs) und können Signalwege innerhalb von Zellen stören.
Die Rolle von P53 bei der Zellregulation
Ein wichtiges Protein, das für die Integrität unseres genetischen Materials unerlässlich ist, heisst p53. Dieses Protein wird oft als der "Wächter des Genoms" bezeichnet, weil es hilft, zu verhindern, dass Zellen krebsartig werden. Wenn es zu Stress kommt, wie z.B. bei DNA-Schäden, wird p53 aktiviert und beginnt zu arbeiten, indem es verschiedene Gene einschaltet, die wichtige Prozesse kontrollieren, wie den Zellzyklus, programmierte Zellsterblichkeit (Apoptose) und Alterung (Seneszenz).
In vielen Krebserkrankungen ist p53 mutiert, was bedeutet, dass es seine schützenden Funktionen nicht effektiv ausführen kann. Selbst in Krebserkrankungen, in denen p53 nicht mutiert ist, können andere Faktoren es inaktivieren. Zu verstehen, wie p53 funktioniert und wie seine Aktivität reguliert wird, ist wichtig für die Entwicklung neuer Krebsbehandlungen.
LncRNAs und ihre Interaktion mit p53
Die Forschung hat gezeigt, dass bestimmte lncRNAs signifikante Beziehungen zum p53-Weg haben. Einige lncRNAs fungieren als Helfer oder Aktivatoren von p53, während andere seine Funktionen hemmen können. In unserer Studie haben wir eine spezifische lncRNA namens PITAR (p53 Inactivating TRIM28 associated RNA) entdeckt, die p53 hemmt und mit dem Tumorwachstum in Verbindung steht.
PITAR ist stark in Glioblastomen exprimiert, einer Art von Hirntumor, und interagiert mit TRIM28, einem Protein, das p53 negativ reguliert. Normalerweise fördert TRIM28 den Abbau von p53 durch Prozesse wie Ubiquitinierung, die Proteine für die Zerstörung markieren. Indem PITAR TRIM28 stabilisiert, erhöht es die Mengen dieses Proteins, was zu einem verstärkten Abbau von p53 führt.
Studienziele und Ergebnisse
Das Hauptziel unserer Forschung war es, zu verstehen, wie PITAR Glioblastome beeinflusst und Einblicke in sein Potenzial als therapeutisches Ziel zu gewinnen. Durch unsere Studien haben wir einige wichtige Punkte identifiziert:
PITAR-Expression in Glioblastom: Wir fanden heraus, dass PITAR in Glioblastom-Gewebe und in gliomastammähnlichen Zellen, die oft resistent gegen Therapien sind, signifikant hochreguliert ist.
Wirkungen der PITAR-Stilllegung: Als wir die PITAR-Spiegel in Gliomazellen reduzierten, bemerkten wir einen Rückgang der Zellproliferation und einen Anstieg des Krebszellsterbens. Das deutete darauf hin, dass PITAR das Tumorwachstum fördert und für das Überleben von Gliomzellen unerlässlich ist.
Interaktion mit TRIM28: Wir entdeckten, dass PITAR direkt an TRIM28-mRNA bindet, was zu einer grösseren Stabilität von TRIM28 und erhöhten Mengen dieses Proteins führt.
Einfluss auf die p53-Spiegel: Durch die Hochregulierung von TRIM28 führte PITAR auch zu niedrigeren Spiegeln von aktivem p53 und zeigte somit, dass PITAR die Funktionen von p53 hemmt.
Reaktion auf DNA-Schäden: Interessanterweise nahmen die PITAR-Spiegel als Reaktion auf DNA-Schäden zu, aber dieser Anstieg geschah unabhängig von p53. Das bedeutet, dass selbst wenn die DNA beschädigt ist, die Wirkung von PITAR verhindern könnte, dass p53 effektiv reagiert, was das Tumorwachstum fördert und zu einer Resistenz gegen Behandlungen wie Chemotherapie führt.
Experimentelle Methoden
Wir führten eine Reihe von Experimenten durch, um unsere Ergebnisse zu validieren und die Rolle von PITAR bei Glioblastomen zu erklären. Hier sind einige wichtige Methoden, die wir verwendet haben:
Zelllinienstudien
Wir verwendeten verschiedene Gliomzelllinien, um die Expression von PITAR und deren Auswirkungen auf das Zellverhalten zu untersuchen. Durch die Stilllegung von PITAR konnten wir den Einfluss auf Zellwachstum, Überleben und Reaktion auf DNA-schädigende Agenzien wie Chemotherapeutika bewerten.
RNA-Sequenzierung und Genanalyse
Mit RNA-Sequenzierungstechniken identifizierten wir differenziell exprimierte Gene in Glioblastom-Proben. Indem wir die Genexpressionsprofile zwischen normalen und krebsartigen Geweben und zwischen gliomastammähnlichen und differenzierten Zellen verglichen, konnten wir Gene wie PITAR pinpointen, die spezifisch in Krebs hochreguliert sind.
Interaktionsstudien
Um zu untersuchen, wie PITAR mit anderen Molekülen interagiert, führten wir RNA-Pull-Down-Assays durch, um zu bestätigen, dass PITAR an TRIM28-mRNA bindet. Ausserdem verwendeten wir Luciferase-Assays, um die Auswirkungen von PITAR auf TRIM28-Transkripte zu messen.
Tiermodelle
Wir testeten die Auswirkungen von PITAR-Stilllegung und -Überexpression in Mausmodellen von Glioblastomen, um zu sehen, wie sich dies auf das Tumorwachstum und das Überleben auswirkte. Diese Experimente verdeutlichten die Bedeutung von PITAR in vivo.
Ergebnisse
Erhöhte PITAR-Spiegel in Glioblastomen
Unsere Analyse zeigte, dass PITAR signifikant in Glioblastom-Geweben überexprimiert ist und positiv mit Tumormarkern korreliert. Das führte uns zu der Hypothese, dass PITAR eine entscheidende Rolle in der Gliom-Biologie spielen könnte.
Wirkungen der PITAR-Stilllegung
Als wir PITAR in Gliomzelllinien stilllegten, beobachteten wir einen deutlichen Rückgang der Zellproliferation, erhöhten Zellsterbens und eine erhöhte Sensitivität gegenüber Chemotherapie. Das wies darauf hin, dass PITAR für das Wachstum und Überleben von Gliomzellen entscheidend ist.
Wirkmechanismus
Wir stellten fest, dass PITAR die TRIM28-Spiegel erhöht, indem es dessen mRNA vor Abbau schützt. Der Anstieg von TRIM28 führte zu einem verstärkten Abbau von p53, was die Rolle von PITAR als p53-Hemmer bestätigte.
Rolle in der DNA-Schadenreaktion
PITAR-Spiegel stiegen, wenn Zellen DNA-schädigenden Agenzien ausgesetzt waren. Allerdings schien die Präsenz von PITAR die Wirksamkeit von p53 bei der Reaktion auf diesen Stress zu verringern, was das Überleben des Tumors erleichtert und die Resistenz gegen Behandlungen fördert.
Diskussion
Bedeutung der Ergebnisse
Die Beziehung zwischen PITAR, TRIM28 und p53 zeigt ein komplexes Zusammenspiel in der Krebsbiologie. Indem PITAR p53 hemmt, ermöglicht es Gliomzellen, den typischen zellulären Antworten auf Stress zu entkommen, die entscheidend zur Verhinderung der Tumorentwicklung sind.
Potenzielles therapeutisches Ziel
Angesichts seiner Rolle beim Tumorwachstum und der Verschaffung von Resistenz gegen Behandlungen könnte PITAR ein vielversprechendes Ziel für neue Therapien zur Glioblastombehandlung sein. Interventionen, die darauf abzielen, die PITAR-Spiegel zu senken, könnten die Funktionen von p53 wiederherstellen und die Wirksamkeit bestehender Behandlungen verbessern.
Zukünftige Richtungen
Weitere Forschungen sind notwendig, um zu erkunden, wie PITAR effektiv angegriffen werden kann, und um die breiteren Implikationen seiner Rolle in anderen Krebsarten zu verstehen. Strategien zu entwickeln, die die Interaktion zwischen PITAR und TRIM28 stören, könnte neue Wege für die Behandlung von Glioblastomen öffnen.
Fazit
Unsere Studie zeigt, dass PITAR eine bedeutende Rolle im Fortschreiten von Glioblastomen spielt, indem es p53 durch seine Assoziation mit TRIM28 hemmt. Diese onkogene lncRNA unterstützt nicht nur das Tumorwachstum, sondern trägt auch zur Resistenz gegen Therapien bei, was die Notwendigkeit gezielter Interventionen verdeutlicht.
Das Verständnis, dass nicht-codierende RNAs, die zuvor als "Junk" abgetan wurden, wesentliche Rollen in der Krebsbiologie spielen, verdeutlicht die sich entwickelnde Landschaft der Krebsforschung. Während wir weiterhin die Komplexität des Genoms entfalten, könnte das gezielte Angreifen dieser nicht-codierenden Moleküle innovative Lösungen für die Krebsbehandlung bieten und die Patientenergebnisse verbessern.
Titel: PITAR, a DNA damage-inducible Cancer/Testis long noncoding RNA, inactivates p53 by binding and stabilizing TRIM28 mRNA
Zusammenfassung: In tumors with WT p53, alternate mechanisms of p53 inactivation are reported. Here, we have identified a long noncoding RNA, PITAR (p53 Inactivating TRIM28 associated RNA), as an inhibitor of p53. PITAR is an oncogenic Cancer/testis lncRNA and is highly expressed in glioblastoma (GBM) and glioma stem-like cells (GSC). We establish that TRIM28 mRNA, which encodes a p53-specific E3 ubiquitin ligase, is a direct target of PITAR. PITAR interaction with TRIM28 RNA stabilized TRIM28 mRNA, which resulted in increased TRIM28 protein levels and reduced p53 steady-state levels due to enhanced p53 ubiquitination. DNA damage activated PITAR, in addition to p53, in a p53-independent manner, thus creating an incoherent feedforward loop to inhibit the DNA damage response by p53. While PITAR silencing inhibited the growth of WT p53 containing GSCs in vitro and reduced glioma tumor growth in vivo, its overexpression enhanced the tumor growth in a TRIM28-dependent manner and promoted resistance to Temozolomide. Thus, we establish an alternate way of p53 inactivation by PITAR, which maintains low p53 levels in normal cells and attenuates the DNA damage response by p53. Finally, we propose PITAR as a potential GBM therapeutic target.
Autoren: Kumaravel Somasundaram, S. Jana, M. Mondal, S. Mahale, B. Gupta, K. R. Prasasvi, L. Kandasami, N. Jha, A. Chowdhury, V. Santosh, C. Kanduri
Letzte Aktualisierung: 2024-04-01 00:00:00
Sprache: English
Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.04.11.536370
Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.04.11.536370.full.pdf
Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Änderungen: Diese Zusammenfassung wurde mit Unterstützung von AI erstellt und kann Ungenauigkeiten enthalten. Genaue Informationen entnehmen Sie bitte den hier verlinkten Originaldokumenten.
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Referenz Links
- https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/
- https://rna.informatik.uni-freiburg.de/IntaRNA/Input.jsp
- https://tcga-data.nci.nih.gov/tcga/
- https://broadinstitute.github.io/picard/
- https://www.gencodegenes.org/releases/19.html
- https://tools.altiusinstitute.org/tcga/?gene=FAM95B1
- https://www.broad.mit.edu/gsea/
- https://bioinf.wehi.edu.au/software/elda/