Die Auswirkungen genetischer Veränderungen auf die Resistenz von Würmern gegenüber Behandlungen
Untersuchen, wie genetische Veränderungen die Wirksamkeit von Medikamenten gegen im Boden lebende Würmer beeinflussen.
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Inhaltsverzeichnis
- Widerstand verstehen
- Das Forschungsproblem
- Ziel der Studie
- Ethik der Studie
- Methoden zur Analyse genetischer Veränderungen
- Sammlung und Verarbeitung der Proben
- Ergebnisse zu genetischen Veränderungen
- Bewertung der Genauigkeit und Zuverlässigkeit der Methoden
- Diskussion über Umwelteinflüsse
- Auswirkungen auf zukünftige Forschung
- Herausforderungen bei der Probenentnahme und -analyse
- Bedeutung der genauen Quantifizierung
- Fazit
- Originalquelle
In vielen Ländern haben schulkinder oft gesundheitliche Probleme durch Infektionen, die von im Boden lebenden Würmern verursacht werden, wie Rundwürmer, Peitschenwürmer und Hakenwürmer. Diese Infektionen können zu ernsthaften gesundheitlichen Problemen führen, weshalb es wichtig ist, effektive Behandlungsmethoden zu finden. Zwei gängige Medikamente zur Behandlung dieser Infektionen sind Albendazol (ALB) und Mebendazol (MEB). Diese Medikamente sind bei vielen Kindern wirksam und ihre Anwendung ist weit verbreitet in schulbasierten Entwurmungsprogrammen.
Im Jahr 2022 erhielten etwa 390 Millionen Kinder diese Medikamente, was rund 62% der gefährdeten Kinder abdeckte, die ernsthafte Gesundheitsprobleme durch diese Wurminfektionen bekommen könnten. Die Weltgesundheitsorganisation (WHO) hofft, die Häufigkeit schwerer Infektionen bis 2030 unter 2% zu senken. Allerdings gibt es wachsende Bedenken, dass eine langfristige Anwendung dieser Medikamente dazu führen kann, dass die Würmer resistent werden.
Widerstand verstehen
Widerstand tritt auf, wenn die Würmer sich an die Medikamente anpassen und sie dadurch weniger wirksam werden. ALB und MEB zielen auf ein spezifisches Protein in den Würmern ab. Wenn diese Medikamente in festen Dosen verabreicht werden, wirken sie möglicherweise nicht so gut für alle Wurmart, die vorhanden sind. Das ist besonders besorgniserregend, weil Resistenzen gegen diese Medikamente bereits bei Tieren festgestellt wurden und dies irgendwann auch die Behandlungen bei Menschen betreffen könnte.
Forschungen zeigen, dass Widerstand mit spezifischen Veränderungen im genetischen Material der Würmer verbunden ist. Diese Änderungen, die als Einzel-Nukleotid-Polymorphismen (SNPs) bezeichnet werden, können in bestimmten Genen auftreten, die wichtig dafür sind, wie die Würmer auf Medikamente reagieren. Zum Beispiel können SNPs an bestimmten Stellen in ihrem genetischen Code direkt die Fähigkeit der Rundwürmer beeinflussen, auf die Behandlung zu reagieren.
Während es klare Beweise dafür gibt, dass diese SNPs bei Tier-Rundwürmern zu Resistenzen führen, ist weniger bekannt, wie sie die menschlichen Würmer beeinflussen. Diese Wissenslücke ist besorgniserregend, denn das Verständnis dieser genetischen Veränderungen könnte helfen, bessere Behandlungsstrategien zu entwickeln.
Das Forschungsproblem
Es gibt mehrere Gründe, warum Informationen darüber, wie diese genetischen Veränderungen menschliche Würmer beeinflussen, rar sind. Erstens gibt es nicht viele Studien, die die Wirksamkeit dieser Medikamente über einen längeren Zeitraum bewertet haben, und viele der vorhandenen Studien haben Designfehler. In einigen Fällen haben die Forscher nicht lange genug nachverfolgt, um zu sehen, ob die Medikamente wirkten.
Zweitens, wenn Studien Genetische Veränderungen untersucht haben, betrafen sie oft nur eine kleine Anzahl von Proben oder waren auf bestimmte geografische Gebiete in bestimmten Ländern beschränkt. Das bedeutet, dass die Ergebnisse möglicherweise nicht überall anwendbar sind. Drittens verwenden unterschiedliche Studien eine Vielzahl von Methoden zur Sammlung und Analyse genetischer Daten, was einen Vergleich der Ergebnisse erschwert.
Ausserdem gibt es einige Unterschiede in der Funktionsweise der Gene bei Tier- und Menschenwürmern, was das Verständnis von Resistenzen komplizierter macht. Daher ist es schwierig zu wissen, auf welche genetischen Veränderungen man sich konzentrieren sollte, um Resistenzen bei menschlichen Würmern effektiv zu verfolgen.
Ziel der Studie
Das Hauptziel dieser Studie war es, mehr darüber herauszufinden, wie genetische Veränderungen bei den Würmern ihre Resistenz gegen Medikamente beeinflussen können. Um dies zu tun, wollten die Forscher sehen, ob bestimmte SNPs in einem spezifischen Gen als Indikatoren für Resistenzen dienen könnten. Sie testeten zuvor entwickelte Methoden zur Analyse genetischen Materials aus verschiedenen Stuhlproben, die während früherer Studien gesammelt wurden, um zu überprüfen, wie gut die Behandlungen funktioniert haben.
Diese Studien fanden an drei verschiedenen Orten statt, wobei alle strenge Richtlinien befolgten, um Konsistenz in der Messung der Wirksamkeit und der Datensammlung zu gewährleisten. Durch den Vergleich der Ergebnisse von diesen Standorten konnten die Forscher nach Mustern suchen, die mit Medikamentenresistenz zusammenhängen.
Ethik der Studie
Bevor die Studien durchgeführt wurden, mussten die Forscher sicherstellen, dass sie ethische Richtlinien einhielten und Genehmigungen von relevanten Gremien einholten. Sie registrierten die Studie auch in klinischen Studien-Datenbanken, um Transparenz zu gewährleisten.
Methoden zur Analyse genetischer Veränderungen
Die Forscher verwendeten einen spezifischen Prozess namens PCR, um das genetische Material aus den gesammelten Stuhlproben zu analysieren. Sie konzentrierten sich auf bestimmte Teile des genetischen Codes, die mit Medikamentenresistenz in Verbindung gebracht werden. Sie wollten sicherstellen, dass ihre Methoden genau und zuverlässig waren.
Um ihre Ergebnisse zu bestätigen, fügten sie Kontrollproben mit bekannten genetischen Eigenschaften hinzu. Ausserdem führten sie Tests durch, um die unteren Nachweisgrenzen und die Genauigkeit ihrer Methoden zu bestimmen.
Sammlung und Verarbeitung der Proben
Die Stuhlproben, die in dieser Studie verwendet wurden, kamen von Kindern, die an drei verschiedenen klinischen Studien in Äthiopien, Laos und der Pemba-Insel beteiligt waren. Diese Studien wurden durchgeführt, um die Wirksamkeit einer Einzeldosis von ALB gegen Wurminfektionen bei schulpflichtigen Kindern zu bewerten. Die Proben wurden gesammelt und verschiedene Testmethoden verwendet, um das Vorhandensein von Würmern zu überprüfen.
Die Forscher hatten vor, zwei Proben-Sets für verschiedene Analysen zu erstellen. Ein Set untersuchte den Zusammenhang zwischen genetischen Veränderungen und der Geschichte der Medikamentennutzung in der Region. Das andere Set konzentrierte sich darauf, wie genetische Veränderungen mit der Wirksamkeit des Medikaments bei den einzelnen Kindern zusammenhingen.
Um die besten Ergebnisse zu erzielen, wählten sie gezielt Proben aus, die vor der Behandlung eine höhere Wurmdichte in ihren Stühlen aufwiesen.
Ergebnisse zu genetischen Veränderungen
Nachdem die Proben aus den Studien analysiert wurden, schauten sich die Forscher an, wie viele und welche genetischen Veränderungen vorhanden waren. Sie entdeckten, dass genetische Veränderungen an verschiedenen Studienstandorten nachweisbar waren, die unterschiedliche Geschichten in der Medikamentennutzung hatten.
Die Gesamtfrequenz dieser genetischen Veränderungen war jedoch niedrig. Die Ergebnisse deuteten darauf hin, dass einige Kinder spezifische genetische Veränderungen hatten, die mit der Wirksamkeit der Behandlung in Verbindung standen, während die meisten keine signifikante Resistenz zeigten.
Die Forscher verglichen auch die genetischen Befunde mit den Reaktionen auf die Behandlungen. Sie wollten sehen, ob es eine Verbindung zwischen dem Vorhandensein dieser genetischen Veränderungen und der Reaktion der Kinder auf das Medikament gab, nachdem sie es erhalten hatten.
Bewertung der Genauigkeit und Zuverlässigkeit der Methoden
Um die Zuverlässigkeit ihrer Analysemethoden zu bewerten, führten die Forscher Tests durch, um zu sehen, wie genau sie genetische Veränderungen identifizieren konnten. Sie fanden heraus, dass ihre Methoden nützliche Informationen lieferten, es aber Einschränkungen und Variationen in den Ergebnissen gab, abhängig von der Wurmart und dem spezifischen genetischen Bereich, den sie untersuchten.
Sie stellten ausserdem fest, dass ihre Tests dazu tendierten, die Häufigkeit einiger genetischer Veränderungen zu überschätzen. Das bedeutet, dass sie zwar einige genetische Veränderungen identifizieren konnten, aber möglicherweise nicht alle Fälle genau erfasst haben.
Diskussion über Umwelteinflüsse
Die Ergebnisse zeigten einige Muster zwischen dem Vorhandensein genetischer Veränderungen und der Geschichte des Medikamentengebrauchs. Zum Beispiel wurden in einigen Regionen, wo die Medikamentennutzung gängiger war, höhere Frequenzen von Resistenzen beobachtet, was mit bisherigen Forschungsergebnissen bei Tieren übereinstimmt.
Allerdings waren die Veränderungen nicht konsistent über die verschiedenen Wurmarten hinweg. Das deutet darauf hin, dass einige genetische Veränderungen eng mit Resistenzen bei bestimmten Wurmarten verbunden sind, aber möglicherweise nicht für andere relevant sind.
Zusätzlich gab es keine klaren Verbindungen zwischen den genetischen Veränderungen in Würmern und ihrer Leistung nach der Behandlung. In manchen Fällen hatten Kinder, die gut auf die Medikation reagierten, dennoch genetische Marker, die mit Resistenzen assoziiert sind.
Auswirkungen auf zukünftige Forschung
Die Ergebnisse unterstreichen die Notwendigkeit detaillierterer Studien, die sich auf genetische Veränderungen bei menschlichen Würmern konzentrieren, insbesondere in Gebieten mit hoher Verwendung von Entwurmungsmedikamenten. Es ist wichtig, diese Veränderungen weiterhin zu überwachen, um Behandlungsstrategien anzupassen und sicherzustellen, dass sie wirksam bleiben.
Darüber hinaus sollten Forscher auch andere Gene neben β-Tubulin berücksichtigen, wenn sie Resistenzen bewerten. Mit Fortschritten in der Sequenzierungstechnologie wird es möglich sein, die vollständigen Genome dieser Würmer zu analysieren, um andere Faktoren zu identifizieren, die zur Resistenz beitragen könnten.
Herausforderungen bei der Probenentnahme und -analyse
Eine der grössten Herausforderungen während der Studie war die Schwierigkeit, ausreichendes DNA-Material von den Würmern in den gesammelten Stuhlproben zu gewinnen. Die Eier einiger Würmer haben dicke Schutzschichten, die es schwierig machen, genetisches Material zu extrahieren.
Daher konnten viele Proben kein verwertbares DNA-Material liefern. Dies schränkte nicht nur die Menge an genetischen Informationen ein, die verfügbar war, sondern warf auch Fragen zur Zuverlässigkeit der in der Studie berichteten SNP-Häufigkeiten auf.
Um die DNA-Ausbeuten in Zukunft zu verbessern, müssen die Forscher möglicherweise verschiedene Methoden zur Probensammlung in Betracht ziehen oder die Anzahl der analysierten Stuhlproben erhöhen. Sie könnten auch überlegen, Proben von mehreren Individuen zu bündeln, um mehr genetisches Material für Tests zu sammeln.
Bedeutung der genauen Quantifizierung
Obwohl die Forscher spezifische genetische Veränderungen in den Wurm-Populationen identifizieren konnten, stellten sie fest, dass die absolute Quantifizierung dieser Veränderungen hilfreich wäre. Das bedeutet, genau zu wissen, wie viele resistente Würmer in einer Probe vorhanden sind, anstatt nur deren Verhältnisse.
Diese Information könnte zu einem besseren Verständnis und Management der Medikamentenresistenz bei diesen Infektionen führen. Die Erforschung neuer Techniken, die eine präzise Quantifizierung ermöglichen, wird ein wertvolles Werkzeug für zukünftige Studien sein.
Fazit
Zusammenfassend hat diese Studie die Rolle genetischer Veränderungen bei der Resistenz von im Boden lebenden Würmern gegen gängige Medikamente untersucht. Während einige Muster erkennbar waren, gibt es noch viel zu lernen darüber, wie diese Veränderungen mit den Behandlungsergebnissen zusammenhängen.
Zukünftige Forschung sollte sich auf eine breitere Palette von Genen konzentrieren und die Methoden zur Sammlung und Analyse von Proben verbessern. Durch ein besseres Verständnis der genetischen Landschaft dieser Würmer können Gesundheitsinterventionen gezielt angepasst werden, um Infektionen effektiv zu reduzieren und das Auftreten von Resistenzen zu verhindern.
Titel: The assessment of single nucleotide polymorphisms in the ss-tubulin genes in human soil-transmitted helminths exposed to different pressure with benzimidazole drugs
Zusammenfassung: BackgroundWe aimed to gain insights into the role of known single nucleotide polymorphisms (SNPs) in codons 167, 198 and 200 of the {beta}-tubulin gene as markers for possible benzimidazole resistance in human soil-transmitted helminths (STHs; Ascaris lumbricoides, Trichuris trichiura, Necator americanus and Ancylostsoma duodenale). MethodsFirstly, we determined the analytical performance of our PCR/pyrosequencing assays. Secondly, we applied them on stool samples collected during clinical trials in Ethiopia, Lao PDR, and Pemba Island (Tanzania) to assess any associations between the presence/ratio of mutant (MT): wild type (WT) SNPs and drug pressure history, individual drug response and time of sampling (baseline vs. follow-up sample). Principal findingsOverall, the limit of blank of our in-house PCR/pyrosequencing assays to detect MT SNPs was non-zero ([~]3.5%), and hence the limit of detection for MT SNPs was relatively high (2% - 7%). The assays systematically overestimated the true underlying ratio of MT:WT SNPS within sample, but we derived functions for more accurate estimates. The assays were more precise when the ratio MT:WT SNPs was high (>5%). No PCR amplicon was observed in 25% of the samples subjected to PCR. In the remaining samples, the presence of MT SNPs in codon 200 was detected in half of the analysed Trichuris samples, the proportion of the analysed samples containing MT SNPs did not exceed 14% for all other codons and STH species. Associations between drug pressure history, individual drug response and time of sampling, were not consistent across all codons and STHs. ConclusionWe could not provide compelling evidence for the role of the known SNPs in the {beta}-tubulin gene as markers for benzimidazole resistance. Our study also highlights that there is a need to assess the diagnostic performance of any assays in order to readily interpret and compare results. Further research should therefore also focus on genes other than the {beta}-tubulin genes. Author summaryAlthough large-sale deworming programs are reducing the morbidity caused by intestinal worms, widespread treatment of large populations for a long period of time may trigger drug resistance. An early detection of DNA mutations that may give rise to resistant worm population is therefore important. We evaluated the analytical performance of in-house assays to detect DNA mutations that are known to cause resistant intestinal worms of animals. Subsequently, we applied these assays on stool samples to verify (i) whether the mutations are more prevalent in areas were large proportions of children have been dewormed for a longer period, (ii) a poor individual drug response can be explained by higher frequency of the mutations. Our results indicate that comprehensive evaluation of the analytical performance of the genotyping tests was required to readily interpret the results. We did not find any compelling evidence that the presence of mutations was associated with either drug pressure or poor individual drug responses. This suggests that it is warranted to explore other mutations than those documented in animal worms.
Autoren: Bruno Levecke, N. Rashwan, P. Cools, M. Albonico, S. M. Ame, M. Ayana, D. Dana, J. keiser, A. Montresor, Z. Mekonnen, S. Roose, S. Sayasone, J. Vercruysse, J. J. Verweij, J. Vlaminck, R. Prichard
Letzte Aktualisierung: 2024-06-04 00:00:00
Sprache: English
Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.04.597280
Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.04.597280.full.pdf
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