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# Biologie# Evolutionsbiologie

Bakterielle Evolution als Reaktion auf Glyphosat-Exposition

Forschung zeigt, wie Bakterien sich an Glyphosat in Süsswasserumgebungen anpassen.

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Mikrobielle Gemeinschaften, also Gruppen von winzigen Organismen wie Bakterien, sind super wichtig für die Gesundheit von Ökosystemen auf der Erde. Forscher haben untersucht, wie sich diese Gemeinschaften über die Zeit verändern, besonders wenn sie Umweltstressoren wie Verschmutzung oder Klimawandel ausgesetzt sind. Es ist klar, dass sich nicht nur diese Gemeinschaften verändern, sondern auch die einzelnen Bakterien darin sich schnell an ihre Umgebung anpassen können. Das kann erhebliche Auswirkungen haben, besonders wenn Krankheitserreger sich als Reaktion auf Behandlungen entwickeln und beeinflussen, wie Krankheiten verlaufen.

Die Vielfalt innerhalb einer Bakterienart ist entscheidend für die gesamte Gesundheit und Stabilität der Gemeinschaft. Wenn sich eine Bakterienart verändert, kann das die Anzahl anderer Bakterien in der Umgebung beeinflussen. Vielfältigere Gemeinschaften können eine breitere Palette von Bakterien unterstützen und sich besser an Veränderungen anpassen. Zum Beispiel fördern in unserem Darm vielfältige Gemeinschaften tendenziell mehr Vielfalt unter den Bakterien über ein paar Monate hinweg, bis die meisten verfügbaren Rollen besetzt sind. In komplexeren Umgebungen wie Süsswassersystemen tritt dieser Effekt jedoch möglicherweise nicht auf, da viele Nischen bereits besetzt sind.

Studien haben gezeigt, dass bestimmte Stressoren wie Schwermetalle oder Chemikalien aus der Landwirtschaft zu Veränderungen führen können, die unabhängig in Bakterienpopulationen stattfinden. Diese ökologischen Veränderungen und die Art und Weise, wie Bakterien sich zusammen entwickeln, formen die Funktionen der Ökosysteme.

Arten von evolutionären Veränderungen in mikrobielle Gemeinschaften

Wenn es darum geht, wie Bakterien als Reaktion auf Umweltbelastungen evolvieren, gibt es verschiedene Möglichkeiten, wie das geschehen kann. Eine Methode nennt man „selektiver Sweep“, bei der ein Bakterium mit einer vorteilhaften Mutation sich ausbreiten und andere Bakterien übertrumpfen kann. Das kann auf genomweiter Ebene geschehen, was bedeutet, dass die meisten Bakterien in der Population Genetische Vielfalt verlieren, während das bevorzugte Bakterium die Oberhand gewinnt. Andererseits, wenn viel genetisches Material gemischt wird, kann sich ein vorteilhaftes Merkmal ausbreiten, ohne dass die Gesamtvielfalt in der Gemeinschaft komplett verloren geht.

In der Natur ist es selten, vollständige Sweeps in ganzen Populationen zu finden. Selbst wenn Forscher Laborexperimente durchgeführt haben, die diese Sweeps begünstigen sollten, beobachten sie oft, dass die Vielfalt erhalten bleibt. Das liegt daran, dass das Vorhandensein verschiedener vorteilhafter Mutationen oft verhindert, dass ein einzelnes Merkmal komplett dominieren kann. In Umgebungen wie dem menschlichen Darm gibt es einen signifikanten Gen-Austausch zwischen verschiedenen Bakterien, was die Vielfalt fördern kann, anstatt einen vollständigen Sweep zu ermöglichen.

Forschungen in natürlichen Ökosystemen wie Seen haben evolutionäre Muster gezeigt, die mit diesen Sweeps übereinstimmen, aber es ist schwierig zu bestimmen, ob diese Veränderungen durch natürliche Selektion oder einfach durch Zufall entstehen. Einige Studien haben beobachtet, dass Bakterienpopulationen im Laufe der Zeit Vielfalt verloren, während andere Veränderungen feststellten, die auf selektivere Prozesse hinwiesen.

Die Auswirkungen von Agrochemikalien-Verschmutzung

Ein wichtiger Faktor für mikrobielle Gemeinschaften im Boden und Wasser ist die Agrochemikalien-Verschmutzung. Es gibt wachsende Bedenken über Pestizide und Dünger, die aus benachbarten Farmen in Süsswassersysteme gelangen. Glyphosat-haltige Herbizide, die in der Landwirtschaft häufig verwendet werden, sind besonders bemerkenswert. Obwohl Glyphosat dazu neigt, an den Boden zu binden, kann es in Flüsse und Seen gespült werden.

In einigen Regionen gibt es Vorschriften, die die Menge an Glyphosat im Wasser beschränken, aber diese Regeln konzentrieren sich auf die Auswirkungen auf grössere Organismen und ignorieren oft den Einfluss auf Bakterien. Einige Studien haben bereits gezeigt, dass Glyphosat bakterielle Gemeinschaften im Wasser verändern und sogar die Populationen von Honigbienen beeinflussen kann.

Glyphosat wirkt, indem es einen bestimmten Stoffwechselweg in Pflanzen blockiert, der für die Produktion essenzieller Aminosäuren nötig ist. Dieser Weg ist auch bei einigen Bakterien und Pilzen vorhanden, was bedeutet, dass bestimmte Bakterien Resistenzen gegen Glyphosat entwickeln können, sei es durch spezifische genetische Veränderungen oder indem sie Glyphosat aus ihren Zellen entfernen.

Untersuchung der bakteriellen Evolution als Reaktion auf Glyphosat

In unserer Forschung wollten wir sehen, wie Bakterien in natürlichen Gewässern, die mit dem Glyphosat-Herbizid Roundup behandelt wurden, evolvieren. Wir haben Experimente mit kleinen „Teichen“ aufgestellt, die mit Wasser aus einem See gefüllt waren und einige davon Glyphosat ausgesetzt, während andere als Kontrollen dienten. Wir haben über mehrere Wochen Proben gesammelt und die genetischen Informationen der vorhandenen Bakterien analysiert.

Unser Ziel war es zu bewerten, wie sich die Bakterien genetisch als Reaktion auf die Glyphosat-Exposition verändert haben. Wir konzentrierten uns auf mehrere Bakterienarten und überwachten ihre genetische Vielfalt sowohl in den behandelten als auch in den unbehandelten Teichen. Während wir einige Hinweise fanden, dass Glyphosat zu Veränderungen in bestimmten Bakterienpopulationen führte, waren diese Veränderungen nicht immer konsistent über die verschiedenen experimentellen Teiche hinweg.

Wir vermuteten, dass Bakterien, die als empfindlich gegenüber Glyphosat vorhergesagt wurden, stärkeren Selektionsdruck erleben würden im Vergleich zu denen, die als resistent vorhergesagt wurden. Allerdings beobachteten wir keine signifikanten Unterschiede in der gesamten genetischen Vielfalt beider Gruppen nach der Exposition. Stattdessen fanden wir heraus, dass spezifische genetische Veränderungen bei empfindlichen Arten stattfanden, insbesondere in Bezug darauf, wie diese Bakterien Aminosäuren verarbeiten.

Messung von Veränderungen in der bakteriellen Vielfalt

In unseren Experimenten verwendeten wir neun 1000-Liter-Teiche, die mit Wasser aus einem unberührten See gefüllt waren, und überwachten sie über einen Zeitraum von acht Wochen. Vier dieser Teiche erhielten zwei Runden Glyphosat-Behandlung, während die anderen entweder Phosphor als Kontrolle erhielten oder gar keine Behandlung erhielten.

Um herauszufinden, wie viele verschiedene Arten von Bakterien nach der Glyphosat-Exposition in jedem Teich vorhanden waren, zählten wir die Arten basierend auf unseren genetischen Daten. Entsprechend unseren Erwartungen zeigten die mit Glyphosat behandelten Teiche signifikant weniger Arten als die Kontrollteiche. Das deutet darauf hin, dass die Glyphosat-Behandlung einen starken Effekt auf die Diversität der Gemeinschaft hatte.

Die meisten Arten, die wir identifiziert haben, waren anfänglich selten, wurden jedoch nach der Glyphosat-Behandlung häufiger, was darauf hindeutet, dass sie gut an die Teichumgebung angepasst waren.

Selektive Sweeps: Was wir gefunden haben

Wir wollten untersuchen, ob die Exposition gegenüber Glyphosat zu weitreichenden genetischen Veränderungen in den Bakterienpopulationen führte. Wenn Glyphosat vollständige selektive Sweeps verursachte, würden wir eine signifikante Reduzierung der genetischen Vielfalt in den behandelten Teichen erwarten. Wir verfolgten eine resistente Art über die Zeit und bemerkten signifikante Zunahmen der genetischen Vielfalt im Glyphosat-behandelten Teich im Vergleich zu den Kontrollen, was dem Gedanken eines vollständigen selektiven Sweeps widerspricht.

Während einige Populationen mögliche Anzeichen eines Sweeps zeigten, war dies nicht konsistent über verschiedene Teiche hinweg. Diese Inkonsistenz wirft Fragen auf, ob die Veränderungen hauptsächlich durch Selektion gegen Glyphosat oder einfach durch zufällige Ereignisse in den Populationen verursacht wurden.

Die meisten Bakterien behielten auch angesichts der Glyphosat-Behandlung eine beträchtliche genetische Vielfalt, und diese Vielfalt könnte bestehende Variationen darstellen, die es ihnen ermöglichen, sich an Umweltbelastungen anzupassen.

Genetische Ziele der Selektion

Trotz der Tatsache, dass wir keine klaren genomweiten Sweeps beobachteten, gelang es uns, spezifische Gene zu identifizieren, die als Reaktion auf die Glyphosatexposition verändert wurden. Wir haben mehrere Methoden entwickelt, um herauszufinden, welche Gene möglicherweise im Fokus der Selektion standen, basierend auf den Veränderungen, die wir in ihren genetischen Sequenzen aufgezeichnet hatten.

Unsere Analyse ergab, dass viele Gene, die am Stoffwechsel beteiligt sind, insbesondere solche, die mit Aminosäuren zusammenhängen, von der Selektion betroffen waren. Das deutet darauf hin, dass Bakterien, die Glyphosat ausgesetzt waren, sich möglicherweise angepasst haben, indem sie ihre Stoffwechselwege veränderten. Interessanterweise fanden wir heraus, dass Gene, die mit Transkription und Translation zu tun haben, unter der Glyphosatexposition weniger betroffen waren.

Durch unsere zahlreichen Analysen fanden wir heraus, dass es oft die Gene waren, die mit dem Stoffwechsel in Zusammenhang standen, die Zeichen der Veränderung in Reaktion auf Glyphosat zeigten, während andere, die an grundlegenden Zellfunktionen beteiligt waren, weniger betroffen schienen.

Fazit

Diese Forschung trägt zum wachsenden Verständnis darüber bei, wie Bakterien in Reaktion auf Umweltbelastungen evolvieren. Unsere Ergebnisse heben hervor, dass, während weitreichende selektive Sweeps selten sein mögen, spezifische Gene, die mit Stoffwechselprozessen verbunden sind, in bestimmten Bakterien unter starkem Selektionsdruck stehen können. Selbst in Fällen, in denen ganze Populationen sich nicht drastisch aufgrund externer Einflüsse wie Glyphosatexposition verändern, können dennoch signifikante Veränderungen auf der Ebene einzelner Gene stattfinden, was das Potenzial für bakterielle Anpassung zeigt.

Unsere Ergebnisse erinnern uns an die komplexen Beziehungen zwischen Umweltstressoren und mikrobielle Gemeinschaften. Zukünftige Studien können auf diesen Erkenntnissen aufbauen, indem sie die langfristigen Auswirkungen verschiedener Chemikalien auf Bakterien und deren breitere Auswirkungen auf Ökosysteme untersuchen.

Fortlaufende Forschung ist entscheidend, um die Dynamik der mikrobiellen Evolution in der Natur zu entschlüsseln, besonders da sich landwirtschaftliche Praktiken und Umweltfaktoren ändern. Das Verständnis dieser Prozesse ist wichtig, um Strategien zum Schutz von Ökosystemen vor den unbeabsichtigten Folgen menschlicher Aktivitäten zu entwickeln.

Originalquelle

Titel: A glyphosate-based herbicide selects for genetic changes while retaining within-species diversity in a freshwater bacterioplankton community

Zusammenfassung: Bacterial populations evolve rapidly in the lab when faced with experimentally-applied selective pressures. Yet how bacteria evolve in nature, in more complex multi-species communities, is both challenging to study and essential to our understanding of ecosystem responses to rapid anthropogenic change. It has been theorized that selection purges within-species diversity in genome-wide selective sweeps, but the prevalence of such sweeps in response to known selective pressures in nature remains unclear. To track bacterial evolution in a semi-natural context, we applied Roundup, a glyphosate-based herbicide (GBH) as a selective pressure to 1000 L ponds containing bacterioplankton communities from a pristine lake. Using metagenomic analyses, we found that GBH treatment substantially affected community diversity, reducing species richness twofold, but did not consistently purge within-species genetic diversity over the four weeks of the experiment. We identified several functional categories of genes targeted by GBH selection across 11 different species of bacteria. There was no evidence for selection on the enzyme targeted by glyphosate, which interferes with amino acid synthesis; however genes involved more broadly in amino acid transport and metabolism were more likely to experience changes in allele frequency, particularly in inferred GBH-sensitive species. Together, these results show how environmental change can rapidly affect bacterial community structure while leaving within-species diversity largely intact. Even without evident genome-wide selective sweeps, we identify consistent genetic targets of selection, pointing to alternative mechanisms of GBH resistance in nature, and suggesting a role for soft or gene-specific selective sweeps in adaptation.

Autoren: B. Jesse Shapiro, E. Derrick, N. Barbosa da Costa, R. D. H. Barrett

Letzte Aktualisierung: 2024-09-19 00:00:00

Sprache: English

Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.17.613573

Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.17.613573.full.pdf

Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Änderungen: Diese Zusammenfassung wurde mit Unterstützung von AI erstellt und kann Ungenauigkeiten enthalten. Genaue Informationen entnehmen Sie bitte den hier verlinkten Originaldokumenten.

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