Saisonale Veränderungen in den Mikroben-Gemeinschaften von Algen
Diese Studie untersucht, wie Jahreszeiten Mikroorganismen auf Algen beeinflussen.
Guido Bonthond, C. M. Mudlaff, F. Weinberger, L. Duesedau, M. Ghotbi, S. Kuenzel
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Inhaltsverzeichnis
- Gracilaria vermiculophylla: Ein Fallbeispiel
- Zweck der Studie
- Probenahmeprozess
- Vorbereitung der Proben
- Datenanalyse
- Verständnis der mikrobiellen Vielfalt
- Identifizierung der Kernmikrobiota
- Saisonalität der mikrobiellen Gemeinschaften
- Verknüpfung von mikrobiellen Veränderungen mit Umweltfaktoren
- Auswirkungen der Studie
- Fazit
- Originalquelle
- Referenz Links
Saisonalität beeinflusst das Leben sowohl an Land als auch im Wasser. Es ist eine natürliche Quelle für Veränderungen, die die Funktionsweise von Pflanzen- und Tiergemeinschaften beeinflussen kann. Diese Veränderungen passieren auf viele Arten, einschliesslich Temperaturschwankungen, Licht und sogar Faktoren wie Salinität und Niederschlag. Ein Bereich, in dem wir diese Veränderungen sehen können, ist bei Algen und dem winzigen Leben, das darauf und darum herum lebt.
Algen findet man oft in Küstenbereichen wie felsigen Küsten und Schlickflächen, wo sie starken saisonalen Änderungen ausgesetzt sind. Diese Algen ziehen eine Vielzahl von Mikroorganismen an, die auf ihren Oberflächen leben. Die Oberfläche der Algen interagiert direkt mit dem umgebenden Wasser und schafft einen Raum für diese Mikroorganismen sich niederzulassen. Diese Gemeinschaft besteht hauptsächlich aus Bakterien, beinhaltet aber auch andere winzige Organismen wie Algen, Pilze und Viren.
Die Schicht von Mikroorganismen auf den Algen bildet einen Biofilm, der die Algen auf viele Arten beeinflussen kann, einschliesslich wie sie wachsen und auf Herausforderungen reagieren. Einige dieser Mikroorganismen können schädlich sein, während andere den Algen helfen, stärker zu wachsen oder mit Stress umzugehen.
Die Mikroorganismen auf Algen können je nach Art der Algen und sogar den verschiedenen Lebensphasen variieren. Das zeigt, dass sowohl die Algen als auch die Umwelt eine Rolle bei der Gestaltung dieser Gemeinschaften spielen.
Gracilaria vermiculophylla: Ein Fallbeispiel
Eine Art von Algen namens Gracilaria vermiculophylla wurde untersucht, um ihre assoziierten mikrobiellen Gemeinschaften besser zu verstehen. Diese Algen sind im Nordwestpazifik heimisch, sind aber mittlerweile in vielen Regionen zu finden, einschliesslich Teilen Europas und Nordamerikas.
Forschungen haben gezeigt, dass bestimmte Mikroorganismen konstant mit G. vermiculophylla verbunden sind, egal wo die Algen gefunden werden. In kontrollierten Experimenten haben Wissenschaftler diese Mikroorganismen über die Zeit beobachtet und festgestellt, dass nicht alle Mikroorganismen das ganze Jahr über vorhanden sind. Einige erscheinen nur während bestimmter Jahreszeiten, was darauf hindeutet, dass diese mikrobiellen Gemeinschaften nicht nur von den Algen, sondern auch von der Jahreszeit geprägt sind.
Zweck der Studie
Diese Studie hat zum Ziel, genauer zu betrachten, wie sich die Mikroorganismen, die auf G. vermiculophylla leben, mit den Jahreszeiten verändern. Durch das regelmässige Sammeln dieser Algen alle zwei Monate über drei Jahre wollten die Forscher herausfinden, ob es Muster gibt, welche Mikroorganismen vorhanden sind und ob einige immer da sind, unabhängig von der Jahreszeit.
Die Forscher glaubten, dass:
- Die Mikroorganismen, die mit G. vermiculophylla verbunden sind, saisonale Veränderungen in ihrer Zusammensetzung und Vielfalt zeigen würden.
- Es bestimmte Mikroorganismen geben würde, die das ganze Jahr über konstant auftreten, was als „Kernmikrobiota“ bekannt ist.
Probenahmeprozess
Um Daten zu sammeln, haben die Teams G. vermiculophylla an zwei verschiedenen Orten in Deutschland gesammelt: Nordstrand (Nordsee) und Heiligenhafen (Ostsee). Diese beiden Gebiete haben unterschiedliche Umweltbedingungen. Der Nordsee-Standort ist stark von Hochwasser und mariner Salinität betroffen, während der Ostsee-Standort eine geringere Salinität und andere Wasserbedingungen aufweist.
Die Probenahme fand alle zwei Monate über insgesamt drei Jahre statt. Während dieser Zeit massen die Forscher auch Temperatur, Salinität und pH-Werte an den Sammelstellen.
An jedem Probenahmepunkt wurden zehn Einzelproben von G. vermiculophylla entnommen, zusammen mit zusätzlichen Wasser- und Sedimentproben. So konnten die Forscher Veränderungen nicht nur in den Algen, sondern auch in der umgebenden Umwelt bewerten.
Vorbereitung der Proben
Nach der Sammlung der Proben bereiteten die Forscher sie für weitere Analysen vor, um die vorhandenen Mikroorganismen zu untersuchen. Dabei wurden Extrakte von den Mikroorganismen erstellt, die auf der Oberfläche der Algen gefunden wurden. Bestimmte Techniken ermöglichten es den Wissenschaftlern, die Mikroorganismen von den Algen zu trennen und sie für die DNA-Analyse vorzubereiten.
Sobald die Extrakte fertig waren, wurde die DNA-Extraktion durchgeführt. Dies geschah mithilfe etablierter Methoden, die es den Forschern ermöglichen, das genetische Material der Mikroorganismen zu analysieren und zu verstehen, welche Arten in den Algenproben vorhanden sind.
Datenanalyse
Die gesammelten Daten durchliefen verschiedene Prozesse, um die Genauigkeit sicherzustellen und aussagekräftige Schlussfolgerungen zu ziehen. Die Forscher schauten sich die einzigartigen Arten von Mikroorganismen an, die gefunden wurden, und wie sich deren Anzahl im Laufe der Zeit veränderte, insbesondere in Bezug auf Jahreszeiten und Umweltfaktoren.
Um die Daten zu visualisieren, verwendeten die Forscher spezifische statistische Techniken, um ähnliche Proben zu gruppieren und ihre Unterschiede zu bewerten. Statistische Methoden ermöglichten es, zu verstehen, wie sich die mikrobielle Zusammensetzung über verschiedene Jahreszeiten und zwischen den beiden Untersuchungsorten variierte.
Verständnis der mikrobiellen Vielfalt
Die Ergebnisse zeigten signifikante Unterschiede in der Vielfalt der Mikroorganismen, die im Laufe des Jahres mit G. vermiculophylla verbunden sind. Die Forscher entdeckten, dass einige Jahreszeiten eine höhere Vielfalt an Mikroorganismen aufwiesen als andere. Zum Beispiel zeigte der späte Winter eine reichhaltigere Mischung von Mikroorganismen im Vergleich zum frühen Sommer, wo weniger Arten gefunden wurden.
Diese Variabilität wird wahrscheinlich von Umweltfaktoren wie Temperatur und Salinität beeinflusst, die sich mit den Jahreszeiten ändern. In den wärmeren Monaten könnte der erhöhte Wettbewerb unter Mikroorganismen dazu führen, dass einige Arten seltener werden.
Identifizierung der Kernmikrobiota
Durch die Analyse identifizierten die Forscher spezifische Gruppen von Mikroorganismen, die konstant mit G. vermiculophylla assoziiert sind. Zwei Haupttypen der Kernmikrobiota wurden definiert:
- Permanente Kern: Mikroorganismen, die das ganze Jahr über konstant vorhanden sind, unabhängig von saisonalen Veränderungen.
- Saisonale Kern: Mikroorganismen, die deutlich in bestimmten Jahreszeiten vorhanden sind, wie bestimmte Bakterien, die im Winter besser gedeihen als im Sommer.
Diese Erkenntnisse deuten darauf hin, dass, während viele Mikroorganismen zu bestimmten Zeiten vorhanden sind, andere eine entscheidende Rolle in der Gemeinschaft der Algen im Laufe des Jahres spielen.
Saisonalität der mikrobiellen Gemeinschaften
Die Studie offenbarte klare saisonale Muster in der Zusammensetzung der mikrobiellen Gemeinschaften, die mit G. vermiculophylla assoziiert sind. Die Unterschiede waren nicht zufällig, sondern folgten einem vorhersehbaren Muster, das zeigt, wie sich Mikroorganismen an die sich ändernden Bedingungen um sie herum anpassen.
Zum Beispiel gab es im späten Winter vielfältigere mikrobielle Gemeinschaften, während die Vielfalt im frühen Sommer deutlich abnahm. Dieses Muster deutet darauf hin, wie Umweltbedingungen die Gemeinschaftsstruktur direkt beeinflussen können.
Verknüpfung von mikrobiellen Veränderungen mit Umweltfaktoren
Die Forscher untersuchten auch, wie Umweltveränderungen die Schwankungen in mikrobiellen Gemeinschaften antreiben. Faktoren wie Temperaturschwankungen und Salinitätsvariationen können die Mikroorganismen, die auf G. vermiculophylla leben, stark beeinflussen und sie veranlassen, sich an ihre Umgebung anzupassen.
Die Unterschiede zwischen den beiden Probenahmestellen deuteten auch darauf hin, dass jeder Standort unterschiedliche mikrobielle Populationen beheimatet, die von lokalen Umweltfaktoren beeinflusst werden.
Auswirkungen der Studie
Zu verstehen, wie sich mikrobielle Gemeinschaften mit den Jahreszeiten verändern, gibt Einblicke in das breitere Ökosystem. Diese Erkenntnisse können helfen, vorherzusagen, wie Algen und ihre assoziierten Mikroben auf Umweltveränderungen reagieren, was entscheidend für das Management mariner Ressourcen und Ökosysteme ist.
Die etablierte Kernmikrobiota bietet auch zukünftige Forschungsansätze. Zu identifizieren, welche Mikroorganismen für die Algen vorteilhaft oder schädlich sind, kann zu nachhaltigeren Praktiken in der Aquakultur oder Naturschutzmassnahmen führen.
Fazit
Die Studie über G. vermiculophylla und ihre mikrobiellen Gemeinschaften zeigt, dass Saisonalität eine entscheidende Rolle bei der Gestaltung dieser Beziehungen spielt. Die Ergebnisse zeigen, dass, während einige Mikroorganismen das ganze Jahr über vorhanden sind, viele sich dramatisch mit den Jahreszeiten verändern. Diese Veränderungen sind eng mit den Umweltbedingungen verbunden, was auf eine komplexe Interaktion zwischen den Algen und ihren mikrobiellen Partnern hinweist.
Durch die kontinuierliche Überwachung dieser Gemeinschaften über die Zeit gewinnen die Forscher wertvolle Einblicke, die unser Verständnis von marinen Ökosystemen und deren Management beeinflussen können. Die Arbeit hebt die komplexen Beziehungen zwischen Algen und den vielfältigen Mikroorganismen hervor, die diese einzigartigen Umgebungen bewohnen.
Titel: Seasonal cycles in a seaweed holobiont: A multiyear time series reveals repetitive microbial shifts and core taxa
Zusammenfassung: Seasonality is an important natural feature that drives cyclic environmental changes. Seaweed holobionts, inhabiting shallow waters such as rocky shores and mud flats, are subject to seasonal changes in particular, but little is known on the influence of seasonality on their microbial communities. In this study, we conducted a bi-monthly, three-year time series to assess the seasonality of microbial epibiota in the seaweed holobiont Gracilaria vermiculophylla. Our results reveal pronounced seasonal shifts that are both taxonomic and functional, oscillating between late winter and early summer across consecutive years. While epibiota varied taxonomically between populations, they were functionally similar, indicating that seasonal variability drives functional changes, while spatial variability is more redundant. We also identified seasonal core microbiota that consistently (re)associated with the host at specific times, alongside a permanent core that is present year-round, independent of season or geography. These findings highlight the dynamic yet resilient nature of seaweed holobionts and demonstrate that their epibiota undergo predictable changes. Therewith, the research offers important insights into the temporal dynamics of seaweed-associated microbiota, and demonstrates that the relationship between seaweed host and its epibiota is not static, but naturally subject to an ongoing seasonal succession process.
Autoren: Guido Bonthond, C. M. Mudlaff, F. Weinberger, L. Duesedau, M. Ghotbi, S. Kuenzel
Letzte Aktualisierung: 2024-10-26 00:00:00
Sprache: English
Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.23.619769
Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.23.619769.full.pdf
Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Änderungen: Diese Zusammenfassung wurde mit Unterstützung von AI erstellt und kann Ungenauigkeiten enthalten. Genaue Informationen entnehmen Sie bitte den hier verlinkten Originaldokumenten.
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