Sci Simple

New Science Research Articles Everyday

# Biologie # Mikrobiologie

Pocken-Ausrottung: Lehren für heute

Die Untersuchung der Ausrottung von Pocken und die Auswirkungen auf neue Viren.

Katie K. Tseng, Heather Koehler, Daniel J. Becker, Rory Gibb, Colin J. Carlson, Maria del Pilar Fernandez, Stephanie N. Seifert

― 8 min Lesedauer


Das Erbe der Pocken und Das Erbe der Pocken und virusbedingte Bedrohungen erkunden. Risiken durch aufkommende Viren Die Geschichte von Pocken und die
Inhaltsverzeichnis

Pocken, verursacht durch das Variola-Virus, spielen eine bedeutende Rolle in der Menschheitsgeschichte. Diese ansteckende Krankheit war berüchtigt für ihre schnelle Verbreitung, die zu schweren Erkrankungen und hohen Sterberaten führte. Bevor sie endlich ausgerottet wurde, machte sie viele Menschen krank und sorgte für weit verbreitete Angst. Doch der Kampf gegen dieses Virus führte auch zu einem wichtigen medizinischen Fortschritt: der Entwicklung des ersten effektiven Impfstoffs.

Der Aufstieg und Fall der Pocken

Pocken kamen vor Jahrhunderten ins Rampenlicht und griffen Bevölkerungen weltweit an. Die Ausbrüche waren so heftig, dass sie viele Menschen mit Narben zurückliessen und unzählige Leben forderten. Diese Situation zwang Wissenschaftler und Ärzte zum Handeln, was zur Entdeckung von Impfmethoden führte. Der erste erfolgreiche Impfstoff wurde mit einem verwandten, aber milderen Virus hergestellt, der ein gewisses Mass an Schutz gegen Pocken bot.

1980 erreichten wir einen Meilenstein, als die Weltgesundheitsorganisation Pocken offiziell für ausgestorben erklärte. Dieser Erfolg wurde grösstenteils den koordinierten Anstrengungen auf der ganzen Welt zugeschrieben, Menschen gegen das Virus zu impfen. Was diesen Erfolg noch bemerkenswerter machte, war, dass es keine tierischen Reservoirs gab, die das Virus ausserhalb der menschlichen Populationen am Leben halten konnten. Hätten Tiere das Virus beherbergen können, hätte es möglicherweise weiterhin eine Bedrohung dargestellt.

Nach der erfolgreichen Ausrottung der Pocken liessen die Impfmassnahmen nach. Infolgedessen nahm die Immunität der Menschen gegen verwandte Viren ab. Trotz dieses Rückgangs wissen Wissenschaftler, dass Viren, die zur gleichen Familie wie das Pockenvirus gehören, immer noch existieren und unter Tieren zirkulieren. Das bedeutet, dass die Möglichkeit besteht, dass einige dieser Viren wieder auf den Menschen überwechseln können, was neue Gesundheitsprobleme mit sich bringen würde.

Verständnis der Orthopoxviren

Orthopoxviren, zu denen das Variola-Virus gehört, sind interessant, weil sie verschiedene Säugetiere infizieren können. Auch wenn wir wissen, dass viele dieser Viren Tiere infizieren können, ist die vollständige Liste der Tierwirte noch weitgehend unbekannt. Ein Grund für dieses Mysterium ist, dass diese Viren viele Zubehörgene haben, die ihnen helfen, von den Immunsystemen ihrer Wirte nicht erkannt zu werden. Einige dieser Gene könnten beeinflussen, wie ein Virus mit verschiedenen Tierarten interagiert.

Während sich diese Viren weiterentwickeln, können im Laufe der Zeit einige Gene verloren gehen oder hinzugefügt werden, was ihre Anpassung an die Wirte beeinflussen könnte. Zum Beispiel hat eine modifizierte Version des Pockenimpfstoffs, genannt modifiziertes Vaccinia-Virus Ankara, einen erheblichen Teil ihres genetischen Materials verloren. Dieser Verlust bedeutet, dass es nicht so umfassend mit Wirten interagiert wie seine virulenteren Verwandten.

Einige andere Orthopoxviren, wie das Mpox-Virus (früher Affenpockenvirus) und das Kuhpockenvirus, haben ein breiteres Spektrum an Wirten. Die jüngste Ausbreitung des Mpox-Virus in verschiedenen Regionen hat Alarm geschlagen über die Möglichkeit, dass es zwischen Tieren und Menschen hin und her springt. Jüngste Ereignisse mit Weisswedelhirschen und SARS-CoV-2 verdeutlichen, wie schnell Viren sich anpassen und verbreiten können.

Aufkommende Viren und Wirt-Interaktion

Wissenschaftler versuchen, vorherzusagen, welche Tiere potenzielle Wirte für diese aufkommenden Viren sein könnten. Viele Modelle basieren jedoch auf ökologischen Eigenschaften der Wirte und ignorieren wichtige molekulare Merkmale der Viren. Manchmal denken Wissenschaftler, dass eine bestimmte Tierart infiziert werden kann, basierend auf ihren Eigenschaften, nur um dann überrascht festzustellen, dass sie bei Tests nicht infiziert werden kann.

Beispielsweise wurden Hausschweine aufgrund ihrer Eigenschaften als potenzielle Wirte für ein Virus angesehen. Doch als sie im realen Leben getestet wurden, wurden sie überhaupt nicht infiziert. Ähnlich wurde bei bestimmten Fledermäusen vorhergesagt, dass sie Wirte für das Nipah-Virus sind, aber auch sie konnten in Versuchen keine Infektion unterstützen. Die Verbindung zwischen dem Virus und seinem potenziellen Wirt kann kompliziert sein und erfordert mehr als nur ökologische Eigenschaften, um sie zu verstehen.

Viren sind auch dafür bekannt, sich im Laufe der Zeit weiterzuentwickeln und manchmal ihr Wirtsspektrum zu verändern. Ein typisches Beispiel ist die Omikron-Variante von SARS-CoV-2, die es schaffte, ein breiteres Spektrum an Tieren zu infizieren als ihre Vorgänger. Durch das Studium der Genome von Viren können Forscher Hinweise auf die potenzielle Wirt-Kompatibilität sammeln, was die Vorhersagemodelle verbessern kann.

Ein neuer Ansatz zur Vorhersage von Wirt-Virus-Assoziationen

Um diese Probleme anzugehen, haben Wissenschaftler neue Methoden mit fortschrittlichen Algorithmen entwickelt. Sie verwendeten ein Modell, das als Boosted Regression Trees (BRTs) bekannt ist und sich in der Ökologie und evolutionären Forschung als nützlich erweist. Dieses Modell kombiniert sowohl die Eigenschaften der Wirte als auch die Merkmale der Viren, um vorherzusagen, welche Säugetiere wahrscheinlich mit bestimmten Orthopoxviren assoziiert sind.

In ihrer Forschung entwickelten sie zwei Modelle. Das erste Modell betrachtete bekannte Wirt-Virus-Interaktionen, während das zweite ökologische Eigenschaften und virale Genomdaten kombinierte. Dadurch konnten sie vorhersagen, welche Tiergenera am ehesten von bestimmten Orthopoxviren infiziert werden könnten.

Mit beiden Ansätzen bewerteten die Forscher, wie unterschiedliche Erkennungsmethoden ihre Vorhersagen beeinflussten. Sie kombinierten Daten aus verschiedenen Erkennungstechniken, um ein umfassenderes Bild potenzieller Wirte zu erhalten.

Leistung der Modelle

Die Modelle, die sich ausschliesslich auf die Eigenschaften der Wirte konzentrierten, zeigten eine angemessene Vorhersagegenauigkeit. Die Kombination von Wirt- und Virusinformationen führte jedoch zu noch grösseren Erfolgen. Bei der Betrachtung der Vorhersageleistung fanden die Forscher heraus, dass die Einbeziehung viraler genetischer Merkmale half, genauere Wirt-Virus-Paarungen zu identifizieren.

Ein bemerkenswertes Ergebnis war die Entdeckung von Mustern, bei denen bestimmte Tierarten anfälliger für Orthopoxviren waren. Keine grosse Überraschung, dass bestimmte Tierfamilien, wie Katzen, wahrscheinlicher diese Viren beherbergen, während andere, wie Kaninchen und Nagetiere, weniger wahrscheinlich betroffene Wirte sind. Diese Informationen beleuchten potenzielle Wege, um zu verstehen, wie diese Viren in menschliche Populationen überspringen könnten.

Klassenungleichgewicht und Optimierungstechniken

Eine Herausforderung, mit der Forscher häufig konfrontiert sind, ist das Klassenungleichgewicht, was bedeutet, dass die Anzahl der Wirte in ihrem Datensatz die Ergebnisse verzerren kann. Forscher müssen sich dieses Problems bewusst sein, um falsche Schlussfolgerungen zu vermeiden. Um diese Herausforderung zu bewältigen, untersuchten die Forscher verschiedene Schwellenwertmethoden, um potenzielle Wirte genau zu klassifizieren.

Indem sie den Schwellenwert anpassten, um eine höhere Sensitivität zu suchen, konnten sie mehr potenzielle Wirte erfassen, auch wenn das bedeutete, einige falsche Positive zu akzeptieren. Das Ziel war es, das Risiko zu minimieren, echte Wirte zu übersehen, während man dennoch eine überschaubare Anzahl von Vorhersagen beibehielt.

Diese Anpassung erwies sich als vorteilhaft, um zu verstehen, welche Tiere möglicherweise Orthopoxviren beherbergen. Beispielsweise stieg bei einem Schwellenwert von 80% die Anzahl der vorhergesagten Wirtgenera drastisch an. Ein ähnlicher Trend wurde beobachtet, als der Schwellenwert auf 90% erhöht wurde. Diese Flexibilität ermöglicht es Wissenschaftlern, ihre Vorhersagen je nach Situation anzupassen.

Die Rolle der geografischen Verteilung

Als die Forscher tiefer in ihre Ergebnisse eintauchten, kartierten sie auch die geografischen Standorte von Tieren, die als potenzielle Wirte für Orthopoxviren vorhergesagt wurden. Diese Kartierung zeigte Gebiete mit hohen Dichten potenzieller Wirte, oft in Regionen, in denen die Impfquoten gegen Pocken niedrig waren. Solche Erkenntnisse deuteten auf ein Risiko hin, dass diese Viren zurückkehren könnten, insbesondere in Regionen mit begrenztem Schutz durch Impfungen.

Regionen wie die östlichen Himalaya, Zentralafrika und bestimmte Inseln wurden als potenzielle Wirte für diese Viren identifiziert. Diese Hotspots zu erkennen, ist entscheidend für die Überwachung potenzieller Ausbrüche und ermöglicht gezielte Überwachungsmassnahmen.

Verständnis der Zubehörgene

Ein interessanter Aspekt der Studie war die Untersuchung von Zubehörgenen, die eine bedeutende Rolle dabei spielen können, wie Viren mit ihren Wirten interagieren. Die Forscher identifizierten, welche Gene am einflussreichsten bei der Bestimmung der Wirt-Kompatibilität waren.

Durch die Hauptkomponentenanalysen gruppierten sie diese Zubehörgene, um Muster zu identifizieren, die erklären könnten, wie bestimmte Viren erfolgreich verschiedene Wirte infizieren. Gene, die mit der Immunumgehung oder Interaktionen mit Wirtszellen assoziiert sind, waren besonders wichtig für die Gestaltung der Beziehungen zwischen verschiedenen Viren und ihren Säugetierwirten.

Herausforderungen und Einschränkungen

Während die Forscher bedeutende Fortschritte gemacht haben, erkannten sie auch einige Herausforderungen an. Eine der Hauptbeschränkungen ist die Abhängigkeit von verfügbaren Daten, was zu Wissenslücken über Wirt-Virus-Interaktionen führen kann. Zudem stellt die Tatsache, dass die Funktionen mancher Gene noch nicht gut charakterisiert sind, ein Hindernis für klarere Schlussfolgerungen dar.

Die Studie hob auch die Bedeutung der Zusammenarbeit bei der Sammlung von Informationen über Viren und ihre Wirte hervor. Indem sie Daten aus verschiedenen Arten und Regionen integrieren, können Forscher ein umfassenderes Bild potenzieller Bedrohungen durch aufkommende Viren erstellen.

Die Zukunft der zoonotischen Virusforschung

In einer zunehmend vernetzten Welt ist das Potenzial, dass Viren von Tieren auf Menschen springen, ständig präsent. Die zunehmende Häufigkeit von Ausbrüchen zwingt uns dazu, unsere Ansätze in der öffentlichen Gesundheit und der Überwachung von Wildtieren zu überdenken. In Anbetracht dessen sind Vorhersagen über potenzielle Wirtarten wichtiger denn je.

Indem sie ständig Modelle verfeinern, um genomische Daten einzubeziehen, können Forscher ihr Verständnis darüber verbessern, wie Viren sich verbreiten könnten. Solches Wissen kann den Behörden helfen, bessere Überwachungsstrategien zu entwickeln und so die Risiken, die von aufkommenden Pathogenen wie denen aus der Orthopoxvirusfamilie ausgehen, zu mindern.

Zusammenfassend lässt sich sagen, dass der Kampf gegen die Pocken gewonnen wurde, der Krieg gegen aufkommende Viren jedoch weitergeht. Es ist wichtig, wachsam und informiert zu bleiben, während neue Studien den Weg für ein besseres Verständnis darüber ebnen, wie diese Erreger mit dem Tierreich interagieren. Und wer weiss? Vielleicht werden wir eines Tages in der Lage sein, den nächsten viralen Bösewicht vorherzusagen, bevor er auch nur die Chance hat zu sagen: „Überraschung!“

Originalquelle

Titel: Viral genomic features predict orthopoxvirus reservoir hosts

Zusammenfassung: Orthopoxviruses (OPVs), including the causative agents of smallpox and mpox have led to devastating outbreaks in human populations worldwide. However, the discontinuation of smallpox vaccination, which also provides cross-protection against related OPVs, has diminished global immunity to OPVs more broadly. We apply machine learning models incorporating both host ecological and viral genomic features to predict likely reservoirs of OPVs. We demonstrate that incorporating viral genomic features in addition to host ecological traits enhanced the accuracy of potential OPV host predictions, highlighting the importance of host-virus molecular interactions in predicting potential host species. We identify hotspots for geographic regions rich with potential OPV hosts in parts of southeast Asia, equatorial Africa, and the Amazon, revealing high overlap between regions predicted to have a high number of potential OPV host species and those with the lowest smallpox vaccination coverage, indicating a heightened risk for the emergence or establishment of zoonotic OPVs. Our findings can be used to target wildlife surveillance, particularly related to concerns about mpox establishment beyond its historical range.

Autoren: Katie K. Tseng, Heather Koehler, Daniel J. Becker, Rory Gibb, Colin J. Carlson, Maria del Pilar Fernandez, Stephanie N. Seifert

Letzte Aktualisierung: 2024-12-12 00:00:00

Sprache: English

Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.10.26.564211

Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.10.26.564211.full.pdf

Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Änderungen: Diese Zusammenfassung wurde mit Unterstützung von AI erstellt und kann Ungenauigkeiten enthalten. Genaue Informationen entnehmen Sie bitte den hier verlinkten Originaldokumenten.

Vielen Dank an biorxiv für die Nutzung seiner Open-Access-Interoperabilität.

Ähnliche Artikel