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# Biologie # Synthetische Biologie

Wie Pflanzen und Tiere sich an wenig Sauerstoff anpassen

Die einzigartigen Wege, wie Pflanzen und Tiere mit niedrigem Sauerstoffangebot umgehen.

Vinay Shukla, Sergio Iacopino, Laura Dalle Carbonare, Yuming He, Alessia Del Chiaro, Antonis Papachristodoulou, Beatrice Giuntoli, Francesco Licausi

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Pflanzen vs. Tiere: Pflanzen vs. Tiere: Sauerstoffanpassung wenig Sauerstoff untersuchen. Überlebensstrategien in Umgebungen mit
Inhaltsverzeichnis

Sauerstoff ist super wichtig für viele lebende Organismen, besonders für die, die darauf angewiesen sind, um Energie zu produzieren. Diese Energieproduktion, auch ATP-Synthese genannt, unterstützt das Wachstum und verschiedene Lebensprozesse. Wenn Sauerstoff aber knapp wird oder die Verfügbarkeit reduziert ist (man nennt das Hypoxie), haben Pflanzen und Tiere ganz eigene Wege entwickelt, um damit umzugehen.

Die Herausforderung mit wenig Sauerstoff

Wenn die Zellen mit niedrigem Sauerstofflevel konfrontiert sind, müssen sie sich anpassen, um zu überleben. Das bedeutet, sie ändern ihre Strukturen und ihren Stoffwechsel, was so viel heisst wie, sie stellen die Dinge in ihren Zellen um, um weiterhin funktionieren zu können. Eine Möglichkeit, wie sie das machen, ist ein Prozess namens transkriptionale Reprogrammierung. Dabei passen die Zellen an, welche Gene aktiv sind, also wie das Licht an- und ausgeht, je nach Situation.

Sowohl Pflanzen als auch Tiere haben spezielle Mechanismen entwickelt, um zu merken, wenn der Sauerstoffspiegel sinkt. Trotz der Unterschiede in ihrer Biologie gibt es erstaunliche Ähnlichkeiten in der Art und Weise, wie sie auf Hypoxie reagieren. Das wirft interessante Fragen auf, wie diese Systeme entstanden sind und ob sie die besten Lösungen fürs Leben in einer komplexen, mehrzelligen Umgebung sind.

Wie Pflanzen das machen: Die Ethylen-Reaktionsfaktoren

In Pflanzen spielt eine Gruppe von Proteinen, die Ethylen-Reaktionsfaktor VII (ERFVIIs) heissen, eine zentrale Rolle beim Sensing von niedrigem Sauerstoff. Diese Proteine werden über einen Weg namens N-Degron-Weg kontrolliert, der bestimmt, wie stabil sie aufgrund ihrer Struktur sind. Wenn der Sauerstoffspiegel sinkt, helfen die PCO-Proteine, die ERFVIIs zu verändern, um der Pflanze zu signalisieren, dass sie ihr Verhalten ändern muss.

Stell dir die ERFVIIs wie eine Gruppe von Lichtern in einer Pflanzenzelle vor. Wenn der Sauerstoffgehalt normal ist, sind diese Lichter vielleicht aus, aber wenn sie Dunkelheit (wenig Sauerstoff) spüren, schalten sie sich ein, um der Pflanze zu helfen, sich anzupassen.

Wie Tiere damit umgehen: Die Hypoxie-induzierbaren Faktoren

Tiere hingegen nutzen Hypoxie-induzierbare Faktoren (HIFS), um niedrigen Sauerstoff zu erkennen. HIFs bestehen aus zwei Proteineinheiten, die zusammenarbeiten. Die Alpha-Einheit ist die, die die Sauerstofflevel wahrnimmt, und wenn genug Sauerstoff da ist, wird sie abgebaut, um alles im Gleichgewicht zu halten. Sinkt der Sauerstoffgehalt, entkommt die HIF-Alphaeinheit der Zerstörung und beginnt, in der Zelle aufzubauen. Dann vereint sie sich mit der anderen Proteineinheit, was zur Aktivierung von Genen führt, die dem Tier helfen, sich an niedrigen Sauerstoff anzupassen.

Ähnlich und doch anders: Konvergenz in den Erkennungsstrategien

Die Ähnlichkeiten zwischen Pflanzen und Tieren, wie sie auf niedrigen Sauerstoff reagieren, haben Forscher dazu gebracht zu beobachten, dass diese Anpassungen vielleicht die besten Wege sind, um mit komplexen Lebenssystemen umzugehen. Beide verwenden zwar ähnliche Methoden, aber die biochemischen Werkzeuge, die sie nutzen, sind unterschiedlich. Es ist ein bisschen so, als würden zwei Leute unterschiedliche Werkzeuge benutzen, um ein ähnliches Möbelstück zu bauen – beide bekommen es hin, aber auf ihre eigene Art.

Warum nutzen Pflanzen und Tiere unterschiedliche Werkzeuge?

Der letzte gemeinsame Vorfahr von Pflanzen und Tieren hatte wahrscheinlich die Mechanismen, die Pflanzen und Tiere heute verwenden. Diese Situation wirft interessante Fragen auf: Warum sind diese beiden Reiche so unterschiedlich, obwohl sie von einem ähnlichen Punkt ausgegangen sind? Das könnte an den unterschiedlichen Lebensweisen von Pflanzen und Tieren liegen. Zum Beispiel haben Tiere aktive Systeme zur Lufttransport, während Pflanzen auf Diffusion angewiesen sind.

Ingenieurwesen eines hypoxieresponsiven Systems in Pflanzen

Um diese Unterschiede weiter zu erkunden, haben Wissenschaftler versucht, ein System in Pflanzen zu schaffen, das den Hypoxiesensor in Tieren nachahmt. Indem sie einen Mechanismus entwickeln, der es Pflanzen ermöglicht, auf niedrige Sauerstofflevel zu reagieren, können sie kontrollieren, wie bestimmte Gene exprimiert werden, ähnlich wie Tiere es tun. Dieser Ansatz kann Pflanzen helfen, besser mit Bedingungen wie Überflutung umzugehen, die den Sauerstoffgehalt im Wasser reduzieren und die Landwirtschaft stark gefährden können.

Der Kampf überfluteter Pflanzen

Wenn Pflanzen in Wasser eingetaucht sind, haben sie Schwierigkeiten, genug Sauerstoff zu bekommen. Traditionelle Methoden, ihre natürlichen Reaktionen zu verändern, können unbeabsichtigte Folgen haben, weil die gleichen Mechanismen, die ihnen helfen, mit einem Stressfaktor umzugehen, auch ihre Fähigkeit beeinflussen können, mit anderen umzugehen, wie Kälte oder Dürre. Mit einem Ansatz der synthetischen Biologie wollten die Forscher ein neues System schaffen, das den Pflanzen hilft, spezifisch auf niedrige Sauerstoffbedingungen zu reagieren, ohne ihre anderen Stressreaktionen zu stören.

Wie funktioniert dieses neue System?

Die Wissenschaftler entwickelten ein System, das Komponenten verwendet, die vom tierischen HIF-Weg inspiriert sind, und fügten es Pflanzen hinzu. Sie schufen ein chimäres Protein, das es ihnen ermöglicht, Sauerstofflevel wahrzunehmen und in Reaktion darauf die Expression bestimmter Gene zu regulieren. In ihren Experimenten mit transgenen Pflanzen schafften sie ein System, das die Stabilität spezifischer Proteine basierend auf der Verfügbarkeit von Sauerstoff kontrollieren konnte. Wenn der Sauerstoffgehalt niedrig war, wurden diese Proteine stabilisiert, was den Pflanzen ermöglichte, Reaktionen zu aktivieren, die ihnen das Überleben erleichtern.

Ergebnisse: Erfolge und Herausforderungen

In ihren Experimenten beobachteten die Forscher, dass ihr neu entwickeltes System effektiv steuern konnte, wie Pflanzen auf niedrige Sauerstoffbedingungen reagierten. Die Pflanzen mit diesem System wuchsen mehr zur Oberfläche, wenn sie unter Wasser waren, was eine vorteilhafte Strategie für das Überleben ist. Allerdings fanden die Forscher auch heraus, dass die Kompromisse immer noch vorhanden waren – während das neue System half, die Hypoxieresistenz zu verbessern, konnte es auch die Fitness und das Wachstum der Pflanzen in anderen Bereichen beeinflussen.

Das grosse Bild: Evolutionäre Implikationen

Die Fähigkeit, solche Systeme in Pflanzen zu entwickeln, wirft wichtige Fragen zur evolutionären Geschichte der Sauerstoffwahrnehmung auf. Zu verstehen, wie und warum sich diese Mechanismen zwischen Pflanzen und Tieren unterscheiden, kann Aufschluss darüber geben, wie diese Anpassungen zur Vielfalt des Lebens beigetragen haben. Es öffnet auch die Tür zu zukünftigen landwirtschaftlichen Anwendungen, sodass Nutzpflanzen so gestaltet werden können, dass sie besser mit herausfordernden Umgebungen zurechtkommen, wie etwa solchen, die vom Klimawandel betroffen sind.

Zukünftige Perspektiven: Anwendungen in der Landwirtschaft

Das entwickelte System zur Sauerstoffwahrnehmung in Pflanzen zeigt das Potenzial der synthetischen Biologie, die Resilienz von Kulturen zu verbessern. Die Hoffnung ist, dass diese Forschung zur Entwicklung von Sorten führt, die besser mit Überschwemmungen und anderen Stressfaktoren umgehen können und letztendlich dazu beiträgt, die Lebensmittelversorgung in einem unberechenbaren Klima zu sichern.

Fazit: Ingenieurwesen des Lebens

Zusammenfassend haben sowohl Pflanzen als auch Tiere clevere Wege gefunden, um mit Sauerstoffmangel umzugehen. Obwohl ihre Methoden Ähnlichkeiten aufweisen, sind die unterschiedlichen Werkzeuge, die sie nutzen, ein Beweis für die Vielfalt in der Natur. Forscher nutzen jetzt diese Erkenntnisse, um Pflanzen zu entwickeln, die besser auf ihre Umgebung reagieren können. Mit den Fortschritten der Wissenschaft, wer weiss, welche faszinierenden Anpassungen vielleicht aus der Schnittstelle von Pflanzen- und Tierbiologie entstehen? Es ist ein bisschen wie eine Science-Fiction-Geschichte, die zum Leben erwacht, wo clevere Lösungen auf die Herausforderungen des Überlebens in einer komplexen Welt treffen.

Originalquelle

Titel: Engineering prolyl hydroxylase-dependent proteolysis enables the orthogonal control of hypoxia responses in plants

Zusammenfassung: Vascular plants and metazoans use selective proteolysis of transcription factors to control the adaptive responses to hypoxia, although through distinct biochemical mechanisms. The reason for this divergence is puzzling, especially when considering that the molecular components necessary to establish both strategies are conserved across the two kingdoms. To explore an alternative evolutionary scenario where plants sense hypoxia as animals do, we engineered a three-components system aimed to target proteins for degradation in an oxygen dependent manner in Arabidopsis thaliana. Applying the synthetic biology framework, we produced a hypoxia-responsive switch independent of endogenous pathways. When applied to control transcription, the synthetic system partially restored hypoxia responsiveness in oxygen-insensitive mutants. Additionally, we demonstrated its potential to regulate growth under flood-induced hypoxia. Our work highlights the use of synthetic biology to reprogram signalling pathways in plants, providing insights into the evolution of oxygen sensing and ofering tools for crop improvement under stress conditions.

Autoren: Vinay Shukla, Sergio Iacopino, Laura Dalle Carbonare, Yuming He, Alessia Del Chiaro, Antonis Papachristodoulou, Beatrice Giuntoli, Francesco Licausi

Letzte Aktualisierung: 2024-12-14 00:00:00

Sprache: English

Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.13.628401

Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.13.628401.full.pdf

Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Änderungen: Diese Zusammenfassung wurde mit Unterstützung von AI erstellt und kann Ungenauigkeiten enthalten. Genaue Informationen entnehmen Sie bitte den hier verlinkten Originaldokumenten.

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