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# Biologie # Mikrobiologie

Colletotrichum: Freund oder Feind bei Pilzen?

Die doppelte Natur von Colletotrichum-Pilzen und ihren Einfluss auf Pflanzen erkunden.

Cassandra L. Ettinger, Jonathan A. Eisen, Jason E. Stajich

― 6 min Lesedauer


Colletotrichum: Colletotrichum: Pilzfreund oder -feind? mariner Pflanzen. Colletotrichum für die Gesundheit Untersuchung der Rolle von
Inhaltsverzeichnis

Colletotrichum ist eine Gruppe von Fungi, die für ihr interessantes Leben bekannt ist, das manchmal freundlich und manchmal, na ja, nicht ganz so nett ist. Diese Fungi können in Pflanzenteilen leben, ohne Schaden anzurichten, oder sie können gemein werden und verschiedene Krankheiten verursachen. Sie sind ziemlich anpassungsfähig und kommen mit einer Vielzahl von Pflanzen klar, was ihre Fähigkeit zeigt, sich an unterschiedliche Umgebungen anzupassen.

Die Zwei Gesichter von Colletotrichum

Wenn es um ihren Lebensstil geht, können Colletotrichum-Fungi etwas dramatisch sein. Sie fangen freundlich an, halten ihre Pflanzenwirte am Leben und gesund, aber sobald es schwierig wird, schalten sie um und fangen an, Ärger zu machen. Dieser Wechsel von freundlich zu feindlich wird als hemibiotropher Lebensstil bezeichnet. In ihrer „netten“ Phase leben sie von dem Wirt, ohne Schaden anzurichten, aber wenn die Bedingungen hart werden, werden sie nekrotroph und sorgen dafür, dass die Pflanze leidet und nicht besonders toll aussieht.

Der Ärger, den sie verursachen

Colletotrichum ist bekannt dafür, eine Art von Pflanzenerkrankung namens Anthraknose zu verursachen. Diese Krankheit führt zu dunklen Flecken oder Läsionen auf Pflanzen, was nicht gerade attraktiv ist! Das macht Colletotrichum zu einem der zehn grössten Fungal-Störenfriede in der Landwirtschaft, die weltweit Pflanzen schädigen.

Interessanterweise sind einige Colletotrichum-Arten wählerisch und hängen nur bei bestimmten Pflanzen ab, während andere wie Partytiere sind und viele verschiedene Pflanzen befallen können. Sie gibt’s schon seit Ewigkeiten und haben sich über Millionen von Jahren zusammen mit blühenden Pflanzen entwickelt, angefangen mit einer Vorliebe für bestimmte Pflanzen und dann erweitert.

Ein neues Zuhause im Wasser finden

Colletotrichum-Fungi sind nicht nur Landratten; sie wurden auch dabei gesehen, die Wasserpflanzenparty zu crashen! Neueste Entdeckungen zeigen, dass diese Fungi auch in Seegräsern wie Zostera marina leben können, die ein Rockstar in Küstenökosystemen ist. Zostera marina hilft, Lebensräume zu schaffen, stabilisiert Sediment und absorbiert Kohlenstoff aus der Atmosphäre, also ist das ein grosses Ding in marinen Umgebungen.

Leben in Seegräsern

Wissenschaftler haben untersucht, wie Colletotrichum mit Zostera marina interagiert. Studien haben gezeigt, dass diese Fungi ziemlich gerne auf den Blättern und Rhizomen des Seegrases abhängen, was darauf hindeutet, dass sie eine gemütliche Beziehung entwickelt haben. Bisher richten sie keinen Schaden an, was Fragen über ihre wahre Natur aufwirft – sind sie nur extra Hausgäste oder haben sie eine dunklere Seite, die darauf wartet, sich zu zeigen?

Die Auswirkungen des Klimawandels

Mit dem Klimawandel, der unsere Ozeane durcheinanderwirbelt, wird es immer wichtiger zu verstehen, wie Colletotrichum die Gesundheit von Seegräsern beeinflusst. Wenn sich das Klima ändert, könnten Seegräser gestresst werden, was den Fungi die Möglichkeit geben könnte, von freundlichen Untermietern zu unerwünschten Schädlingen zu werden.

tiefer graben: Genom-Analyse

Um ein klareres Bild davon zu bekommen, was Colletotrichum sp. CLE4 (eine spezifische Art, die in Zostera marina lebt) so treibt, haben Wissenschaftler sein Genom kartiert. Das ist so, als würde man das gesamte Handbuch eines einzigartigen Wesens lesen, um zu sehen, was es antreibt. Sie fanden heraus, dass dieser spezielle Stamm im Vergleich zu einigen seiner Cousins ein relativ kleines Genom hat.

Was macht CLE4 besonders?

Das Genom von Colletotrichum sp. CLE4 ist ziemlich kompakt, mit etwa 12.000 Genen. Das bedeutet, es hat nicht so viel genetisches Material wie andere verwandte Fungi. Die Wissenschaftler fanden heraus, dass es trotz der geringeren Anzahl an Genen immer noch sehr effizient funktioniert und in ihren Bewertungen eine Abschlussrate von fast 99 % zeigt. Das macht ihn zu einem zuverlässigen Kandidaten für die Untersuchung, wie Fungi sich an unterschiedliche Umgebungen anpassen.

Warum so wenige Gene?

Die kleinere Genomgrösse kann ein Zeichen für “genomische Straffung” sein. Denk daran wie an ein Fungi auf Diät, das das Überflüssige streicht, um sich auf das Wesentliche zu konzentrieren. Diese Art der Reduktion kann passieren, wenn sich eine Art an eine bestimmte Umgebung anpasst, wie beim marinen Leben, in dem sich Colletotrichum sp. CLE4 befindet.

Was haben die Wissenschaftler entdeckt?

Bei genauerer Betrachtung der Gene sahen die Wissenschaftler, dass viele konservierte Genfamilien in Colletotrichum sp. CLE4 fehlten, was darauf hindeutet, dass es im Laufe der Zeit einen Teil seines genetischen „Gepäcks“ verloren hat. Fehlende Gene können solche sein, die beim Transport, Stoffwechsel und sogar bei Abwehrmechanismen gegen Pflanzenwirte helfen. Auch wenn das alarmierend erscheinen mag, kann es auch bedeuten, dass der Pilz einen Weg gefunden hat, mit weniger auszukommen.

Wer sind seine Verwandten?

Im grossen Stammbaum der Fungi ist Colletotrichum sp. CLE4 am nächsten mit seinem Verwandten C. godetiae verwandt, der dafür berüchtigt ist, Krankheiten auf Landpflanzen zu verursachen. Überraschenderweise teilt sein Genom ein hohes Mass an Ähnlichkeit mit C. godetiae, was Fragen aufwirft, ob es sich um einen neuen marinen Stamm handeln könnte.

Das Gute, das Schlechte und die Fungi

Wie sieht das Urteil über Colletotrichum sp. CLE4 aus? Die Ergebnisse legen nahe, dass es wahrscheinlich mit Zostera marina abhängt, ohne Schaden anzurichten, solange alles normal läuft. Aber wenn die Dinge schwierig werden – wie bei Stress oder widrigen Bedingungen – könnte dieser freundliche Pilz beschliessen, feindlich zu werden.

Diese Fähigkeit, zwischen nützlich und schädlich zu wechseln, ist nicht einzigartig für Colletotrichum sp. CLE4. Viele Pilze haben doppelte Fähigkeiten, bei denen sie unter den richtigen Umständen hilfreich sein können, aber auch problematisch werden, wenn sich die Situation ändert.

Was kommt als Nächstes für Colletotrichum?

Das Verständnis der Ökologie von Colletotrichum in marinen Umgebungen ist entscheidend, insbesondere wenn der Planet sich erwärmt. Das Potenzial dieser Fungi, zwischen nützlich und schädlich zu wechseln, bedeutet, dass mehr Forschung nötig ist. Die Wissenschaftler sind gespannt darauf, wie andere Stressoren, wie der Klimawandel, seine pathogene Seite auslösen könnten.

Zusammengefasst ist Colletotrichum eine faszinierende Pilzgruppe, die als Freund oder Feind agieren kann, besonders wenn es um ihre Beziehung zu verschiedenen Pflanzenwirten, einschliesslich Seegräsern, geht. Mit fortlaufender Forschung und Überwachung können wir hoffen, diese kleinen Organismen und ihren Einfluss auf die Umwelt besser zu verstehen. Also denk das nächste Mal, wenn du in der Nähe des Wassers oder auf einem Feld bist, daran, dass das gute alte Colletotrichum vielleicht gerade in der Nähe lauert und entscheidet, ob es die Pflanzen mit seiner Anwesenheit beglücken oder ein bisschen Chaos verursachen soll!

Originalquelle

Titel: Genomic streamlining of seagrass-associated Colletotrichum sp. may be related to its adaptation to a marine monocot host

Zusammenfassung: Colletotrichum spp. have a complicated history of association with land plants. Perhaps most well-known as plant pathogens for the devastating effect they can have on agricultural crops, some Colletotrichum spp. have been reported as beneficial plant endophytes. However, there have been only a handful of reports of Colletotrichum spp. isolated from aquatic plant hosts and their ecological role in the marine ecosystem is underexplored. To address this, we present the draft genome and annotation of Colletotrichum sp. CLE4, previously isolated from rhizome tissue from the seagrass Zostera marina. This genome (48.03 Mbp in length) is highly complete (BUSCO ascomycota: 98.8%) and encodes 12,015 genes, of which 5.7% are carbohydrate-active enzymes (CAZymes) and 12.6% are predicted secreted proteins. Phylogenetic placement puts Colletotrichum sp. CLE4 within the C. acutatum complex, closely related to C. godetiae. We found a 8.69% smaller genome size, 21.90% smaller gene count, and the absence of 591 conserved gene families in Colletotrichum sp. CLE4 relative to other members of the C. acutatum complex, suggesting a streamlined genome possibly linked to its specialized ecological niche in the marine ecosystem. Machine learning analyses using CATAStrophy on CAZyme domains predict this isolate to be a hemibiotroph, such that it has a biotrophic phase where the plant is kept alive during optimal environmental conditions followed by a necrotrophic phase where the fungi actively serves a pathogen. While future work is still needed to definitively tease apart the lifestyle strategy of Colletotrichum sp. CLE4, this study provides foundational insight and a high-quality genomic resource for starting to understand the evolutionary trajectory and ecological adaptations of marine-plant associated fungi.

Autoren: Cassandra L. Ettinger, Jonathan A. Eisen, Jason E. Stajich

Letzte Aktualisierung: 2024-12-17 00:00:00

Sprache: English

Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.17.629027

Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.17.629027.full.pdf

Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Änderungen: Diese Zusammenfassung wurde mit Unterstützung von AI erstellt und kann Ungenauigkeiten enthalten. Genaue Informationen entnehmen Sie bitte den hier verlinkten Originaldokumenten.

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