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Avanços na Segmentação Interativa para Imagens Médicas

O MONet melhora a precisão e reduz o trabalho na segmentação de lesões pulmonares.

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Índice

A Segmentação Interativa é um método usado pra delimitar áreas específicas em imagens, especialmente em imagens médicas como tomografias. Isso é super importante pra tarefas como identificar lesões pulmonares em pacientes com COVID-19. Os métodos tradicionais combinam ferramentas automáticas com a participação do usuário pra refinar os resultados. Mas esses sistemas costumam ter dificuldades com dados confusos ou barulhentos, dificultando a adaptação rápida quando as condições mudam.

Desafios na Segmentação

As técnicas de segmentação atuais normalmente exigem muito rotulagem manual, o que é um processo que toma tempo. Em muitos casos, elas não se adaptam facilmente a novos dados ou variações, especialmente quando se deparam com diferentes equipamentos ou condições dos pacientes. Isso é um grande obstáculo quando se trata de lesões pulmonares da COVID-19, já que elas podem aparecer de formas diferentes basendo em vários fatores.

Pra melhorar a situação, são necessários métodos de segmentação interativa que possam se adaptar rapidamente às mudanças. Esses métodos permitem atualizações eficientes em conjuntos de dados rotulados já existentes, facilitando o treinamento de modelos automáticos de segmentação no futuro.

Métodos Existentes

Algumas ferramentas existentes em segmentação interativa mostraram potencial. Por exemplo, o BIFSeg usa caixas delimitadoras e rabiscos desenhados pelo usuário pra ajudar a identificar áreas de interesse. Da mesma forma, o MIDeepSeg permite que os usuários forneçam entradas de clique pra ajustes. Porém, ambos os métodos dependem de redes maiores, o que significa que não se adaptam rapidamente a novos dados sem um esforço computacional significativo.

Outros métodos, como DybaORF e ECONet, tentaram tornar o aprendizado online mais eficiente. O DybaORF usa características feitas à mão, enquanto o ECONet emprega uma rede convolucional rasa pra aprender características e classificações juntas. Apesar desses avanços, o ECONet é limitado porque depende apenas de rabiscos do usuário pra aprender, exigindo muita interação do usuário pra alcançar precisão de nível expert.

Solução Proposta: MONet

Pra resolver essas limitações, foi desenvolvido uma rede adaptativa de probabilidade online em múltiplas escalas, chamada MONet. O MONet combina várias características em diferentes escalas pra melhorar a precisão e a adaptabilidade nas tarefas de segmentação. Ele foca em permitir que correções do usuário influenciem áreas próximas com características semelhantes, aprendendo tanto com as segmentações automáticas iniciais quanto com as entradas do usuário.

O MONet propõe três componentes principais:

  1. Extração de Características em Múltiplas Escalas: Captura características relevantes em várias escalas, resultando em segmentações mais precisas.
  2. Aprendizado Adaptativo: Implementa uma função de perda única que usa correções fornecidas pelo usuário pra aprimorar o aprendizado.
  3. Poda Guiada por Probabilidade: Esse método descarta rótulos incertos das segmentações iniciais pra agilizar o processo de treinamento.

Como o MONet Funciona

O MONet opera pegando uma imagem de tomografia inicial onde um modelo automatizado fez uma segmentação preliminar. Quando o usuário desenha correções ou contornos, o MONet usa essas entradas pra refinar a segmentação inicial. Ele reconhece que as áreas ao redor das correções provavelmente compartilham características semelhantes, aproveitando essa informação pra obter resultados melhores.

A arquitetura do MONet emprega um extrator de características em múltiplas escalas que processa a entrada em diferentes dimensões. Isso permite que ele receba tamanhos variados de características, melhorando seu desempenho em relação a métodos que usam apenas uma única escala. Cada camada do MONet também usa práticas padrão, como normalização em lote e funções de ativação, pra manter saídas de alta qualidade.

Treinamento e Avaliação

Treinar o MONet envolve tanto aprendizado supervisionado quanto interativo. Inicialmente, ele treina em um grande conjunto de dados rotulados, aproveitando a segmentação automática inicial. Na fase interativa, correções do usuário são incorporadas, ajudando o modelo a aprender de forma eficiente sem precisar de um retrain completo pra cada novo volume de tomografia.

O método foi testado por especialistas em um ambiente controlado. Eles compararam os resultados com métodos anteriores de ponta, incluindo ECONet e MIDeepSeg. As avaliações mostraram que o MONet superou esses métodos, alcançando maior precisão enquanto exigia menos esforço percebido dos usuários.

Resultados

Os resultados do estudo são promissores. O MONet não apenas produziu melhor precisão na segmentação, mas também reduziu significativamente a carga de trabalho percebida pelos usuários. As avaliações mostraram que os usuários sentiram menos esforço e frustração ao usar o MONet em comparação com seus predecessores.

Através de uma série de experimentos, o MONet demonstrou que poderia rapidamente e efetivamente se adaptar a novas condições de dados, o que é essencial para aplicações práticas em imagens médicas.

Conclusão

Em resumo, o MONet oferece uma melhoria significativa na segmentação interativa de lesões pulmonares em imagens de tomografia. Ao integrar de forma eficiente interações do usuário e processos automáticos, ele oferece uma solução robusta para os desafios enfrentados nos métodos atuais. As melhorias na precisão e a redução da carga de trabalho dos usuários fazem do MONet uma escolha atrativa pra clínicos e pesquisadores que lidam com tarefas de imagem da COVID-19.

Esse trabalho destaca a importância de sistemas adaptativos em imagens médicas, mostrando que, ao combinar várias estratégias, é possível criar ferramentas que atendem às demandas dos ambientes de saúde modernos.

Fonte original

Título: Adaptive Multi-scale Online Likelihood Network for AI-assisted Interactive Segmentation

Resumo: Existing interactive segmentation methods leverage automatic segmentation and user interactions for label refinement, significantly reducing the annotation workload compared to manual annotation. However, these methods lack quick adaptability to ambiguous and noisy data, which is a challenge in CT volumes containing lung lesions from COVID-19 patients. In this work, we propose an adaptive multi-scale online likelihood network (MONet) that adaptively learns in a data-efficient online setting from both an initial automatic segmentation and user interactions providing corrections. We achieve adaptive learning by proposing an adaptive loss that extends the influence of user-provided interaction to neighboring regions with similar features. In addition, we propose a data-efficient probability-guided pruning method that discards uncertain and redundant labels in the initial segmentation to enable efficient online training and inference. Our proposed method was evaluated by an expert in a blinded comparative study on COVID-19 lung lesion annotation task in CT. Our approach achieved 5.86% higher Dice score with 24.67% less perceived NASA-TLX workload score than the state-of-the-art. Source code is available at: https://github.com/masadcv/MONet-MONAILabel

Autores: Muhammad Asad, Helena Williams, Indrajeet Mandal, Sarim Ather, Jan Deprest, Jan D'hooge, Tom Vercauteren

Última atualização: 2023-09-24 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://arxiv.org/abs/2303.13696

Fonte PDF: https://arxiv.org/pdf/2303.13696

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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