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# Ciências da saúde# Informatica sanitaria

Melhorando os Prontuários Eletrônicos de Saúde com a Ferramenta EHR-QC

Um novo kit de ferramentas melhora a qualidade e a padronização dos registros eletrônicos de saúde.

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Os Prontuários Eletrônicos de Saúde (PES) são versões digitais dos gráficos de papel dos pacientes. Eles têm várias informações de saúde importantes, como detalhes pessoais, resultados de exames, tratamentos e anotações dos médicos. Os PES ficaram super populares em hospitais e clínicas, facilitando o acesso e o uso dos dados de saúde por médicos e pesquisadores. Esses dados podem ser úteis pra muitas coisas, tipo rastrear surtos de doenças, analisar tendências de saúde e estudar a eficácia dos tratamentos. Mas também rolam desafios com os PES, especialmente em relação à qualidade e consistência dos dados.

Importância da Qualidade dos Dados

Um grande problema com os PES é que os dados podem ter erros ou estar incompletos. Isso inclui informações faltando, erros nas entradas e inconsistências entre diferentes sistemas. Esses problemas podem levar a conclusões erradas quando os pesquisadores analisam os dados. Por exemplo, se o peso de uma criança é registrado errado, isso pode resultar em doses de medicação perigosas. Pra resolver essas questões, os pesquisadores criaram várias ferramentas e estruturas pra melhorar a qualidade dos dados dos PES. Porém, muitas dessas ferramentas funcionam só com tipos específicos de dados e não resolvem todos os erros que podem acontecer.

Desafios de Padronização

Outra grande questão com os dados dos PES é a falta de padronização. Diferentes hospitais e clínicas usam formatos e termos diferentes pra descrever a mesma informação. Isso dificulta a combinação de dados de diferentes fontes. Por exemplo, se um hospital registra o diagnóstico de um paciente como "ataque cardíaco" e outro como "infarto do miocárdio", os pesquisadores podem não perceber que estão falando da mesma condição sem uma forma de comparar os termos.

Pra melhorar a situação, os pesquisadores estão buscando maneiras de padronizar os dados dos PES. Isso inclui a criação de formatos comuns para os dados e o uso de uma linguagem consistente entre os diferentes sistemas. Ao tornar os dados mais uniformes, fica mais fácil analisá-los e compartilhá-los entre diferentes prestadores de cuidados de saúde.

O Papel dos Modelos Comuns de Dados

Uma abordagem pra padronizar os dados dos PES é o desenvolvimento de Modelos Comuns de Dados (MCD). Esses modelos fornecem uma estrutura de como os dados devem ser organizados, facilitando a comparação e a análise. O Modelo Comum de Dados da Parceria de Resultados Médicos Observacionais (OMOP-CDM) é um exemplo disso. Ele permite que organizações de saúde convertam seus formatos de dados únicos em uma versão padronizada, facilitando a pesquisa e a colaboração entre diferentes locais.

No entanto, converter dados pra esse formato padrão pode ser complicado. Muitas ferramentas existentes são específicas pra certos formatos e podem não ser flexíveis o suficiente pra se adaptar a diferentes necessidades. Isso levou ao desenvolvimento de ferramentas e métodos mais versáteis pra ajudar no processo de conversão de dados.

Apresentando o EHR-QC Toolkit

Pra ajudar a enfrentar os desafios de padronização e controle de qualidade dos dados dos PES, foi desenvolvido um novo toolkit chamado EHR-QC. Esse toolkit tem como objetivo automatizar o processo de preparação dos dados dos PES pra pesquisa. O EHR-QC inclui recursos pra padronizar formatos de dados, garantir a precisão dos conceitos clínicos e realizar verificações detalhadas na qualidade dos dados.

O toolkit consiste em duas partes principais: o Pipeline de Padronização e o Pipeline de Pré-processamento. O Pipeline de Padronização foca na conversão dos dados dos PES pra um formato padrão, deixando pronto pra análise. O Pipeline de Pré-processamento ajuda os pesquisadores a examinarem os dados em busca de erros e a prepará-los pra uso posterior.

Funcionalidade do EHR-QC Toolkit

O toolkit EHR-QC permite que os usuários insiram dados de várias fontes, seja de bancos de dados existentes ou arquivos planos padrão. Os usuários podem configurar configurações específicas pra personalizar o processo de acordo com suas necessidades. Essa flexibilidade significa que o toolkit pode se adaptar a diferentes tipos e formatos de dados dos PES.

Uma das funções principais do EHR-QC é a migração de dados pro esquema OMOP-CDM. Esse processo garante que os dados dos PES sejam convertidos corretamente e de forma consistente. O toolkit pode importar dados, mapear pra termos padrões e exportá-los no formato desejado. Durante o processo, várias verificações são realizadas pra garantir que os dados permaneçam precisos e que qualquer discrepância seja resolvida.

Mapeamento de Conceitos e Padronização de Terminologia

Uma parte crucial da padronização dos dados dos PES envolve mapear conceitos clínicos pra um vocabulário comum. Isso significa que os termos usados em diferentes sistemas de PES precisam estar alinhados com terminologias padrão, como as usadas pra medicamentos e doenças. O toolkit EHR-QC inclui um método inovador pra mapeamento automático de conceitos. Essa técnica combina múltiplas abordagens pra melhorar a precisão do mapeamento de termos clínicos, enquanto maximiza a cobertura dos conceitos analisados.

O toolkit utiliza uma combinação de técnicas de correspondência difusa e avaliações de similaridade semântica pra encontrar as correspondências mais próximas entre os termos clínicos em diferentes sistemas. Ao refinar esses mapeamentos, os pesquisadores podem alinhar melhor seus dados com padrões estabelecidos, tornando as análises mais robustas e confiáveis.

Pré-processamento de Dados para Análise

Além de padronizar formatos de dados, o toolkit EHR-QC inclui funções de pré-processamento pra uma análise exploratória detalhada e garantia de qualidade. Essas funções ajudam os usuários a identificar e resolver quaisquer anomalias nos dados dos PES, como informações faltando e outliers.

Os recursos de exploração de dados fornecem aos usuários relatórios que resumem as características principais dos dados dos PES. Esses relatórios incluem informações sobre valores ausentes, distribuições e outras métricas importantes. Ao visualizar esses dados, os pesquisadores podem rapidamente identificar potenciais problemas que podem precisar ser corrigidos antes de realizar análises mais detalhadas.

Lidando com Dados Faltantes e Outliers

Lidar com dados faltantes é um aspecto significativo pra garantir a qualidade dos dados. O toolkit EHR-QC incorpora vários métodos pra tratar entradas faltantes, permitindo que os usuários escolham a melhor abordagem com base nas características do conjunto de dados. Ao testar diferentes técnicas de imputação, o toolkit pode identificar o método mais eficaz pra preencher as lacunas nos dados.

Da mesma forma, o toolkit também oferece ferramentas pra detectar e resolver outliers nos dados. Usando técnicas estatísticas avançadas, ele pode identificar valores extremos que podem distorcer os resultados da análise. Isso permite que os pesquisadores apliquem correções ou removam pontos de dados problemáticos, garantindo que a qualidade dos dados permaneça alta no geral.

Conclusão

O toolkit EHR-QC representa um grande avanço na gestão de prontuários eletrônicos de saúde. Ao automatizar os processos de padronização, controle de qualidade e preparação de dados, ele fornece uma solução abrangente pra pesquisadores e prestadores de saúde. A capacidade de converter dados dos PES pra um formato padronizado facilita uma colaboração e análise melhores entre diferentes cenários de saúde.

À medida que a saúde continua a se desenvolver e a pesquisa orientada por dados se torna mais prevalente, ferramentas como o EHR-QC vão desempenhar um papel crítico em garantir que os prontuários eletrônicos de saúde sejam precisos, confiáveis e úteis pra melhorar o atendimento ao paciente. No final das contas, esse toolkit não só melhora a eficiência da pesquisa, mas também contribui pra melhores resultados em saúde e um sistema de saúde mais integrado.

Fonte original

Título: EHR-QC: A streamlined pipeline for automated electronic health records standardisation and preprocessing to predict clinical outcomes

Resumo: The adoption of electronic health records (EHRs) has created opportunities to analyze historical data for predicting clinical outcomes and improving patient care. However, non-standardized data representations and anomalies pose major challenges to the use of EHRs in digital health research. To address these challenges, we have developed EHR-QC, a tool comprising two modules: the data standardization module and the preprocessing module. The data standardization module migrates source EHR data to a standard format using advanced concept mapping techniques, surpassing expert curation in benchmarking analysis. The preprocessing module includes several functions designed specifically to handle healthcare data subtleties. We provide automated detection of data anomalies and solutions to handle those anomalies. We believe that the development and adoption of tools like EHR-QC is critical for advancing digital health. Our ultimate goal is to accelerate clinical research by enabling rapid experimentation with data-driven observational research to generate robust, generalisable biomedical knowledge. HighlightsO_LIEHR-QC accepts EHR data from a relational database or as a flat file and provide an easy-to-use, customized, and comprehensive solution for data handling activities. C_LIO_LIIt offers a modular standardization pipeline that can convert any EHR data to a standardized data model i.e. OMOP-CDM. C_LIO_LIIt includes an innovative algorithmic solution for clinical concept mapping that surpasses the current expert curation process. C_LIO_LIWe have demonstrated that the imputation performance depends on the nature and missing proportion, hence as part of EHR-QC we included a method that searches for the best imputation method for the given data. C_LIO_LIIt also contains an end-to-end solution to handle other anomalies such as outliers, errors, and other inconsistencies in the EHR data. C_LI

Autores: Sonika Tyagi, Y. Ramakrishnaiah, N. Macesic, A. Peleg

Última atualização: 2023-06-02 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.05.30.23290765

Fonte PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.05.30.23290765.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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