Insights sobre o Envelhecimento: Metilação do DNA em Vespas Joia
Essa pesquisa revela conexões entre a metilação do DNA e o envelhecimento em vespas joia.
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Índice
- Modelos de Pesquisa Atual
- O Surgimento dos Estudos Ómicos
- O Relógio Epigenético
- Duração da Vida e Configuração do Estudo
- Extraindo DNA
- Sequenciamento e Análise de Dados
- Principais Conclusões: Metilação Diferencial
- Variabilidade na Metilação
- Entropia Epigenética
- Construindo o Relógio Epigenético
- Conclusões e Implicações
- Fonte original
Envelhecer é um processo natural que afeta todos os seres vivos. Ele traz mudanças em como nossas células e corpos funcionam. Conforme a gente envelhece, nossos corpos ficam mais suscetíveis a doenças. O envelhecimento é influenciado por muitos fatores, incluindo nossos genes e o ambiente em que vivemos. Essa mistura pode dificultar o estudo do envelhecimento de forma completa, especialmente em animais mais complexos, como os mamíferos. Por causa disso, os pesquisadores geralmente estudam organismos mais simples, como vermes minúsculos e moscas-das-frutas, para entender o básico sobre o envelhecimento.
Modelos de Pesquisa Atual
Os cientistas descobriram muitos benefícios em usar criaturas simples para os estudos de envelhecimento. Elas são mais fáceis e baratas de manter em laboratórios e têm uma vida útil mais curta. Esses fatores tornam mais simples observar as mudanças ao longo do tempo. Muitos desses pequenos modelos têm seu material genético mapeado, o que ajuda na pesquisa. No entanto, nem todos têm as mesmas características genéticas que os humanos. Por exemplo, dois modelos comuns, Drosophila (moscas-das-frutas) e C. elegans (vermes cilíndricos), não têm uma característica conhecida como Metilação do DNA.
A metilação do DNA é um processo que adiciona um pequeno marcador químico chamado grupo metila a uma parte do DNA. Essa mudança pode influenciar como os genes se comportam e pode afetar as funções gerais do corpo. Estudos mostraram que, à medida que os organismos envelhecem, seus padrões de metilação do DNA mudam significativamente. Essas mudanças desempenham um papel em como o envelhecimento se apresenta e se sente. Embora os animais modelo comuns não tenham essa característica, outros tipos de invertebrados, como formigas e abelhas, mostram sinais de mudanças na metilação do DNA relacionadas ao envelhecimento.
Um organismo que poderia ajudar os pesquisadores a estudar o envelhecimento melhor é a vespa joia, conhecida cientificamente como Nasonia vitripennis. Essa vespa tem alguns dos mesmos benefícios que outros animais de estudo e também possui um sistema de metilação funcional. Os pesquisadores estão agora trabalhando para ver como sua metilação muda conforme a vespa envelhece.
O Surgimento dos Estudos Ómicos
Avanços recentes na tecnologia permitiram que os cientistas estudassem a metilação do DNA mais de perto do que antes. Um método comum é chamado de sequenciamento de bisulfito de genoma completo. Essa técnica permite que os pesquisadores analisem os diferentes padrões de metilação em todo o genoma. Uma maneira de identificar mudanças é através de algo chamado Posições Metiladas Diferencialmente, ou DMPs, que são áreas do DNA que se tornam mais ou menos metiladas à medida que o organismo envelhece.
Os cientistas também descobriram que a variabilidade do processo de metilação aumenta conforme um indivíduo envelhece. Essa imprevisibilidade aumentada é chamada de deriva epigenética. Ela pode afetar a capacidade do corpo de manter funções estáveis. Os pesquisadores podem medir essa deriva de algumas maneiras. Um método observa quanto a metilação muda em locais específicos, enquanto outro calcula a perda geral de informação nos padrões de metilação ao longo do tempo.
O Relógio Epigenético
Uma descoberta interessante na pesquisa sobre envelhecimento é a ideia de um relógio epigenético. Esse relógio usa dados de muitos genes para estimar quão velho um organismo é biologicamente. Os pesquisadores descobriram que essa idade biológica pode, às vezes, dar uma ideia melhor dos riscos à saúde do que a idade cronológica. No entanto, ainda não está claro como esses relógios funcionam completamente.
Neste estudo recente, os cientistas queriam analisar as mudanças nos padrões de metilação em Nasonia vitripennis para ver se ela tem um metiloma relacionado ao envelhecimento. Isso ajudaria a entender se há mudanças detectáveis nos DNA à medida que a vespa envelhece.
Duração da Vida e Configuração do Estudo
A pesquisa focou na vida útil das vespas Nasonia, que foram mantidas em condições controladas de laboratório. As vespas foram separadas por gênero e sua sobrevivência foi monitorada de perto. Este estudo incluiu tanto vespas machos quanto fêmeas, fornecendo uma visão abrangente de suas durações de vida e como elas podem diferir.
Extraindo DNA
Para estudar o DNA das vespas, os pesquisadores as coletaram logo após a eclosão. Algumas podem já ter acasalado. As vespas foram colocadas em frascos, receberam comida e os pesquisadores acompanharam suas taxas de sobrevivência. Várias amostras foram coletadas em diferentes idades para ver como a metilação do DNA mudava ao longo do tempo.
As vespas foram congeladas para a extração de DNA, que foi feita usando um kit especial. A qualidade do DNA foi medida para garantir que estava bom para sequenciamento.
Sequenciamento e Análise de Dados
Os pesquisadores usaram técnicas modernas para sequenciar todo o genoma das vespas. Eles incluíram uma amostra controle durante o processo para checar se as mudanças na metilação eram precisas. Após o sequenciamento, os dados foram examinados para encontrar diferenças significativas nos padrões de metilação com base na idade das vespas.
Analisando os dados, os pesquisadores procuraram locais específicos no DNA onde a metilação havia mudado. Eles prestaram atenção especial a locais que mostraram diferenças claras entre amostras coletadas em diferentes idades.
Principais Conclusões: Metilação Diferencial
O estudo encontrou um grande número de locais no DNA da vespa que mostraram mudanças significativas na metilação à medida que envelheceram. Muitos desses locais eram mais metilados ou menos metilados, o que correspondia a genes específicos. Os pesquisadores descobriram que as vespas machos e fêmeas tinham padrões diferentes de metilação à medida que envelheciam.
Para os machos, alguns genes se tornaram mais metilados, enquanto outros se tornaram menos. As fêmeas mostraram um padrão diferente. Esses resultados foram essenciais para ajudar os pesquisadores a entender as implicações biológicas dessas mudanças.
Variabilidade na Metilação
Além de olhar para mudanças específicas na metilação, os pesquisadores também analisaram quão variáveis essas mudanças eram. Eles identificaram muitos locais no DNA onde os níveis de metilação variavam com a idade. Esses foram chamados de posições metiladas de forma variável (VMPs). Eles localizaram muitas dessas VMPs em diferentes genes, sugerindo um amplo impacto na genética da vespa à medida que envelhecia.
Entropia Epigenética
Os pesquisadores também olharam para um conceito chamado entropia epigenética, que indica quão imprevisíveis os padrões de metilação se tornam à medida que a vespa envelhece. Eles descobriram que essa imprevisibilidade diferia entre vespas machos e fêmeas. As fêmeas mostraram um padrão claro de aumento da imprevisibilidade, enquanto os machos não apresentaram uma relação significativa entre idade e entropia.
Construindo o Relógio Epigenético
Para estudar melhor o processo de envelhecimento, os pesquisadores construíram um relógio epigenético a partir de suas descobertas. Ao olhar para os locais-chave de metilação, eles criaram uma forma de prever a idade biológica das vespas. O relógio que desenvolveram estava intimamente ligado à idade real das vespas, mostrando que poderia refletir com precisão seu estado biológico.
Conclusões e Implicações
O estudo mostra que a Nasonia vitripennis fornece insights valiosos sobre a relação entre a metilação do DNA e o envelhecimento. Os pesquisadores encontraram padrões claros de mudanças no DNA com a idade, incluindo posições metiladas diferencialmente, metilação variável e um relógio epigenético que prevê com precisão a idade da vespa.
Essa pesquisa tem implicações para entender o envelhecimento em outras espécies, inclusive em humanos. Ela abre novas avenidas para estudar como fatores ambientais e escolhas de estilo de vida afetam nossos processos biológicos de envelhecimento.
Ao estabelecer uma espécie de inseto modelo para estudar mudanças epigenéticas relacionadas ao envelhecimento, esta pesquisa paveia o caminho para futuras explorações no campo, incluindo possíveis intervenções para influenciar como envelhecemos.
Título: Exploring the ageing methylome in the model insect,Nasonia vitripennis
Resumo: BackgroundThe ageing process is a multifaceted phenomenon marked by the gradual deterioration of cellular and organismal functions, accompanied by an elevated susceptibility to diseases. The intricate interplay between genetic and environmental factors complicates research, particularly in complex mammalian models. In this context, simple invertebrate organisms have been pivotal, but the current models lack detectable DNA methylation limiting the exploration of this critical epigenetic ageing mechanism. This study introduces Nasonia vitripennis, the jewel wasp, as an innovative invertebrate model for investigating the epigenetics of ageing. Leveraging its advantages as a model organism and possessing a functional DNA methylation system, Nasonia emerges as a valuable addition to ageing research. ResultsWhole-genome bisulfite sequencing unveiled dynamic alterations in DNA methylation, with differentially methylated CpGs between distinct time points in both male and female wasps. These changes were associated with numerous genes, enriching for functions related to telomere maintenance, histone methylation, and mRNA catabolic processes. Additionally, other CpGs were found to be variably methylated at each timepoint. Sex-specific effects on epigenetic entropy were observed, indicating differential patterns in the loss of epigenetic stability over time. Constructing an epigenetic clock containing 19 CpGs revealed a robust correlation between epigenetic age and chronological age. ConclusionsNasonia vitripennis emerges as a promising model for investigating the epigenetics of ageing, shedding light on the intricate dynamics of DNA methylation and their implications for age-related processes. This research not only expands the repertoire of ageing models but also opens avenues for deeper exploration of epigenetic mechanisms in the context of ageing.
Autores: Eamonn B Mallon, K. Brink, C. Thomas, A. Jones, T. W. Chan
Última atualização: 2024-03-01 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.02.14.528436
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.02.14.528436.full.pdf
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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