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# Biologia# Genética

Ervilhas: Um Mergulho Profundo na Genética Delas

Analisando a diversidade genética e as características das ervilhas para futuros cruzamentos.

― 8 min ler


Insights Genéticos sobreInsights Genéticos sobreErvilhasda genética da ervilha.Novas descobertas mudam a compreensão
Índice

Ervilhas são um tipo de planta que vem sendo cultivada há milhares de anos. Elas se originaram de uma região conhecida como Crescente Fértil, que fica em partes do Oriente Médio. Hoje em dia, as ervilhas são principalmente cultivadas como uma colheita de campo. Cerca de três quartos das ervilhas são usados pelas suas Sementes secas, enquanto o resto é cultivado para consumo fresco como vegetais. Nos últimos anos, o mercado de ervilhas cresceu muito, com exportações chegando a cerca de três bilhões de dólares em 2022. As ervilhas também são às vezes usadas como ração para animais e são populares em jardins caseiros.

Diversidade das Ervilhas

As ervilhas vêm em muitos tipos diferentes, tanto em termos de sua composição genética quanto de suas características físicas. As diferenças genéticas entre as várias plantas de ervilha são bem significativas, muito mais do que vemos nos humanos. Existem dois grupos principais de ervilhas: as cultivadas, que são principalmente Pisum sativum, e as selvagens conhecidas como P. fulvum. Essas ervilhas selvagens são bem diferentes dos tipos cultivados, exibindo traços genéticos únicos que podem afetar sua capacidade de reprodução. Além disso, outro tipo, P. abyssinicum, tem suas próprias diferenças genéticas, que também podem impactar a reprodução.

Essas variações são reconhecidas há muito tempo, datando pelo menos do século 16. Um botânico chamado Gerard ilustrou várias formas de ervilhas, descrevendo suas características únicas, como sementes rugosas. As características das ervilhas, incluindo suas flores grandes e o fato de que muitas vezes se cruzam entre si (endogamia), tornaram-nas ideais para um cientista chamado Gregor Mendel. Mendel é conhecido por estudar como características são transmitidas de uma geração para a próxima, e ele usou ervilhas para conduzir seus experimentos.

Trabalho de Mendel com Ervilhas

Os experimentos de Mendel são considerados alguns dos melhores já feitos na área da genética. Ele examinou várias características nas ervilhas, como forma da semente, cor da vagem e altura da planta. Seu trabalho lançou as bases para o estudo da genética, mas muitos detalhes sobre os genes subjacentes que controlam essas características ainda estavam pouco claros, mesmo depois de mais de cem anos.

Em estudos recentes, cientistas têm usado técnicas avançadas para analisar as variações genéticas nas ervilhas. Eles coletaram informações sobre 697 linhas de ervilha e sequenciaram seus genomas para criar um Mapa Genético que detalha a relação entre diferentes plantas de ervilha. Conseguiram identificar cerca de 154,8 milhões de variações de alta qualidade dentro dessas plantas, focando principalmente em polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs). Essa pesquisa não só lança luz sobre as relações entre diferentes tipos de ervilhas, mas também ajuda a definir a estrutura genética em que elas se enquadram.

Variação Genética e Características

Depois de compilar os dados genéticos, os pesquisadores focaram em características específicas que Mendel havia observado. Eles analisaram características como sementes redondas vs. rugosas, a cor das vagens e a altura das plantas.

Sementes Redondas vs. Rugosas

Ao examinar a diferença entre sementes redondas e rugosas, os pesquisadores encontraram um sinal genético forte associado a uma localização específica no genoma. Essa localização corresponde a um gene responsável pelo ramificamento do amido, que afeta a textura das sementes de ervilha. Descobriu-se que uma mutação específica nesse gene leva à aparência rugosa de algumas ervilhas. Essa descoberta ajuda a explicar por que certas variedades de ervilhas são cultivadas para diferentes propósitos-sementes redondas são frequentemente preferidas para armazenamento a longo prazo, enquanto sementes rugosas são tipicamente colhidas mais cedo.

Cotiledones Verdes vs. Amarelos

As ervilhas também mostram variações na cor dos cotiledones, com alguns sendo verdes e outros amarelos. Os pesquisadores identificaram um gene que controla se os cotiledones ficam amarelos. Descobriram que algumas linhas de ervilha carregam mutações nesse gene, que afetam significativamente a cor dos cotiledones. Esse conhecimento é essencial para os breeders que querem desenvolver novas variedades com características específicas.

Cor da Vagem

A cor da própria vagem é outra característica importante. Embora a maioria das pesquisas sobre cor de vagem tenha se concentrado em vagens amarelas, os pesquisadores estabeleceram que o gene responsável por essa cor também afeta outras partes da planta, incluindo folhas e flores. Encontraram uma deleção específica no DNA que parece correlacionar com a cor da vagem amarela, fornecendo insights sobre a base genética dessa característica.

Forma da Vagem

A forma das vagens de ervilha é determinada por dois genes, e os pesquisadores encontraram regiões genéticas significativas associadas à forma das vagens. Essas descobertas destacam os fatores genéticos intrincados que influenciam a aparência física das ervilhas, especialmente em relação à estrutura da vagem.

Altura da Planta

Outra característica que Mendel estudou foi a altura das plantas. Os pesquisadores identificaram um sinal genético importante que corresponde a um gene que regula a altura da planta, que está envolvido no sistema hormonal da planta. Eles notaram que variantes específicas nesse gene estão ligadas a plantas mais baixas, o que é importante para práticas de reprodução que visam produzir plantas com alturas desejáveis.

Posição da Flor

A posição da flor no caule também é uma característica que Mendel analisou. Os pesquisadores encontraram sinais genéticos significativos associados a essa característica e continuaram a explorar a complexidade genética por trás dela. Descobriram um lócus adicional que parece modificar o fenótipo da posição da flor, sugerindo que a genética pode ser mais complicada do que se pensava anteriormente.

Expansão da Análise de Características

Mendel inicialmente se concentrou em características claras, mas muitas características das plantas existem em um espectro. No estudo atual, os cientistas examinaram 74 características adicionais relacionadas às ervilhas, incluindo aquelas que afetam sementes, vagens e flores. Usaram uma abordagem abrangente para identificar numerosos marcadores genéticos associados a essas características.

Entre as novas descobertas estavam características identificadas anteriormente, como cor das folhas e largura da vagem. Os pesquisadores localizaram novos lócus genéticos que influenciam essas características agrícolas importantes, e os resultados fornecem informações valiosas para programas de reprodução futuros.

Complexidade Genética nas Ervilhas

A pesquisa de Mendel revelou que algumas características podem ser afetadas por múltiplos genes, conhecidas como Características Poligênicas. Os pesquisadores descobriram que as características estudadas por Mendel não dependem apenas de variantes genéticas raras; na verdade, correspondem a variações genéticas mais significativas. Por exemplo, em características como altura da planta e forma da vagem, as variações genéticas eram bastante substanciais e não apenas devido a pequenas diferenças.

Além das características recém-caracterizadas, o estudo também revelou descobertas inesperadas. Por exemplo, descobriram que várias características que influenciam a pigmentação e o tamanho são moldadas por múltiplos lócus trabalhando juntos, mostrando que a genética das plantas pode ser bem intricada.

Direções Futuras

As descobertas significativas desse trabalho abrem portas para uma gama de estudos futuros. Uma área de foco será usar novas tecnologias, como sequenciamento de DNA de leitura longa, para aprofundar as variações complexas encontradas na genética das ervilhas. Também há uma necessidade de investigar como genes específicos interagem entre si, particularmente em casos de redundância genética-quando múltiplos genes desempenham funções semelhantes. Essas interações podem ajudar a explicar variações em características que eram difíceis de entender anteriormente.

Conclusão

O estudo das ervilhas é mais do que apenas entender uma única espécie de planta. A diversidade genética e as características associadas às ervilhas oferecem uma área rica para pesquisa que pode levar a avanços nas práticas de reprodução de plantas. Os mapas genéticos detalhados e os marcadores apresentados neste estudo servem como um recurso valioso para futuros trabalhos, visando desvendar ainda mais as complexidades da genética das ervilhas e melhorar as práticas agrícolas para uma melhor produção de colheitas. Essa pesquisa não apenas honra o trabalho pioneiro de Mendel, mas também prepara o terreno para o futuro da genética e reprodução de plantas.

Fonte original

Título: Genomic and Genetic Insights into Mendel's Pea Genes

Resumo: Pea, Pisum sativum, is an excellent model system through which Gregor Mendel established the foundational principles of inheritance. Surprisingly, till today, the molecular nature of the genetic differences underlying the seven pairs of contrasting traits that Mendel studied in detail remains partially understood. Here, we present a genomic and phenotypic variation map, coupled with haplotype-phenotype association analyses across a wide range of traits in a global Pisum diversity panel. We focus on a genomics-enabled genetic dissection of each of the seven traits Mendel studied, revealing many previously undescribed alleles for the four characterized genes, R, Le, I and A, and elucidating the gene identities and mutations for the remaining three uncharacterized traits. Notably, we identify: (1) a ca. 100kb deletion upstream of the Chlorophyll synthase (ChlG) gene, which generates aberrant transcripts and confers the yellow pod phenotype of gp mutants; (2) an in-frame premature stop codon mutation in a Dodeca-CLE41/44 signalling peptide which explains the parchmentless mutant phenotype corresponding to p; and (3) a 5bp in-frame deletion in a CIK-like receptor kinase gene corresponding to the fasciated stem phenotype fa, which Mendel described in terms of flower position, and we postulate the existence of a Modifier of fa (Mfa) locus that masks this meristem defect. Mendel noted the pleiotropy of the a mutation, including inhibition of axil ring anthocyanin pigmentation, a trait we found to be controlled by allelic variants of the gene D within an R2R3-MYB gene cluster. Furthermore, we characterize and validate natural variation of a quantitative genetic locus governing both pod width and seed weight, characters that Mendel deemed were not sufficiently demarcated for his analyses. This study establishes a cornerstone for fundamental research, education in biology and genetics, and pea breeding practices.

Autores: Shifeng Cheng, C. Feng, B. Chen, J. Hofer, Y. Shi, M. Jiang, B. Song, L. Lu, L. Wang, A. Howard, A. Bendahmane, A. Fouchal, C. Moreau, C. Sawada, C. LeSignor, E. Barclay, E. Vikeli, G. Tsanakas, H. Zhao, J. Cheema, L. Sayers, L. Wingen, M. Vigouroux, M. Vickers, M. Ambrose, M. Dalmais, P. Higuera-Poveda, R. Spanner, R. Horler, R. Wouters, S. Chundakkad, X. Zhao, X. Li, Y. Sun, Z. Huang, X. Deng, B. Steuernagel, C. Domoney, N. Ellis, N. Chayut

Última atualização: 2024-06-03 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.31.596837

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.31.596837.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

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