Aproveitando Modelos de Linguagem para Detecção de Alzheimer
Usando modelos de linguagem pra melhorar a identificação dos sinais de Alzheimer em registros clínicos.
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Índice
- Visão Geral da Doença de Alzheimer
- O Papel dos Modelos de Linguagem Grandes na Geração de Dados
- Criando uma Taxonomia para os Sintomas de Alzheimer
- Métodos Usados para Geração de Dados
- Conjuntos de Dados Usados na Pesquisa
- Impacto da Verificação de Dados no Desempenho
- Superando Desafios em Dados Clínicos
- Avaliação dos Resultados do LLM
- Qualidade da Geração de Dados
- Analisando os Resultados
- Conclusão
- Direções Futuras
- Visão Geral do Trabalho Relacionado
- Desafios da Mineração de Texto Clínico
- Estratégias para Melhoria
- Processo de Anotação de Dados
- Próximos Passos
- Resumo
- Fonte original
- Ligações de referência
Modelos de Linguagem Grandes (LLMs) conseguem criar textos que soam naturais e são usados em várias áreas, incluindo medicina. Uma área que ainda não foi totalmente explorada é como usar esses modelos para ajudar a extrair informações importantes de registros clínicos, principalmente em casos onde os dados são limitados, sensíveis ou distribuídos de forma desigual. Este artigo investiga como os LLMs podem ajudar a identificar sinais e sintomas da Doença de Alzheimer (DA) a partir de registros eletrônicos de saúde (EHRs). Essa tarefa é bem difícil, pois exige alto nível de especialização.
Visão Geral da Doença de Alzheimer
A Doença de Alzheimer é uma condição séria que afeta muitos adultos ao redor do mundo. Ela causa problemas com memória, comportamento e na realização de atividades do dia a dia. Identificar sinais e sintomas da DA nos registros médicos é essencial para um diagnóstico precoce e planejamento de cuidados. No entanto, essa tarefa fica mais complicada devido ao pouco dado médico disponível e à complexidade dos sintomas.
O Papel dos Modelos de Linguagem Grandes na Geração de Dados
Os LLMs mostraram um desempenho forte em várias tarefas de linguagem natural. No entanto, o uso deles na mineração de textos médicos ainda não foi explorado profundamente, devido aos desafios únicos nesta área. Este trabalho investiga como os LLMs podem ajudar a criar Dados Sintéticos para auxiliar na identificação de sinais e sintomas relacionados à DA.
Criando uma Taxonomia para os Sintomas de Alzheimer
Para guiar os LLMs na geração de dados úteis, desenvolvemos um sistema de classificação simples para os sintomas da DA, baseado em conhecimento de especialistas. Esse sistema inclui nove tipos de sintomas que cobrem as diferentes áreas afetadas pela DA: aspectos cognitivos, comportamentais e funcionais.
Métodos Usados para Geração de Dados
Aplicamos dois métodos para gerar dados com os LLMs:
- Data-to-Label: Rotulamos frases de uma coleção pública de EHRs para identificar sinais e sintomas relacionados à DA.
- Label-to-Data: Geramos novas frases com base nas definições de sinais e sintomas da DA.
Esses métodos ajudam a deixar o processo de coleta de dados mais eficiente e nos permitem usar dados sintéticos para apoiar a tarefa de classificação.
Conjuntos de Dados Usados na Pesquisa
Para treinar nosso sistema, utilizamos três conjuntos de dados:
- Gold Dataset: Este conjunto consiste em anotações de especialistas em EHRs de pacientes com DA, aprovado para uso pelas autoridades competentes.
- Silver Dataset: Este conjunto inclui frases do banco de dados MIMIC-III, anotadas usando o método data-to-label.
- Bronze Dataset: Este conjunto contém frases geradas pelo LLM usando o método label-to-data.
Descobrimos que usar os conjuntos de dados silver e bronze melhorou o desempenho do sistema em comparação ao uso apenas do conjunto gold.
Impacto da Verificação de Dados no Desempenho
Para testar nossos métodos, criamos sistemas que conseguem identificar sinais e sintomas relacionados à DA a partir de EHRs. Ao combinar diferentes conjuntos de dados para o treinamento, vimos melhorias significativas. Por exemplo, quando juntamos os conjuntos gold e bronze, a precisão frequentemente superou os resultados obtidos apenas com os dados gold.
Superando Desafios em Dados Clínicos
Os principais obstáculos na mineração de textos clínicos vêm da disponibilidade limitada e da sensibilidade dos dados médicos. Nossa abordagem usou LLMs para lidar com esses desafios, permitindo gerar conjuntos de dados sintéticos que capturam a linguagem clínica importante sem incluir informações pessoais sensíveis.
Avaliação dos Resultados do LLM
Embora os LLMs consigam criar dados úteis, há problemas comuns como imprecisões factuais, conhecidas como alucinações. Essas discrepâncias podem afetar a qualidade das informações extraídas. No entanto, exploramos se essas imprecisões poderiam ser usadas de forma positiva para gerar dados sintéticos que mantêm as características essenciais dos textos clínicos.
Qualidade da Geração de Dados
Comparamos os resultados dos conjuntos de dados silver e bronze e descobrimos que a qualidade das anotações variou. Os dados bronze mostraram melhor confiabilidade em comparação com os dados silver. A avaliação revelou que os LLMs produziram resultados mais consistentes no conjunto bronze, resultando em um treinamento de modelo mais eficaz.
Analisando os Resultados
Ao avaliar vários modelos através de diferentes combinações de conjuntos de dados, observamos que os modelos se beneficiaram muito de incorporar os conjuntos de dados silver e bronze. Os resultados confirmaram que usar dados gerados por LLM pode levar a melhorias substanciais na identificação de condições relacionadas à DA.
Conclusão
Este estudo destaca o potencial de usar modelos de linguagem grandes para melhorar a geração de dados clínicos para identificar sinais e sintomas da Doença de Alzheimer. Ao introduzir um novo processo de classificação e gerar conjuntos de dados sintéticos através dos LLMs, encontramos melhorias nos sistemas de detecção. Nossos achados mostram a utilidade de incorporar conhecimento de especialistas nas saídas dos LLMs e sugerem novas oportunidades para aplicações futuras de dados médicos.
Direções Futuras
Olhando para o futuro, planejamos explorar métodos adicionais para melhorar a qualidade das anotações produzidas pelos LLMs. Isso inclui abordar preocupações éticas e garantir que nossa abordagem permaneça responsável e segura. Também pretendemos aplicar nossos métodos a outras áreas dentro do processamento de texto clínico para continuar melhorando a acessibilidade e qualidade dos dados.
Visão Geral do Trabalho Relacionado
À medida que os LLMs avançaram muito, suas capacidades em gerar textos úteis em diferentes campos foram reconhecidas. No entanto, os desafios, como o risco de alucinações, continuam sendo uma preocupação em aplicações clínicas. Outras pesquisas exploraram a viabilidade de usar LLMs para extrair e analisar informações de registros clínicos.
Desafios da Mineração de Texto Clínico
A mineração de texto clínico tem muitas aplicações, mas também enfrenta desafios como a disponibilidade limitada de dados médicos diversos e a necessidade de privacidade dos dados. Foram feitos esforços para criar conjuntos de dados públicos e dados sintéticos para ajudar no treinamento de modelos para analisar textos clínicos. Apesar desse progresso, problemas com qualidade e consistência dos dados continuam a surgir.
Estratégias para Melhoria
Existem várias maneiras de enfrentar os problemas associados às saídas dos LLMs. As estratégias incluem limpar os dados de treinamento para reduzir erros, incorporar conhecimento externo para melhorar a compreensão do modelo e usar feedback humano para verificar os dados gerados.
Processo de Anotação de Dados
As diretrizes de anotação que desenvolvemos foram baseadas em insights de especialistas e refinadas através das saídas dos LLMs. Essas diretrizes desempenharam um papel crucial em garantir que os dados gerados fossem tanto precisos quanto relevantes.
Próximos Passos
Pesquisas futuras buscarão refinar ainda mais os processos envolvidos na geração e validação das saídas dos LLMs. Além disso, examinaremos as implicações do uso de LLMs em contextos médicos e como abordar considerações éticas de forma eficaz.
Resumo
Em resumo, aproveitar os LLMs para a augmentação de dados clínicos representa uma avenida promissora para melhorar a detecção de sinais e sintomas da Doença de Alzheimer. Com os resultados positivos observados em nossas várias combinações de conjuntos de dados, esperamos abrir caminho para novas abordagens na análise de dados médicos no futuro.
Título: Two Directions for Clinical Data Generation with Large Language Models: Data-to-Label and Label-to-Data
Resumo: Large language models (LLMs) can generate natural language texts for various domains and tasks, but their potential for clinical text mining, a domain with scarce, sensitive, and imbalanced medical data, is underexplored. We investigate whether LLMs can augment clinical data for detecting Alzheimer's Disease (AD)-related signs and symptoms from electronic health records (EHRs), a challenging task that requires high expertise. We create a novel pragmatic taxonomy for AD sign and symptom progression based on expert knowledge, which guides LLMs to generate synthetic data following two different directions: "data-to-label", which labels sentences from a public EHR collection with AD-related signs and symptoms; and "label-to-data", which generates sentences with AD-related signs and symptoms based on the label definition. We train a system to detect AD-related signs and symptoms from EHRs, using three datasets: (1) a gold dataset annotated by human experts on longitudinal EHRs of AD patients; (2) a silver dataset created by the data-to-label method; and (3) a bronze dataset created by the label-to-data method. We find that using the silver and bronze datasets improves the system performance, outperforming the system using only the gold dataset. This shows that LLMs can generate synthetic clinical data for a complex task by incorporating expert knowledge, and our label-to-data method can produce datasets that are free of sensitive information, while maintaining acceptable quality.
Autores: Rumeng Li, Xun Wang, Hong Yu
Última atualização: 2023-12-09 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://arxiv.org/abs/2401.06774
Fonte PDF: https://arxiv.org/pdf/2401.06774
Licença: https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/
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