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# Biologia# Biologia do Desenvolvimento

Desvendando o Destino Celular no Desenvolvimento Embrionário Inicial

Este estudo mostra como as células embrionárias se diferenciam em linhagens distintas.

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Nos estágios iniciais do desenvolvimento, as células passam por um processo chamado gastrulação. Durante esse tempo, as células em uma estrutura conhecida como blastula começam a assumir papéis específicos, levando à formação de diferentes partes do embrião. Sinais de genes ajudam a guiar essas mudanças. Um sinal crucial nesse processo vem de uma proteína chamada Nodal. Essa proteína ajuda a moldar a formação de dois grupos importantes de células: o Mesoderma e o Endoderma. O mesoderma se torna a camada média de tecidos, enquanto o endoderma forma a camada mais interna, que eventualmente se desenvolve em órgãos como o intestino.

O Papel do Nodal na Determinação do Destino Celular

Nodal faz parte de uma família maior de proteínas chamada TGF-β. Ela atua como um morfógeno, o que significa que fornece informações com base em sua concentração no ambiente embrionário. Quando as concentrações de Nodal estão altas, tende a empurrar as células para se tornarem células endodermicas. Níveis mais baixos de sinalização de Nodal incentivam as células a se desenvolverem em células mesodermicas. À medida que o embrião começa a gastrulação, Nodal causa uma mistura desses dois tipos de células precursoras, mas como essas células eventualmente se tornam mais especializadas ainda não está totalmente entendido.

Pesquisas recentes mostraram que outras vias de sinalização colaboram com o Nodal na determinação de como as células diferenciam-se em endoderma ou mesoderma. Em zebrafish, foi indicado que o processo de decidir o destino celular pode incorporar um pouco de aleatoriedade.

Descobertas sobre a Especificação do Mesendoderma

A camada superior do embrião, conhecida como mesendoderma dorsal, requer os níveis mais altos de Nodal para se formar. Quando a sinalização de Nodal é inibida, essa camada é a primeira a regredir. As células que se tornam endoderma anterior e a placa pré-cordal (uma parte essencial do mesoderma) vêm de uma origem comum dentro do mesendoderma anterior e dependem de níveis similares de sinalização de Nodal para seu desenvolvimento. No entanto, os mecanismos exatos que separam seus destinos ainda permanecem obscuros.

Pesquisas apontaram que contatos prolongados entre células podem influenciar positivamente a especificação desses tipos celulares. Mas os fatores-chave ativados pela sinalização de Nodal que ditam esses caminhos separados ainda precisam de mais exploração.

Uma das proteínas envolvidas nesse processo é a Gsc. Essa proteína pode inibir a formação de células endodermicas anteriores ao impedir que genes como o sox17 sejam ativados. No entanto, estudos em zebrafish que não têm Gsc não mostraram de forma conclusiva seu papel na especificação de mesoderma ou endoderma. Isso levanta a possibilidade de que existam outras proteínas não identificadas que trabalham junto com a Gsc nessa rede regulatória.

Investigando Mudanças no Estado Celular

Neste estudo, os cientistas construíram uma visão de como as células transitam de um estado para outro, olhando especialmente para como as células endodermicas anteriores e da placa pré-cordal evoluem. Usando técnicas avançadas de célula única, conseguiram seguir as origens e o desenvolvimento das células endodermicas anteriores a partir de seus progenitores da placa pré-cordal. Notavelmente, essa separação começa bem cedo durante a gastrulação.

Para obter mais clareza, os pesquisadores combinaram dados de célula única de várias condições, incluindo zebrafish normais e aqueles com atividade de Nodal alterada. Eles descobriram que as células endodermicas anteriores surgem de progenitores da placa pré-cordal. Além disso, mudanças no nível epigenético desempenharam um papel significativo nessa diferenciação.

Trabalhos experimentais mostraram que interromper uma proteína influente na modificação da cromatina, chamada srcap, poderia levar a mudanças em como essas células se especificam em placa pré-cordal ou endoderma anterior. Além disso, experimentos adicionais revelaram que a Ripply1, outro repressor transcricional, trabalha junto com a Gsc para suprimir a formação de endoderma, ligando-se a elementos genéticos cruciais.

Confirmando as Origens da Linhagem do Endoderma Anterior

Mais investigações apoiaram a ideia de que as células endodermicas anteriores vêm de progenitores da placa pré-cordal. As células foram observadas de perto usando marcadores genéticos para acompanhar sua progressão de um tipo para outro. A análise revelou que antes de continuar em seu caminho de diferenciação, as células endodermicas anteriores e da placa pré-cordal inicialmente compartilhavam uma quantidade significativa de características genéticas.

À medida que o desenvolvimento avançava, os pesquisadores notaram que os dois tipos celulares começaram a divergir de forma mais clara, indicando suas identidades únicas. No final da gastrulação, a distinção em seus perfis genéticos era evidente, com alguns genes se tornando mais pronunciados em uma linhagem sobre a outra.

A Importância da Comunicação Celular

A comunicação celular desempenha um papel vital durante o desenvolvimento. A proximidade das células da placa pré-cordal e endodermicas anteriores permite que elas interajam diretamente, influenciando o desenvolvimento uma da outra através de sinalização. Ao analisar essas interações, parecia que certas vias de sinalização, incluindo interações Nodal-Lefty, eram particularmente importantes para ajudar a determinar o destino dessas células.

O estudo descobriu que perturbações na estrutura de sinalização resultaram em mudanças na quantidade de células que se tornaram endodermicas anteriores versus células da placa pré-cordal. Isso sugere que a sinalização Nodal-Lefty regula não apenas a produção dessas células, mas também suas decisões subsequentes de destino.

Papel da Cromatina e Regulação Transcricional

À medida que as células transitam de um tipo para outro, mudanças na estrutura da cromatina podem afetar quão acessíveis certos genes são para expressão. Ao estudar a dinâmica da acessibilidade da cromatina, os pesquisadores identificaram pontos críticos na trajetória de desenvolvimento onde ocorreram mudanças. Eles notaram que a organização da cromatina estava fortemente envolvida na especificação dessas células.

As dinâmicas da cromatina parecem ser governadas por proteínas, como aquelas que formam o complexo SWI/SNF. Aqui, a srcap se destacou como um jogador significativo, influenciando como os genes eram expressos durante o processo de desenvolvimento. Manipular a atividade da srcap levou a mudanças notáveis no equilíbrio dos tipos celulares que se desenvolvem, sugerindo que ela desempenha um papel crítico em garantir a especificação adequada do destino celular.

Integrando Insights Genômicos

Para obter uma compreensão abrangente de como vários fatores genéticos influenciam o destino celular, os pesquisadores utilizaram uma combinação de técnicas. Eles empregaram tanto sequenciamento de RNA de célula única quanto ensaios para analisar a acessibilidade da cromatina. Isso lhes permitiu identificar quais genes tinham níveis de expressão diferencial e como as configurações da cromatina sustentavam essas variações.

Com essa abordagem múltipla, eles encontraram uma correlação direta entre a acessibilidade genética e os níveis de expressão de marcadores cruciais. Isso levantou implicações importantes sobre como a estrutura da cromatina poderia influenciar a trajetória de desenvolvimento de células vizinhas.

Os pesquisadores notaram que certos genes mostraram padrões distintos de acessibilidade, que se alinharam com seus níveis de expressão em células da placa pré-cordal ou endodermicas anteriores. Isso reforça a ideia de que as dinâmicas da cromatina são um princípio central na regulação do destino celular durante os estágios iniciais do desenvolvimento.

A Colaboração de Gsc e Ripply1

Embora a Gsc tenha sido estabelecida como um repressor da especificação do endoderma, o papel da Ripply1 tinha sido menos claro. Este estudo sugeriu que a Ripply1 também serve para inibir o desenvolvimento do endoderma anterior, trabalhando junto com a Gsc. Quando ambos os genes foram inativados, uma aumento nas células endodermicas anteriores foi notado. Essa descoberta enfatizou seu papel cooperativo na regulação de como as células se especificam em linhagens distintas.

Experimentos subsequentes demonstraram que a Ripply1, quando superexpressa, poderia reduzir significativamente o número de células endodermicas anteriores. Essas observações sugerem que a Ripply1 tem um papel direto na modulação da paisagem transcricional necessária para a formação adequada dos tipos celulares.

Implicações para a Compreensão da Biologia do Desenvolvimento

As percepções obtidas deste estudo destacam a complexidade da diferenciação celular durante o desenvolvimento embrionário. A interação de sinais, dinâmicas da cromatina e atividade de fatores transcricionais pinta um quadro detalhado de como linhagens celulares específicas podem emergir de um pool comum de células progenitoras.

A exploração de como os níveis de sinalização do Nodal podem levar a estados de cromatina diferenciais revela uma camada importante de regulação crítica para tomar decisões de desenvolvimento. As interações entre várias vias de sinalização e repressores transcricionais implicam ainda em uma estrutura sutil na qual as decisões de destino celular não são ditadas apenas por sinais únicos, mas sim por uma combinação de influências que moldam o ambiente desenvolvimental.

Entender esses mecanismos não só avança a biologia do desenvolvimento, mas também pode ter implicações para a medicina regenerativa, onde a manipulação de vias de sinalização e fatores transcricionais poderia ser a chave para guiar a diferenciação de células-tronco em contextos terapêuticos.

Conclusão

Resumindo, esta pesquisa elucida os processos por trás de como as linhagens endodermicas anteriores e da placa pré-cordal são especificadas a partir de células progenitoras comuns em zebrafish. Focando nos papéis da sinalização de Nodal e na interação de fatores transcricionais-chave, o estudo sublinha a importância da comunicação celular e da organização da cromatina na determinação do destino celular. A supressão colaborativa pela Gsc e Ripply1 oferece uma perspectiva refinada sobre as redes regulatórias envolvidas no desenvolvimento embrionário. Investigações em andamento provavelmente continuarão a descobrir os intrincados mecanismos em ação, avançando a compreensão da biologia do desenvolvimento e suas aplicações.

Fonte original

Título: Ripply1 and Gsc collectively suppress anterior endoderm differentiation from prechordal plate progenitors

Resumo: During gastrulation, the mesendoderm is firstly specified by morphogens such as Nodal, and then segregates into endoderm and mesoderm in a Nodal concentration-dependent manner. However, the mechanism underlying the segregation and crosstalk of different sub-groups within the meso- and endoderm lineages remains unclear. Here, taking zebrafish prechordal plate (PP) and anterior endoderm (Endo) as research model, using single-cell multi-omics and live imaging analyses, we show that anterior Endo progenitors originate directly from PP progenitors. A single-cell transcriptomic trajectory analysis of wild-type, ndr1 knockdown and lft1 knockout Nodal explants confirms the diversification of anterior Endo fate from PP progenitors. Gene Ontology (GO) enrichment analysis indentifies that the change of chromatin organization potentiates the segregation of endodermal cell fate from PP progenitors. Single-cell ATAC & RNA sequencing further reveals that two transcriptional regulators, gsc and ripply1, exhibit varied activation patterns in PP and Endo lineages at both the chromatin and RNA expression levels. We further demonstrate that Ripply1 functions coordinately with Gsc to repress endodermal cell fate by directly binding to the cis-elements of sox32 and sox17. Modulating the expression levels of these regulators tilts the cell fate decision between the PP and Endo lineages.

Autores: Peng-Fei Xu, T. Cheng, X. Liu, Y. Dong, Y. Tian, Y.-Y. Xing, C.-Y. Chen, C. Liu, Y.-F. Li, Y. Huang, D.-H. Zhuo, J.-Y. Luan, X.-X. Fu, Z.-X. Jin, J. Mo, H. Liang

Última atualização: 2024-06-18 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.05.29.542713

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.05.29.542713.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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