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Aprimorando o Reconhecimento de Entidades em Transcrições Médicas Barulhentas

Esse estudo aborda os desafios de captar termos médicos precisos a partir de áudio ruidoso.

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A tecnologia de Reconhecimento Automático de Fala (ASR) ajuda a transformar a linguagem falada em texto escrito. Isso tem várias utilidades na saúde, como acelerar a Transcrição médica e integrar com registros de saúde. Mas, o desempenho do ASR cai significativamente quando se trata de Áudio Barulhento, dificultando a identificação precisa de informações importantes nessas transcrições.

No campo médico, o Reconhecimento de Entidade Nomeada (NER) é fundamental. Ele envolve identificar termos específicos relacionados à saúde, como nomes de medicamentos ou condições médicas. Transcrições barulhentas podem levar a erros e mal-entendidos, atrapalhando as tarefas clínicas. Este artigo apresenta um novo conjunto de dados projetado para resolver esses problemas, com o objetivo de melhorar o desempenho dos sistemas de NER em transcrições de áudio barulhento.

A Importância da Transcrição Precisa

Transcrever áudio para texto é essencial para manter registros médicos precisos. Quando médicos e pacientes conversam, o ASR pode ajudar a documentar essas interações sem levar muito tempo. Essa eficiência permite que os profissionais de saúde se concentrem mais no atendimento ao paciente e menos na papelada. As informações transcritas podem incluir diagnósticos, planos de tratamento e anotações de pacientes.

Usar NER nessas transcrições pode fornecer mais insights, facilitando a extração de informações clínicas críticas. Por exemplo, detectar Reações Adversas a Medicamentos pode ajudar a garantir a segurança do paciente ao monitorar os efeitos colaterais mencionados pelos pacientes.

O Desafio do Áudio Barulhento

Apesar dos benefícios do ASR, muitos desafios ainda existem, especialmente quando a qualidade do áudio é ruim. Ambientes barulhentos podem vir de várias pessoas falando ou sons de fundo, o que pode confundir tanto os sistemas de ASR quanto os modelos de NER. A pesquisa tem frequentemente se concentrado na eficácia do ASR em gravações de áudio claras, deixando de lado a necessidade de estudar o desempenho em ambientes mais realistas e barulhentos.

Erros na transcrição podem levar a grandes mal-entendidos. Se um paciente menciona "dor de cabeça", mas o ASR imprime errado como "avanço", sistemas de NER padrão não vão reconhecer isso como um termo relevante. Além disso, modelos treinados com áudio limpo podem ter dificuldades em entender os padrões e contextos alterados em dados barulhentos. Essa lacuna entre ASR e NER precisa ser resolvida para melhorar as práticas de documentação médica.

Apresentando um Novo Conjunto de Dados

Para ajudar a unir a lacuna ASR-NLP, criamos um novo conjunto de dados chamado BioASR-NER. Este conjunto foca em extrair menções de reações adversas a medicamentos e outras entidades relevantes de gravações de conversas médicas, especificamente do exame Brief Test of Adult Cognition by Telephone (BTACT). Ele contém cerca de 2.000 gravações, tanto claras quanto barulhentas, oferecendo recursos valiosos para pesquisadores que buscam melhorar o desempenho do NER em dados barulhentos.

Limpando Transcrições Barulhentas

Para enfrentar o desafio do barulho no áudio, desenvolvemos um novo método para limpar transcrições. Este método usa o GPT4 para aumentar a precisão das transcrições. Exploramos duas abordagens: aprendizado zero-shot e few-shot. O aprendizado zero-shot não usa exemplos adicionais, enquanto o few-shot envolve um número limitado de exemplos para guiar o modelo.

Através da nossa pesquisa, também realizamos uma análise de erros para identificar onde os sistemas de ASR encontram dificuldades, que tipo de correções o GPT4 pode fazer e as limitações que ele enfrenta. Essa análise ilumina maneiras de melhorar a qualidade da transcrição e, consequentemente, o desempenho do NER.

Pesquisa Relacionada

Houve muitos avanços tanto em ASR quanto em NER, mas frequentemente esses avanços se concentram em áudios mais claros ou ambientes controlados. Muitos estudos relataram taxas de erro baixas em sistemas de transcrição, mas não levam em conta o barulho que muitas vezes está presente em situações do mundo real. Essa falta de dados do mundo real limita a compreensão de como esses sistemas vão se sair em ambientes de saúde reais.

Pesquisas anteriores também enfatizaram a importância do reconhecimento de entidades em contextos clínicos, mas frequentemente ignoram a necessidade de avaliar o desempenho em dados barulhentos. Nosso trabalho visa preencher essa lacuna, focando especificamente em transcrições de áudio barulhento em ambientes biomédicos.

Processo de Coleta de Dados

Ao criar nosso conjunto de dados, seguimos um processo rigoroso. Primeiro, coletamos conjuntos de dados iniciais, especificamente CADEC e BTACT. Assistentes treinados então gravaram o texto desses conjuntos. Cada arquivo de áudio foi normalizado para garantir um volume consistente. Por fim, geramos áudio barulhento misturando várias gravações com sons de fundo.

Entendendo o Reconhecimento de Entidade Nomeada Biomédica

O NER biomédico foca em identificar termos específicos relacionados à saúde a partir do texto. Isso pode incluir nomes de medicamentos, condições médicas e outras entidades relacionadas. O reconhecimento preciso desses termos é crucial para várias tarefas na saúde, como monitoramento de medicamentos e identificação de sintomas dos pacientes a partir das transcrições.

Existem diversos métodos e conjuntos de dados para NER biomédico. Algumas abordagens usam técnicas avançadas de deep learning para melhorar as taxas de reconhecimento. No entanto, muitos desses métodos se concentraram em dados limpos, deixando uma lacuna quanto ao desempenho em transcrições barulhentas.

Desempenho do ASR em Ambientes Barulhentos

Como mencionado anteriormente, os sistemas de ASR frequentemente reportam métricas de desempenho otimistas ao avaliá-los apenas em gravações limpas. No entanto, quando o áudio barulhento é incluído, os resultados podem ser muito piores, com taxas de erro de palavras significativamente mais altas. Essa discrepância destaca a necessidade de métodos de avaliação mais realistas que levem em conta as condições encontradas em ambientes de saúde do dia a dia.

Ao analisar o desempenho de vários sistemas de ASR, pesquisadores notaram que muitos sistemas têm dificuldades quando há barulho de fundo ou quando há várias pessoas falando. Como resultado, precisamos focar em desenvolver sistemas que consigam lidar com esses desafios.

Metodologia para Melhorar o NER

Em nosso estudo, propusemos métodos simples para melhorar o desempenho do NER em transcrições ASR barulhentas. Usando o GPT4 como uma ferramenta para pós-processamento de transcrições, buscamos melhorar a precisão geral dos modelos de reconhecimento de entidades. O objetivo era refinar as transcrições e reduzir erros, permitindo que os sistemas de NER funcionassem de forma mais eficaz.

Prompting Zero-Shot

No prompting zero-shot, instruímos o GPT4 a corrigir transcrições barulhentas com base no contexto fornecido. Ao informar o modelo sobre os tópicos específicos e identificar os possíveis desafios de transcrição, nosso objetivo era aumentar a precisão da saída.

Aprendizado Few-Shot

O aprendizado few-shot ofereceu outra abordagem para melhorar a precisão da transcrição, fornecendo ao modelo exemplos específicos de transcrições e suas versões corrigidas. Esse método ajuda o GPT4 a reconhecer padrões e aplicar correções a novas instâncias.

Avaliação de Desempenho

Avaliar o desempenho dos sistemas de NER em transcrições limpas e barulhentas foi nosso foco. A avaliação visava comparar a eficácia dos modelos base com os modelos melhorados pelo processo de limpeza do GPT4. Usamos métricas como precisão, recall e pontuações F1 para quantificar as melhorias.

Os resultados iniciais mostraram uma queda significativa no desempenho do NER em transcrições barulhentas em comparação com dados limpos, ressaltando os desafios impostos pelo barulho. No entanto, ao usar os métodos zero-shot e few-shot com o GPT4, observamos melhorias na precisão do reconhecimento de entidades.

Descobertas dos Conjuntos de Dados CADEC e BTACT Sintético

Os resultados do conjunto de dados CADEC indicaram uma queda dramática no desempenho do NER quando testado em dados transcritos por ASR. A introdução do prompting zero-shot trouxe uma melhoria notável, mostrando as capacidades do GPT4 em limpar transcrições barulhentas.

Da mesma forma, no conjunto de dados BTACT sintético, também observamos quedas de desempenho devido ao barulho, mas as melhorias dos métodos do GPT4 foram menos pronunciadas. Essas diferenças ressaltam como vários fatores, como a estrutura dos dados e o contexto, influenciam os resultados.

Discussão sobre Erros em ASR-NER

Erros no NER podem surgir de várias fontes. Isso inclui imprecisões na transcrição, desafios do barulho de fundo, mal-entendidos de contexto e limitações dos próprios sistemas de NER. Abordar esses erros é vital para melhorar as taxas de reconhecimento.

O barulho de fundo pode levar à má interpretação de palavras, enquanto a aleatoriedade inerente no ASR pode introduzir novos erros. Por exemplo, se um nome de medicamento for mal ouvido, o NER pode categorizá-lo incorretamente, causando complicações na segurança do paciente ou na precisão do tratamento.

Direções Futuras

Ainda há muito a explorar para abordar a lacuna ASR-NLP em aplicações biomédicas. Primeiro, incorporar informações de áudio pode fornecer contexto adicional para melhorar o desempenho. À medida que a tecnologia evolui, usar representações de áudio avançadas pode aprimorar as capacidades de reconhecimento e transcrição.

Em segundo lugar, explorar outras tarefas de NLP biomédico, como sumarização de texto e respostas a perguntas usando transcrições barulhentas, é uma área promissora para futuras pesquisas. Entender como esses modelos se adaptam aos desafios impostos por gravações barulhentas contribuirá para o progresso geral nos sistemas de NLP em saúde.

Conclusão

Este estudo destaca os desafios significativos enfrentados pelo ASR e pelo NER em contextos médicos, especialmente ao lidar com áudio barulhento. Ao apresentar o conjunto de dados BioASR-NER e explorar métodos para melhorar a limpeza de transcrições com o GPT4, damos passos para fechar a lacuna de desempenho no reconhecimento de entidades biomédicas.

Os avanços em ASR e NER podem levar a melhores práticas de documentação na saúde, melhorando, em última análise, o atendimento ao paciente. A pesquisa contínua nessa área será essencial para aprimorar ainda mais as ferramentas usadas nos ambientes de saúde modernos.

Fonte original

Título: Extracting Biomedical Entities from Noisy Audio Transcripts

Resumo: Automatic Speech Recognition (ASR) technology is fundamental in transcribing spoken language into text, with considerable applications in the clinical realm, including streamlining medical transcription and integrating with Electronic Health Record (EHR) systems. Nevertheless, challenges persist, especially when transcriptions contain noise, leading to significant drops in performance when Natural Language Processing (NLP) models are applied. Named Entity Recognition (NER), an essential clinical task, is particularly affected by such noise, often termed the ASR-NLP gap. Prior works have primarily studied ASR's efficiency in clean recordings, leaving a research gap concerning the performance in noisy environments. This paper introduces a novel dataset, BioASR-NER, designed to bridge the ASR-NLP gap in the biomedical domain, focusing on extracting adverse drug reactions and mentions of entities from the Brief Test of Adult Cognition by Telephone (BTACT) exam. Our dataset offers a comprehensive collection of almost 2,000 clean and noisy recordings. In addressing the noise challenge, we present an innovative transcript-cleaning method using GPT4, investigating both zero-shot and few-shot methodologies. Our study further delves into an error analysis, shedding light on the types of errors in transcription software, corrections by GPT4, and the challenges GPT4 faces. This paper aims to foster improved understanding and potential solutions for the ASR-NLP gap, ultimately supporting enhanced healthcare documentation practices.

Autores: Nima Ebadi, Kellen Morgan, Adrian Tan, Billy Linares, Sheri Osborn, Emma Majors, Jeremy Davis, Anthony Rios

Última atualização: 2024-03-25 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://arxiv.org/abs/2403.17363

Fonte PDF: https://arxiv.org/pdf/2403.17363

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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