Simple Science

Ciência de ponta explicada de forma simples

# Biologia# Bioquímica

Novas descobertas sobre a proteína Gag do HIV-1 e interações com medicamentos

Pesquisas mostram interações importantes na proteína Gag do HIV-1, ajudando no desenvolvimento de medicamentos.

― 7 min ler


Dinâmica da Proteína GagDinâmica da Proteína Gagdo HIV-1proteína Gag no HIV-1.Investigando interações de drogas com a
Índice

O HIV-1, ou Vírus da Imunodeficiência Humana tipo 1, é um vírus que ataca o sistema imunológico, levando à AIDS (Síndrome da Imunodeficiência Adquirida). Para se reproduzir, o HIV-1 precisa criar novas partículas virais, conhecidas como virions. Um componente crucial nesse processo é uma proteína chamada Gag. Essa proteína desempenha um papel importante na montagem e liberação de novas partículas virais das células infectadas.

O Papel do Poliproteína Gag

A poliproteína Gag é composta por diferentes seções chamadas MA, CA, SP1, NC, SP2 e P6. Essas seções trabalham juntas para construir e liberar partículas virais imaturas. O Gag age como uma estrutura, formando um andaime na superfície da célula e criando uma casca que irá encapsular o material genético e as proteínas do vírus.

Estudos científicos recentes usando uma técnica chamada tomografia eletrônica criogênica (cryo-ET) mostraram que a estrutura imatura do Gag se assemelha a uma gaiola esférica. Essa gaiola é feita de unidades repetidas chamadas hexâmeros. A seção CA do Gag é essencial para estabilizar essa estrutura. Antes do vírus amadurecer, uma enzima chamada protease corta a poliproteína Gag em suas partes individuais, permitindo que o vírus se torne infeccioso.

Interação com Inositol Hexakisfosfato (IP6)

A estrutura imatura do Gag também interage com uma molécula chamada inositol hexakisfosfato (IP6). Essa interação acontece em pontos específicos dentro da estrutura da proteína. Embora o IP6 não seja necessário para formar a estrutura imatura do Gag, ter níveis adequados é crucial para o vírus amadurecer corretamente.

Importância do Capsídeo como Alvo para Medicamentos

Dado seu papel crítico no ciclo de vida viral, o capsídeo (a casca externa formada pelas proteínas Gag) é um alvo principal para novos medicamentos projetados para combater o HIV-1. Um medicamento notável que ataca essa área é o Bevirimat (BVM). Este medicamento impede os passos finais do processamento do Gag, interrompendo a maturação do vírus. No entanto, com o tempo, o vírus pode desenvolver resistência a esse medicamento, tornando o tratamento menos eficaz.

Lenacapavir: Uma Nova Esperança

Outro medicamento promissor é o Lenacapavir (LEN), que foi aprovado para pacientes com HIV-1 resistente a medicamentos. O LEN se liga ao capsídeo maduro e ajuda a impedir que o vírus cause infecção. Ele também pode se ligar ao Gag e, quando utilizado em células infectadas, reduz a quantidade de vírus maduro produzido.

Apesar de sua promessa, os cientistas ainda não caracterizaram completamente como o LEN interage com a estrutura imatura do Gag. Entender isso pode ajudar a melhorar o tratamento com o LEN.

Avanços na Compreensão das Interações de Medicamentos

Para entender melhor como esses Inibidores funcionam, os pesquisadores têm usado técnicas avançadas de imagem para estudar a estrutura da proteína Gag quando ligada a diferentes medicamentos. Eles desenvolveram métodos para visualizar essas proteínas em seu ambiente nativo, criando partículas semelhantes a vírus (VLPs) a partir de células de mamíferos.

Ao estudar essas VLPs usando cryo-EM, os cientistas podem obter insights valiosos sobre como os medicamentos interagem com a proteína Gag e como essas interações afetam a estrutura e a função do vírus.

Análise Estrutural de Alta Resolução

Estudos recentes conseguiram usar imagens avançadas para visualizar a estrutura imatura do Gag e ver como os inibidores conhecidos se ligam a ela. Os pesquisadores direcionaram as VLPs para observar e analisar a estrutura do Gag em detalhes.

Usando VLPs com diferentes condições (tratados com BVM, LEN ou ambos), produziram imagens altamente detalhadas que revelam como esses medicamentos interagem com a rede de Gag. Essa informação é crucial para entender como o vírus amadurece e como os medicamentos podem interromper efetivamente esse processo.

Olhando Detalhadamente para a Estrutura Imatura do Gag

As imagens de alta resolução da estrutura imatura do Gag mostram detalhes intrincados de como as proteínas se encaixam. As proteínas Gag interagem de maneiras específicas que são essenciais para construir a casca do vírus. As imagens permitem visualizar como diferentes proteínas se juntam em várias interfaces dentro da estrutura.

Interações Chave na Estrutura Imatura do Gag

Dentro da estrutura imatura do Gag, várias interações chave estabilizam:

  1. Interface Intra-Hexamérica: Isso envolve interações entre proteínas Gag dentro da mesma unidade hexamérica.
  2. Interfaces Inter-Hexaméricas: Essas são interações entre diferentes unidades hexamérica, mostrando como elas se mantêm unidas para formar uma estrutura maior.

Os aminoácidos específicos envolvidos nessas interações ajudam a manter a forma e a estabilidade da montagem do Gag.

Importância do Resíduo R18

Um aminoácido crítico na estrutura imatura do Gag é o R18. Esse resíduo desempenha um papel significativo na interação com o IP6 e também está envolvido na ligação com medicamentos como o LEN. Entender como o R18 se comporta em diferentes contextos pode esclarecer como o vírus maduro é formado e como os inibidores podem interromper esse processo.

Mecanismos de Ligação Únicos do LEN

O LEN demonstra um mecanismo de ação único que altera a estrutura imatura do Gag. Quando o LEN se liga, ele envolve várias unidades de Gag, criando novas interfaces de interação que não estavam presentes antes. Essa ligação é diferente de como o LEN interage com estruturas de Gag maduras, indicando que seus efeitos podem variar dependendo da fase de montagem viral.

Insights sobre a Ligação do BVM

O BVM se liga à estrutura do Gag na bundinha de seis hélices CA-SP1, mas a posição exata da ligação tem sido um tema debatido. Estudos recentes de alta resolução forneceram clareza sobre como o BVM interage com a estrutura imatura do Gag, ajudando a refinar nossa compreensão dos mecanismos desse medicamento.

A ligação do BVM pode levar a uma mudança na forma como o IP6 interage com as proteínas Gag também. Entender essa relação pode informar futuras estratégias de tratamento, especialmente em relação a mutações de resistência.

Simulações de Dinâmica Molecular

Para explorar mais a dinâmica da ligação do LEN e do BVM, os pesquisadores usaram simulações computacionais que imitam os processos biológicos. Essas simulações ajudam a prever como esses medicamentos se comportarão na presença da estrutura do Gag e como sua ligação influenciará a montagem viral geral.

Potencial de Terapia Combinada

Combinar inibidores como BVM e LEN pode oferecer uma nova abordagem de tratamento. Estudos sugerem que esses dois medicamentos podem trabalhar juntos sem interferir nos efeitos um do outro. Essa combinação poderia proporcionar um meio mais eficaz de interromper o ciclo de vida viral e impedir que o HIV-1 se reproduza.

Conclusão

A pesquisa contínua sobre os mecanismos de inibidores do HIV-1, como BVM e LEN, é vital para melhorar as opções de tratamento. Ao entender os detalhes intrincados de como esses medicamentos interagem com a proteína Gag, os cientistas podem projetar terapias mais eficazes que visam diferentes estágios do ciclo de vida viral.

Trabalhos futuros aproveitando técnicas avançadas de imagem e simulações serão essenciais para desenvolver novas estratégias antivirais e melhorar a vida das pessoas afetadas pelo HIV-1.

Fonte original

Título: Structural insights into inhibitor mechanisms on immature HIV-1 Gag lattice revealed by high-resolution in situ single-particle cryo-EM

Resumo: HIV-1 inhibitors, such as Bevirimat (BVM) and Lenacapavir (LEN), block the production and maturation of infectious virions. However, their mechanisms remain unclear due to the absence of high-resolution structures for BVM complexes and LENs structural data being limited to the mature capsid. Utilizing perforated virus-like particles (VLPs) produced from mammalian cells, we developed an approach to determine in situ cryo-electron microscopy (cryo-EM) structures of HIV-1 with inhibitors. This allowed for the first structural determination of the native immature HIV-1 particle with BVM and LEN bound inside the VLPs at high resolutions. Our findings offer a more accurate model of BVM engaging the Gag lattice and, importantly, demonstrate that LEN not only binds the mature capsid but also targets the immature lattice in a distinct manner. The binding of LEN induces a conformational change in the capsid protein (CA) region and alters the architecture of the Gag lattice, which may affect the maturation process. These insights expand our understanding of the inhibitory mechanisms of BVM and LEN on HIV-1 and provide valuable clues for the design of future inhibitors.

Autores: Yong Xiong, C. Wu, M. E. Meuser, J. S. Rey, H. Meshkin, R. Yang, S. C. Devarkar, C. Freniere, J. Shi, C. Aiken, J. R. Perilla

Última atualização: 2024-10-09 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.09.617473

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.09.617473.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

Obrigado ao biorxiv pela utilização da sua interoperabilidade de acesso aberto.

Mais de autores

Artigos semelhantes