Avanços nas Técnicas de Imagem por Espectrometria de Massa
Um novo método melhora muito a resolução de imagem para amostras biológicas.
Jianing Wang, C. Xie, X. Diao, L. Guo, T. K.-Y. Lam, R. Li, Y. Chen, Y. Zhang, J. Fang, Z. Cai
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Índice
Estudar como as biomoléculas estão organizadas em um nível bem pequeno é crucial pra entender como os sistemas biológicos funcionam. Pra isso, precisamos de ferramentas de imagem de alta qualidade que deixem a gente ver os componentes celulares nos seus lugares reais. Uma das melhores ferramentas que temos é a microscopia óptica, principalmente os métodos avançados que permitem ver estruturas menores do que normalmente é possível com luz. Essas ferramentas deixam a gente observar em detalhes lugares dentro das células, como os organelas.
Porém, esses métodos ópticos focam mais nas proteínas e usam anticorpos que são bem específicos pra essas proteínas. Embora os anticorpos sejam ótimos pra encontrar proteínas, eles limitam nossa habilidade de olhar pra outras moléculas pequenas, como os metabolitos, porque precisamos de sondas específicas pra vê-las claramente. Além disso, usar corantes fluorescentes pode criar problemas com sinais sobrepostos, o que dificulta obter imagens claras de diferentes moléculas em um único experimento.
Uma alternativa chamada imagem de espectrometria de massa (MSI), especificamente espectrometria de massa assistida por laser de desorção – ionização (MALDI-MSI), permite ver muitos tipos de biomoléculas, como Lipídios, metabolitos e proteínas, sem precisar de rótulos especiais. Diferente dos métodos ópticos, o MALDI-MSI consegue detectar moléculas pequenas sem se preocupar com rótulos ou corantes específicos. Porém, os instrumentos comerciais padrão dessa técnica geralmente não conseguem ver detalhes muito finos, com uma Resolução de cerca de 5 a 20 micrômetros. Esse nível de detalhe não é suficiente pra olhar pra estruturas muito pequenas dentro das células.
Pra melhorar essa resolução, os cientistas inventaram várias técnicas. Uma maneira é ajustar como o laser atinge a amostra de trás do slide e focar na superfície, o que melhorou a resolução pra cerca de 1,2 micrômetros. Outra técnica envolve usar lentes especiais pra reduzir o espaço entre a lente e a amostra. Esse ajuste pode encolher o foco do laser pra cerca de 1,4 micrômetros. Porém, esses métodos costumam exigir ferramentas complicadas e cuidado ao manusear as amostras, o que pode dificultar o uso amplo.
Outro problema com algumas dessas técnicas avançadas é que a forma como preparamos as amostras pode reduzir a sensibilidade delas, levando a dados menos claros. Algumas técnicas podem fornecer detalhes altos, mas podem quebrar as moléculas, dificultando a coleta de informações úteis sobre as amostras.
Em contraste, um método mais novo chamado Microscopia de Expansão (ExM) pode melhorar nossa habilidade de ver pequenos detalhes sem precisar de configurações ópticas avançadas. O ExM funciona ampliando as Amostras Biológicas com um gel especial, permitindo uma imagem mais detalhada com microscópios normais. Desde que o ExM foi introduzido, ele foi adaptado pra vários tipos de amostras biológicas e técnicas de imagem. Os pesquisadores até desenvolveram um novo tipo de imagem de espectrometria de massa usando os princípios do ExM, alcançando uma melhor resolução em torno de 1 micrômetro. Porém, os métodos tradicionais de MALDI-MSI ainda estão atrás na questão da resolução.
Esse artigo apresenta um novo método: MALDI-MSI de expansão dez vezes (10X ExMSI), que ajuda a alcançar uma resolução muito maior de cerca de 500 nanômetros. Esse novo método permite que os cientistas analisem amostras biológicas em detalhe, facilitando o estudo da sua composição química e como elas diferem umas das outras.
Desenvolvendo o Fluxo de Trabalho do 10X ExMSI
Pra criar o método 10X ExMSI, os pesquisadores tiveram que desenvolver um novo fluxo de trabalho pra imagens de alta resolução na escala das células. O processo começa com a coleta de tecido fixado e cortá-lo em fatias finas. Essas fatias são então colocadas em uma câmara especial pra ajudar a fixar as proteínas em uma matriz de gel. Depois de tratar o tecido com uma enzima pra quebrar as proteínas, o gel é deixado pra expandir livremente.
O método requer atenção cuidadosa a cada etapa. Por exemplo, é crucial que o gel seja virado de cabeça pra baixo durante a expansão, assim a amostra fica voltada pra cima. Essa orientação garante que o laser consiga penetrar o gel e alcançar o tecido corretamente. Uma vez que o gel expande, ele é seco e preparado pra imagem de espectrometria de massa.
Os pesquisadores também medem o tamanho da amostra antes e depois da expansão pra determinar quanto ela aumentou. Nos testes, eles descobriram que um fator de expansão dez vezes é alcançável usando esse método, permitindo um nível de resolução bem fino.
Com a resolução espacial melhorada, os cientistas conseguem distinguir entre diferentes partes da amostra que não conseguiam ver antes. Por exemplo, eles podem ver claramente o núcleo em amostras de tecido cerebral, algo que os métodos de imagem padrão não conseguiam resolver de forma eficaz.
Ajustando a Deposição da Matriz pra Imagens de Alta Qualidade
Aplicar uma matriz uniformemente na amostra é essencial pra obter os melhores resultados em imagens de espectrometria de massa. Certas matrizes mostraram funcionar bem pra imagens de alta resolução, e essas foram escolhidas pra usar no método 10X ExMSI. Se as partículas da matriz forem grandes demais, elas podem causar a dispersão das moléculas, o que afeta a resolução. Portanto, os pesquisadores controlaram cuidadosamente o tamanho da matriz pra garantir uma amostragem eficaz.
Um dispositivo especial foi projetado pra ajudar a aplicar essa matriz de forma precisa. Os parâmetros foram personalizados pra garantir que o método de aplicação da matriz oferecesse a maior sensibilidade pro processo de imagem.
Uma das principais forças da abordagem ExMSI é que ela não requer condições rigorosas pra aplicar a matriz, ao contrário de alguns métodos tradicionais que têm opções muito limitadas. O método 10X ExMSI mostra grande promessa pra melhorar ainda mais a resolução.
Alta Cobertura de Vias Lipídicas
Pra testar a eficácia do 10X ExMSI, os pesquisadores usaram amostras do cérebro de camundongos. Eles prepararam dois tipos de amostras, uma com o novo método de expansão e outra sem, pra ver como as duas se comparavam. As amostras expandidas mostraram muitos sinais fortes quando analisadas, indicando que o processo não causou uma perda significativa de lipídios.
Os cientistas conseguiram identificar muitos tipos diferentes de lipídios tanto nas amostras expandidas quanto nas padrão. Eles descobriram que o processo de expansão alterou a forma como alguns lipídios foram detectados, levando a novos e empolgantes dados sobre os padrões de distribuição de lipídios.
Os resultados mostraram um aumento significativo na detecção de certas espécies lipídicas após a expansão, especialmente no modo de íon positivo, destacando os benefícios do novo método. No geral, o processo de expansão resultou em uma retenção muito melhor das amostras de lipídios e aumentou o número de espécies detectadas.
Imagens do Cérebro de Camundongo e Cerebelo
Uma área importante de pesquisa é o hipocampo no cérebro do camundongo, que desempenha um papel fundamental na memória e aprendizado. Usando o método 10X ExMSI, os cientistas conseguiram ver a estrutura fina do hipocampo mais claramente em comparação com métodos tradicionais. A nova imagem mostrou mais detalhes em diferentes regiões do tecido, permitindo que os pesquisadores visualizassem áreas importantes que antes eram indistintas.
Melhorias semelhantes foram vistas ao fazer imagens do cerebelo. O método 10X ExMSI proporcionou uma visualização mais clara das várias camadas e estruturas dentro do cerebelo, mostrando diferenças distintas na distribuição de lipídios. Essas descobertas destacam a capacidade do novo método de descobrir detalhes importantes na arquitetura cerebral que são vitais pra entender sua função.
Alta Resolução Espacial em Experimentos Adicionais
À medida que os pesquisadores continuaram a refinar o método 10X ExMSI, eles realizaram mais testes de imagem pra esclarecer estruturas em escalas muito pequenas. Usando um tamanho de ponto de laser menor, eles conseguiram obter imagens ainda mais claras das estruturas cerebrais. Eles descobriram que o método forneceu efetivamente resolução submicrométrica, permitindo que os cientistas identificassem neurônios individuais e suas conexões.
A resolução aprimorada revelou novas informações sobre como diferentes tipos de células cerebrais, como as células de Purkinje, estão organizadas. As redes dendríticas dessas células puderam ser visualizadas claramente, o que é uma conquista significativa no campo da imagem.
ExMSI em Células Únicas
Os pesquisadores também queriam ver se o método 10X ExMSI poderia ser usado pra analisar células individuais, não apenas seções de tecido. Pra testar isso, eles olharam pra células A549, um tipo de linha celular de câncer de pulmão humano. O espectro de massa mostrou várias espécies lipídicas distribuídas dentro das células.
O novo método de imagem forneceu vistas detalhadas das células, permitindo que os cientistas observassem como diferentes lipídios estão distribuídos dentro da célula. Eles puderam comparar as distribuições lipídicas em amostras expandidas e padrão e descobriram que a técnica de expansão melhorou significativamente a clareza das imagens.
Essa capacidade de detectar detalhes no nível de célula única abre novas possibilidades pra entender os papéis que os lipídios desempenham em diferentes estados celulares e variações entre as células.
Conclusão
O desenvolvimento do método 10X ExMSI marca um novo capítulo na imagem biológica. Ao combinar técnicas de ionização suave com expansão de amostras, esse método melhora a resolução e permite o exame detalhado de amostras biológicas. Através de técnicas de imagem mais refinadas, os pesquisadores podem entender melhor os papéis complexos dos lipídios e outras biomoléculas em um nível subcelular.
À medida que a comunidade científica explora essa nova ferramenta poderosa, espera-se que contribua para avanços em áreas como neurobiologia, pesquisa do câncer e lipidômica. A capacidade de visualizar estruturas em um detalhe tão fino pode levar a uma compreensão mais profunda de como os processos biológicos funcionam e como podem ser influenciados.
Título: Ten-Fold Expansion MALDI Mass Spectrometry Imaging of Tissues and Cells at 500 nm Resolution
Resumo: Achieving high spatial resolution in matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry imaging (MALDI-MSI) is crucial for detailed molecular mapping in biological tissues and cells. However, conventional MALDI-MSI platforms are typically limited to spatial resolutions of 5-20 m, restricting their ability to visualize fine subcellular structures. Here, we present a novel ten-fold expansion MALDI-MSI (10X ExMSI) method that attains 500 nm spatial resolution without the need for specialized optics or customized instrumentation. By physically expanding biological samples using a swellable hydrogel matrix, our method maintains high retention and broadens the detection range of lipids, ensuring comprehensive lipid profiling. We demonstrated the effectiveness of 10X ExMSI by visualizing intricate subcellular structures within mouse brain tissues, including individual nuclei, astrocytes, Purkinje cells, and, notably, dendritic arborizations-features previously unresolvable using mass spectrometry imaging. Applying 10X ExMSI to single-cell analysis of cultured cells revealed detailed spatial distributions of lipids at the subcellular to organelle level. Notably, the method is fully compatible with standard commercial MALDI-MSI platforms, enabling widespread adoption without significant additional investment. The 10X ExMSI offers a transformative tool for high-resolution molecular imaging, opening new avenues for molecular analysis in diverse biological and biomedical fields, including neuroscience, pathology, and cellular biology.
Autores: Jianing Wang, C. Xie, X. Diao, L. Guo, T. K.-Y. Lam, R. Li, Y. Chen, Y. Zhang, J. Fang, Z. Cai
Última atualização: 2024-10-22 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.20.619316
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.20.619316.full.pdf
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
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