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FAM83ファミリータンパク質:ゼブラフィッシュ研究からの洞察

研究によると、FAM83Fはゼブラフィッシュの発生とDNA損傷応答に関与していることがわかった。

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FAM83F:FAM83F:ゼブラフィッシュのインサイえる影響を強調している。研究はFAM83Fが発達とDNA修復に与
目次

FAM83ファミリーは、FAM83AからFAM83Hまでの8つのタンパク質で構成されてる。このタンパク質は多くの脊椎動物に見られるけど、単純な生物にはないんだ。これらのタンパク質の主な特徴は、DUF1669ドメインっていう特定の部分があること。これは進化の過程でほとんど変わらないまま保たれているんだけど、科学者たちはこのタンパク質の正確な機能をまだ完全には理解してないんだ。

FAM83タンパク質は、がんとの関連で特に注目されてる。乳がん、肺がん、甲状腺がんなど、いろんなタイプのがんで高い量が見られるんだ。FAM83Aは腫瘍が治療に抵抗する手助けをする役割があるって研究されてるけど、FAM83Fもがんとの関係があるけど、あんまり理解されてないみたい。

FAM83Fとその相互作用

FAM83Fは、体内のいろんなタンパク質と相互作用して、いろんな細胞プロセスを助けてる。例えば、ケースインキナーゼ1(CK1)と結合することが示されていて、これはいろんな細胞機能に関与してるんだ。この相互作用は、FAM83Fが細胞内でどこにいるかに重要なんだ。FAM83Fは、特定のアミノ酸の配列を通じてCK1と相互作用してる。

研究によると、FAM83Fは細胞間通信に重要なWntシグナル伝達経路とも関連してる。この経路は多くの発生プロセスに影響を与えるんだ。FAM83Fが過剰に存在すると、胚の発生異常を引き起こすことがある。また、FAM83Fはp53というタンパク質を安定化させることが知られていて、これは細胞周期を調節してがんの形成を防ぐ役割を持ってる。

FAM83F研究の重要性

FAM83Fががんと関連しているという証拠が増えてるけど、まだまだわからないことが多い。これがさらなる研究の必要性を示してるんだ。特にゼブラフィッシュのような動物モデルは、このタンパク質を研究するのに価値がある。なぜなら、彼らの発生は早くて透明だから、変化を簡単に観察できるんだ。

ゼブラフィッシュにおけるFAM83Fの研究

FAM83Fの機能を探るために、科学者たちはゼブラフィッシュの類似タンパク質、fam83faに注目した。研究者たちは、fam83faが初期の発生にどのように関与しているか、またその喪失が胚の発生や放射線による損傷への応答にどのように影響を与えるかを理解したいと思ってた。

ゼブラフィッシュの胚は、孵化腺でfam83faを発現していて、これは孵化時に卵の外層を分解するのに重要なんだ。実験では、CRISPR技術を使ってfam83faが欠けたゼブラフィッシュを作った。結果、こうした胚は通常より早く孵化したことが示され、fam83faが孵化のタイミングを調節するのに役立っていることを示唆してる。

FAM83F変異体の孵化欠陥

科学者がゼブラフィッシュの胚からfam83faを取り除くと、胚がかなり早く孵化することに気づいた。この早期の孵化は、fam83faが孵化タイミングに関与していることを示唆してる。孵化腺は卵の外層を柔らかくする酵素を放出して、胚が脱出できるようにする。これらの酵素の放出タイミングは、ゼブラフィッシュの成功した孵化にとって重要なんだ。

正常なゼブラフィッシュでは、孵化のプロセスは受精後48〜72時間の間に行われるけど、fam83fa変異体では、孵化が最大で10時間早く起こる可能性があった。この変化は孵化プロセスのコントロールを失うことを示していて、胚の発生や生存に影響を与えるかもしれない。

DNA損傷への感受性

孵化の欠陥に加えて、fam83fa変異体は放射線によって引き起こされるDNA損傷に対して感受性が高まってた。通常、細胞はさまざまなプロセスを通じて放射線による損傷を修復できるけど、fam83faが欠けることでこれらの修復メカニズムが損なわれるかもしれない。

胚が放射線にさらされたとき、fam83faがない胚は、野生型(正常な)胚と比べて深刻な発生問題を示した。DNA損傷による細胞死を減らす代わりに、fam83faの喪失は胚をより脆弱にしてしまった。

FAM83F研究におけるp53の安定性理解

研究の重要な部分はp53に関連していて、これは細胞周期を調節し、損傷した細胞の分裂を防ぐことでがんの発生を防ぐ役割がある。今年、fam83faを取り除くと胚のp53のレベルが低下すると予想されたんだけど、結果としてfam83fa変異体と正常胚の間でp53のレベルに有意な差は見られなかったんだ。放射線にさらされた後も変わらなかった。

この発見は、FAM83Fがp53を安定化させるという以前の研究と矛盾してる。代わりに、他の要因がゼブラフィッシュ胚のp53レベルを調節している可能性があり、その活性はfam83faによって直接影響を受けていないかもしれない。

自食作用と細胞経路の調査

fam83fa変異体がなぜDNA損傷に対してより感受性が高いのかを探るために、研究者たちはこれらの胚で活性な遺伝子を分析した。いくつかの重要な遺伝子がダウンレギュレーションされていて、特に自食作用(オートファジー)に関連する遺伝子がそうだった。自食作用は、細胞成分の分解と再利用に重要で、特にDNA損傷のようなストレス状態のときに必要なんだ。

自食作用に関与するタンパク質のダウンレギュレーションは、fam83faの喪失がこの重要なプロセスを損なうことを示唆していて、細胞が損傷に対して脆弱になるかもしれない。この損傷したり不要な細胞成分の適切な再利用が妨げられると、細胞はさらにストレスを受けて死ぬ可能性があるんだ。

遺伝子発現分析と結果

遺伝子発現の分析では、リン脂質3-リン酸(PI(3)P)に結合するタンパク質をコードする遺伝子が減少していることが明らかになった。これは自食小胞の形成と機能において重要な役割を果たす。fam83fa変異体におけるこれらのタンパク質の減少は、これらの細胞の自食作用の機能に重大な問題があることを示唆してる。

RNAシーケンシングを使用して、研究者たちは正常胚と変異体胚の間で数千の遺伝子の活動を比較できた。その結果、リソソームや自食作用に関与する多くの遺伝子が影響を受けていることが示された。例えば、リソソーム機能に関連する遺伝子はfam83fa変異体でしばしばダウンレギュレーションされていて、自食作用経路が損なわれていることを示している。

自食作用経路の障害の影響

fam83fa変異体における自食作用経路の障害は、DNA損傷に対する感受性の高さや早期の孵化の理由かもしれない。ストレス状態のとき、細胞は通常、自食作用を活性化して損傷した成分を取り除き、細胞死に抵抗するんだけど、これらの変異体では自食作用関連遺伝子のダウンレギュレーションが、細胞がストレスに効果的に反応する能力を減少させて、損傷に対してより脆弱にしてる可能性があるんだ。

さらに、孵化腺の細胞は孵化時に卵膜を分解するプロテアーゼを放出するんだけど、自食作用が障害されると酵素の放出の調節が影響を受けて、変異体の早期孵化が観察される結果になってるかもしれない。

結論:FAM83F研究の広い意義

ゼブラフィッシュにおけるfam83faの研究は、FAM83Fおよびその関連タンパク質の発生やがんにおける機能を明らかにする手助けをしてる。fam83faが孵化や細胞の損傷に対する応答にどのように寄与しているのかを理解することで、特にがんにおけるFAM83タンパク質の役割についての洞察が得られるかもしれない。

科学者たちがこれらの経路を探求し続けることで、FAM83タンパク質がさまざまな生物学的プロセスに関与していることについての理解が進むだろう。この研究の意義はゼブラフィッシュだけに留まらず、FAM83Fの役割を理解することで、がん治療や治療戦略の潜在的なターゲットを明らかにできるかもしれない。

ゼブラフィッシュを使ったこの研究は、FAM83タンパク質の複雑さや発生や疾患予防における重要性を解き明かす重要なステップを提供してる。これらのプロセスの背後にあるメカニズムを探求し、どう臨床的な場面で応用できるかをさらに研究する必要があるね。

オリジナルソース

タイトル: Zebrafish reveal new roles for Fam83f in hatching and the DNA damage-mediated autophagic response

概要: The FAM83 (Family with sequence similarity 83) family is highly conserved in vertebrates, but little is known of the functions of these proteins beyond their association with oncogenesis. Of the family, FAM83F is of particular interest because it is the only membrane-targeted FAM83 protein. When over-expressed, FAM83F activates the canonical Wnt signalling pathway and binds to and stabilizes p53; it therefore interacts with two pathways often dysregulated in disease. Insights into gene function can often be gained by studying the roles they play during development, and here we report the generation of fam83f knock-out (KO) zebrafish, which we have used to study the role of Fam83f in vivo. We show that endogenous fam83f is most strongly expressed in the hatching gland of developing zebrafish embryos, and that fam83f KO embryos hatch earlier than their wild-type (WT) counterparts, despite developing at a comparable rate. We also demonstrate that fam83f KO embryos are more sensitive to ionizing radiation than WT embryos--an unexpected finding, bearing in mind the previously-reported ability of FAM83F to stabilize p53. Transcriptomic analysis shows that loss of fam83f leads to downregulation of phosphatidylinositol-3-phosphate (PI(3)P) binding proteins and impairment of cellular degradation pathways, particularly autophagy, a crucial component of the DNA damage response. Finally, we show that Fam83f protein is itself targeted to the lysosome when over-expressed in HEK293T cells, and that this localization is dependent upon a C terminal signal sequence. The zebrafish lines we have generated suggest that Fam83f plays an important role in autophagic/lysosomal processes, resulting in dysregulated hatching and increased sensitivity to genotoxic stress in vivo.

著者: Rebecca A Jones, F. Cooper, G. Kelly, D. Barry, M. J. Renshaw, G. Sapkota, J. C. Smith

最終更新: 2024-02-12 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.10.579757

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.10.579757.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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