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# 生物学# 神経科学

軸索BARseqを使った神経接続のマッピング

新しい方法で脳内の神経細胞のつながりを詳しくマッピングできるようになった。

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軸索BARseqでマッピン軸索BARseqでマッピングされたニューロン追跡するんだ。画期的な方法がニューロンの接続を効果的に
目次

ニューロンは脳の基本的な構成要素で、信号の送受信を担当してるんだ。各ニューロンには細胞体と軸索と呼ばれる長い繊維があるよ。マウスの脳だけでも7000万以上のニューロンがあって、彼らの軸索を合わせると何千キロメートルにもなるんだ。これらのニューロンがどうつながってコミュニケーションをとるかを理解することは、脳の機能を研究する上で超重要なんだ。

接続をマッピングするための従来の方法

研究者たちはずっとニューロンの接続を追跡する方法を探してきたんだ。一般的に使われている2つの主要な方法は以下の通り:

  1. 単一ニューロン追跡:この方法では、個々のニューロンを一つずつラベル付けして、接続を高詳細にマッピングすることができる。ゴルジ法やウイルスを使った現代の方法が使われることが多いけど、この方法だと一度にマッピングできるニューロンの数は少ないんだ。

  2. バルク追跡:このアプローチでは、特定の脳の領域にウイルスを注入するんだ。ウイルスがそのエリアのさまざまなニューロンに広がって、ニューロンが取る主要な経路を見えるようにする。大規模なニューロン集団の接続を明らかにすることはできるけど、個々のニューロンの詳細なデータは不足してるんだ。

新しいアプローチ:軸索BARseq

伝統的な方法の限界を克服するために、軸索BARseqという新しい技術が開発されたんだ。このアプローチでは、一回の実験で何千ものニューロンの接続をマッピングできるんだよ。

軸索BARseqの仕組み

軸索BARseqは、ニューロンにユニークなRNA配列(バーコードと呼ばれる)をタグ付けする方法を使うよ。仕組みは以下の通り:

  1. ニューロンのタグ付け:バーコードのライブラリを持ったウイルスを特定の脳のエリアに注入する。そのウイルスに感染した各ニューロンは、ユニークなバーコードを取り込むんだ。

  2. RNAの輸送:バーコードは軸索を沿って移動して、他のニューロンとつながるポイントに到達する。

  3. シーケンシング:軸索端末からバーコードを集めて、高スループットシーケンシングを行ってバーコードを読み取る。このことで、ユニークなバーコードの配列に基づいてどのニューロンがつながっているかがわかるんだ。

この方法では、何十万ものニューロンの接続を一度に追跡できて、ニューロンの接続に関する高い詳細度を提供するんだ。

軸索BARseqの利点

軸索BARseqにはいくつかの利点がある:

  1. 高スループット:研究者は多くのニューロンを同時に分析できるから、大規模な研究が可能になるんだ。

  2. 精度:バーコードを使うことで、軸索が絡まってたり密集してても接続を正確に特定できるんだよ。

  3. 空間分解能:この方法のおかげで、ニューロンの細胞体の場所とその軸索の投影を関連付けることができて、脳の接続性をより明確に理解できるようになる。

軸索BARseqの応用

研究者たちは、脳のさまざまな領域に軸索BARseqを適用してる。例えば、音の情報を処理する聴覚皮質の接続を研究するために使われてるんだ。

例:聴覚皮質からの投影をマッピング

最近の実験では、研究者たちはバーコード付きのウイルスをマウスの聴覚皮質に注入したんだ。2日後に軸索をシーケンシングして、8600以上のユニークな軸索バーコードを特定した。このデータを使って、聴覚処理に関連する脳のさまざまな領域への接続をマッピングできたんだ。

結果と発見

結果は、異なるタイプのニューロンがさまざまな標的にどう投影しているかを示したよ。得られたデータを分析することで、研究者たちは投影パターンに基づいてニューロンを分類することができたんだ。外側のエリアを狙うニューロンは皮質の異なる層に投影する傾向がある一方、内側のエリアを狙うニューロンは主に表層に投影してた。

限界と将来の展望

軸索BARseqは強力なツールだけど、限界もあるんだ。例えば、シナプス接続の詳細は提供できないから、ニューロンがどうコミュニケーションを取ってるかを正確には示せないんだ。それに、各ニューロンの構造の細かい詳細を再構築する際に不正確な部分があるかもしれない。

今後、研究者たちはこの方法を改善するために、従来の追跡技術と組み合わせてニューロンの接続の細かい詳細を捉える方法を探ってるんだ。また、投影パターンと遺伝情報を関連付けて、異なるニューロンタイプがどう機能するかをよりよく理解するための道もあるよ。

結論

要するに、軸索BARseqはニューロンの接続を研究する上での promisingな進展だね。この新しい方法のおかげで、脳の機能を支える複雑な接続網をマッピングする能力が向上するよ。研究者たちがこれらの技術をさらに洗練させていくにつれて、私たちの脳の働きについてもっと包括的な洞察が得られることを期待できるし、新しい発見や脳の障害に対する治療法の可能性も広がるね。

オリジナルソース

タイトル: Massive Multiplexing of Spatially Resolved Single Neuron Projections with Axonal BARseq

概要: Neurons in the cortex are heterogeneous, sending diverse axonal projections to multiple brain regions. Unraveling the logic of these projections requires single-neuron resolution. Although a growing number of techniques have enabled high-throughput reconstruction, these techniques are typically limited to dozens or at most hundreds of neurons per brain, requiring that statistical analyses combine data from different specimens. Here we present axonal BARseq, a high-throughput approach based on reading out nucleic acid barcodes using in situ RNA sequencing, which enables analysis of even densely labeled neurons. As a proof of principle, we have mapped the long-range projections of >8,000 mouse primary auditory cortex neurons from a single brain. We identified major cell types based on projection targets and axonal trajectory. The large sample size enabled us to systematically quantify the projections of intratelencephalic (IT) neurons, and revealed that individual IT neurons project to different layers in an area-dependent fashion. Axonal BARseq is a powerful technique for studying the heterogeneity of single neuronal projections at high throughput within individual brains.

著者: Anthony M Zador, L. Yuan, X. Chen, H. Zhan, H. L. Gilbert

最終更新: 2024-02-21 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.02.18.528865

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.02.18.528865.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

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