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# 生物学# 分子生物学

クライオ電子顕微鏡のサンプル準備の進展

EasyGridは、クライオEMイメージングのためのサンプル準備を簡素化するよ。

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EasyGridでクライオEasyGridでクライオEMを改善するに変える。クライオ電子顕微鏡のサンプル準備を革命的
目次

クライオ電子顕微鏡法(cryo-EM)は、大きな分子や細胞の構造を非常に低温で見るための強力な技術だよ。これにより、科学者たちはこれらのサンプルを自然に近い状態で研究できるんだ。クライオ-EMには主に2つの使い方があって、一つは単一粒子解析(SPA)、これは個々のタンパク質構造を見る方法、もう一つはクライオ電子トモグラフィー(cryo-ET)、これは細胞内部のサンプルを調べる方法だよ。ただ、これらの方法に適したサンプルを作るのは難しくて、困難を伴うことが多いんだ。

サンプル準備の重要性

クライオ-EMから良い結果を得るためには、科学者たちはサンプルを慎重に準備する必要があるよ。SPAの場合、分子を含む凍った水の薄い層が必要なんだ。この層は50ナノメートルより厚くならないようにしなきゃいけなくて、イメージングに使う特別なメッシュサポートであるグリッドを覆わなきゃいけない。その層の形成方法は、グリッドの粘着性や液体の厚さ、サンプルが凍る速さなどの多くの要因に影響されるんだ。

科学者たちは通常、最適なサンプル準備法を見つけるために多くの方法をテストする必要があって、これにはかなりの時間がかかることもあるよ。最近では、このプロセスを助けるための新しいツールが開発されているんだ。いくつかは従来の急速凍結法を使っているし、他にはマイクロフルイディクスやエタンジェッティングなどの高度な技術を利用している。でも、これらの新しいツールがあっても、サンプルの準備はまだ大きな課題で、自動化されたシステムが必要とされているんだ。

サンプル準備における新しい解決策

クライオ-EMの大きな問題の一つは、高品質のサンプルを得ることだよ。サンプルは氷の結晶が形成されないように迅速に凍結しなきゃいけないんだ。そうじゃないとサンプルが損なわれるからね。EasyGridプラットフォームは、この問題を解決するために開発されたんだ。これはクライオ-EMのサンプル準備プロセスを改善するための自動化システムだよ。

EasyGridはサンプル準備のさまざまな段階を制御できるんだ。まず、サンプルの広がりを良くするためにグリッドの条件を最適化するところから始まるよ。次に、自動的にサンプル溶液の薄い層をグリッドに適用して、すぐにエタンジェッティングで凍結するんだ。この方法は冷却を速めて、サンプルの質を保つのを助け、イメージングのためにクリアな状態を維持するんだ。

EasyGridプラットフォームの特徴

EasyGridプラットフォームは、サンプル準備プロセスに特定の役割を持つさまざまなモジュールが詰まっているんだ。

グリッドのロードとハンドリングモジュール

このモジュールは、クライオ-EMに使われるグリッドをロードして管理するのを助けるよ。各グリッドは自動化システムによって丁寧に持ち上げられ、移動されるから、準備中の損傷の可能性が減るんだ。

プラズマ処理モジュール

EasyGridのこの部分は、大気圧プラズマ処理という特別な技術を使って、グリッドの表面をより湿潤にするんだ。これにより、サンプルがグリッド上で均等に広がりやすくなるんだ。

デュアルノズルピコリットルドロップディスペンサー

このモジュールは、自動的にサンプル溶液の小さな水滴をグリッドに供給するんだ。多くの水滴を素早く分配して、均一なサンプル層を作ることができるよ。

湿度制御サンプルスプレッディングモジュール

サンプルが十分に薄くなるように、EasyGridは圧力波を使ってグリッド上で水滴を広げる特別な方法を採用しているんだ。これは湿った環境で行われるから、サンプルが急速に蒸発するのを防ぐんだ。

ガラス化と保存モジュール

サンプルが準備できたら、すぐに凍結する必要があるよ。EasyGridには、冷やしたエタンを使ってサンプルを迅速に凍結するシステムがあるんだ。凍結後、グリッドは液体窒素で保存され、安全に保たれるんだ。

EasyGridコントロールによる品質管理

品質管理は、クライオ-EMのサンプル準備において非常に重要だよ。EasyGrid Control(EGC)という新しいモジュールが、グリッド上のサンプルの品質を評価するために設計されたんだ。EGCは、凍結したサンプルの厚さがイメージングに適しているかどうかを迅速に判断できるんだ。

EGCは、高度なイメージング技術を使って、グリッド上の氷の厚さを示すマップを作成するんだ。これらのマップは、科学者がさらに研究するために最適なサンプルを持つグリッドを特定するのを助けるんだ。

EGCのイメージングモード

EGCには、サンプルを視覚化するための異なるモードがあるんだ:

  1. 低倍率での厚さマッピング:このモードは、サンプルの質の概観を提供するんだ。
  2. 高倍率でのスクリーニング:これにより、グリッド上の特定の領域を詳細に調べることができるよ。
  3. 詳細な厚さマッピング:このステップでは、グリッドのさまざまなエリアで最適な厚さを確保するのを助けるんだ。

EasyGridの応用:研究のための高品質サンプル

EasyGridは、サンプル準備の自動化だけじゃなく、サンプルの質を向上させることも大事なんだ。これは成功するイメージングにとって不可欠だよ。

単一粒子解析(SPA)の最適化

SPAでは、研究者たちはタンパク質の3D構造を可視化したいんだ。EasyGridは、サンプルがグリッドに均一に広がるようにして、これを実現する手助けをするんだ。この設定により、より良いイメージングが可能になって、研究者たちは研究しているタンパク質構造の高解像度の詳細を得ることができるよ。

研究者たちは、異なるタンパク質のサンプルをEasyGridを使って準備して、イメージの解像度が印象的なものになったんだ。

クライオ-ETのためのガラス化品質の向上

細胞をクライオ-ETでイメージングする際、細胞を取り囲む氷の質が重要なんだ。EasyGridのジェットガラス化の方法は大きな利点を提供するよ。これは、イメージングに干渉する氷の結晶の形成を防ぐんだ。

細胞を直接グリッド上で培養して、それからEasyGridを使って準備して凍結することで、研究者たちは、結果として得られたサンプルが標準的な方法に比べて質がはるかに高いことを見つけたんだ。

従来の方法と比べたEasyGrid

従来のサンプル準備法、たとえば吸水やウィッキングは多くの欠点があるんだ。これらの方法はサンプルにアーチファクトを導入する可能性があって、大きな細胞にはあまり適していないこともあるよ。

EasyGridのアプローチは高速で、サンプルを損なうリスクを最小限に抑えているんだ。圧力波技術を使うことで、吸水やウィッキングによって発生する歪みを避けながら、迅速にサンプルを広げられるんだ。これは、準備プロセス中に繊細な細胞の構造を維持するために特に重要だよ。

サンプル準備におけるロボティクスと精度

EasyGridのロボット機能により、一貫した再現性のあるサンプル準備が可能になるんだ。サンプルの正確な分配を確保するのは均一性にとって重要だし、操作の正確なタイミングはサンプルの質の変動を減らすことにもつながるんだ。

クライオ-EMワークフローの合理化

EasyGridを使うことで、研究者たちはクライオ-EMのワークフローの多くのステップを自動化できるようになったんだ。この自動化により、人為的エラーを排除して、より信頼できる結果を得ることができるんだ。サンプルを素早くスクリーニングして準備できることで、研究者たちはサンプル準備の細かいところよりも、自分の研究にもっと集中できるようになるんだ。

未来に目を向けて

EasyGridのチームは、その機能をさらに向上させるために日々努力しているんだ。サンプル準備をさらに最適化するために高度な機能を取り入れようとしているんだ。それには、さまざまな生化学的条件のスクリーニングや、ダイナミックなプロセスを捕捉するための時間解析実験の促進が含まれる可能性があるよ。

EasyGridは、ラボがクライオ-EMにアプローチする方法を劇的に変える可能性があるんだ。そのモジュール設計により、大規模な研究施設から小さなラボまで、さまざまな環境で使用できるんだ。

結論

クライオ電子顕微鏡法は、現代生物学において重要なツールで、科学者たちが分子や細胞の構造を詳細に観察できるようにしているんだ。サンプル準備はこのプロセスの中で難しいステップだけど、EasyGridはこのタスクを合理化し、改善するための革新的な解決策を提供するんだ。サンプルの準備を自動化し、質を向上させることで、EasyGridは複雑な生物システムの理解を進め、さまざまな研究分野での突破口に貢献する可能性があるんだ。

オリジナルソース

タイトル: EasyGrid: A versatile platform for automated cryo-EM sample preparation and quality control

概要: Imaging biological macromolecules in their native state with single-particle cryo-electron microscopy (cryo-EM) or in situ cryo-electron tomography (cryo-ET) requires optimized approaches for the preparation and vitrification of biological samples. Here, we describe EasyGrid, a versatile technology enabling systematic, tailored and advanced sample preparation for cellular and structural biology. This automated, standalone platform combines in-line plasma treatment, microfluidic dispensing, blot-less sample spreading, jet-based vitrification and on-the-fly grid quality control using light interferometry to streamline cryo-EM sample optimization. With EasyGrid, we optimized grid preparation for different purified macromolecular complexes and subsequently determined their structure with cryo-EM. We also demonstrated how the platform allows better vitrification of large, mammalian cells compared to standard plunge-freezing. Automated sample preparation with EasyGrid establishes an advanced, high-throughput platform for both single-particle cryo-EM and cellular cryo-ET sample preparation.

著者: Gergely Papp, O. Gemin, V. Armijo, M. Hons, C. Bissardon, R. Linares, M. W. Bowler, G. Wolff, K. Kovalev, A. Babenko, V. T. Salo, S. Schneider, C. Rossi, L. Lecomte, T. Deckers, K. Lauzier, R. Janocha, F. Felisaz, J. Sinoir, W. P. Galej, J. Mahamid, C. W. Muller, S. Eustermann, S. Mattei, F. Cipriani

最終更新: 2024-03-13 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.18.576170

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.18.576170.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

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