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# 生物学# 生化学

TB菌のメカニズムに関する新しい洞察

研究が結核感染におけるESAT-6の重要な機能を明らかにしたよ。

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TB菌のESATTB菌のESAT6について探る新しい発見。MtbにおけるESAT-6の役割に関する
目次

結核、またはTBは、Mycobacterium tuberculosis(Mtb)という細菌によって引き起こされる感染症だ。これは世界中で深刻な問題で、毎年160万人以上が亡くなってる。TBの課題の一つは、細菌が免疫システムから隠れたり、何年もinactive(非活動)な状態で人に留まることができる点だ。世界中で約17億人がMtbの潜伏感染を持っていると考えられている。さらに、薬に耐性がある細菌のケースが増えていることで問題が悪化してる。

Mtbが体に感染する仕組み

Mtbは、感染を効果的にセットアップするために、さまざまな道具、いわゆる病原性因子を使っていて、これは細菌内の特別なシステムを通じて届けられる。研究によると、Mtbは特定の細胞構造、特に食胞膜を傷つけることができる。このプロセスは主にESX-1という分泌システムに依存していて、主役はESAT-6というタンパク質だ。ESAT-6の働きの理解はまだ進行中。

研究者たちは、ESAT-6が膜をどう傷つけるか、そしてこれがどうMtbが細胞内の隔離領域から逃れるのを助けるかを理解するために多くの研究を行ってきた。しかし、以前の研究は、洗剤での汚染などの問題があって、結果が複雑になっている。最近、研究者たちは分離されたタンパク質を使わずに全細菌を研究することに目を向けている。これらの実験は貴重な情報を提供してるが、分泌システムの異なる成分がどのように協力するかが複雑さを加えている。

ESAT-6に関する最近の発見

たくさんの研究が行われてるけど、科学者たちはまだESAT-6がどう機能するかを明確に理解できていない。この研究では、異なる条件下で徹底的なテストを行うことでその点を解決しようとしている。さまざまな技術が使われていて、ESAT-6がCFP-10という別のタンパク質にどれだけ結合するかを測定するために生物層干渉法(BLI)という方法も使ってる。科学者たちは、ESAT-6がどのように大きなクラスターを形成するかを確認するために高機能なイメージング技術も使っている。

研究者たちは、ESAT-6に結合できる新しい種類のナノボディをアルパカから生成した。このナノボディは、Mtb感染中のESAT-6の機能を研究するためのツールとなる。彼らはいくつかのテストを行い、このナノボディが感染した細胞内でのMtbの成長を阻止するのにどう働くかを理解しようとしている。

ESAT-6とCFP-10タンパク質の生成

ESAT-6とCFP-10を研究するために、チームは細菌を使ってこれらのタンパク質を作成した。彼らはE. coliという一般的な細菌を使ってタンパク質を生産した。タンパク質を生成するために使用されたDNAの配列を確認して、正しい配列があることを確認した。次に、タンパク質を精製して、さらなるテストに適した良質のものにした。これらのタンパク質は、ESAT-6がCFP-10とどのように相互作用するかを調査するために不可欠だ。

ダイマー形成の検証

主な目標の一つは、ESAT-6とCFP-10が安定したペアリング、いわゆるダイマーを形成できるかを見ることだった。研究者たちは、さまざまな条件下でこれらのタンパク質の異なる混合物をテストして、その振る舞いを観察した。彼らはネイティブPAGEという技術を使って混合物を分析し、ESAT-6とCFP-10が実際に複合体を形成できることを確認した。

溶血活性のテスト

研究のもう一つの重要な側面は、ESAT-6が溶血を引き起こすかどうかをテストすることだった。過去の研究にはばらつきがあったが、研究者たちは、彼らのESAT-6の形態が単独では溶血を引き起こさなかったことを発見した。しかし、特定の細菌が赤血球と直接接触すると赤血球を破壊できることがわかった。これは、Mtbが近縁種のMycobacterium marinum(Mm)と比較してどのように振る舞うかについての疑問を浮かび上がらせた。

結合強度の測定

ESAT-6とCFP-10の相互作用の強さを理解するために、研究者たちはBLIを使った実験を行った。彼らは、ESAT-6がCFP-10と強く相互作用する一方で、自分自身とも結合する能力があることを発見した。この自己結合は酸性条件下でより顕著に起こり、これは感染した細胞内の環境に合致している。これらの発見は、酸性条件がESAT-6の大きな複合体の形成を促進する可能性があることを示唆している。

大きなESAT-6複合体の形成

研究者たちは、pHが低いほどESAT-6が中性条件と比較して大きな構造を形成することに注目した。彼らは、これらの大きな複合体が形成されるのにどれくらいの時間がかかるかを調べる追加のテストを行った。彼らは、ESAT-6がpH4.5のときにこれらの複合体がより目に見えるようになり、pH7.5のときよりも目立つことを観察した。これは、特定の細胞内の酸性環境がESAT-6に重要な変化を引き起こす可能性があることを示している。

ESAT-6複合体の観察

イメージング技術を使って、研究者たちはこれらの大きなESAT-6複合体を視覚化することができた。彼らはさまざまな形態のESAT-6を混ぜて、それを顕微鏡で観察した。画像は、中性条件下では存在しない複雑な構造を示していた。これは、環境がESAT-6の振る舞いに影響を与えることを示唆している。

ストイキオメトリの分析

ESAT-6複合体の性質をさらに調査するために、チームは化合物がカラムを通過する際の分子量を測定する方法を使用した。中性pHでは、ESAT-6がダイマーを形成することがわかったが、酸性pHではより大きな複合体の存在が確認された。これは、ESAT-6が異なる条件下でどのように相互作用するかについての洞察を提供した。

ESAT-6に対するナノボディの開発

この研究には、ESAT-6を特異的に標的とするナノボディの生成も含まれていた。この新しいツールは、研究者が感染中のESAT-6の機能を観察するのを助けることができる。この研究では、このナノボディがESAT-6に結合し、Mtb感染におけるその役割に関する有用な情報を提供できることが示された。

ナノボディによる機能テスト

研究者たちは、新しいナノボディが細胞内のMtbの成長を減少させるかどうかをテストした。彼らは、暗闇で光る修飾されたMtb菌株に感染した細胞を観察するなど、さまざまなアプローチを使用した。結果は、ナノボディで処理された細胞が対照群に比べて細菌の成長が大幅に減少したことを示していた。

結論

この研究は、ESAT-6に関するいくつかの重要な発見を強調している。まず、ESAT-6が酸性環境で急速に大きな複合体を形成できることを確認した。次に、CFP-10がないとき、ESAT-6は中性条件でダイマー状態を維持していることがわかった。最後に、新しく開発されたナノボディE11rvは、細胞内でのMtbの成長を抑制する可能性を示している。

研究者たちは、一般的に使用されるESAT-6構造の一つのアミノ酸配列についての不完全な情報に関して驚くべき発見をした。しかし、彼らのデータは異なるタグを持つ構造間に実質的な違いを示さなかった。

全体的に、Mtbの病原性因子の機能を調査することは、生きたシステム内での細菌の取り扱いが難しいため、挑戦を伴う。今回の研究の発見は、Mtbが宿主細胞とどのように相互作用するかを理解するための新しい方法を提供する可能性があり、TB感染の治療や管理に新しいアプローチをもたらすかもしれない。

オリジナルソース

タイトル: ESAT-6 undergoes self-association at phagosomal pH and an ESAT-6 specific nanobody restricts M. tuberculosis growth in macrophages

概要: Mycobacterium tuberculosis (Mtb) is known to survive within macrophages by compromising the integrity of the phagosomal compartment in which it resides. This activity primarily relies on the ESX-1 secretion system, predominantly involving the protein duo ESAT-6 and CFP-10. CFP-10 likely acts as a chaperone, while ESAT-6 likely disrupts phagosomal membrane stability via a largely unknown mechanism. we employ a series of biochemical analyses, protein modeling techniques, and a novel ESAT-6-specific nanobody to gain insight into the ESAT-6s mode of action. First, we measure the binding kinetics of the tight 1:1 complex formed by ESAT-6 and CFP-10 at neutral pH. Subsequently, we demonstrate a rapid self-association of ESAT-6 into large complexes under acidic conditions, leading to the identification of a stable tetrameric ESAT-6 species. Using molecular dynamics simulations, we pinpoint the most probable interaction interface. Furthermore, we show that cytoplasmic expression of an anti-ESAT-6 nanobody blocks Mtb replication, thereby underlining the pivotal role of ESAT-6 in intracellular survival. Together, these data suggest that ESAT-6 acts by a pH dependent mechanism to establish two-way communication between the cytoplasm and the Mtb-containing phagosome.

著者: Fikadu G Tafesse, T. A. Bates, M. Trank-Greene, X. Nguyenla, A. Anastas, S. Gurmessa, I. R. Merutka, S. D. Dixon, A. Shumate, A. R. Groncki, M. A. Parson, J. R. Ingram, E. Barklis, J. E. Burke, U. Shinde, H. L. Ploegh

最終更新: 2024-03-19 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.08.16.553641

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.08.16.553641.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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