樹木の健康と微生物の相互作用を理解する
研究で、木の健康と微生物コミュニティの複雑な関係が明らかになった。
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樹木の健康が世界中で注目されてるけど、それは「ダイバック」と呼ばれる問題によるもので、樹木の健康が低下することを指すんだ。この問題は森林や作物で増えてて、気候変動による気温上昇がさらに悪化させてる。暖かい天気は樹木の病気を増やすことがあって、いろんな要因が絡んでる複雑な状況なんだ。
樹木の健康の低下には、生物による病気などの生きた要因と、環境条件のような非生物的要因が関わってることが多い。これらの要因はさまざまな方法で一緒に作用するから理解するのが難しいんだ。特に、血管の枯れ症というタイプの樹木の病気は、樹木の水や栄養の流れを妨げる病気で、これが樹木の健康に与える影響は大きいんだ。
多くの植物の病気は特定の病原体から来てるってのは一般的に認められてるけど、最近の研究で病気が複数の微生物の相互作用からも生じる可能性があることが分かってきたんだ。植物内に住む小さい微生物の複雑さを考えると、それらの関係を研究して樹木の健康にどう影響するかを理解することが大切なんだ。
マイクロバイオームの役割
微生物群集、つまりマイクロバイオームは、特定の環境に住む微生物のグループのこと。樹木の中では、健康やダイバックの速度に大きく影響することがある。ただ、これらのコミュニティの影響を評価するのが難しいのは、たくさんの異なる微生物が共存してるからなんだ。中には普通の条件下では害を与えない植物内に住む真菌もいるんだ。
これらの真菌群は、樹木に対して有益な影響もあれば、有害な影響もあるんだ。樹木が周囲に適応するのを助けたり、さまざまなストレス要因に対する抵抗力を提供したりすることもある。たとえば、いくつかの真菌は水や栄養の吸収を助けたり、有害なものから守ったりするんだ。これらの微生物の関係は、環境要因によって変わることもあるんだ。
場合によっては、通常は無害な真菌がストレス条件、たとえば干ばつや栄養不足のときに有害になることもある。これが、真菌群がどのように役立つから病気を引き起こすまでの切り替えを理解するのが難しくさせてるんだ。
樹木の健康と病気のダイナミクス
樹木の健康はさまざまな要因、特に有害な生物の存在によって劇的に変わることがある。例えば、オリーブ果樹園でアントラクロースと呼ばれる病気に苦しんでいるとき、科学者たちは病気のレベルが高いときに有益なエンドファイトが少なくなっているのを観察したんだ。別の例では、コナラの木では、特定の細菌種が樹木を侵略している甲虫と一緒に繁栄していることが分かって、さまざまな微生物の組み合わせが樹木の健康に影響を与えていることを示唆してるんだ。
樹木の病気は、生物的要因、微生物による病気などと、非生物的要因、土壌の特性や気候条件のようなものの両方に影響される。特に天候の変化、つまり気温の上昇や降水パターンの変化が樹木にストレスを与えることがある。このストレスが樹木の防御を弱めて、昆虫や病気、環境条件からのさまざまな脅威に対して脆弱にするんだ。
ブドウの木のダイバック
この低下の一例がブドウの木のダイバックで、ブドウ栽培にとって大きな脅威なんだ。この病気の原因はいまだに研究中で、さまざまな木を利用する真菌が関わっていると考えられている。一つの重要な病気の形態がブドウ木の幹病で、これが収穫量の低下や果実の質の低下を引き起こして、栽培者に経済的損失をもたらすんだ。症状は、しおれた葉や幹の腐敗、全体的な樹木の健康の低下として現れることがある。
幹病のようなものは、幹に死んだ部分や葉のしおれを含む複雑な症状を引き起こすことがある。症状の現れ方や進行速度にはバラツキがある。研究者たちは、いくつかの真菌が関与していることを確認しているけど、彼らの正確な役割や互いに、またブドウの木との相互作用は不明なんだ。
興味深いことに、これらの病気に関連した多くの真菌は健康な植物にも見られるから、単にその存在が病気を引き起こすわけではないことを示唆してるんだ。これが、これらの関係がブドウの木の健康にどう影響するかを理解するのを難しくしてるんだ。
研究の目標
ブドウの木とそこに住む生物との関係を明らかにするために、研究者たちは複数のブドウ園で調査を行い、健康なブドウの木と症状のあるものを評価したんだ。目的は、これらのブドウの木の幹に生息する真菌群を分析して、病気の症状の存在に関連した特定の真菌があるかどうかを調べることだったんだ。
健康なブドウと病気のブドウからサンプルを2年間集めることで、研究者たちはこれらの真菌群がブドウの木の健康に関連してどのように変化するかを追跡しようとしたんだ。この長期的な研究は、さまざまな真菌種が健康や病気の状態にどう寄与するかを見る機会を提供したんだ。
方法論
この研究では、西スイスにあるいくつかのブドウ園からブドウの木の木材サンプルを採取したんだ。各ブドウ園には同じ年齢と出所の植物が植えられていて、結果のバラツキを最小限に抑えたんだ。4年の間に、研究者たちは病気の発生を記録し、健康なものと症状のあるもの両方の幹から木材サンプルを集めたんだ。
サンプルは、現在の技術を使って真菌の存在を確認されて、これにより多様な微生物群集を正確に特定することができた。これは遺伝子配列解析を含み、木材内の真菌の構成を詳しく見せてくれるんだ。
発見: 真菌群落の構成
全体として、この研究は膨大なデータを得て、ブドウの木の幹に住む多様な真菌種を明らかにしたんだ。研究者たちは何千もの異なる真菌のバリアントを特定して、幹内のマイクロバイオームの複雑さを示してる。
驚くべきことに、特定の真菌の存在と植物の健康状態の間に明確な相関関係は見つからなかったんだ。多くの真菌は健康なブドウと症状のあるブドウの両方に存在していて、これらの微生物が単に存在することが必ずしも病気を引き起こすわけではないことを示してる。この発見は、他の要因、たぶん環境条件も樹木の健康に重要な役割を果たしているかもしれないことを示唆してるんだ。
健康なブドウと病気のブドウの違い
無症状のブドウに関連する真菌を症状のあるものと比較したとき、科学者たちは全体の多様性は高かったけど、有害と考えられる特定の真菌が病気のある植物でより一般的であるという一貫したパターンは見つからなかったんだ。これは、特定の真菌が常に病気を引き起こすという以前の仮定に挑戦する重要な発見なんだ。
研究者たちがさらに深く掘り下げると、健康なブドウにより頻繁に現れるタクサがいくつか特定されて、病気に対する潜在的な保護効果がある可能性が示唆されたんだ。ただ、特定の真菌が病気に直接関連しているという考えは、あまり明確でなくなり、これらの微生物とその宿主植物との関係をさらに調査する必要があることを強調してるんだ。
環境の影響
この研究はまた、環境要因がブドウの健康に与える影響も強調してるんだ。土壌の特性や気候などの要因が樹木の健康と病気の存在に大きな影響を与えることがある。特に、土壌の水分保持能力がブドウの木の病気の発生を理解する上での重要な考慮事項として特定されたんだ。
これらの環境要因が微生物群とどのように相互作用するかを理解することが、病気に対する作物の抵抗力を強化する管理手法の洞察を提供するかもしれないんだ。
結論
ブドウの幹病に関する研究は、樹木とその微生物の住人との間の複雑な相互作用を示してるんだ。特定の真菌がしばしば病気に関与しているけど、結果は樹木の健康に寄与する要因がたくさんあることを示唆してる。
この研究は、植物の健康を調べる際には、個々の生物だけでなく、樹木が存在する生態系全体を考慮することの重要性を強調しているんだ。将来の研究は、特にストレス条件下での環境要因と微生物群の相互作用に焦点を当てて、ブドウの木や他の木本植物の健康を維持する方法をよりよく理解する必要があるんだ。
タイトル: Landscape-scale endophytic community analyses in replicated grapevine stands reveal that dieback disease is not caused by specific fungal communities
概要: Tree diebacks are complex and multi-factorial diseases with suspected biotic and abiotic components. Microbiome effects on plant health are challenging to assess due to the complexity of fungal and bacterial communities. Grapevine wood dieback is the main threat to sustainable production worldwide and no causality with microbial species has been established. Here, we aimed to test the hypothesis that grapevine esca disease progression has reproducible drivers in the fungal species community. For this, we analyzed a set of 21 vineyards planted simultaneously with a single susceptible cultivar to provide replication at the landscape scale. We sampled a total of 496 plants across vineyards in two different years to perform deep amplicon sequencing analyses of the fungal communities inhabiting grapevine trunks. The communities were highly diverse with a total of 4,129 amplified sequence variants assigned to 697 distinct species. Individual plants varied in fungal community composition depending on the year of sampling, vineyard location, and disease status. However, we detect no specific fungal species driving symptom development across the vineyards contrary to long-standing expectations. Our study shows how landscape-scale replicated field surveys allow for powerful hypothesis-testing for complex dieback disease drivers and prioritize future research towards additional factors.
著者: Daniel Croll, V. Monod, V. Hofstetter, O. Viret, V. Zufferey, K. Gindro
最終更新: 2024-04-10 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.05.588363
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.05.588363.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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