牽引力顕微鏡の進展
新しい技術が細胞の力や相互作用の理解を深めてるよ。
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私たちの体の細胞は、いろんな生物学的プロセスで重要な役割を果たす力を生成する能力があるんだ。これには、成長や傷の治癒、感染などの脅威への反応が含まれる。一つの人気のある研究手法は、トラクションフォース顕微鏡(TFM)と呼ばれるもの。これを使うことで、科学者たちは細胞が周囲にかける力をリアルタイムで測定できて、細胞が環境とどう相互作用するかを学べるんだ。
TFMの仕組み
TFMの基本的な考え方はシンプルで、細胞を柔軟な表面に置くんだ。その表面には、細胞からの力で起こる変化を可視化するための小さな蛍光ビーズがある。細胞がこの表面を引っ張ったり押したりすると、変形が生じる。細胞が表面と相互作用する前後の画像をキャッチすることで、研究者たちは作用している力を計算できるんだ。
最初に、科学者たちは細胞が特定の柔軟な表面にくっつくと、目に見えるシワを作ることを発見した。これが、力を表面全体にマッピングする手法につながった。イメージング技術の進歩により、研究者たちは蛍光ビーズの動きを追跡できるようになり、細胞が生成する力についての情報を明らかにできるんだ。
正確な測定の重要性
TFMの測定精度は、表面の変形に関するデータをどれだけ集められるかに依存してる。変形が測定される頻度が高いほど、得られる力の計算が正確になる。測定精度を向上させるために、研究者たちはイメージング品質を向上させるための複数の手法を導入している。
これには、細胞の動きを追跡するマーカーの数を増やすことや、高度なイメージング技術を使うことも含まれる。例えば、2種類の異なる色の蛍光ビーズを使ったり、スーパー分解能顕微鏡技術を適用したりすることができる。最近の手法である強化トレーサー密度スーパー解像顕微鏡は、表面に小さなマーカーを付けることで、微細な動きをより詳細に追跡できるようになったんだ。
イメージング技術の進歩
DNAベースのフルオロキューブのような小さなマーカーを利用することが、最近のTFMにおける革新だ。これらのマーカーは、重なり合わずに近くに配置できるから、解像度の高いイメージングが可能になる。画像の質を向上させるために、研究者たちは全内反射蛍光(TIRF)顕微鏡も使っていて、背景のノイズを減らして蛍光マーカーをよりよく可視化できるようにしてる。
実際、科学者たちはこれらの小さなマーカーから得たデータを、従来の蛍光ビーズと組み合わせて動きをより効果的に追跡してる。画像分析の方法を改良することで、研究者たちは作用している力をより明確に理解できるようになったんだ。
基材材料の役割
TFM実験中に細胞が置かれる素材は、得られる画像の質にも大きく影響する。従来、ハイドロゲルとエラストマーの2種類の材料が使われてきた。ポリアクリルアミド(PAA)ゲルやポリジメチルシロキサン(PDMS)エラストマーが一般的な選択肢だ。PDMSは、光学的な透明度が高いから、イメージングには好まれるんだ。
蛍光ビーズをPAAゲルに混ぜると、光散乱や背景蛍光の問題が生じて、データを正確に分析するのが難しくなる。だから、ビーズは今やゲルの表面に付けられることが多くなり、追跡が良くなり、画像もクリアになるんだ。
実験の設定
TFMを行うためのセットアップは、細胞培養を準備して、選んだ基材の上に置くことから始まる。基材は細胞がうまくくっつくように処理され、蛍光マーカーが取り付けられる。このマーカーが、実験中の動きを可視化してくれるんだ。
細胞と基材の準備ができたら、次は細胞が基材に力をかけている様子を一連の画像としてキャッチするんだ。細胞が表面から取り除かれたら、研究者たちは新しい画像を以前のものと比較して、細胞の力に応じて基材がどう変わったかを分析する。
動きを追跡するためのツール
マーカーの動きを理解するために、研究者たちはいくつかの追跡技術に頼っている。オプティカルフロートラッキングという手法がその一つで、時間をかけて撮影した画像のペアを分析して、変化を検出し、動きを追跡する。このプロセスでは、マーカーの位置がどう調整されるかを特定するためのさまざまなアルゴリズムを使うことができるんだ。
一つの高度なアプローチは、異なる2つのチャンネルからデータを組み合わせる(フルオロキューブ用と従来のビーズ用)。このデュアルチャネル追跡は、作用している力の全体像を把握できるから、細胞が生成するトラクションフォースを正確に測定できるようになるんだ。
従来のTFMの限界
TFMには多くの利点があるけど、空間解像度に関して限界もある。標準の解像度は数マイクロメートルに達することが多くて、細胞内の小さな構造を研究したり、小さなバクテリアからの力を正確に測定したりするのが難しい。これらの限界に対処するために、より詳細な測定が可能な高度なセンサーや技術が登場しているんだ。
基材の種類の比較
さまざまな基材の種類を比較することは、それぞれの利点と欠点を理解するのに重要だ。PDMS基材は光学的透明度に優れているため、蛍光マーカーのイメージングには好ましい。一方、PAAゲルは便利だけど、光散乱や全体的なイメージング品質に関連した課題がある。
一般的に、基材の表面の粗さや孔のサイズは、トラクションフォースをどれだけ効果的に測定できるかに大きな役割を果たすことが示されている。研究によれば、PDMSはPAAと比べて光学的アーチファクトが少ない均一な表面を提供できるんだ。
デュアルラベリング技術
測定をさらに改善するために、科学者たちはデュアルラベリング技術を使い始めている。これには、フルオロキューブのような小さなマーカーと従来の大きな蛍光ビーズを基材に取り付けることが含まれる。この組み合わせは、明瞭さを失うことなく追跡を強化するんだ。研究者たちは、これらのマーカーの付着を最適化するために基材を修正して、細胞がかける力の分析を改善できるようにしてる。
小さくてあまり明るくないマーカーの追跡には課題があるけど、信頼できる結果を得るための方法が開発されている。実験を戦略的に設計し、画像を処理することで、科学者たちは細胞が環境に力をかける様子についての正確な情報を得られるようになったんだ。
高解像度の測定
最後に、研究者たちは、両方のタイプのマーカーと高度なイメージング手法を取り入れた改良技術で高解像度のデータ収集が可能であることを示している。これらの高解像度の測定は、細胞内の構造と密接に関連するトラクションフォースの詳細なパターンを明らかにできる。
要するに、TFMの進展により、より良いイメージング技術、改善された基材、より効果的な追跡方法が生まれた。研究者たちがこれらのアプローチをさらになお進化させていくことで、細胞メカニクスにおける作用する力についての理解が深まり、生物科学や医療研究のさらなる進展に繋がることが期待できるんだ。
タイトル: Traction Force Microscopy with DNA FluoroCubes
概要: From cell differentiation to morphogenesis and cell migration, a multitude of processes are coordinated by mechanical forces that cells generate. Among diverse techniques to assess the mechanical properties of the cell, traction force microscopy (TFM) has emerged as one of the most popular methods for quantifying cell-generated stresses. Standard TFM procedures rely on fiducial markers in the extracellular environment to measure the deformations that are caused by cellular forces. Typically, fluorescent beads are used as fiducials. However, the replacement of beads with fluorescently labeled DNA structures can have numerous advantages, including a smaller size of the markers and the possibility of customizing the DNA structures, for example to read out orthogonal information or to realize a switchable surface functionalization. Here, we develop a multi-purpose platform for combining such setups with TFM. As fiducials we employ FluoroCubes - nanometer-sized DNA constructs - for TFM. These constructs are grafted to a high refractive index polyethylene siloxane surface for the precise tracking of displacements resulting from cell-generated forces. To ensure a local transmission of traction forces from the adhesion ligands to the substrate, we also graft RGD peptides, which represent the smallest ligands of the extracellular matrix, onto our elastic substrates. To further enhance the spatial resolution of the TFM, FluoroCubes can be supplemented with densely packed fluorescent beads as fiducials. We propose a modification of the Kanade-Lucas-Tomasi (KLT) optical flow tracking (OFT) algorithm for optimal, simultaneous tracking of FluoroCubes and beads. Together, the developed experimental setup and tracking algorithm yield highly resolved maps of traction forces that correlate well with the spatial distribution of kindlin at focal adhesions.
著者: Benedikt Sabass, A. Mortazavi, J. Jiang, P. Laric, D. Helmerich, R. Seifert, M. Sauer
最終更新: 2024-04-15 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.12.589182
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.12.589182.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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