ダイアトムにおけるLhcxタンパク質の役割
珪藻は光保護と炭素固定のためにLhcxタンパク質に依存してる。
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目次
珪藻は世界中の海にいる小さな藻類なんだ。100,000種類以上の異なる珪藻が存在するよ。これらの生物は海での食物生産のおよそ40%を占めていて、地球の炭素固定にとって大事な役割を果たしているんだ。つまり、珪藻は二酸化炭素を私たちが呼吸する酸素に変えるのを助けるために必要不可欠なんだ。
珪藻の生息地
珪藻は浅い潮間帯や海の表面など、様々な海の環境で繁栄する。受け取る光の量は大きく変わって、光が多すぎると彼らには害になることもあるんだ。珪藻が処理できる以上の光にさらされると、細胞にダメージを与える反応性酸素種のような有害な物質を生成しちゃうんだ。
光からの保護メカニズム
過剰な光から自分を守るために、珪藻は光のエネルギーを熱として散逸させる方法を発展させた。このプロセスは、フソキサンチンやクロロフィルと呼ばれる色素を含む珪藻の構造の特定の部分で起こる。これはクロロフィル蛍光分析によって測定されるとき、非光化学的消光(NPQ)と呼ばれるんだ。これを助ける主な要因は、特定の色素の変化、チラコイド膜内の酸性環境、Lhcxという特定のタンパク質の3つだよ。
Lhcxタンパク質の役割
Lhcxタンパク質は珪藻の光収穫複合体というタンパク質グループの一部なんだ。異なる種類の珪藻に見られて、光エネルギーを捕らえて利用するのを管理するのに重要なんだ。興味深いことに、よく研究されている珪藻の一種では、これらのタンパク質が欠けていると光ダメージが増加したことが分かって、細胞を光から守る重要性が示されたんだ。
ある海洋珪藻、タラッシオシラ・スデオナナには複数のLhcxタンパク質があって、異なる光条件下での機能を調べられている。研究者たちは、特定の型のLhcx6_1が他の型とは異なる振る舞いをすることを発見した。T. スデオナナがLhcx6_1を持たないように改造されると、高光条件下で野生型よりもよく機能したけど、両方の改良型の細胞は高光にさらされるとダメージを受けたんだ。
Lhcxアイソフォーム間の類似性
Lhcxタンパク質の研究では、T. スデオナナや他の珪藻種を含む異なる種間での類似性が示された。遺伝学的研究では、これらのタンパク質を進化的関係に基づいて異なるグループに分類した。この分類は、科学者がこれらのタンパク質が異なる藻類でどのように似たり異なったりするかを理解するのに役立つよ。
Lhcxタンパク質の分布
T. スデオナナや他の種からのLhcxタンパク質は海洋で広く分布していることがわかった。これは海洋珪藻の生息地とも関連している。しかし、特定の型、Lhcx6_1はT. スデオナナに似た珪藻に主に見られて、珪藻の適応に特化した役割を示唆しているんだ。
珪藻におけるタンパク質の蓄積
Lhcxタンパク質の存在は光条件によっても異なる。T. スデオナナの細胞が高光にさらされると、特定のLhcxタンパク質のレベルが大幅に増加した。一方で、Lhcx6_1のレベルはあまり変化せず、一貫して存在していることを示している。これは、いくつかのLhcxタンパク質が光に反応する一方で、Lhcx6_1のようなものは一定の保護機能を果たしていることを示唆しているんだ。
Lhcxタンパク質のゲノム編集
Lhcxタンパク質の機能をさらに理解するために、科学者たちはCRISPRという技術を使って、特定のLhcxタンパク質が欠けたT. スデオナナの改良バージョンを作成した。これにより、これらのタンパク質が欠けていることで珪藻の成長や光ストレスの扱いにどんな影響があるかを見ることができたんだ。
結果は、Lhcx1とLhcx2を取り除くことで、珪藻が高光の下で自分を守る能力が大幅に減少したことを示した。しかし、Lhcx6_1がない状態では、細胞は同様の条件でよりよく対処するように見えたけど、両方の改良型細胞は光ダメージを受けたんだ。
Lhcxタンパク質がPSIIに与える影響
光合成の過程において、PSII(光系II)は重要なコンポーネントで、Lhcxタンパク質はそのパフォーマンスに好影響を与えるんだ。T. スデオナナの改良型細胞でLhcxタンパク質が欠けていると、高光にさらされたときにPSIIの効率が低下し、これらのタンパク質が適切な光合成活動を維持するのに重要であることを示しているよ、特にストレス下で。
クロロフィル蛍光パラメータ
さらに珪藻を分析したところ、強い光を導入するとクロロフィルから放出される蛍光に影響が出た。野生型細胞では、光に対する反応が迅速で、非光化学的消光(NPQ)レベルが安定して増加した。一方で、Lhcxタンパク質が欠けた改良型細胞は反応が遅く、高光レベルに適応するのに苦労していることを示唆している。
予想外なことに、Lhcx6_1が欠けた改良型細胞は野生型に比べてNPQ値が高かった。このことは、Lhcx6_1が異なる役割を果たしている可能性があり、PSIIでエネルギーを管理する役割を果たしているかもしれないってこと。
結論
結論として、T. スデオナナのような珪藻は、光エネルギーを管理して過剰な光によるダメージから自分を守るために、さまざまなLhcxタンパク質に頼っているんだ。一部のタンパク質は高光でのエネルギー消散や光保護にとって重要だけど、他のものはまだ完全には理解されていない異なる機能を持っているかもしれない。珪藻のLhcxタンパク質に関する研究は、これらの生物が変化する海洋環境でどう生き延びているかを明らかにするだけでなく、彼らの地球的な生態系や炭素固定プロセスにおける役割の理解も深めているんだ。これらのタンパク質やその機能の探求は、海洋生物学における重要な研究分野として続いているよ。
タイトル: Different functions of Lhcx isoforms in photoprotective mechanism in the marine diatom Thalassiosira pseudonana
概要: Photosynthesis needs light energy, but that exceeding the maximal capacity of photosynthesis enhances formation of reactive oxygen species, which potentially causes photodamages. Therefore, light-harvesting complexes (Lhc) in phototrophs harbor various proteins and pigments to function in both light capture and energy dissipation. Diatom Lhcx proteins are reported to be a critical component for thermal dissipation of excess light energy, but the molecular mechanism of photoprotection is still not fully understood and the functions of each Lhcx isoform are not yet differentiated. Here, we focused on two types of Lhcx isoforms in Thalassiosira pseudonana: TpLhcx1/2, putative major components for energy-dependent fluorescence quenching (qE); and TpLhcx6_1, functionally unknown isoform uniquely conserved in Thalassiosirales. TpLhcx1/2 proteins accumulated more under high light than under low light, while the TpLhcx6_1 protein level was constitutive irrespective of light intensities and CO2 concentrations. High-light induced photodamage of photosystem II was increased in the genome-editing transformants of these Lhcx isoforms relative to the wild-type. Transformants lacking TpLhcx1/2 showed significantly lowered qE capacities, strongly suggesting that these proteins are important for the fast thermal energy dissipation. While in contrast, genome-editing transformants lacking the TpLhcx6_1 protein rather increased the qE capacity. TpLhcx6_1 transformants were further evaluated by the low-temperature time-resolved chlorophyll fluorescence measurement, showing the longer fluorescence lifetime in transformants than that in the wild type cells even at the dark-acclimated state of these cells. These results suggest that TpLhcx6_1 functions in photoprotection through non-photochemical energy dissipation in the different way from qE. One sentence summaryThe marine diatom Thalassiosira pseudonana dissipates excess light energy for photoprotection via two types of mechanisms supported by different Lhc isofoms.
著者: Ginga Shimakawa, M. Nakayasu, S. Akimoto, K. Yoneda, S. Ikuta, Y. Matsuda
最終更新: 2024-04-19 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.16.589823
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.16.589823.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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