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蚊よけの進化について

新しい方法が、より良い害虫駆除のための忌避剤を改善することを目指しているよ。

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虫除け剤の新しい最前線虫除け剤の新しい最前線とを目指してる。革新的な技術が病気を運ぶ蚊に立ち向かうこ
目次

蚊とか血を吸う虫って、毎年多くの人を殺す病気を運ぶんだよね。この健康問題に対処するには、これらの害虫をコントロールするもっと効果的な物質を見つけたり作ったり使ったりする必要がある。コントロールには虫を殺すだけじゃなくて、人を噛ませないようにすることも含まれる。DEETとかピカリジン、IR3535みたいな一般的な忌避剤が使われてるけど、欠点もあるんだ。例えば、DEETは特定の布地を傷めたり、一部の動物には有害だったりするんだって。最近の数十年で新しいタイプの忌避剤があまり出てきてないから、早く新しい選択肢を見つける方法が必要なんだ。

現在の忌避剤とその問題

DEETみたいな一般的な忌避剤は高濃度で使わなきゃいけないから、使える場所が限られるんだ。また、環境や野生生物に有害なこともある。一部の忌避剤は特定の蚊には効くけど別の蚊には効かないんだよね。例えば、IR3535はエジプト蚊には効果的だけど、マラリアを広げるアノフェレス蚊には効かない。こういう制限があるから、新しい忌避剤候補を見つけて試す新たな方法を考えなきゃいけないんだ。

新しい忌避剤を見つけるための戦略

新しい忌避剤候補を見つける方法はいくつかある。ひとつは行動テストで、忌避剤の効果を実際の状況で観察するという方法だ。例えば、第二次世界大戦中、USDAは多くの化合物をテストして虫をどれだけ寄せ付けないかを調べて、DEETの発見につながったんだ。その他にも、化合物の分子構造を研究して、虫の感覚とどう反応するかを見たりする方法があるけど、これらは時間がかかって労力も必要なんだよね。

歴史的データを活用した新しい解決策

USDAは化合物の構造とその忌避効果との関係を詳しく記録した大規模なデータセットを持ってるけど、今まで完全には活用されてこなかった。この研究では、深層学習と呼ばれる人工知能の一種を使ってこのデータセットを分析する現代的なアプローチを採用した。これによって、どの化学構造が効果的な忌避剤になりそうかをよりよく理解できるようになるんだ。

USDAデータセットのデジタル化と分析

USDAのデータセットは、忌避剤の効果に関する多くの情報を含んでたけど、長い間印刷された形でだけ存在してたんだ。最近になってやっとスキャンされてオンラインで利用できるようになった。研究者たちはこのデータをコンピュータが読み取れる形式に変換したんだ。情報を慎重に処理した後、異なる蚊の種を対象にした特定のテストに集中した。このプロセスで大きなデータセットが得られ、新しい忌避剤の効果を予測するモデルを訓練するために使われることになった。

予測モデルの構築

深層学習モデルを活用して、研究者たちはさまざまな化合物の忌避剤としての効果を予測することを目指してる。特に、化学化合物の構造に基づいて特性を予測するのに有望なグラフニューラルネットワークというモデルを選んだ。データセットが準備できたら、モデルは歴史的データから学習でき、新しい候補のテストに向けてより良い予測ができるようになるんだ。

新しい候補のテスト

モデルが効果的かどうかを確かめるために、研究者たちは実験室でその予測をテストする必要があった。彼らは特殊な膜餌法を使って、潜在的な忌避剤が蚊の餌を止める能力を測定した。モデルの予測に基づいて有望な候補を選んだ後、彼らはこれらの分子の忌避効果をテストした。結果はモデルのさらなる改良に使われ、新しいデータに基づいた予測を継続的に改善するためのアクティブラーニングアプローチが可能になった。

カルシウムイメージングの役割

研究者たちは、さまざまな化合物に対する蚊の脳の反応を観察するために高度なイメージング技術も使ったんだ。特に、匂いを処理する役割を持つ蚊の脳の特定の部分、触角葉に注目した。異なる物質がどのようにさまざまなニューロンを活性化するかを分析することで、蚊が忌避剤をどう検知するかの洞察を得ようとしたんだ。

効果的な分子の発見

このプロセスを通じて、研究者たちは潜在的に忌避剤として機能する幅広い化学物質を見つけた。これらの新しい分子のいくつかは、DEETと同等かそれ以上の効果を示しているんだ。このことは、特にマラリアが一般的な地域での蚊が運ぶ病気と闘うために重要なんだ。

候補の性能評価

潜在的な忌避剤候補を特定した後、次のステップは、さまざまな環境での性能を評価することだった。研究者たちは、選ばれた分子を蚊だけでなく、ダニなどの他の害虫に対してもテストした。彼らは多くの候補が異なる種に対して効果的で、幅広い利用可能性を示していることを発見したんだ。

制限の理解

期待される結果にもかかわらず、モデルの予測が実際の化合物の挙動とどれだけ合っているのかには疑問が残った。一部の変動が示すように、モデルは効果的な候補を提案できるけど、実際の性能は環境要因や害虫の特定の生物学によって異なる可能性があるんだ。

忌避剤発見の未来

この発見は、歴史的データと現代技術を結びつけて新しい忌避剤を見つける重要性を強調してる。この研究は新しい製品を見つけるだけじゃなく、他の行動を変える物質を異なる文脈で研究する可能性も開いているんだよね。

結論

要するに、古いデータセットのデジタル化、深層学習モデルの適用、実験室でのテストを組み合わせることで、新しくて効果的な害虫忌避剤を見つけるための有望な方法を提供してる。研究が続けば、蚊の個体群やそれが運ぶ病気の管理がより良くなり、最終的には命を救い、公衆衛生を向上させる助けになるはずだよ。

オリジナルソース

タイトル: A deep learning and digital archaeology approach for mosquito repellent discovery

概要: Insect-borne diseases kill >0.5 million people annually. Currently available repellents for personal or household protection are limited in their efficacy, applicability, and safety profile. Here, we describe a machine-learning-driven high-throughput method for the discovery of novel repellent molecules. To achieve this, we digitized a large, historic dataset containing [~]19,000 mosquito repellency measurements. We then trained a graph neural network (GNN) to map molecular structure and repellency. We applied this model to select 317 candidate molecules to test in parallelizable behavioral assays, quantifying repellency in multiple pest species and in follow-up trials with human volunteers. The GNN approach outperformed a chemoinformatic model and produced a hit rate that increased with training data size, suggesting that both model innovation and novel data collection were integral to predictive accuracy. We identified >10 molecules with repellency similar to or greater than the most widely used repellents. We analyzed the neural responses from the mosquito antennal (olfactory) lobe to selected repellents and found a limited correlation between these responses and our GNN representation. This approach enables computational screening of billions of possible molecules to identify empirically tractable numbers of candidate repellents, leading to accelerated progress towards solving a global health challenge.

著者: Alexander B Wiltschko, J. N. Wei, C. Ruiz, M. Vlot, B. Sanchez-Lengeling, B. K. Lee, L. Berning, M. W. Vos, R. W. Henderson, W. W. Qian, D. M. Ando, K. M. Groetsch, R. C. Gerkin, J. A. Riffell, K. J. Dechering

最終更新: 2024-05-02 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.09.01.504601

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.09.01.504601.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

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