抗菌薬耐性に対する新しい戦略
研究者たちが細菌を標的にした新しい抗菌薬を見つけるための有望なテストを開発してるよ。
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抗菌薬耐性(AMR)は、長い間認識されてきた深刻な問題だよ。要するに、バイキン、特にバクテリアが、私たちが使っている薬に対して耐性を持つようになってきているってこと。近年、この問題は悪化していて、新しい抗菌薬の開発数は減少してる。
新しい抗菌薬を見つける主な方法は、薬がバクテリアをどれだけ殺したり、成長を止めたりするかをテストしたり、薬が攻撃できるバクテリア内の特定のターゲットを特定することだよ。今使われている抗菌薬のほとんどは、科学者たちがいろんなバクテリアにどんな影響を与えるかを見て、実験室で見つけたものなんだ。残念ながら、過去20年間に発売された新しい薬のほとんどは、既存の薬のバリエーションであって、全く新しい選択肢ではないんだ。AMRに対処するために、研究者たちは新しいターゲットに作用する抗菌薬を見つけたり、バクテリアを止めるための新しい方法を探しているよ。
何をターゲットにしているの?
新しい抗菌薬の開発での主なターゲットの一つは、バクテリアの中にある分泌機構(Sec機構)だよ。これは、バクテリアが自分の細胞の中で作ったタンパク質を細胞の外で必要な場所に運ぶ仕組みだ。Sec機構は、バクテリアが膜を通して必要なタンパク質を移動させるのに重要だから、新しい薬の重要なターゲットになってるんだ。
研究によれば、Sec機構はバクテリア内のタンパク質輸送において重要な役割を果たしていることがわかっている。Sec機構の中核部分には、他のタンパク質を膜を越えて輸送するのを助ける特定のタンパク質が含まれてるよ。輸送用に設計されたタンパク質は、移動のために特別な配列が始まりに付けられるんだ。それが機構に認識されると、膜を越えて移動され、その特別な配列は取り除かれて、完全なタンパク質が残る。
科学者たちはこの仕組みがどう機能するかについて多くを学んでいて、それが機構をブロックする方法を考えるのに役立っているよ。ただ、現在のブロッカーのテストはこのシステムの一部だけに焦点を当てていて、全体の機構を見ていないから、効果が制限されることがあるんだ。
新しいテストの開発
新しい抗菌薬を見つけるためのより良いテストを作るために、研究者たちはバクテリア内でのタンパク質の輸送を監視するリアルタイムの方法を開発したよ。この方法は、NanoLuc Binary Technologyという光を生成するシステムを使ってるんだ。基本的に、タンパク質が細胞の外に成功裏に移動すると、測定可能な光を放つんだ。この方法は感度が高く、研究者たちが候補薬がこの輸送プロセスをどれだけ止められるかを確認するのに役立つんだ。
新しいテストでは、研究者たちは生きたバクテリアで動作するように方法を適応させたんだ。つまり、実際のバクテリア細胞の環境で候補薬の効果を試せるってこと。彼らはこの方法を使って、Sec機構を効果的に阻害できる新しい薬の候補を特定できることを示したよ。
テストの効果
実験では、科学者たちは特別なバクテリアと、タンパク質が成功裏に移動したときに簡単に表示されるようにタグ付けされたタンパク質を使ったんだ。彼らはこれらのタンパク質を監視して、どれだけの異なる化合物、つまり候補薬がこの輸送プロセスをブロックできるかを見たんだ。このアプローチにより、どの化合物がバクテリアに対して効果的かを特定しつつ、意図した通りに機能しない化合物からの誤った結果を減らすことができるんだ。
彼らは、5000種類の異なる化合物のライブラリーを使って、どれがタンパク質輸送を成功裏に阻害できるかを確認したんだ。彼らは、これらの化合物の効果を慎重に測定して、どれが上手く働くかを調べたよ。
新しい化合物の発見
大量の化合物のライブラリーを調べた結果、研究者たちは、生きたバクテリア内でSec機構をブロックできるいくつかの有望な薬を特定したんだ。特に、低濃度で作用するものを探していて、使いやすくて安全かもしれないものを見つけたよ。彼らはこれらの化合物の活性を確認するためにさらにテストを行い、一部は輸送プロセスに非常に特定の効果を示したんだ。
テストの結果、これらの潜在的な薬のいくつかは、バクテリアが生存するために必要な重要なタンパク質の分泌を効果的に阻害できることがわかったんだ。これは重要で、バクテリアはしばしばこれらのタンパク質を使って生き延びたり、病気を引き起こしたりするからね。それらの移動をブロックすることで、研究者たちはバクテリアを弱めることを目指している。
結果の正確性を確保する
これらの薬をテストする際、研究者たちは、活動の低下が他の理由で細胞がうまく機能していないことを意味する場合もあることを考慮に入れていたんだ。結果の正確性を確保するために、彼らは全体のバクテリア機能を測定するコントロールテストを作成して、誤ったポジティブを排除するのに役立てたよ。これは重要で、科学者たちが実際にSec機構をターゲットにする化合物に集中できるようにするからね。
研究の次のステップ
研究者たちは、新しいテストアプローチが新しい抗菌剤を見つけるのに多くの可能性を示していると結論付けたよ。様々な感染を引き起こすことができるE. coliのようなバクテリアにとって、タンパク質を輸送する能力を制限することが重要な戦略になるかもしれない。実際、輸送システムがうまく機能していなくても、バクテリアはまだ生存できることがあるから、治療には挑戦があるんだ。でも、このシステムをターゲットにした新しい化合物を開発するための理解を深めることができれば、将来的には効果的な治療法が得られるかもしれない。
大きな視点
抗菌薬耐性は増大する問題であり、公衆衛生にとって重要な脅威をもたらしている。バクテリア感染を治療する新しい方法を見つけることが重要だよ。多くのバクテリアが既存の薬に対して耐性を持ってきているから、革新的なテスト方法を通じて新しい抗菌剤を見つける努力は決定的だね。
バクテリアのSec機構をターゲットにすることは、新しい道を提供するかもしれない。これにより、研究者たちは耐性株に対抗するだけでなく、バクテリアがまだ適応していない方法で作用する薬を見つけることができるかもしれない。これは感染と抗菌薬耐性に対する治療オプションを改善するための重要な方法になるんだ。
研究者たちがテストを洗練させ、有望な新しい化合物を特定し続ける中で、抵抗性バクテリアを打ち負かす効果的な治療法を開発することを期待しているよ。これは進行中の戦いだけど、この分野の科学の進歩は、より良い健康結果とAMRに対抗する明るい未来につながるかもしれないね。
タイトル: A whole cell luminescence-based screen for inhibitors of the bacterial Sec machinery
概要: There is a pressing need for new antibiotics to combat rising resistance to those already in use. The bacterial general secretion (Sec) system has long been considered a good target for novel antimicrobials thanks to its irreplacable role in maintaining cell envelope integrity; yet the lack of a robust, high-throughput method to screen for Sec inhibition has so far hampered efforts to realise this potential. Here, we have adapted our recently-developed in vitro assay for Sec activity - based on the split NanoLuc luciferase - to work at scale and in living cells. A simple counterscreen allows compounds that specifically target Sec to be distinguished from those with other effects on cellular function. As proof of principle we have applied this assay to a library of 5000 compounds and identified a handful of moderately effective in vivo inhibitors of Sec. We therefore anticipate that the methods presented here will be scalable to larger compound libraries, in the ultimate quest for Sec inhibitors with clinically relevant properties.
著者: William John Allen, T. Salter, I. Collinson
最終更新: 2024-05-10 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.10.593495
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.10.593495.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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